| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,411 | C→G | 4.6% | intergenic (+223/‑708) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,411 | 0 | C→G | 4.6% | 17.6 ‑1.5 ‑0.2 | 240 | intergenic (+223/‑708) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/7): ref base (130/99): total (134/106) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.22e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.78e-01 | ||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
CTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCC > NC_014034/1395311‑1395511
|
ttCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCt < 2:3084561/101‑1 (MQ=255)
tCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTg < 2:397111/101‑1 (MQ=255)
cGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGc < 1:2102787/101‑1 (MQ=255)
gCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGcc < 2:2145914/101‑1 (MQ=255)
gCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGcc > 2:261299/1‑101 (MQ=255)
caccacCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcg > 1:2689660/1‑101 (MQ=255)
caccacCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcg > 2:4162668/1‑101 (MQ=255)
accaccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCCGCcgg > 1:1672629/1‑101 (MQ=255)
ccaccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCAGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggt < 1:1523475/101‑1 (MQ=255)
caccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtg < 2:1737341/101‑1 (MQ=255)
caccGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcgggg > 1:1534327/1‑99 (MQ=255)
cGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatc > 2:3417267/1‑101 (MQ=255)
cGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAACGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCccgtcatc > 2:1249249/1‑101 (MQ=255)
gCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg < 1:3023934/101‑1 (MQ=255)
cAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.a > 2:4648326/1‑101 (MQ=255)
aaaTTTACACCGTCAGGATAGCGGGTTAGGCAACGGCAGGCG.CACCCCCCGCGGGGGCTTGAATCGAATCCGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.a < 2:4479599/100‑1 (MQ=255)
aaTTTACCCCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCAAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCcggtgatcggtg.at < 1:4025066/101‑1 (MQ=255)
aTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCggtgatcggtg.atc < 1:2394836/101‑1 (MQ=255)
aTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCggtgatcggtg.atc < 2:1541292/101‑1 (MQ=255)
aTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCggggatcggtg.atc > 1:902124/1‑101 (MQ=255)
aTTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCggggatcgggg.atc > 2:851077/1‑101 (MQ=255)
tttccccGGCTGGTCCGGGGGTTTCGGAACGGGAGTCGCCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCa < 1:122525/96‑1 (MQ=25)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg > 1:1576605/1‑101 (MQ=255)
ttACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAg > 1:3446605/1‑101 (MQ=255)
acacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCg > 1:2781062/1‑101 (MQ=255)
acacCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGGG.ATCAGCg > 2:2692648/1‑101 (MQ=255)
ccGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTc > 1:805163/1‑101 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGc < 2:901034/101‑1 (MQ=255)
gTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGc > 1:1128238/1‑101 (MQ=255)
tCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCt < 1:1888895/101‑1 (MQ=255)
cTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTc < 2:2509369/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcc > 1:1258899/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcc > 2:241564/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTcc > 1:3276057/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTccccc < 1:1565066/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCGcccccc > 1:768114/1‑101 (MQ=255)
aGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCcg > 1:3334749/1‑101 (MQ=255)
aGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCcg > 1:4362631/1‑101 (MQ=255)
gTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCgggg < 2:3851517/101‑1 (MQ=255)
gTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCgggg > 2:361635/1‑101 (MQ=255)
ttACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCCGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGGCGCTCCCCCCGCggggg > 1:1972874/1‑101 (MQ=255)
tACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 1:1773351/101‑1 (MQ=255)
tACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGGG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGCGGGc > 2:823335/1‑101 (MQ=255)
aCGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCg > 1:2835863/1‑101 (MQ=255)
gAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 1:3805763/101‑1 (MQ=255)
caaccGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 2:2555237/97‑1 (MQ=255)
aaaCGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 2:2934059/101‑1 (MQ=255)
aaaCGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGGGATCGGGG.ATCAGCGGGCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 1:1392815/1‑101 (MQ=255)
cGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:4131801/101‑1 (MQ=255)
acactgTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa > 2:2395214/6‑101 (MQ=2)
cactgTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:550018/97‑1 (MQ=2)
tgTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAct < 2:364363/100‑2 (MQ=2)
tgTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAct < 2:4389553/100‑2 (MQ=2)
aGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCGaaa > 2:377209/1‑101 (MQ=255)
aGTCG.CCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:403347/101‑1 (MQ=255)
gTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAC.GCTGGCGCGCGCCGCGCCG..GATCTTTGTCTGCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAActc < 1:3162291/101‑3 (MQ=2)
cG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt > 1:2278449/1‑101 (MQ=255)
cG.CCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAt < 1:3567299/101‑1 (MQ=255)
g.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCGGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATc > 1:4719794/1‑101 (MQ=255)
tCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgc > 1:1799584/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGCTCGAAACATcgcc > 2:1314802/1‑101 (MQ=255)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATcgccgc < 1:1042531/101‑1 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCttt < 1:4162914/101‑1 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGc > 2:2162733/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGc > 2:295191/1‑101 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCgg < 2:3446393/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGTATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt < 2:3491787/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt < 2:3951342/101‑1 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt > 1:3108544/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt > 1:1904689/1‑101 (MQ=255)
ggCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGGG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGt > 1:1174167/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGa > 2:2910573/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGAc > 2:4190470/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGGCa > 2:4538520/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg > 1:487636/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAg < 1:4648582/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAgg < 1:1705247/101‑1 (MQ=255)
cGAAACTGCCCCCGCGGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ACCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCt < 1:3304601/101‑1 (MQ=255)
gAAACTGCCCCCGCTGCCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg < 2:15525/101‑1 (MQ=255)
gAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTg > 2:4323186/1‑101 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg < 2:4250736/101‑1 (MQ=255)
aaaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTgg > 2:1999207/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGt > 2:2451969/1‑101 (MQ=255)
aCTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 1:2939327/101‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa > 1:87160/1‑101 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 2:2031517/101‑1 (MQ=255)
ccgCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa < 2:1174077/99‑1 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa < 2:2835698/101‑1 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 2:100228/1‑101 (MQ=255)
gCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACg > 2:472824/1‑101 (MQ=255)
cACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgt > 1:3903611/1‑101 (MQ=255)
aCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtg > 2:745947/1‑101 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt > 1:2529575/1‑101 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCg < 2:1128152/101‑1 (MQ=255)
cTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGGTCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCt < 2:1873398/101‑1 (MQ=255)
tGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTc > 1:233603/1‑101 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc < 1:4307665/101‑1 (MQ=255)
ggCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcc > 2:3203681/1‑101 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTG.ATGAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccc < 1:1543723/101‑1 (MQ=255)
cccTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccc < 2:1672524/101‑1 (MQ=255)
|
CTTCGCACCACCGGAGCAATTTACACCGTCTGGTCAGCGGGTTACGAAACGGCAGTCG.CTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTG.ATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCGCCGCTTTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCC > NC_014034/1395311‑1395511
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|