| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,030 | 0 | A→G | 7.6% | 258.1 ‑6.0 ‑1.4 | 1672 | D209D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (43/88): ref base (716/821): total (762/910) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.49e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.73e-02 | ||||||||||
Only 100 of 2085 total aligned reads displayed.
TGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGC > NC_014034/221930‑222130
|
gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:2363085‑M1/70‑1 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:4357354‑M1/64‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg < 1:751097‑M1/67‑1 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:3766092‑M1/27‑101 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:2195759‑M1/26‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtcggtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGggatcggtcgggtc > 1:3618009‑M1/79‑98 (MQ=255)
tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc > 1:4119293/1‑101 (MQ=255)
cggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 1:918019‑M1/21‑101 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:1294808‑M1/24‑1 (MQ=255)
tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 2:2887691/1‑101 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 2:1997079‑M1/23‑101 (MQ=255)
cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 1:3339707/101‑1 (MQ=255)
ccgttggatcggtggggtccctgggctcggtcgggtccgtaGGATCTGTCGGGTCCGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:3512555/96‑1 (MQ=11)
gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTCGGGGCCGGGGGCTCGGCCGGGCCCGGGGGCtcggc > 1:2081689/1‑100 (MQ=2)
tgtgatctttcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:2969352/92‑1 (MQ=14)
tggggtcggtcggaTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 2:3887110‑M1/15‑101 (MQ=255)
tgggatgagtccgggccgtgggatccgtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGTTCGGTCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:1310893/93‑1 (MQ=11)
tgggagcgggcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:1359842/99‑1 (MQ=11)
gggggccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcg < 2:247712/94‑1 (MQ=14)
ggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 2:1220751‑M1/13‑101 (MQ=255)
gtcggcggggtcagggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:2454539/94‑1 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat > 2:2579453‑M2/1‑99 (MQ=255)
atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:2010410/101‑1 (MQ=11)
atcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt < 1:4397927‑M1/91‑1 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatc > 1:3131679‑M2/1‑98 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatc > 1:4188267‑M2/1‑98 (MQ=255)
cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 1:4739143/101‑1 (MQ=11)
cggccgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc < 1:2306226/101‑1 (MQ=11)
ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 1:167116/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg < 2:1561911‑M2/101‑6 (MQ=255)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTGGGGGCGGCCGGGTCAGCGGGTTAGGTCGGATCCg > 1:4659337/1‑101 (MQ=11)
gggggtgtccgtgggatcggtcgggtccgttggatccgtcggGTCTGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 1:4556089/95‑1 (MQ=11)
gtgggatcgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:3015762‑M1/58‑101 (MQ=255)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgt < 1:1132289‑M2/101‑7 (MQ=255)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGCTCGGCCGGCTCCGCGGGATCGGTCGGACCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCgcg > 1:2619500/1‑99 (MQ=14)
gggttccctggcatcggtcgtgtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg < 2:2298554/97‑3 (MQ=11)
gggtggctgggctcggtggtgtgcgctggatgggtcggGCGCGTGGGGTCGGGCGGGTGCCTCGGACCCGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg < 1:3692799/94‑1 (MQ=2)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatc > 2:1697116‑M2/1‑89 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGatccgtgggatc > 2:2070499‑M2/1‑89 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggacggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCTGatccatgggata < 1:82816‑M2/101‑13 (MQ=255)
ccgtgggatcggtgggttccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:1002194/101‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCgcgggttcg > 1:3876439/1‑93 (MQ=11)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTAGGAtcgg < 2:3605937‑M1/52‑1 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg > 1:3959537/1‑101 (MQ=11)
gtgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgt > 2:1465770‑M2/1‑75 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggg > 2:3669909/1‑100 (MQ=14)
ggtgcgtcggtcgtgtccgtgggtcctgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 2:3347065/95‑1 (MQ=11)
tgggatcggtcggatcggtgggatcggtgggGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtc < 2:3072929/101‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggATCGGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:1780134/101‑1 (MQ=17)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:1937901/1‑101 (MQ=14)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCAGAGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATAGGACGGGACCGTGGGAGCGGGCGGAGCCGTGGGAtcgagcg > 2:344489/1‑97 (MQ=2)
ggatcggtcgggtccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:222187/101‑1 (MQ=11)
ggatccgtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:722141/101‑1 (MQ=11)
gtcggtggggtccgtaggttcggtcggGTCCGTGGGGTCGGTTTGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt < 1:2141614/100‑1 (MQ=11)
atggggcgggtccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt < 1:671760/95‑1 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTTTGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg > 1:4056312/1‑101 (MQ=11)
ggtcggacccggggggtcgggaggTTCCGTCGGATCCGTCGGGCCGGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccg < 2:2662078/101‑1 (MQ=2)
gtcggggccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgt > 1:284640‑M2/1‑77 (MQ=255)
tcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtg < 1:4267873‑M2/101‑26 (MQ=255)
cgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg > 1:1741346/1‑99 (MQ=11)
ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcggctccgtggga > 2:1390906/1‑100 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtggga > 2:4157262‑M2/1‑73 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggccgggtcc < 2:632378‑M2/101‑43 (MQ=255)
cgtggggtccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGgtggggtccgtggggtcgg > 2:3761990/1‑99 (MQ=11)
gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcggggccgtggggtgcgg > 2:917942/1‑100 (MQ=11)
gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt > 1:1192172/1‑101 (MQ=14)
gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggg < 2:2124443‑M2/101‑34 (MQ=255)
tgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtg < 2:3255969‑M2/101‑35 (MQ=255)
tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCTTGGGGTCGGTg > 2:4529966/1‑101 (MQ=11)
gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg > 2:1881419‑M2/1‑66 (MQ=255)
ctgttgcaTCGGTCGGATCGTTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:4304411/94‑1 (MQ=14)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgagatc < 1:2543599‑M2/101‑41 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg > 1:3232752‑M2/1‑60 (MQ=255)
cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:553441/101‑1 (MQ=14)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgg > 2:4438724‑M2/1‑57 (MQ=255)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg > 1:1449835/1‑99 (MQ=11)
gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGtcggtggg > 2:4073682/4‑101 (MQ=11)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg > 2:3990420‑M2/1‑56 (MQ=255)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtggg > 1:2719566/1‑101 (MQ=11)
gtcCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat > 1:573563‑M2/2‑54 (MQ=255)
gtCCGTGGGATCGGGCGAATCACTGGCATCGGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt < 2:4650475/100‑1 (MQ=11)
atcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt < 1:3435277‑M1/85‑1 (MQ=255)
tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 2:1138464‑M2/1‑53 (MQ=255)
tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtc > 1:1859743‑M2/1‑42 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtcc < 1:1553634‑M2/101‑61 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 1:4489754‑M2/101‑52 (MQ=255)
ttggAGCGGTTGGGTGCGTGGGTTCGGTCGGCTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg < 1:3501039/99‑1 (MQ=14)
taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGtc > 2:4752290/3‑100 (MQ=14)
tccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtc > 1:1053660‑M2/1‑44 (MQ=255)
gcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc < 1:1946236/100‑1 (MQ=14)
cggtcgtGTCCGTCGGATGGGTCGGATCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGAtcg < 2:3172964/101‑1 (MQ=18)
ccgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc < 2:796147‑M2/99‑59 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGGGGGAtggg > 2:10076/1‑101 (MQ=11)
tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgta > 2:2752792‑M2/1‑40 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc > 2:2411225‑M2/1‑35 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg < 2:2339964‑M2/101‑68 (MQ=255)
cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTCGGGTCCGTgg > 2:106404/2‑101 (MQ=17)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:4200329/101‑1 (MQ=255)
ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:2927499/1‑101 (MQ=18)
aTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggat < 1:4330871/101‑3 (MQ=14)
|
TGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGC > NC_014034/221930‑222130
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|