BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	221,967	G→A	55.8%	D230D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	221,967	0	G→A	55.8%	0.0 ‑1.7 0.0	320	D230D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (78/99): ref base (73/68): total (152/168)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.77e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 932 total aligned reads displayed.


CCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAT  >  NC_014034/221867‑222067


     acCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgt                                                                                                 <  1:2293442/101‑1 (MQ=255)


           gCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                           <  2:1193024/101‑1 (MQ=255)


             cGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                                                         >  2:306227/1‑101 (MQ=255)


                  cTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                                                                    <  1:683070/101‑1 (MQ=255)


                    tCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                  <  2:331058/101‑1 (MQ=255)


                     cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                 <  1:4203716/101‑1 (MQ=255)


                         tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtg                                                                              >  1:2052730‑M1/72‑101 (MQ=255)


                            ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                          <  2:1620623/101‑1 (MQ=255)


                             gtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                         <  2:2066196/101‑1 (MQ=255)


                                 gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                      <  2:3723545‑M1/38‑1 (MQ=255)


                                 gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcgGGcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggatcggt                                                                      <  2:682918‑M1/38‑1 (MQ=255)


                                 gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                      >  2:2648949‑M1/64‑101 (MQ=255)


                                  ggggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                                                                     >  2:3235325‑M1/63‑101 (MQ=255)


                                   gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGgatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg                                                                    >  2:3860452‑M1/62‑101 (MQ=255)


                                    ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgg                                                                   >  1:2686139‑M1/61‑101 (MQ=255)


                                      atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                 <  2:1719544‑M1/43‑1 (MQ=255)


                                         ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                              <  1:4587548‑M1/46‑1 (MQ=255)


                                          gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                             <  1:4370074‑M1/47‑1 (MQ=255)


                                           tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                            >  1:2605674‑M1/54‑101 (MQ=255)


                                           tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                            <  1:184951‑M1/48‑1 (MQ=255)


                                             gATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                         >  1:1303145/1‑101 (MQ=255)


                                              gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggc                                                         <  1:1002062‑M1/51‑2 (MQ=255)


                                                tccgtgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                       >  2:600011‑M1/49‑101 (MQ=255)


                                                        atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCCTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTcgggc                                               <  1:99564‑M1/61‑2 (MQ=255)


                                                         tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                              >  1:3201681‑M1/40‑101 (MQ=255)


                                                          gACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                            >  2:1036200/1‑101 (MQ=255)


                                                          cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                             >  2:857120‑M1/39‑101 (MQ=255)


                                                          cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                             >  1:2533589‑M1/39‑101 (MQ=255)


                                                           ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                            <  1:2195883‑M1/64‑1 (MQ=255)


                                                           gcGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                           <  1:3022502/100‑1 (MQ=255)


                                                               gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                        >  2:3424351‑M1/34‑101 (MQ=255)


                                                                 gtctgtggATGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                      <  2:4690586/95‑1 (MQ=11)


                                                                 gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                      <  2:431851‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                                                   ccatgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                    <  1:3860694‑M1/72‑1 (MQ=255)


                                                                     gtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                  >  2:751023‑M1/28‑101 (MQ=255)


                                                                      tgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatcgggc                                 <  2:2498609‑M1/75‑3 (MQ=255)


                                                                      tgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                 >  1:3766092‑M1/27‑101 (MQ=255)


                                                                      cGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                >  1:138446/1‑101 (MQ=255)


                                                                      cGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                >  1:3308926/1‑101 (MQ=255)


                                                                       ggATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                               <  1:1133834/101‑1 (MQ=255)


                                                                        ggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                               <  2:2746513‑M1/77‑1 (MQ=255)


                                                                           tccttGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                            <  1:4499621/97‑1 (MQ=11)


                                                                           cc.GTGGGATCGTTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                           <  2:294770/100‑1 (MQ=1)


                                                                            cggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcg                           <  1:856580‑M1/81‑5 (MQ=255)


                                                                              gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg                         >  1:278965/1‑100 (MQ=11)


                                                                                 ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGAACCGCGGCATCGGTGGGATCCGTggg                      >  2:4239837/10‑101 (MQ=11)


                                                                                   gttcgtgggatcggtcggctccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                    <  2:363319/94‑1 (MQ=11)


                                                                                   gtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgtggggt                    >  2:4587295‑M1/14‑99 (MQ=255)


                                                                                   cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGag                    >  2:4499371/1‑100 (MQ=255)


                                                                                   atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggtccgtgGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCAGTGGGAACGGTCGGACCCGTggggt                    >  2:1388864/8‑99 (MQ=11)


                                                                                    tcggtggtATCGGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                   <  2:4366767/101‑1 (MQ=11)


                                                                                    tccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                   <  2:184133/98‑1 (MQ=11)


                                                                                     cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                  <  1:4147902/101‑1 (MQ=255)


                                                                                     ccgttggatcggtggggtccctgggctcggtcgggtccgtaGGATCTGTCGGGTCCGTCGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                  <  2:3512555/96‑1 (MQ=11)


                                                                                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                  <  2:2420980/96‑1 (MQ=11)


                                                                                       gtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgt                >  1:3103611‑M2/1‑93 (MQ=255)


                                                                                       gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgtg                >  1:1355117/1‑99 (MQ=11)


                                                                                        tggggttggtcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc               <  1:3622798/94‑1 (MQ=11)


                                                                                        tgggatgagtccgggccgtgggatccgtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGTTCGGTCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc               <  2:1310893/93‑1 (MQ=11)


                                                                                        tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc               <  1:572425/101‑1 (MQ=11)


                                                                                         ggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg              <  1:4301284‑M1/94‑1 (MQ=255)


                                                                                         gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGAgcgggcg              >  1:1615298/2‑101 (MQ=11)


                                                                                         gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGAtcgaacg              >  2:3941095/2‑97 (MQ=11)


                                                                                           gttcgggcggagccgtgggatcgggcgggtcggggggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCGGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgga            <  1:3549233/99‑2 (MQ=14)


                                                                                           gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcgGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCggg            <  2:2167918/101‑1 (MQ=11)


                                                                                            atcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgggGTCCGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCgggc           >  2:52783/1‑100 (MQ=14)


                                                                                            atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat           >  2:2890763‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                                            atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat           >  2:2579453‑M2/1‑99 (MQ=255)


                                                                                             tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGAGCCGTCGGGTCGCTCcggcc          >  1:4648018/1‑99 (MQ=11)


                                                                                              tggtcgggtccgtgggggccgtcggagccgggggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc         <  1:2333623/100‑1 (MQ=11)


                                                                                              gggtcgggtccgtggggnccgtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc         <  2:94140/100‑1 (MQ=11)


                                                                                              gggtcggggccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc         <  1:1066912/100‑1 (MQ=11)


                                                                                              ctggcgggtccgtgggatgggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc         <  2:3194737/97‑1 (MQ=11)


                                                                                              cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccatgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcc         <  2:41757‑M2/101‑5 (MQ=255)


                                                                                              cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcc         <  1:4719586‑M2/101‑5 (MQ=255)


                                                                                              cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGGCGGGTCCGGGAGAGGGGGCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGTGTCGGGGGGATGGGGCggggcg         >  2:1088418/1‑98 (MQ=2)


                                                                                               ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg        <  1:171/101‑1 (MQ=11)


                                                                                               ggtcgggtccgtgggatctgtcgggtccgtggtatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcgg        <  1:1923270‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                                                               ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg        <  1:1197535‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                                                                               ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg        <  2:1510508/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                gtggggtccgtgggatcggtcgggtcggtgggatcggtcGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt       <  1:3474652/98‑1 (MQ=11)


                                                                                                gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGt       >  2:4051867/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgt       <  1:2394736‑M2/101‑7 (MQ=255)


                                                                                                gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgt       >  2:1997146‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                                                                                gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGTCGGCGGGGGCCGGCGGGTcggc       >  1:944361/1‑98 (MQ=11)


                                                                                                 tcgggtccgtgggatgggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg      <  2:2107653/101‑2 (MQ=14)


                                                                                                  cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgg     <  1:3995759‑M2/101‑9 (MQ=255)


                                                                                                  cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcg     >  1:2003746‑M2/1‑82 (MQ=255)


                                                                                                  cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgg     >  1:3396856‑M2/1‑93 (MQ=255)


                                                                                                   gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAATGGTCGGGTCCCTGGGGTCGGTCGGGCCCGTGgg    >  1:4072422/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                   gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg    <  1:4432152‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                                                   gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagg    >  2:2294778‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                                                                                   gggtccgtgggatcgctcgggtccgtgggatcggtcGGGGCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCCTGGGAACGGGCGGGTccaggag    >  1:762052/1‑96 (MQ=11)


                                                                                                   ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggg    >  2:4410290‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                                                                                   ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggg    <  1:2105931‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                                                    ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga   <  1:628649‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                                                                    ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggga   <  2:1943096‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                                                                    ggtccgtgggaggggtcgggtccgtcggatcggtggGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa   <  1:1512725/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                     gtccgtgggatcgttcggatccgtgtgatccgtcggATTCGTTGGATCGGTCGGATTCGTTGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAt  <  1:2906896/101‑1 (MQ=17)


                                                                                                     gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGCCCGTGGGGTcggccgggc  >  2:2358904/1‑93 (MQ=11)


CCGACACCGTCGCCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGC.GTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAT  >  NC_014034/221867‑222067

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 16 ≤


ATCG

< 24 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG