BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,000	C→G	3.0%	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,000	0	C→G	3.0%	34.5 0.0 ‑0.0	902	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (14/15): ref base (408/463): total (422/480)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.91e-01

Only 100 of 1866 total aligned reads displayed.


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100


         ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                             <  1:2423714/101‑1 (MQ=255)


            gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggc                                                                                          <  1:1002062‑M1/51‑2 (MQ=255)


              tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                        >  1:3036138‑M1/55‑101 (MQ=255)


                  tgggatctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                    >  1:219696‑M1/45‑101 (MQ=255)


                       tccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                               >  2:357040‑M1/46‑101 (MQ=255)


                          gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                            <  1:1353805‑M1/59‑1 (MQ=255)


                            cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                          <  1:1063949‑M1/61‑1 (MQ=255)


                             gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                         <  1:2059527‑M1/68‑1 (MQ=255)


                              ggtccgggggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                        >  2:7493‑M1/33‑101 (MQ=255)


                               gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                       <  2:431851‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                   gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   <  2:1916960‑M1/68‑1 (MQ=255)


                                   gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   <  1:235550‑M1/68‑1 (MQ=255)


                                    tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                  <  1:4304658‑M1/69‑1 (MQ=255)


                                    tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGgatcggcg                                                                  <  2:2601130‑M1/69‑3 (MQ=255)


                                     gggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                 >  2:2195759‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                     gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                 >  1:451213‑M1/32‑101 (MQ=255)


                                     cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                 <  1:4008274/101‑1 (MQ=255)


                                      ggatccgtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                >  2:3479595‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                      ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                <  1:2581837/101‑1 (MQ=255)


                                        gtccGTCGGATCGGTGGGACCGGGCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                              <  2:3216736/98‑1 (MQ=11)


                                         tcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGACcgtgggatcggctgggcg                                                             <  1:2861935‑M1/74‑8 (MQ=255)


                                              gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                        <  2:2898036/101‑3 (MQ=11)


                                               ggCTCCGTCGGATCGGTCGGCTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                       <  2:3307885/101‑1 (MQ=11)


                                                ggtccggaggatccgtcggctcagtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCAGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                      <  2:2421331/93‑1 (MQ=11)


                                                 gtccgtggggtccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                     >  1:4139836‑M1/20‑101 (MQ=255)


                                                 gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGATCCGTGGGAt                                                     >  2:1505068/8‑101 (MQ=11)


                                                   ccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtcc                                                   >  1:1936052‑M2/3‑95 (MQ=255)


                                                    cgtgtgatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                  <  2:2049517/96‑1 (MQ=11)


                                                     gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggg                                                 >  1:2516983/4‑100 (MQ=11)


                                                     gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggg                                                 >  2:3837835/1‑100 (MQ=14)


                                                      tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtg                                                >  2:403493‑M2/3‑92 (MQ=255)


                                                      tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCGGGGGGAtcggtc                                                >  2:235539/3‑101 (MQ=11)


                                                      gggggtcggtcggttccgtgggatcggccgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                <  2:1611586/96‑1 (MQ=11)


                                                       gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGGCCGTGGGGTGGGTCGGGGCCGTggtgggggtcg                                               >  2:2509603/2‑92 (MQ=11)


                                                        ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGAtcggtcgg                                              >  2:658852/1‑101 (MQ=11)


                                                          gtgggtcggatccgttggatcggtcggatccgtaggatcGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                            <  2:2289389/98‑1 (MQ=11)


                                                          gtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat                                            >  1:4679761‑M2/2‑99 (MQ=255)


                                                          gtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat                                            >  2:4244936‑M2/2‑99 (MQ=255)


                                                          atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAGCGGTCGGGt                                            >  2:4460828/1‑101 (MQ=11)


                                                          atcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTcgggc                                            <  1:3420178‑M1/91‑2 (MQ=255)


                                                           tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtcggatc                                           >  1:2639888‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                                            cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatcg                                          >  2:491734‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                            cggtcggcgccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          <  2:849055/101‑1 (MQ=11)


                                                             ggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                         >  1:167116/1‑101 (MQ=11)


                                                             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg                                         >  1:4601328‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                             cgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCg                                         >  1:86184/2‑101 (MQ=14)


                                                              gtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGTCGGCGGGGGCCGGCGGGTcggc                                        >  1:944361/1‑98 (MQ=11)


                                                              gtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                        <  1:3809852‑M1/95‑1 (MQ=255)


                                                              gccgcgtccgtgggatcggtagggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGt                                        <  2:3640986/96‑1 (MQ=11)


                                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGTTCCgggg                                      >  2:1985202/1‑98 (MQ=14)


                                                                cggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGtccgcgg                                      <  2:4660498‑M1/97‑4 (MQ=255)


                                                                 gggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgcgagcgtgga                                     >  1:504362/1‑91 (MQ=11)


                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAATGGTCGGGTCCCTGGGGTCGGTCGGGCCCGTGgg                                     >  1:4072422/1‑101 (MQ=11)


                                                                 gggtccgggggatcggtcgggtccgtgggctcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                     <  2:93449/101‑1 (MQ=14)


                                                                 ggggccgtggggtcgggcgggtgcgggggatcggtcGGGTACGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                     <  1:760075/101‑1 (MQ=11)


                                                                 ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGatccgtggg                                     <  1:1133998‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                 ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCAGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATACGTGgg                                     >  1:2969540/4‑101 (MQ=11)


                                                                 cggcccttgggatcggtcgggtccgtgcgatcggtcggGTCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                     <  2:4369827/94‑1 (MQ=11)


                                                                  gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga                                    <  1:4202241‑M2/99‑11 (MQ=255)


                                                                   gtccgtgggatcggtctggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggat                                   >  1:682982‑M2/1‑90 (MQ=255)


                                                                    tccgtgggatcggtcgggtcggtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtc                                  >  1:3618009‑M2/1‑78 (MQ=255)


                                                                    tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatc                                  <  2:1259185‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                    gcggagggaccggtgggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                  <  2:3116752/96‑1 (MQ=11)


                                                                    gccgtggggtccgtcggatccgtgggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                  <  1:2299323/100‑1 (MQ=11)


                                                                     ccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGAtcg                                 >  2:1013262/1‑101 (MQ=11)


                                                                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTGCGTGgggtag                                 >  2:3718948/1‑97 (MQ=14)


                                                                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                 <  1:1294808‑M2/101‑25 (MQ=255)


                                                                     ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcg                                 <  2:2703809‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                                      cgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgg                                >  2:1105770/1‑101 (MQ=11)


                                                                      cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGGCGGGGCGGTGGGAtcgg                                >  2:1708108/1‑101 (MQ=1)


                                                                      cgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                <  1:1416111/98‑1 (MQ=14)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATTGGTCGGGTCCGTTGGGtcggt                               >  1:3328172/1‑101 (MQ=11)


                                                                       gggggatctgtcgggttcgtcgggtcggtcgtATCCTGGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                               <  2:1827921/99‑1 (MQ=11)


                                                                        tgggatcggtcggttccgttggatcggtcggTTCCGTGAGATCGGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                              <  2:3003198/101‑1 (MQ=14)


                                                                         gtcctcggtgggggccgtcggatcggtgcgGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGGGGGAtcggtcg                             <  2:1405194/97‑1 (MQ=2)


                                                                         gggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             >  1:4428133/1‑101 (MQ=11)


                                                                          ggatcggccggatccgtgggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtcgg                            <  1:1846059/101‑1 (MQ=17)


                                                                             tcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggatc                         >  2:211510‑M2/1‑80 (MQ=255)


                                                                                gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGACCGggcgggtcagg                      >  2:1359750/1‑98 (MQ=11)


                                                                                ctcatatccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATCGATCGGGTCCGTGGCATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtaggatccgt                      <  2:3941255/95‑1 (MQ=11)


                                                                                 tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggggccgtc                     >  2:1190760/1‑101 (MQ=11)


                                                                                  ggggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                    >  1:2124564‑M2/2‑64 (MQ=255)


                                                                                  cgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg                    >  1:1741346/1‑99 (MQ=11)


                                                                                  cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg                    >  1:1999155/1‑101 (MQ=255)


                                                                                   gggtccgtggggtcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                   <  1:1202786/101‑1 (MQ=14)


                                                                                   gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcgggtccgtggg                   >  2:4173667/1‑101 (MQ=11)


                                                                                   gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                   >  1:2742957/1‑101 (MQ=11)


                                                                                   ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGGCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                   >  1:3173164/4‑101 (MQ=14)


                                                                                      tccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtc                >  1:589776/1‑101 (MQ=11)


                                                                                      tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                >  2:2788882‑M2/1‑71 (MQ=255)


                                                                                        cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg              >  1:1518720/1‑101 (MQ=14)


                                                                                        cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg              <  1:3903788‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                                                                        cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgggggatcgg              <  2:4545199‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                                                                          tggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc            <  2:3402857/101‑2 (MQ=11)


                                                                                          taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTg            >  2:572374/3‑101 (MQ=14)


                                                                                              gtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAt        <  2:4106657/97‑1 (MQ=11)


                                                                                              atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt        >  1:3488324/1‑101 (MQ=11)


                                                                                                 ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccg     >  1:3232752‑M2/1‑60 (MQ=255)


                                                                                                 cgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCCGGGTCGGTgggtgccg     >  1:4355656/2‑96 (MQ=14)


                                                                                                  gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgg    >  1:3697852/1‑98 (MQ=11)


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG