Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA NC_014034 221,994 A→G 1.6% D221D (GAT→GAC RCAP_rcc00185 ← hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*NC_014034221,9940A→G 1.6% 8.3 ‑0.2 ‑0.0763D221D (GAT→GACRCAP_rcc00185hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (7/6):  ref base (360/390):  total (367/396)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.83e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.98e-01

Only 100 of 1835 total aligned reads displayed.

TGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAT  >  NC_014034/221894‑222094
                                                                                                    |                                                                                                    
 gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                     >  1:3358141‑M1/74‑101 (MQ=255)
 gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                                     >  1:3723775‑M1/74‑101 (MQ=255)
 ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                                     <  2:1620623/101‑1 (MQ=255)
  tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                                    >  1:4146493‑M1/73‑101 (MQ=255)
    cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGAtcgg                                                                                                  <  2:4545199‑M1/31‑1 (MQ=255)
            tCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgcccac                                                                                          <  2:856123/101‑6 (MQ=255)
                 ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                     <  1:1214257‑M1/50‑1 (MQ=255)
                  gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggc                                                                                    <  1:1002062‑M1/51‑2 (MQ=255)
                   gtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                   >  2:577630‑M1/56‑101 (MQ=255)
                    tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                  <  2:2052609‑M1/47‑1 (MQ=255)
                      cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAtccgtggggtccg                                                                                <  1:2523823‑M1/49‑6 (MQ=255)
                            atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                          <  1:2437869‑M1/61‑1 (MQ=255)
                              cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                        <  2:198524‑M1/63‑1 (MQ=255)
                              cGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                        >  1:3524447/1‑101 (MQ=255)
                                 tcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatccGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                     >  1:4073924‑M1/36‑101 (MQ=255)
                                  cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                    <  1:508887‑M1/67‑1 (MQ=255)
                                   gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                   <  1:187047‑M1/68‑1 (MQ=255)
                                     gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                 <  2:431851‑M1/70‑1 (MQ=255)
                                     gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                 >  1:2356442‑M1/38‑101 (MQ=255)
                                       ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                               >  1:3196817‑M1/36‑101 (MQ=255)
                                         gttgggtcggtcgggtccgtggggtcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                             >  2:3706603‑M1/28‑101 (MQ=255)
                                          tgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                            >  2:210778‑M1/27‑101 (MQ=255)
                                               ctggcgggGTCGGTGGGGTCGGCCGGGGCCGTGGGATAGGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                       <  1:344523/96‑1 (MQ=11)
                                                  gtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCgtgggatcggtcgggcccgt                                                    <  1:2593867‑M1/77‑7 (MQ=255)
                                                   tcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                   >  1:2752890‑M1/18‑101 (MQ=255)
                                                     gggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                 <  1:195697‑M1/80‑1 (MQ=255)
                                                     ggggcggtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                 <  1:23015/97‑1 (MQ=11)
                                                       gtcggtgggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                               <  1:1297242/100‑1 (MQ=11)
                                                       gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGTGGGAt                                               >  2:1505068/8‑101 (MQ=11)
                                                       gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGGGGATCCGTGGGATCGGGAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGac                                               >  1:2662232/5‑100 (MQ=11)
                                                        tcggtgggGTCCGGCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                              <  1:2062690/101‑1 (MQ=11)
                                                        tccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                              <  2:184133/98‑1 (MQ=11)
                                                         cggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                             <  2:3633388/101‑1 (MQ=255)
                                                         ccgtggggtccGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTccgtggggtcc                                             >  1:4366913‑M1/12‑97 (MQ=255)
                                                           gtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgt                                           <  2:3394505‑M2/101‑9 (MQ=255)
                                                           gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                           >  1:362301/1‑101 (MQ=11)
                                                           gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCCGGTCCGCCGGAtcggt                                           >  1:1557745/1‑101 (MQ=14)
                                                            tgtgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccctggGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                          <  2:2604828/98‑1 (MQ=11)
                                                            tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtg                                          >  2:403493‑M2/3‑92 (MQ=255)
                                                            tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCGGGGGGAtcggtc                                          >  2:235539/3‑101 (MQ=11)
                                                             ggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                         <  1:4301284‑M1/94‑1 (MQ=255)
                                                             gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGAtcgaacg                                         >  2:3941095/2‑97 (MQ=11)
                                                             cggATCGGTGGGATCCGTGGGGTGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                         <  1:1681397/101‑1 (MQ=11)
                                                              ggggccgtcggggccgggggatcgggcgggtccgtggcatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                        <  1:4010835/95‑1 (MQ=14)
                                                               gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGa                                       <  1:4508738‑M2/101‑2 (MQ=255)
                                                                gttggtcgggtcggggggatggggcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                      <  1:1354481/98‑1 (MQ=11)
                                                                gtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat                                      >  2:4244936‑M2/2‑99 (MQ=255)
                                                                gtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat                                      >  1:4679761‑M2/2‑99 (MQ=255)
                                                                atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAGCGGTCGGGt                                      >  2:4460828/1‑101 (MQ=11)
                                                                atcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                      <  1:2010410/101‑1 (MQ=11)
                                                                atcggtccggtccgtgggctcggtcggggccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggat                                      <  2:2426320/101‑3 (MQ=11)
                                                                  gggtcggggccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                    <  1:1066912/100‑1 (MQ=11)
                                                                   ggtctgatccgtgggatcggtcgggtccctaggatcGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                   <  2:2172220/101‑1 (MQ=14)
                                                                   ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg                                   >  1:4601328‑M2/1‑96 (MQ=255)
                                                                   ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatcgg                                   <  1:600917‑M2/101‑6 (MQ=255)
                                                                   ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg                                   >  1:2887867‑M2/1‑96 (MQ=255)
                                                                   cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCg                                   >  1:86184/2‑101 (MQ=14)
                                                                      cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                >  1:390824/1‑99 (MQ=11)
                                                                      cggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGtccgcgg                                <  2:4660498‑M1/97‑4 (MQ=255)
                                                                       gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgg                               <  1:2995619‑M2/101‑21 (MQ=255)
                                                                       gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                               <  2:291848/101‑1 (MQ=11)
                                                                       gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                               >  1:675418/1‑101 (MQ=11)
                                                                       gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagg                               >  2:2294778‑M2/1‑92 (MQ=255)
                                                                       gggtccgggggatcggtcgggtccgtgggctcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                               <  2:93449/101‑1 (MQ=14)
                                                                       ggggccgtggggtcgggcgggtgcgggggatcggtcGGGTACGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                               <  1:760075/101‑1 (MQ=11)
                                                                       ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGatccgtggg                               <  1:1133998‑M2/101‑10 (MQ=255)
                                                                       cggcccttgggatcggtcgggtccgtgcgatcggtcggGTCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                               <  2:4369827/94‑1 (MQ=11)
                                                                        gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga                              <  1:4202241‑M2/99‑11 (MQ=255)
                                                                         gtgcgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggttggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                             <  2:666297/98‑1 (MQ=11)
                                                                         gtccgtcgggtcggtcgggtccgtgggatcggtctgGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                             <  2:3832307/101‑1 (MQ=11)
                                                                          tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc                            >  1:1418981‑M2/1‑89 (MQ=255)
                                                                          gtcgtgggatcggtcgggtccgtgcgctcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                            <  2:3202635/99‑1 (MQ=11)
                                                                           ccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGAtcg                           >  2:1013262/1‑101 (MQ=11)
                                                                           ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGggcccg                           >  2:1411389/1‑97 (MQ=11)
                                                                            cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGCCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCTTGGGAtcgg                          >  2:2824553/1‑101 (MQ=14)
                                                                             gtgggctcggttgggtccgtgggctcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                         <  2:3560909/101‑1 (MQ=14)
                                                                             gtgggatcggtcgggtccatgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggc                         <  2:746772‑M2/101‑16 (MQ=255)
                                                                               gggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                       >  1:4428133/1‑101 (MQ=11)
                                                                               gggatcggtcgggtccctgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                       <  2:1100209/101‑1 (MQ=11)
                                                                               gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGGtcggttg                       >  2:3015574/1‑99 (MQ=11)
                                                                                   tcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                   >  2:1357924/1‑101 (MQ=11)
                                                                                     ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccg                 >  2:2742793‑M2/1‑78 (MQ=255)
                                                                                     ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggagcggtcgggtccg                 <  2:4175404‑M2/101‑24 (MQ=255)
                                                                                     ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGCGGGATCGcccgggtccg                 >  1:2128131/1‑101 (MQ=11)
                                                                                      gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAGCCGTGGGATCGGGCGGGTCCCTGGAATCGgtcggtaccgt                >  1:1764938/1‑101 (MQ=11)
                                                                                      gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgt                <  1:2209533‑M2/101‑25 (MQ=255)
                                                                                       tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggggccgtc               >  2:1190760/1‑101 (MQ=11)
                                                                                        cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggatccgtgg              <  1:3071519‑M2/101‑27 (MQ=255)
                                                                                        cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgg              <  2:3131479‑M2/101‑27 (MQ=255)
                                                                                        cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggggccgtgg              <  2:490565‑M2/101‑27 (MQ=255)
                                                                                         gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGgtcgggtccgtcgg             >  1:3832542/1‑101 (MQ=11)
                                                                                          ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggg            <  2:1710139‑M2/101‑29 (MQ=255)
                                                                                           atccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat           >  2:2519874‑M2/2‑72 (MQ=255)
                                                                                            tccgtggtatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc          >  2:1923158‑M2/1‑60 (MQ=255)
                                                                                             ccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg         >  1:3256170‑M2/1‑70 (MQ=255)
                                                                                               gtgggctctggcggGTCCGTTGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt       <  2:3265127/101‑1 (MQ=11)
                                                                                                tggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtcggtc      >  2:4116307/1‑100 (MQ=11)
                                                                                                 gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcg     <  1:944330‑M2/101‑36 (MQ=255)
                                                                                                  ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcggggccgtcggatgggtgcg    >  2:3474440/1‑92 (MQ=14)
                                                                                                   gatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg   <  2:1258378‑M2/101‑38 (MQ=255)
                                                                                                    |                                                                                                    
TGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAT  >  NC_014034/221894‑222094

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG