BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,991	G→C	2.5%	P222P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	221,991	0	G→C	2.5%	18.1 ‑0.4 0.0	676	P222P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (9/12): ref base (310/336): total (322/354)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.65e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1830 total aligned reads displayed.


TGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221891‑222091


tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtg                                                                                                      >  1:2052730‑M1/72‑101 (MQ=255)


  ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggg                                                                                                    >  2:574633‑M1/70‑101 (MQ=255)


   gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtggga                                                                                                   >  1:4490938‑M1/69‑101 (MQ=255)


      ccgtgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                >  2:3525422‑M1/72‑101 (MQ=255)


       cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg                                                                                               <  1:3792822‑M1/37‑1 (MQ=255)


       cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                               <  1:4137373‑M1/31‑1 (MQ=255)


         tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                                                                                             >  1:2739227‑M1/63‑101 (MQ=255)


               tCGCCGGAGCGCGCTCAGCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGTCCCGTTCGGATCGTTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCTGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                       <  2:380834/101‑1 (MQ=25)


                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                      <  1:574684‑M1/46‑1 (MQ=255)


                ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                      >  1:3890458‑M1/62‑101 (MQ=255)


                cgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                      <  1:3029279‑M1/40‑1 (MQ=255)


                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                   <  1:4752419‑M1/43‑1 (MQ=255)


                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                  <  2:3345124‑M1/50‑1 (MQ=255)


                    ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                  >  1:2267221‑M1/52‑101 (MQ=255)


                     gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggc                                                                                 <  1:1002062‑M1/51‑2 (MQ=255)


                            gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                          <  1:2501996‑M1/52‑1 (MQ=255)


                             ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                         <  1:1732433‑M1/53‑1 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     >  2:2782935‑M1/39‑101 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggatcggtcgtctcc                                                                     >  2:4019014‑M1/45‑96 (MQ=255)


                                     cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                 <  1:1281312‑M1/67‑1 (MQ=255)


                                        gtccgtgggatcggtcgggtcggtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                              >  1:3231877‑M1/32‑101 (MQ=255)


                                        gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                              <  2:2987936‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                         tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                             >  2:39234‑M1/31‑101 (MQ=255)


                                            gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                          <  1:7498‑M1/68‑1 (MQ=255)


                                             tgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatcgggc                                                         <  2:2498609‑M1/75‑3 (MQ=255)


                                             tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtg                                                         <  1:2332993‑M1/69‑2 (MQ=255)


                                              gggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                        <  1:830767‑M1/76‑1 (MQ=255)


                                              cggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcg                                                        <  2:2006684‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                               ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                       >  1:2106200/1‑101 (MQ=255)


                                                 atcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgag                                                     <  2:4476798‑M1/73‑2 (MQ=255)


                                                  tcggtccggtccgtggggtccGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatcggtcgggtc                                                    >  2:1770489‑M1/22‑98 (MQ=255)


                                                   ctgtgggagtggtcggGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTcc                                                   <  1:3419604/91‑1 (MQ=11)


                                                        ggtgcggtaggAGCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg                                              <  2:1077854/97‑1 (MQ=0)


                                                          gtcggtgggATAGGGGGGCTCGGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                            <  1:2964209/100‑1 (MQ=11)


                                                          cTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                            <  1:939392/101‑1 (MQ=255)


                                                           tgcgtggggtcggtcgggtccgtgggggcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                           <  1:2856656/92‑1 (MQ=11)


                                                           tccgtcggATCGGTGGTATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                           <  2:168566/98‑1 (MQ=11)


                                                           tccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                           <  2:2394722/98‑1 (MQ=11)


                                                            ccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                          >  2:1001983‑M1/18‑101 (MQ=255)


                                                              gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtcggt                                        <  2:2891564‑M2/101‑9 (MQ=255)


                                                               tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                       <  2:4378221/99‑1 (MQ=11)


                                                               tgggatcggtcggaGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                       >  2:3259184‑M1/15‑101 (MQ=255)


                                                               tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc                                       <  2:3700368/101‑1 (MQ=14)


                                                                cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggggggtcg                                      >  2:3621432/1‑93 (MQ=11)


                                                                 ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGAtcggtcgg                                     >  2:658852/1‑101 (MQ=11)


                                                                 ggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGggatcggtggc                                     <  2:2237110‑M1/89‑4 (MQ=255)


                                                                   gtccggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                   <  1:4396683/95‑1 (MQ=14)


                                                                    tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatc                                  >  1:3131679‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                                                    tcgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgagaTTGGTCGGATCCGTGGGATCGCTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                  <  1:4060680/101‑1 (MQ=14)


                                                                     tgggcgggtcggtggggtcggtcgggtccgtcggatcggtCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                 <  1:653237/97‑1 (MQ=11)


                                                                     gggtcggggccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                 <  1:1066912/100‑1 (MQ=11)


                                                                     ctggcgggtccgtgggatgggtcggatccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                 <  2:3194737/97‑1 (MQ=11)


                                                                     cggtggggtgcgtgggagcggtcgggtacgtgggatCGGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                 <  1:4192428/101‑1 (MQ=14)


                                                                     cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtcggatcc                                 <  1:3592832‑M2/101‑16 (MQ=255)


                                                                     cggtcggcgccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                 <  2:849055/101‑1 (MQ=11)


                                                                     cggcgggttccgtgggatcggtcgggtcggggggatcggtccgGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTGGGATCGGTCGGGTcc                                 <  1:3494132/93‑1 (MQ=11)


                                                                      ggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg                                <  1:2549881‑M1/94‑1 (MQ=255)


                                                                       gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGCTcggg                               >  1:1997089/1‑98 (MQ=11)


                                                                        tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                              >  2:1960157/1‑100 (MQ=14)


                                                                         cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCTGtgg                             >  1:3324314/1‑99 (MQ=11)


                                                                         cggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGtccgcgg                             <  2:4660498‑M1/97‑4 (MQ=255)


                                                                          gggtccgggggatcggtcgggtccgtgggctcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                            <  2:93449/101‑1 (MQ=14)


                                                                          ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGatccgtggg                            <  1:1133998‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                           ggtccgtgggaggggtcgggtccgtcggatcggtggGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                           <  1:1512725/101‑1 (MQ=11)


                                                                            gtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                          >  1:3990662/1‑101 (MQ=11)


                                                                            gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggat                          >  1:1633565‑M2/1‑90 (MQ=255)


                                                                            gtccgggggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                          <  1:2178736/101‑1 (MQ=14)


                                                                             tccgtgggatcggtcgggtccgtcggagcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                         <  1:1398711/101‑1 (MQ=14)


                                                                             gccgtgtgctcggtccggtccgtggggtccgtcggACCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                         <  2:431975/100‑1 (MQ=11)


                                                                              ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg                        >  1:3694739‑M2/1‑88 (MQ=255)


                                                                              ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcg                        <  2:2703809‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                                               cgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtccg                       <  2:4112167/101‑3 (MQ=11)


                                                                                gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGGCGGGAGGGTCGGTGggggcggg                      >  2:2138345/1‑95 (MQ=0)


                                                                                gtgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgt                      >  2:1465770‑M2/1‑75 (MQ=255)


                                                                                  gggatcggacggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGCAGGGTCGGTCGGGGCCGCCGGCTCGGGAGGTTCAGAGGGAtcggtcg                    >  2:1142601/1‑101 (MQ=2)


                                                                                   ggatcggccggatccgtgggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtcgg                   <  1:1846059/101‑1 (MQ=17)


                                                                                      tcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc                <  2:2085448/101‑1 (MQ=255)


                                                                                       cggtcgcgtccatgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc               <  2:1241095/101‑1 (MQ=14)


                                                                                        ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccg              <  1:4330918‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                                                        ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggagcggtcgggtccg              <  2:4175404‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                                                        ggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccg              <  1:4657244‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                                                        ggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGTGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg              >  1:1352460/1‑101 (MQ=14)


                                                                                        ggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg              <  1:2403751/101‑1 (MQ=255)


                                                                                         ttcggatgcgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCCGTCGGGTACGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt             <  2:2325356/100‑1 (MQ=14)


                                                                                         gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgt             >  1:262756‑M2/1‑77 (MQ=255)


                                                                                          tcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtg            <  1:4267873‑M2/101‑26 (MQ=255)


                                                                                           cgggctcgtggggtgcgtcggATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcggatccgtag           <  2:1580712/95‑3 (MQ=11)


                                                                                           cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggggccgtgg           <  2:490565‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                                                           cggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcg           >  2:4249428/1‑101 (MQ=11)


                                                                                            gggtccgtggggtcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg          <  1:1202786/101‑1 (MQ=14)


                                                                                            ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg          <  1:1935548/98‑1 (MQ=255)


                                                                                             ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcggctccgtggga         >  2:1390906/1‑100 (MQ=11)


                                                                                             gatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg         >  2:738460/3‑101 (MQ=11)


                                                                                              atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGgtcggagccgtggtat        >  2:3452608/2‑96 (MQ=11)


                                                                                               tccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtc       <  2:3084442/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                ccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc      <  1:4575441/101‑1 (MQ=11)


                                                                                                 cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgggggatcgg     <  2:4545199‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                                                                                    gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg  >  2:1881419‑M2/1‑66 (MQ=255)


                                                                                                    gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCCGgtggggtccgtggggtcggccg  >  2:2592746/1‑96 (MQ=11)


                                                                                                    gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg  <  2:1332173‑M2/101‑36 (MQ=255)


TGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221891‑222091

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG