BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,021	G→A	19.0%	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,021	0	G→A	19.0%	0.0 ‑0.3 0.0	1755	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (161/173): ref base (667/753): total (829/926)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.15e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2063 total aligned reads displayed.


ATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221922‑222121


gtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                                      >  1:2746677‑M1/47‑101 (MQ=255)


 tccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                                     >  1:1053660‑M1/46‑101 (MQ=255)


   gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTNC.g                                                                                                  >  1:3629149/1‑101 (MQ=255)


       ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGGTCC.GTggg                                                                                              <  1:2869705‑M1/62‑1 (MQ=255)


        ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGa                                                                                             >  2:2288777‑M1/39‑101 (MQ=255)


         gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCC.GTCGGAt                                                                                            >  1:69188‑M1/89‑101 (MQ=255)


         gtcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCC.GTGGGAt                                                                                            >  1:1258468‑M1/89‑101 (MQ=255)


         gggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGAt                                                                                            <  1:1789319/101‑1 (MQ=255)


             gttgtgtccGTGAGATCGGTTGTATCCGTGGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCC.GTCGGGtccgt                                                                                        <  2:1363514/93‑1 (MQ=14)


              tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGatcggtg                                                                                       <  1:2332993‑M1/69‑2 (MQ=255)


               gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGAtcggtcg                                                                                      >  1:451213‑M1/32‑101 (MQ=255)


                ggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGAtcggtcgg                                                                                     <  1:2520019‑M1/77‑1 (MQ=255)


                ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGAtcggtcgg                                                                                     >  1:2106200/1‑101 (MQ=255)


                     cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCC.GTGGGATAGGTCGGGTCCg                                                                                <  2:1859631‑M1/25‑1 (MQ=255)


                       tcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                              >  1:11686‑M1/18‑101 (MQ=255)


                       gcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                              >  1:1126666‑M1/18‑101 (MQ=255)


                            acggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                         >  1:3813275‑M1/70‑101 (MQ=255)


                             ccgttggatcggtggggtccctgggctcggtcgggtccgtaGGATCTGTCGGGTCCGTCGGATCCGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                        <  2:3512555/96‑1 (MQ=11)


                             ccgtcggAGCGGTCGGGTCCGTTGGCTCGGTCGGGTCCGTTGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcc                                                                        <  2:4664642/99‑2 (MQ=11)


                                tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGTGGGATCCGTGGGGtcgctc                                                                     >  1:3469533/3‑101 (MQ=11)


                                tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGGACG.CGGGTCCGGTGGGGTAGGTCGGTCCCGTGGGAtggttg                                                                     >  2:4565609/3‑96 (MQ=2)


                                gggggtcggtcggttccgtgggatcggccgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                     <  2:1611586/96‑1 (MQ=11)


                                 gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcggtgg                                                                    >  1:3361959/2‑99 (MQ=11)


                                 cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcg                                                                    <  1:3994935/101‑1 (MQ=11)


                                  ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCC.GTGGGCTCGGTCGGGGCCGGGGGGgccgtcgg                                                                   >  2:24858/1‑101 (MQ=11)


                                    gtccgtggggtccgtgggatcgggggggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                 <  1:4612533/94‑1 (MQ=14)


                                    atcggttgggtccgggggatcggtcgggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                 <  1:774913/101‑1 (MQ=11)


                                     tcggtcgggtcggtggggtccctcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                <  2:3894203/101‑1 (MQ=11)


                                     tcggtcggggccgtgggatgggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                <  2:4009432/101‑1 (MQ=11)


                                      gcggggggtccgtgggagcggtggggtccgtgggatcggtgGGGTGGGTGGGATCGGGCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                               <  1:4290622/96‑1 (MQ=2)


                                      cggtcgtgtccgtgggctccgtcggatccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                               <  2:4468024/101‑1 (MQ=11)


                                      cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtcggatcc                                                               <  1:2657447‑M2/101‑16 (MQ=255)


                                       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGGTCGATCGGATCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg                                                              >  1:204614/1‑101 (MQ=11)


                                       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCC.GTGGGATCGGTCGGCCCCGTGGGTGCGGACGGATCCg                                                              >  2:173017/1‑101 (MQ=11)


                                       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatcgg                                                              <  1:600917‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                       ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg                                                              <  1:3895602‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                        gtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                             <  2:2394601/101‑1 (MQ=11)


                                        ctcgggtccgtgggtcatgtcgggtccctgcgatcggTCGGGTCCTTGGGGTCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                             <  2:566890/100‑1 (MQ=11)


                                         tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtc                                                            <  2:1180631‑M2/101‑19 (MQ=255)


                                          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGTTCCgggg                                                           >  2:1985202/1‑98 (MQ=14)


                                          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTccagat                                                           >  2:422644/1‑97 (MQ=11)


                                           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggg                                                          <  1:1899890‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGAATGGTCGGGTCCCTGGGGTCGGTCGGGCCCGTGgg                                                          >  1:4072422/1‑101 (MQ=11)


                                           gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg                                                          <  1:4432152‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                           ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GGGGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGgg                                                          >  1:3044029/4‑101 (MQ=14)


                                           ggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCggggg                                                          >  2:1418887/4‑97 (MQ=11)


                                           ggatccgggggatcggtcgggtccgtgggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                          <  1:3267177/98‑1 (MQ=14)


                                             gtccgggggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                        <  1:2178736/101‑1 (MQ=14)


                                               gggtgcgatctgtcggcgcggtgggagcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGGCC.GGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                      <  1:1388958/99‑1 (MQ=11)


                                               ccgtgggatcggtgggttccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                      <  1:1002194/101‑1 (MQ=11)


                                               ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg                                                      >  1:4192666‑M2/1‑88 (MQ=255)


                                                cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcgg                                                     <  2:1031107‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                 gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggt                                                    >  1:298178‑M2/1‑86 (MQ=255)


                                                 gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggt                                                    <  1:2421115‑M2/101‑16 (MQ=255)


                                                 gtgggatccgtcggttccgtgggatcggtcgcGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                    <  2:4083228/101‑1 (MQ=11)


                                                  tgggatcggtcggatcggtgggatcggtgggGTCCGTGGGATCGGTGGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtc                                                   <  2:3072929/101‑1 (MQ=11)


                                                  tgcgttccgtgggttcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtc                                                   >  2:2185951‑M1/48‑101 (MQ=255)


                                                   gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCTCC.GTGGGATCGGACGGATCCGTGGGCTCGGCCGGTTCCGTGGGAtcggcag                                                  >  1:197259/1‑98 (MQ=11)


                                                   gggatcggtcgggtccctgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                  <  2:1100209/101‑1 (MQ=11)


                                                     gatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgccggg                                                >  1:413798/1‑101 (MQ=11)


                                                       tgtgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc                                              <  1:2587403/98‑1 (MQ=14)


                                                       tcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggatc                                              >  2:211510‑M2/1‑80 (MQ=255)


                                                        cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTGC.GTGGGATCGGTCGGGTTCGTGGTATCGGACGGGGCCGTGGGTTCGggccggtcc                                             >  2:3262289/1‑101 (MQ=11)


                                                         ggtcggacccggggggtcgggaggTTCCGTCGGATCCGTCGGGCCG.GTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccg                                            <  2:2662078/101‑1 (MQ=2)


                                                         cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg                                            >  1:1611877‑M1/41‑101 (MQ=255)


                                                          gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCGgccgggtcccg                                           >  2:3791641/1‑99 (MQ=11)


                                                          gtcgggtccgctggctccgtcggGTCCGTGGGCTCTGTCGGGGCC.GTGCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                                           <  2:488104/101‑1 (MQ=11)


                                                             gggtcgttgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                        >  2:4312334‑M2/1‑63 (MQ=255)


                                                             gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcgggcgggtccgtggg                                        <  2:2967075‑M2/101‑28 (MQ=255)


                                                             ggatccgtgggatcggtgggATCCGTTGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGgtcgggtccgtagg                                        <  1:506296/98‑1 (MQ=11)


                                                              gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTAGGATCGgtcggggccgtagat                                       >  2:3692569/3‑97 (MQ=11)


                                                                  cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                                   >  1:874046/1‑101 (MQ=14)


                                                                  cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                   >  2:3183580‑M2/1‑69 (MQ=255)


                                                                  cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                   >  1:1705756‑M2/1‑58 (MQ=255)


                                                                   gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                                  >  2:2750169/1‑101 (MQ=14)


                                                                     gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                                <  1:2288250/101‑3 (MQ=11)


                                                                      gggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                               <  2:1266371‑M1/74‑1 (MQ=255)


                                                                         tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                            <  2:3362218/101‑1 (MQ=14)


                                                                         tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                            >  1:97489‑M2/1‑62 (MQ=255)


                                                                          cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatcc                           <  2:2587251‑M2/101‑41 (MQ=255)


                                                                          cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc                           <  2:820988/101‑2 (MQ=11)


                                                                           ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtaggatcgg                          <  2:3605937‑M2/101‑53 (MQ=255)


                                                                             tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtg                        <  1:3187286/101‑2 (MQ=11)


                                                                               ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtggg                      <  2:150886/101‑1 (MQ=11)


                                                                                ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                     >  1:4356859/3‑100 (MQ=14)


                                                                                gATCCGGGGGGTCCGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGa                     <  2:2334533/101‑1 (MQ=11)


                                                                                 ctcCGGGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat                    >  2:416707‑M2/2‑54 (MQ=255)


                                                                                  tCCGTGGGATCGGTCGGATCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatc                   <  2:2052609‑M2/101‑49 (MQ=255)


                                                                                     gtagggtcggtcggGTCC.GTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                <  2:192283/95‑1 (MQ=14)


                                                                                     gtaggATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                <  2:638656/98‑1 (MQ=14)


                                                                                     gTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                <  1:1490750‑M2/101‑52 (MQ=255)


                                                                                      tGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtc               <  1:4686249‑M2/101‑64 (MQ=255)


                                                                                         gATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTAGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCAGTGGGa            >  2:3443123/1‑101 (MQ=14)


                                                                                         gATCGGTCGGGTCC.GTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa            >  2:927135/1‑101 (MQ=14)


                                                                                           tcggtcggGTCC.GTCGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc          <  2:2875952/101‑1 (MQ=14)


                                                                                           tccgtggggTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCCGAGCCGGGGGagc          >  2:734934/7‑99 (MQ=17)


                                                                                             cgtgGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg        <  1:3549629‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                                                              gtcggGTCC.GTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGATCCGTGGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTGGGAccggt       >  2:4374858/1‑101 (MQ=14)


                                                                                              gtcggGTCC.GTCGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggt       <  1:3704164/101‑1 (MQ=14)


                                                                                                cggGTCC.GTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg     >  1:1341837‑M2/1‑39 (MQ=255)


ATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.GTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221922‑222121

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG