BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,012	A→G	3.5%	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,012	0	A→G	3.5%	84.4 ‑0.2 ‑0.0	1604	D215D (GAT→GAC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (31/30): ref base (747/796): total (778/826)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.94e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.31e-01

Only 100 of 1889 total aligned reads displayed.


GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGA  >  NC_014034/221912‑222111


 gtcccgcTTATCGGCGGTGGGCGGCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                                    <  2:3583826/97‑1 (MQ=21)


   ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                  <  1:3235526‑M1/54‑1 (MQ=255)


     cgcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                <  1:4603905/101‑1 (MQ=255)


       gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                              >  2:4393072‑M1/50‑101 (MQ=255)


       gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                              <  2:1117442‑M1/52‑1 (MQ=255)


       gggatcggtcggggccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                              >  2:2079273‑M1/50‑101 (MQ=255)


          atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTcgggc                                                                                           <  2:3414845‑M1/61‑2 (MQ=255)


             ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                        <  1:2195883‑M1/64‑1 (MQ=255)


             gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                        >  2:1036200/1‑101 (MQ=255)


              gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                       <  1:1353805‑M1/59‑1 (MQ=255)


               tcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatccGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                      >  1:4073924‑M1/36‑101 (MQ=255)


                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                     <  1:1281312‑M1/67‑1 (MQ=255)


                cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCcgtag                                                                                     <  1:1130312‑M1/61‑3 (MQ=255)


                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                    <  1:4430420‑M1/68‑1 (MQ=255)


                  ggtccgggggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                   >  2:7493‑M1/33‑101 (MQ=255)


                    tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                 >  2:4267626‑M1/37‑101 (MQ=255)


                     ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                >  2:2519737‑M1/30‑101 (MQ=255)


                       gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                              <  1:211535‑M1/68‑1 (MQ=255)


                         gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                            >  1:451213‑M1/32‑101 (MQ=255)


                         cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                            <  2:51160/101‑1 (MQ=255)


                            aTGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAATGGTGGGac                                                                         >  2:2906720/1‑100 (MQ=255)


                             tcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatcggtcgggtc                                                                        <  2:4490688‑M1/80‑4 (MQ=255)


                             tcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGACcgtgggatcggctgggcg                                                                        <  1:2861935‑M1/74‑8 (MQ=255)


                              gCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                       <  2:1999038/101‑1 (MQ=11)


                                gTGGGGTCCGGCGGAGCGGGCGGTTCGGGGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                     <  1:173033/101‑1 (MQ=11)


                                 tcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                    <  2:3487601‑M1/84‑1 (MQ=255)


                                  gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                   >  1:2581653/1‑99 (MQ=1)


                                  gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                   >  1:527460/1‑99 (MQ=11)


                                     gtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgtggggt                                                                >  2:4587295‑M1/14‑99 (MQ=255)


                                      tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                               >  1:1416748/1‑101 (MQ=255)


                                      tccgtgggatcggtcgggacagtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                               <  2:2601779/95‑1 (MQ=11)


                                       ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAgcg                                                              >  2:3643353/6‑101 (MQ=11)


                                         gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                            >  1:362301/1‑101 (MQ=11)


                                         gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgag                                                            >  1:4305873/1‑99 (MQ=255)


                                          tgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                           >  2:1725609‑M1/15‑101 (MQ=255)


                                            gggtccgtcggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtggg                                                         >  1:982356/7‑101 (MQ=11)


                                            ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGAtcggtcgg                                                         >  2:658852/1‑101 (MQ=11)


                                             gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCggg                                                        >  2:4192420/1‑101 (MQ=11)


                                             gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcagtcgga                                                        >  1:767979/1‑100 (MQ=14)


                                             gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccggggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCggg                                                        <  1:4008351/101‑1 (MQ=11)


                                             gagaggtcgggtcggtgggattcggcgggtgcgtgtgatcGGTCGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                        <  1:205989/97‑1 (MQ=11)


                                              atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtcgggt                                                       <  1:3424558‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                              atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat                                                       <  2:3232551‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                              atcggtccggtccgtgggctcggtcggggccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggat                                                       <  2:2426320/101‑3 (MQ=11)


                                               tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatc                                                      <  2:1860821‑M2/101‑4 (MQ=255)


                                                cggtcgggtccgtgggttcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                     <  1:3173263/101‑1 (MQ=14)


                                                cggtcggcgccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                     <  2:849055/101‑1 (MQ=11)


                                                ccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                     <  2:1262783/99‑1 (MQ=14)


                                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatcgg                                                    <  1:600917‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                                 ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt.ggatcgGTCGGATCCGATGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtcggtacgatacgt                                                   >  2:4690050/1‑92 (MQ=14)


                                                  gtcggaTCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                   >  2:413754‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                   tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCggggcgggg                                                  >  2:1627602/1‑95 (MQ=11)


                                                    cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcg                                                 >  1:2003746‑M2/1‑82 (MQ=255)


                                                     gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg                                                >  2:213068‑M2/1‑92 (MQ=255)


                                                     gggtccgggggatcggtcgggtccgtgggctcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                <  2:93449/101‑1 (MQ=14)


                                                      ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtggGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGGCGGGTCCGTGggg                                               >  2:1943135/1‑100 (MQ=11)


                                                      gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga                                               <  1:4202241‑M2/99‑11 (MQ=255)


                                                       gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggat                                              >  1:1633565‑M2/1‑90 (MQ=255)


                                                       gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGGCCCGTGGGGTcggccgggc                                              >  2:2358904/1‑93 (MQ=11)


                                                       atccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                              >  1:2334666/2‑101 (MQ=11)


                                                        tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGAGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGAtc                                             >  2:3848010/1‑101 (MQ=14)


                                                         ccgtgggatcggtgggttccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                            <  1:1002194/101‑1 (MQ=11)


                                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGGCGCATCCCTGGGGTGGGGCGGGTGCGCGGGATCGGTCGGGGcccggggaccg                                            >  2:4064530/1‑92 (MQ=2)


                                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcg                                            >  1:2654881‑M2/1‑88 (MQ=255)


                                                         ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTGCGTGgggtag                                            >  2:3718948/1‑97 (MQ=14)


                                                          cgtgggatgggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtccg                                           <  2:1416654/101‑3 (MQ=11)


                                                           gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggt                                          <  1:2421115‑M2/101‑16 (MQ=255)


                                                             gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCCGTGGGGtcggttg                                        >  2:3015574/1‑99 (MQ=11)


                                                             gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcg                                        <  2:2204793‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                               gatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggg                                      >  2:2817456/1‑101 (MQ=11)


                                                               gatccgtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                      >  2:2299850‑M2/1‑71 (MQ=255)


                                                                 tcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtc                                    >  1:869514‑M2/1‑80 (MQ=255)


                                                                    gtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                                 >  1:184158/1‑101 (MQ=11)


                                                                    gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGAACCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggggcagt                                 >  1:3825953/1‑96 (MQ=14)


                                                                    ggggggtccgtggggtccgtgggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                                 <  1:2509747/98‑1 (MQ=11)


                                                                     tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggggccgtc                                >  2:1190760/1‑101 (MQ=11)


                                                                       ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                              <  1:1935548/98‑1 (MQ=255)


                                                                        gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgga                             >  2:4335909/3‑100 (MQ=255)


                                                                          tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                           >  1:4146493‑M2/1‑71 (MQ=255)


                                                                            cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                         >  1:1518720/1‑101 (MQ=14)


                                                                            cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGtcgcgtcggtggggtccg                         >  1:3700740/1‑101 (MQ=11)


                                                                             gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                        >  1:1192172/1‑101 (MQ=14)


                                                                               cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCTGTAGGATCGGTCGCGTCCGTCGGGTCCGGgg                      >  1:3930411/11‑101 (MQ=11)


                                                                                gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGGTCGGTggg                     >  1:684943/7‑101 (MQ=14)


                                                                                  atcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggt                   >  2:395320/1‑99 (MQ=11)


                                                                                      gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgg               >  2:2730970/1‑98 (MQ=11)


                                                                                       tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggttcggtg              <  2:3324666‑M2/101‑55 (MQ=255)


                                                                                         ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg            <  1:1060138‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                         ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtggg            <  2:150886/101‑1 (MQ=11)


                                                                                          ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg           >  1:4356859/3‑100 (MQ=14)


                                                                                           gtcCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggat          >  2:577630‑M2/2‑54 (MQ=255)


                                                                                            tCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtc         >  1:2967263‑M2/1‑42 (MQ=255)


                                                                                            tCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc         >  1:3036138‑M2/1‑53 (MQ=255)


                                                                                              cGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg       <  1:3334251‑M2/101‑51 (MQ=255)


                                                                                               gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggt      <  1:2289522‑M2/101‑52 (MQ=255)


                                                                                                ttggAGCGGTTGGGTGCGTGGGTTCGGTCGGCTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg     <  1:3501039/99‑1 (MQ=14)


                                                                                                tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtc     <  1:4686249‑M2/101‑64 (MQ=255)


                                                                                                 tggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg    <  2:3139524/100‑3 (MQ=14)


                                                                                                  ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcgggcggggccgtcgg   <  2:1365758‑M2/101‑66 (MQ=255)


                                                                                                   gATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg  <  1:2744684‑M2/101‑56 (MQ=255)


GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGA  >  NC_014034/221912‑222111

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG