BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,015	G→C	3.8%	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,015	0	G→C	3.8%	88.7 0.0 0.0	1541	T214T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (30/32): ref base (707/770): total (738/803)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1894 total aligned reads displayed.


CGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221915‑222115


   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                    >  2:331941‑M1/51‑101 (MQ=255)


     tCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                  >  2:137943/1‑101 (MQ=255)


     tCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                  >  2:2365615/1‑101 (MQ=255)


      gatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                                                                 <  1:4167757‑M1/54‑1 (MQ=255)


        tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                               <  2:4256472‑M1/62‑1 (MQ=255)


         cgggcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                              >  1:135069‑M1/45‑101 (MQ=255)


          ggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.g                                                                                            <  2:3004558‑M1/58‑1 (MQ=255)


             cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCc.gtag                                                                                         <  1:1130312‑M1/61‑3 (MQ=255)


               ggtccgggggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGa                                                                                       >  2:7493‑M1/33‑101 (MQ=255)


                gggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGAt                                                                                      <  1:4367586/101‑1 (MQ=255)


                atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGAt                                                                                      >  1:150689‑M1/38‑101 (MQ=255)


                 tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGAtc                                                                                     <  2:363914‑M1/65‑1 (MQ=255)


                   cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGAtcgg                                                                                   <  1:3528731‑M1/67‑1 (MQ=255)


                    gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCAGGGTCG.GTGGGAtcggt                                                                                  <  2:2817004‑M1/68‑1 (MQ=255)


                     tCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGAtcggtc                                                                                 >  1:3942536/1‑101 (MQ=255)


                         gtccGTCGGATCGGTGGGACCGGGCCGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGAt                                                                             <  2:3216736/98‑1 (MQ=11)


                         atccGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTAGGAtcggtcgggt                                                                             <  1:4530219/98‑3 (MQ=1)


                         aTGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGAt                                                                             >  1:996551/1‑101 (MQ=255)


                          tcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATc                                                                            <  2:418800‑M1/74‑1 (MQ=255)


                          ctggcgggGTCGGTGGGGTCGGCCGGGGCCGTGGGATAGGTGGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATc                                                                            <  1:344523/96‑1 (MQ=11)


                           cggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                           <  2:1295018‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                 ggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGtgggg                                                                     <  2:1133500‑M1/87‑2 (MQ=255)


                                  gtcggtgggATAGGGGGGCTCGGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                    <  1:2964209/100‑1 (MQ=11)


                                   tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                   <  2:1537371/101‑1 (MQ=255)


                                    ccgtggggtccGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTccgtggggtcc                                                                  >  1:3174926‑M1/12‑97 (MQ=255)


                                    ccgtcggAGCGGTCGGGTCCGTTGGCTCGGTCGGGTCCGTTGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcc                                                                  <  2:4664642/99‑2 (MQ=11)


                                     cgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                 <  2:3562121‑M1/85‑1 (MQ=255)


                                      gtgggatcgggccgttccgtgggatccgtcggctccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                <  2:1203505/98‑1 (MQ=11)


                                      gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggg                                                                >  2:3837835/1‑100 (MQ=14)


                                       tgtgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccctggGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                               <  2:2604828/98‑1 (MQ=11)


                                       tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtc                                                               >  2:1449741‑M2/3‑92 (MQ=255)


                                       tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGGACG.CGGGTCCGGTGGGGTAGGTCGGTCCCGTGGGAtggttg                                                               >  2:4565609/3‑96 (MQ=2)


                                       tcggATCGGTGGGACCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                               <  2:2081917/101‑1 (MQ=11)


                                         ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCC.GGGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGAtcggtcgg                                                             >  2:658852/1‑101 (MQ=11)


                                            tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtcggatc                                                          >  1:2639888‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                            tccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGAATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                          <  1:4309850‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                            tcaggcggaTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                          >  2:438582‑M1/10‑101 (MQ=255)


                                             gggtcgggtccgtggggnccgtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                                                         <  2:94140/100‑1 (MQ=11)


                                             cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGAATCGGTCGGATcc                                                         >  1:4083470/1‑101 (MQ=14)


                                             cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatcg                                                         >  1:2329145‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                              ggtcgggtccgtgggatctgtcgggtccgtggtatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcgg                                                        <  1:1923270‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                              ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCg                                                        >  2:4477258/1‑101 (MQ=14)


                                              ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg                                                        <  2:2228012‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                              ggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCg                                                        <  1:2549881‑M1/94‑1 (MQ=255)


                                               gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                       >  1:4223082/7‑101 (MQ=11)


                                               gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGt                                                       >  2:4051867/1‑101 (MQ=11)


                                               gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGCTcggg                                                       >  1:1997089/1‑98 (MQ=11)


                                                tcgggtccgtgggatcggtcgggtccatgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                      <  1:2856035/101‑2 (MQ=11)


                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggattggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGTTCCGTGgggtccgtgggatcggtcgg                                                    <  2:2900363‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGgg                                                    >  1:4439363/1‑101 (MQ=14)


                                                  gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagg                                                    <  1:384486‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                  ggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGgg                                                    >  1:4630226/4‑101 (MQ=11)


                                                  ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GGGGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGgg                                                    >  1:3044029/4‑101 (MQ=14)


                                                   gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga                                                   <  1:1392771‑M2/99‑11 (MQ=255)


                                                    gtccgtggggtagggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCC.GGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                  <  1:1618694/101‑1 (MQ=11)


                                                    atccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggac                                                  <  1:2191370‑M2/100‑12 (MQ=255)


                                                      ccgtgggatcggtgggttccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                <  1:1002194/101‑1 (MQ=11)


                                                      ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg                                                >  2:4320921‑M2/1‑88 (MQ=255)


                                                      ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGCTCGGTCGGGTCCGCGGGCTCGGTCGGGTCCggggggtcg                                                >  1:3347267/1‑93 (MQ=11)


                                                      ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg                                                >  1:796220‑M2/1‑88 (MQ=255)


                                                      ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTTGGAgcg                                                >  2:2306093/1‑101 (MQ=14)


                                                      ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                >  1:90485/1‑101 (MQ=11)


                                                       cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTGGGGTCGGTGGGAgcgg                                               >  2:2003629/1‑101 (MQ=14)


                                                       cgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcgg                                               >  1:3254382‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                                        gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggg                                              <  1:2503343‑M2/101‑16 (MQ=255)


                                                        gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGCtgggt                                              >  2:1946119/1‑101 (MQ=11)


                                                        gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTACCTGTGATCGGTCTGGTCCGAGGGAtcggt                                              >  1:4700394/1‑101 (MQ=11)


                                                         tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtc                                             <  1:542834‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                          gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                            <  1:205874‑M2/101‑29 (MQ=255)


                                                          gggatcgggcgggtccggcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgttcg                                            <  2:3479188/101‑1 (MQ=11)


                                                             gaccgttgggtccgtgggatgggtcagACTCGTGGCAGCTGTTGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggat                                         <  2:1881308/94‑3 (MQ=2)


                                                              gcggtcggatccgtggggtcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtc                                        >  2:856506‑M2/2‑80 (MQ=255)


                                                               cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                       <  2:4119051/101‑1 (MQ=11)


                                                               cggtcggggccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtcc                                       >  2:1732328‑M2/1‑79 (MQ=255)


                                                                ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccg                                      <  1:626428‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggggtcggtcgggtccgt                                     <  1:1829014‑M2/101‑25 (MQ=255)


                                                                 ctcatatccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTAC.GTGGGATCGATCGGGTCCGTGGCATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGgtaggatccgt                                     <  2:3941255/95‑1 (MQ=11)


                                                                  tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGCCGGGTCGCTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGgtcgggcccctg                                    >  2:3716271/1‑98 (MQ=11)


                                                                   cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                   <  2:3131479‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                                   cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggggccgtgg                                   <  2:490565‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                                   cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtag                                   <  1:2744327‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                                     ggtccgtcggatcggtcggATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                 >  2:1635955‑M2/1‑62 (MQ=255)


                                                                      gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                >  1:3723775‑M2/1‑72 (MQ=255)


                                                                        ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg                              >  1:1262873/1‑100 (MQ=255)


                                                                           tggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc                           <  2:3402857/101‑2 (MQ=11)


                                                                           tgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCC.GTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTg                           >  1:2394857/1‑101 (MQ=11)


                                                                            gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGGTCAGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                          >  1:4016105‑M2/1‑66 (MQ=255)


                                                                            gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                          <  1:2288250/101‑3 (MQ=11)


                                                                            aggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCAGTGGGGTCCGTCGGGGCCGTgt                          >  2:2141490/2‑100 (MQ=11)


                                                                             ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTcgg                         <  1:696042/101‑1 (MQ=11)


                                                                               atcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggc                       <  2:2533444‑M2/101‑39 (MQ=255)


                                                                                  ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGGCGGGTCCGTGGGAtcgg                    >  2:570399/1‑101 (MQ=14)


                                                                                  cgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccg                    <  2:2430799/100‑3 (MQ=11)


                                                                                     cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg                 >  1:3641215/1‑99 (MQ=11)


                                                                                      gggcgcgtgggATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                >  2:1050979‑M2/6‑56 (MQ=255)


                                                                                      ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                <  1:1060138‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                                                      ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgcggg                >  1:1719357/1‑95 (MQ=11)


                                                                                         tCCGTGGGATCGGTCGGCTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc             >  1:2115193‑M2/1‑53 (MQ=255)


                                                                                                   cggtcggGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtcc   >  1:1180721‑M2/1‑32 (MQ=255)


                                                                                                   cggtcggGTCC.GTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg   <  2:2719412/101‑1 (MQ=14)


CGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGG  >  NC_014034/221915‑222115

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG