BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,027	G→C	11.1%	P210P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,027	0	G→C	11.1%	0.0 ‑0.4 ‑0.0	1711	P210P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (89/99): ref base (685/809): total (792/919)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.99e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.93e-01

Only 100 of 2082 total aligned reads displayed.


CGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221927‑222127


 cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                                     <  1:4393319‑M1/67‑1 (MQ=255)


  gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                                    <  1:2059527‑M1/68‑1 (MQ=255)


      cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGatcc                                                                                                <  2:2299190‑M1/15‑2 (MQ=255)


      ccgttcggcgCGTGGGTCCCGTGGCATCAGTCGGGTCCGTGGCTTCGGTCGGGTCGGGGGGATCTGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                <  1:4551212/92‑1 (MQ=0)


         tggggttcGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATTGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                             <  1:2789855/94‑1 (MQ=11)


         tgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                             >  1:3766092‑M1/27‑101 (MQ=255)


         tgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                             <  1:2202961‑M1/75‑1 (MQ=255)


         tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                             >  2:1214167‑M1/33‑101 (MQ=255)


         tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtc                                                                                             >  1:817873‑M1/33‑101 (MQ=255)


         gggggtGCGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                             <  1:2347087/96‑1 (MQ=11)


           ggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                           <  1:997474‑M1/77‑1 (MQ=255)


             ctcggtcggttccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                                         >  2:138430‑M1/29‑101 (MQ=255)


               ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                       >  1:3004595‑M1/78‑101 (MQ=255)


                 gTGGGGTCCGGCGGAGCGGGCGGTTCGGGGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                     <  1:173033/101‑1 (MQ=11)


                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggttcgtgGGATCGGTGGGATCGGTGGGAGCTGTCGGCCCGGTGGGTTCGGTCGGATCGGTgg                                                                                   >  2:1550463/11‑101 (MQ=2)


                   cgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                   >  2:1997079‑M1/23‑101 (MQ=255)


                      gcccgtcggATCCGTGGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                <  2:1459598/97‑1 (MQ=11)


                      atcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                >  2:3071331‑M1/71‑101 (MQ=255)


                       tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                               >  1:1416748/1‑101 (MQ=255)


                       tccgtggtatctgtcggctccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                               <  2:4309603/93‑1 (MQ=11)


                         ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                             >  2:3254181/1‑101 (MQ=255)


                           tgtgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                           <  2:421737/98‑1 (MQ=11)


                            gggggccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                          <  2:247712/94‑1 (MQ=14)


                            gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGCGGGCTCGGACGGGTCCGCGGGGTCAGTCGGATCCGTGGGAtcgggcg                                                                          >  1:4655701/2‑101 (MQ=14)


                            cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtcggtcg                                                                          <  2:4076097‑M1/37‑1 (MQ=255)


                              gatcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCcgg                                                                        >  2:4359681/1‑101 (MQ=11)


                               gtgcgtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                       <  1:652013/94‑1 (MQ=11)


                               gtcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggat                                                                       <  1:2533486/100‑3 (MQ=11)


                               atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat                                                                       >  2:2579453‑M2/1‑99 (MQ=255)


                               atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggATCGGCGGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTCGGCtcgggagcgg                                                                       >  2:1681292/1‑95 (MQ=11)


                                tgggtcgggtccgtggggtcggtcgggtgcgtcgggtcGTGGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTc                                                                      <  1:3230805/99‑1 (MQ=11)


                                tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatc                                                                      >  2:3790936‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTCGGTCggggcg                                                                     >  2:207799/1‑98 (MQ=14)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtcggatcc                                                                     <  1:3592832‑M2/101‑16 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcc                                                                     >  2:3507305‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                 cggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     <  1:1997263‑M1/93‑1 (MQ=255)


                                  ggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTGGGGTCGGTGGGGAGCGTGGGGTCGTTGggggtcg                                                                    >  2:2964021/1‑97 (MQ=11)


                                   gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgt                                                                   >  1:4485635‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                    tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggagcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                                  <  1:4328687/101‑2 (MQ=14)


                                     cggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGtccgcgg                                                                 <  2:4660498‑M1/97‑4 (MQ=255)


                                      gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGGCGGGtttgtggg                                                                >  2:2129364/1‑94 (MQ=11)


                                      gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATAGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                <  1:2598792/101‑1 (MQ=14)


                                      gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagg                                                                <  1:2898212‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                      ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGATGCGTGgg                                                                >  1:734479/4‑101 (MQ=11)


                                      agttccgttggatcgcccgggttcgtggtatcggtcggGGCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                <  1:473208/98‑1 (MQ=11)


                                       ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggga                                                               <  1:547389‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                       ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggga                                                               <  2:1943096‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                        gtccgtcgggtcggtcggggccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                              <  1:2689449/101‑1 (MQ=11)


                                         tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc                                                             >  2:4551538‑M2/1‑89 (MQ=255)


                                         gccgtggggtccgtcggatccgtgggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                             <  1:2299323/100‑1 (MQ=11)


                                         gccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                             <  1:1190850/100‑1 (MQ=14)


                                          ccgtgggatcggtgggttccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                            <  1:1002194/101‑1 (MQ=11)


                                          ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCgcgggttcg                                                            >  1:3876439/1‑93 (MQ=11)


                                          ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcg                                                            <  1:1630305‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                          ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                            >  1:90485/1‑101 (MQ=11)


                                           cgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGAtcgg                                                           >  1:3422218/1‑101 (MQ=11)


                                           cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                           >  1:3959537/1‑101 (MQ=11)


                                              ggggtcggtcgggtccgtgggagcgggaggGTCCGTGAGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                        <  1:192336/101‑1 (MQ=11)


                                               ggatcggccggatccgtgggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtcgg                                                       <  1:1846059/101‑1 (MQ=17)


                                               ggatccgtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                       <  2:722141/101‑1 (MQ=11)


                                                 atccgtgggatcggtcgggtcggtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggt                                                     <  1:3495623‑M1/58‑1 (MQ=255)


                                                  tcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtc                                                    >  2:2202837‑M2/1‑80 (MQ=255)


                                                   cggtcgggtccgttggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtcc                                                   >  2:3670348‑M2/1‑79 (MQ=255)


                                                    ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGgtcgggtccg                                                  >  2:3159523/1‑101 (MQ=11)


                                                    ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTTTGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg                                                  >  1:4056312/1‑101 (MQ=11)


                                                    ggtcggacccggggggtcgggaggTTCCGTCGGATCCGTCGGGCCGGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccg                                                  <  2:2662078/101‑1 (MQ=2)


                                                     gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGTGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgt                                                 >  2:235525‑M1/40‑101 (MQ=255)


                                                     gtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgt                                                 <  1:3118696‑M2/101‑25 (MQ=255)


                                                      tcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc                                                >  1:2430934/1‑101 (MQ=11)


                                                      gcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc                                                <  1:41764/100‑1 (MQ=11)


                                                       ggggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                               >  1:2124564‑M2/2‑64 (MQ=255)


                                                            ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggccgggtcc                                          <  2:632378‑M2/101‑43 (MQ=255)


                                                              gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcggggccgtggggtgcgg                                        >  2:917942/1‑100 (MQ=11)


                                                              gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                                        >  2:2750169/1‑101 (MQ=14)


                                                              gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcggggccgtcggttcggg                                        >  2:3887842/1‑98 (MQ=11)


                                                               taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTg                                       >  1:3683001/3‑101 (MQ=14)


                                                                gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                      >  2:1881419‑M2/1‑66 (MQ=255)


                                                                gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                                      >  2:4166078/1‑99 (MQ=11)


                                                                 gggtcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtagg                                     >  1:41184‑M2/1‑54 (MQ=255)


                                                                  gatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCCGGgggg                                    >  2:3343683/1‑100 (MQ=11)


                                                                      ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtaggatcgg                                <  2:3605937‑M2/101‑53 (MQ=255)


                                                                         cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                             <  2:553441/101‑1 (MQ=14)


                                                                         cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGAtcggtcg                             >  2:3994693/1‑101 (MQ=14)


                                                                          gggcgcgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                            >  2:1050979‑M2/6‑56 (MQ=255)


                                                                               cGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgg                       <  1:3334251‑M2/101‑51 (MQ=255)


                                                                                 cgggaTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                     >  2:1133912‑M2/2‑49 (MQ=255)


                                                                                      tcggtcggGTCCGTCGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                <  2:2875952/101‑1 (MQ=14)


                                                                                      tccgtggggTCCGTTGGATCGGTCGGGGCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                <  2:177273/95‑1 (MQ=18)


                                                                                      tccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtc                >  1:1053660‑M2/1‑44 (MQ=255)


                                                                                       ccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg               >  1:1266462‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                                                       ccgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc               <  2:796147‑M2/99‑59 (MQ=255)


                                                                                         gtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt             <  1:4266295‑M1/98‑1 (MQ=255)


                                                                                         gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcgggtccgt             <  1:1353805‑M2/101‑61 (MQ=255)


                                                                                           cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggcagtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtgg           <  2:4440777‑M2/101‑74 (MQ=255)


                                                                                           cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtag           <  1:1130312‑M2/101‑63 (MQ=255)


                                                                                            gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGCtcggtcgg          >  2:47630/1‑101 (MQ=17)


                                                                                             ggTCCGTGGGATCCGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtggga         >  2:1294716‑M2/1‑26 (MQ=255)


                                                                                               tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc       >  2:2411225‑M2/1‑35 (MQ=255)


                                                                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg      >  2:3436902‑M2/1‑34 (MQ=255)


                                                                                                  gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt    >  1:1528476/1‑101 (MQ=255)


CGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221927‑222127

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG