Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,395,955 | C→G | 3.1% | intergenic (+767/‑164) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,395,955 | 0 | C→G | 3.1% | 5.2 ‑3.5 ‑0.0 | 192 | intergenic (+767/‑164) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (0/6): ref base (92/94): total (92/100) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.96e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.79e-01 |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
GATCGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTG > NC_014034/1395855‑1396054
|
gATCGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGc < 2:3952884/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGc > 2:2655055/1‑101 (MQ=255)
gATCGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGCCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATTGAAACGATGCGATCATGGCCTACGTCGGGc > 1:286992/1‑101 (MQ=255)
aTCGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCa < 2:3636679/101‑1 (MQ=255)
tCGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAg < 2:1673059/101‑1 (MQ=255)
cGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAgg > 2:2156573/1‑100 (MQ=255)
cGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGt > 2:155039/1‑101 (MQ=255)
cGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGt > 2:2763740/1‑101 (MQ=255)
cGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGt > 1:2906499/1‑101 (MQ=255)
gAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTg > 1:3935720/1‑101 (MQ=255)
gAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTg < 1:2763904/101‑1 (MQ=255)
aaaCTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTgg < 1:3580874/101‑1 (MQ=255)
aaCTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGa > 1:793757/1‑101 (MQ=255)
aaCTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGa < 2:273828/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACt < 2:3296748/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTg < 1:2499404/101‑1 (MQ=255)
cgccgcCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGt < 2:526242/101‑1 (MQ=255)
cgccgcCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGt < 2:2470484/101‑1 (MQ=255)
gccgccTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTc < 2:1291395/101‑1 (MQ=255)
ccgccTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCg < 2:3068396/101‑1 (MQ=255)
gccTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCt < 2:4026845/101‑1 (MQ=255)
ccTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTc < 1:420453/101‑1 (MQ=255)
tATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTccc > 1:3409275/1‑101 (MQ=255)
tATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTccc > 2:1363095/1‑101 (MQ=255)
cGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTcccccc < 1:1183393/101‑1 (MQ=255)
cGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTcccccc > 2:2567574/1‑101 (MQ=255)
atacGGACGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACCATGCGCTCACAGCCTACGTCGGGCAGCGGACTGGCCGGTCCCCCcgtg > 2:3918164/4‑99 (MQ=21)
ccGGTCGAGCCCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCggg < 1:2048461/101‑1 (MQ=255)
ggTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCggggg > 1:3066500/1‑101 (MQ=255)
ggTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCggggg < 1:3187939/101‑1 (MQ=255)
ggTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGACGCTCCCCCCGCggggg > 1:4751006/1‑101 (MQ=255)
gTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:627093/101‑1 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGCAGTCGCCCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.Gt < 1:3272763/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGa < 1:2998401/101‑1 (MQ=255)
gccgcGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATc < 1:2092797/101‑1 (MQ=255)
gccgcGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATc < 1:1844051/101‑1 (MQ=255)
cgcgCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGa < 2:3028794/101‑1 (MQ=255)
gcgcAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGaa < 1:2640973/101‑1 (MQ=255)
gcgcAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGaa < 2:410915/101‑1 (MQ=255)
aggatgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACTATGCTGGCTCGACCGAGTTCACGGCGGGCTATCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGaa < 2:4311944/96‑1 (MQ=2)
aggatgTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTAGATCGAAACTATGCTGGCTCGACCGAGTTCACGGCGGGCTATCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGaa < 1:1994921/96‑1 (MQ=0)
ggcAGTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCTTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCGCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGaaa < 1:2388687/100‑1 (MQ=255)
cgcAGTCCCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGaaa < 2:3354343/101‑1 (MQ=255)
cggTCGCGCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACt < 1:456054/99‑1 (MQ=255)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGGATCGaaccc > 1:686447/1‑98 (MQ=37)
aGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GGGGGTTGAAACtg > 2:2284172/1‑100 (MQ=255)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGc > 2:4139755/1‑101 (MQ=255)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCg < 2:1461568/101‑1 (MQ=255)
cccGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATc < 2:1884033/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATcc > 2:3860287/1‑101 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATcc < 1:4581888/101‑1 (MQ=255)
ccGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATcc < 1:3862693/101‑1 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCcg > 2:388903/1‑101 (MQ=255)
cgcgGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCcg < 1:387902/101‑1 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCcgc > 2:750351/1‑101 (MQ=255)
gcgGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCcgc < 1:953119/101‑1 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCcgcg < 1:729362/101‑1 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCAAGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCcgcg > 2:111859/1‑101 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCt < 1:1761801/101‑1 (MQ=255)
ggggCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCt < 2:2900682/101‑1 (MQ=255)
gggGGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCtt < 2:4662317/101‑1 (MQ=255)
gggCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCtt > 1:1745910/1‑101 (MQ=255)
cGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGcc > 1:2173617/1‑101 (MQ=255)
gTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCt > 2:1813916/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTc < 2:2986387/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTTGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCAc < 2:119661/101‑1 (MQ=255)
gATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCAc < 2:4380455/101‑1 (MQ=255)
aTCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCAcc > 1:879937/1‑100 (MQ=255)
tCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGc > 1:3537587/1‑101 (MQ=255)
cGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGcc > 2:1004476/1‑101 (MQ=255)
cGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGcc > 1:1088875/1‑101 (MQ=255)
cGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCCCGATCCGCGCTTGCCTCCCGcc > 1:1202839/1‑101 (MQ=255)
gAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCt > 2:3729097/1‑101 (MQ=255)
gAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCt > 2:800298/1‑101 (MQ=255)
aaaCGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTg > 2:830817/1‑101 (MQ=255)
aCGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGcc < 2:3143583/101‑1 (MQ=255)
cGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCcg > 1:3112429/1‑101 (MQ=255)
aTGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCcgcg < 1:2859193/101‑1 (MQ=255)
gCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTc < 2:2312661/101‑1 (MQ=255)
gCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGGGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTc < 2:879863/101‑1 (MQ=255)
cGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCg < 2:1088789/101‑1 (MQ=255)
gTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGc > 2:3216156/1‑101 (MQ=255)
ttCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGCTCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCt < 2:286958/101‑1 (MQ=255)
tCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTc > 1:100765/1‑101 (MQ=255)
tCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTc > 1:2293382/1‑101 (MQ=255)
tCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTc > 1:3346228/1‑101 (MQ=255)
tCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTc > 1:4516713/1‑101 (MQ=255)
tCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTc > 1:614023/1‑101 (MQ=255)
cATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTcc > 1:4407172/1‑101 (MQ=255)
cATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTcc > 1:1342497/1‑101 (MQ=255)
tGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTcccc > 1:857041/1‑101 (MQ=255)
ggCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTccccc > 1:832245/1‑101 (MQ=255)
gCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTcccccc > 1:4721398/1‑101 (MQ=255)
ccTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCcg < 2:4750750/101‑1 (MQ=255)
tACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCcgcg < 1:4636794/101‑1 (MQ=255)
aCGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCgg > 2:1053877/1‑101 (MQ=255)
tCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCggggg < 2:401538/101‑1 (MQ=255)
ggCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCgg > 1:2619908/1‑100 (MQ=255)
gCAGTGGCCTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGCC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 2:2509259/101‑1 (MQ=255)
gCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:848836/1‑101 (MQ=255)
|
GATCGAAACTGCGCCGCCTATCGCATCCGGTCGAGCGCCGCGCAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACGATGCGTTCATGGCCTACGTCGGGCAGTGGACTGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGC.GTGGATCGAAACTCGCCCTCGATCCGCGCTTGCCTCACGCCTGCCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTG > NC_014034/1395855‑1396054
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|