BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,979	G→C	2.6%	T226T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,979	0	G→C	2.6%	25.7 ‑0.4 ‑0.4	715	T226T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (11/9): ref base (330/364): total (342/373)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.51e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.93e-01

Only 100 of 1688 total aligned reads displayed.


CCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCG  >  NC_014034/221879‑222079


ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcg                                                                                                      <  1:4654983‑M1/12‑1 (MQ=255)


  gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt                                                                                                    <  1:2789047‑M1/14‑1 (MQ=255)


   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                                                                                                   <  1:3706833‑M1/15‑1 (MQ=255)


        gcggtcggatccgtggggtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                              >  2:856506‑M1/82‑101 (MQ=255)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                            <  2:2122687‑M1/22‑1 (MQ=255)


           gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                                                                           <  1:4551791‑M1/23‑2 (MQ=255)


             cggatccgtgggatcggtcggatccgtggtatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                         >  2:1820373‑M1/77‑101 (MQ=255)


             cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTgg                                                                                         <  2:490565‑M1/25‑1 (MQ=255)


              ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggg                                                                                        >  2:574633‑M1/70‑101 (MQ=255)


               tggtggTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGAtcggtcgggtccgtgggctcggtcggggccgtggga                                                                                       >  1:3620910/1‑101 (MQ=255)


               tggtggTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGAtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccggggga                                                                                       >  1:3139724/1‑101 (MQ=255)


                 tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     >  1:4146493‑M1/73‑101 (MQ=255)


                    gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                  >  1:1962800‑M1/70‑101 (MQ=255)


                     tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGgatcggcg                                                                                 <  2:3261807‑M1/33‑3 (MQ=255)


                     tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                 >  2:4073616‑M1/69‑101 (MQ=255)


                       ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgg                                                                               >  1:2686139‑M1/61‑101 (MQ=255)


                       aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                               <  1:306261/101‑1 (MQ=255)


                        gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggg                                                                              <  2:1258378‑M1/36‑2 (MQ=255)


                         cGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                             <  2:3380427/101‑1 (MQ=255)


                         cGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGAt                                                                             >  2:398253/1‑101 (MQ=255)


                                 gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggc                                                                     <  1:1002062‑M1/51‑2 (MQ=255)


                                  atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                    <  1:793353‑M1/46‑1 (MQ=255)


                                   tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   <  1:2881878‑M1/47‑1 (MQ=255)


                                    ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                  <  1:3235526‑M1/54‑1 (MQ=255)


                                         tCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                             <  2:3731503/101‑1 (MQ=255)


                                            tcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                          >  2:1602008‑M1/46‑101 (MQ=255)


                                             cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         >  1:2533589‑M1/39‑101 (MQ=255)


                                             cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  1:97189‑M1/63‑1 (MQ=255)


                                               gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                       <  1:2017677‑M1/65‑1 (MQ=255)


                                               gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGt                                                       <  1:692414‑M1/59‑1 (MQ=255)


                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                    >  2:4167511‑M1/40‑101 (MQ=255)


                                                   ggtccgggggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                   >  2:7493‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                                        gtgggatcggtcgggtccgtggggtcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                              >  1:1307199‑M1/28‑101 (MQ=255)


                                                        gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                              <  1:235550‑M1/68‑1 (MQ=255)


                                                        gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                              >  2:2356309/1‑101 (MQ=255)


                                                        gTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                              <  2:3083794/101‑1 (MQ=255)


                                                         tgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                             <  1:2202961‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                                           ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                           <  1:1133834/101‑1 (MQ=255)


                                                            gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggt                                          <  1:3519563‑M1/72‑2 (MQ=255)


                                                             atcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgag                                         <  2:4476798‑M1/73‑2 (MQ=255)


                                                               cggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                       <  2:4563150‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                                                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                      >  1:1218638‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                                                   cgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                   >  2:1997079‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                                                    gggtccgtggggtcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                  >  1:106420‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                                                    ggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                  <  1:3808496‑M1/80‑1 (MQ=255)


                                                                      atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCCTGGGATCGGACGGATACGTggatt                                >  1:547116/8‑98 (MQ=11)


                                                                       tcggtgggGTCCGGCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                               <  1:2062690/101‑1 (MQ=11)


                                                                       tccgtgggatcggtcgggacagtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                               <  2:2601779/95‑1 (MQ=11)


                                                                       tccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                               <  1:3433806/95‑1 (MQ=11)


                                                                        cggtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                              <  1:334272/101‑1 (MQ=11)


                                                                        ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAgcg                              >  2:3643353/6‑101 (MQ=11)


                                                                        ccgtcggAGCGGTCGGGTCCGTTGGCTCGGTCGGGTCCGTTGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcc                              <  2:4664642/99‑2 (MQ=11)


                                                                          gtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGAtcggg                            >  2:2732026/1‑100 (MQ=11)


                                                                          gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCCGGTCCGCCGGAtcggt                            >  1:1557745/1‑101 (MQ=14)


                                                                           tgtgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                           <  2:421737/98‑1 (MQ=11)


                                                                           tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                           <  2:4378221/99‑1 (MQ=11)


                                                                           tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc                           <  1:1358016/101‑1 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGGCCGTGGGGTGGGTCGGGGCCGTggtgggggtcg                          >  2:2509603/2‑92 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                          <  1:243099‑M1/88‑1 (MQ=255)


                                                                             ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                         >  1:4702159/1‑101 (MQ=11)


                                                                              gttcggtcgggtcggtcggatccgtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                        <  2:1018240/99‑1 (MQ=1)


                                                                               atcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                       <  1:4397927‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                                                               atcggtccggtccgtgggctcggtcggggccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggat                       <  2:2426320/101‑3 (MQ=11)


                                                                                 gggtcgggtccgtggggnccgtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                     <  2:94140/100‑1 (MQ=11)


                                                                                 cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGGCGGGTCCGGGAGAGGGGGCGGGTCCGGGGGGTCGGTCGTGTCGGGGGGATGGGGCggggcg                     >  2:1088418/1‑98 (MQ=2)


                                                                                 cggtcggaTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                     >  2:3577829‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                                                                  ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                    >  1:167116/1‑101 (MQ=11)


                                                                                  ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcgg                    >  2:3199395‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                                  ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCg                    >  2:1354389/1‑101 (MQ=11)


                                                                                  cgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                    >  1:419875‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                                                                   gtgggagccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcggGCCCGTGGGCGCGGTCGGGGCCGCGGGCTGGGGGGGGCCCGTGGGGTGGCTCGGGGCCgc                   >  1:2984585/8‑100 (MQ=2)


                                                                                   gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCTCGGGATCGGTCGGATCCGt                   >  1:1881420/1‑101 (MQ=14)


                                                                                   gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGATTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg                   >  1:4067148/1‑100 (MQ=11)


                                                                                   gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGt                   >  1:4488071/1‑101 (MQ=11)


                                                                                    tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                  >  2:1177874/1‑100 (MQ=11)


                                                                                    tcggatgcgtgggatcggtcggatgcgtgtgatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                  <  2:1500623/101‑2 (MQ=11)


                                                                                    tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTAGGGGCCggg                  >  2:1705651/1‑99 (MQ=11)


                                                                                     cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcg                 <  2:3004407‑M2/101‑20 (MQ=255)


                                                                                      gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggattggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGgggtccgtgggatcggtcgg                <  2:2900363‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                                      gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggg                <  2:219671‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                                      gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg                <  1:213093‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                                      gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg                <  1:4287430‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                                      gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagg                >  2:2294778‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                                                                        gtgcgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggttggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt              <  2:666297/98‑1 (MQ=11)


                                                                                        gtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt              >  1:3990662/1‑101 (MQ=11)


                                                                                        atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggat              <  2:3476141‑M2/100‑12 (MQ=255)


                                                                                         tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc             >  1:1762716‑M2/1‑89 (MQ=255)


                                                                                         tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc             >  1:1418981‑M2/1‑89 (MQ=255)


                                                                                         tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGatccgtgggatc             >  2:2070499‑M2/1‑89 (MQ=255)


                                                                                         gccgtgtgctcggtccggtccgtggggtccgtcggACCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc             <  2:431975/100‑1 (MQ=11)


                                                                                          ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGggcccg            >  2:1411389/1‑97 (MQ=11)


                                                                                           cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGCCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCTTGGGAtcgg           >  2:2824553/1‑101 (MQ=14)


                                                                                            gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTGGGAtgggt          >  1:3887352/1‑101 (MQ=11)


                                                                                              gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg        >  2:1937901/1‑101 (MQ=14)


                                                                                               ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGAtcggccgg       >  1:2298687/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                  tcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtc    >  1:869514‑M2/1‑80 (MQ=255)


                                                                                                    ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccg  <  1:4330918‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                                                                    ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccg  <  1:626428‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                                                                    ggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg  >  1:2594268/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                    ggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggggtcggtcgggtccg  <  2:3861458‑M2/101‑24 (MQ=255)


CCGAGGCTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCG  >  NC_014034/221879‑222079

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG