BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,036	C→G	3.0%	P207P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,036	0	C→G	3.0%	75.7 ‑1.4 ‑0.4	1558	P207P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (17/32): ref base (661/847): total (678/880)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.42e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.02e-01

Only 100 of 2064 total aligned reads displayed.


TCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGG  >  NC_014034/221936‑222136


ggggggcggggggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                      <  1:914173/91‑1 (MQ=14)


 cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                     <  1:4008274/101‑1 (MQ=255)


     tcggtccggtccgtggggtccGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatcggtcgggtc                                                                                                 >  2:1770489‑M1/22‑98 (MQ=255)


        gtgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                              >  2:1465770‑M1/76‑101 (MQ=255)


        gtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                              >  2:2977971‑M1/19‑101 (MQ=255)


         tcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                             >  1:2752890‑M1/18‑101 (MQ=255)


         tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                             >  2:2887691/1‑101 (MQ=255)


          gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                            <  1:205874‑M1/28‑1 (MQ=255)


          gggCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGg                                                                                            <  2:651949‑M2/101‑2 (MQ=255)


            ggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                          <  2:1004982‑M1/87‑1 (MQ=255)


             gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGGGGATCCGTGGGATCGGGAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGac                                                                                         >  1:2662232/5‑100 (MQ=11)


              tccttgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggctccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                        <  2:3618586/95‑1 (MQ=11)


              tccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                        <  2:3263429‑M1/83‑1 (MQ=255)


               ccgtggggtccGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                       <  2:4309907‑M1/90‑1 (MQ=255)


               ccgtggggtccGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTccgtggggtcc                                                                                       >  1:3174926‑M1/12‑97 (MQ=255)


                 gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGTTCCGTGGGAtcggt                                                                                     >  2:2656278/4‑101 (MQ=11)


                  tgtgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                    <  2:421737/98‑1 (MQ=11)


                   ttgatgggtcgggttcgtggggtttgtcggatccgtgcGATCTGTCGGATCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                   <  2:4659081/99‑1 (MQ=11)


                    ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                  >  1:4702159/1‑101 (MQ=11)


                    ggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                  >  2:1220751‑M1/13‑101 (MQ=255)


                     gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGCTCGGGCGGGTCCGTGGGAtcggccggt                                                                                 >  1:1845525/1‑100 (MQ=11)


                      atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggATCGGCGGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTCGGCtcgggagcgg                                                                                >  2:1681292/1‑95 (MQ=11)


                       tcggtcgggtcggtggggtccctcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                               <  2:3894203/101‑1 (MQ=11)


                       tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGAGCCGTCGGGTCGCTCcggcc                                                                               >  1:4648018/1‑99 (MQ=11)


                       tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatc                                                                               <  1:2172344‑M2/101‑4 (MQ=255)


                       tcggtcggggccgtgggatgggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                               <  2:4009432/101‑1 (MQ=11)


                       caggtggggtccgtgggctcgttcgggcccgtgggatgGGTGGGGTCCGTTGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                               <  1:4307997/99‑1 (MQ=11)


                        tggtcggatctgtgggatcggtcggacccgaaggctcGGTCGGGTCCGTAAGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                              <  2:734405/100‑1 (MQ=11)


                        gcttccgctccgtgggatccttcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                              <  2:3361757/93‑1 (MQ=11)


                        cggtcgtgtccgtgggctccgtcggatccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                              <  2:4468024/101‑1 (MQ=11)


                        cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGAATCGGTCGGATcc                                                                              >  1:4083470/1‑101 (MQ=14)


                        cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGatcg                                                                              >  1:2329145‑M2/1‑97 (MQ=255)


                        cggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcgggccc                                                                              <  1:1531600‑M1/93‑4 (MQ=255)


                        cggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                              <  1:1997263‑M1/93‑1 (MQ=255)


                         ggtctgatccgtgggatcggtcgggtccctaggatcGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                             <  2:2172220/101‑1 (MQ=14)


                          gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGATCGGTCGGGGCCgg                                                                            >  2:1141118/1‑100 (MQ=11)


                          gtcgggtccgggggatgggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                            <  1:819691/101‑1 (MQ=14)


                          ctcgggtccgtgggtcatgtcgggtccctgcgatcggTCGGGTCCTTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                            <  2:566890/100‑1 (MQ=11)


                           tcgggtccgtgggatgggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                                           <  2:2107653/101‑2 (MQ=14)


                            cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                                          >  2:2473004/1‑99 (MQ=11)


                            cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                          >  1:390824/1‑99 (MQ=11)


                            cggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCcgtgg                                                                          <  1:4514954‑M1/97‑3 (MQ=255)


                             gggttcgtgggtcctgtcgggtgcgttggatcggtcGGGTCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                         <  2:1557644/101‑1 (MQ=1)


                             gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggg                                                                         <  1:421781‑M2/101‑10 (MQ=255)


                             gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggg                                                                         <  1:2412931‑M2/101‑10 (MQ=255)


                             ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGgg                                                                         >  1:3044029/4‑101 (MQ=14)


                             ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGATGCGTGgg                                                                         >  1:734479/4‑101 (MQ=11)


                             ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCAGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATACGTGgg                                                                         >  1:2969540/4‑101 (MQ=11)


                             ggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggg                                                                         <  1:2105931‑M2/101‑10 (MQ=255)


                             cggcccttgggatcggtcgggtccgtgcgatcggtcggGTCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                         <  2:4369827/94‑1 (MQ=11)


                              ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggga                                                                        >  2:1990068‑M2/1‑91 (MQ=255)


                              gaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGtccgtgggg                                                                        <  2:2547779‑M1/99‑5 (MQ=255)


                              gaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGa                                                                        >  1:3717328‑M1/3‑101 (MQ=255)


                               gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggat                                                                       >  1:1633565‑M2/1‑90 (MQ=255)


                                tcggtcggagccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtc                                                                      >  1:1051201‑M1/52‑101 (MQ=255)


                                tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc                                                                      >  1:1418981‑M2/1‑89 (MQ=255)


                                tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc                                                                      >  2:1060059‑M2/1‑89 (MQ=255)


                                tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatc                                                                      <  1:288753‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                gccgtggggtccgtgggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                      <  1:3643582/100‑1 (MQ=11)


                                 ccgtgggatcggtgggttccgggggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                     <  1:1002194/101‑1 (MQ=11)


                                   gtgggatccgtcggttccgtgggatcggtcgcGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   <  2:4083228/101‑1 (MQ=11)


                                    tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtc                                                                  <  1:542834‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                    tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                  >  2:2752726/1‑101 (MQ=11)


                                     ggggtcggtcgggtccgtgggagcgggaggGTCCGTGAGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                 <  1:192336/101‑1 (MQ=11)


                                         tgtgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc                                                             <  1:2587403/98‑1 (MQ=14)


                                         tcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGGACCGGGGGATTGgtcgggcc                                                             >  2:3463216/1‑99 (MQ=11)


                                         acggtcgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                             >  1:3813275‑M2/2‑69 (MQ=255)


                                          ggggcggggccgtgggatgggtcggAGCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                                            <  1:172113/97‑1 (MQ=11)


                                          cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtcc                                                            <  2:3081896‑M2/101‑23 (MQ=255)


                                           ggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccg                                                           >  1:3308087/1‑101 (MQ=11)


                                            ttcggatgcgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCCGTCGGGTACGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgt                                                          <  2:2325356/100‑1 (MQ=14)


                                              cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                        <  2:1321974‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                                ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcggctccgtggga                                                      >  2:1390906/1‑100 (MQ=11)


                                                gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggg                                                      <  2:2391863‑M1/66‑1 (MQ=255)


                                                 atccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggat                                                     >  1:4372920‑M2/2‑72 (MQ=255)


                                                  tccgtggtatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                    >  2:1923158‑M2/1‑60 (MQ=255)


                                                  tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatc                                                    <  1:638720‑M2/101‑31 (MQ=255)


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                                                   ccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                                   <  2:3187086‑M2/101‑32 (MQ=255)


                                                   ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg                                                   >  1:1262873/1‑100 (MQ=255)


                                                        ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTcgg                                              <  2:3524235/101‑1 (MQ=11)


                                                          atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                            <  1:3388297/101‑1 (MQ=14)


                                                            cgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                          >  1:3476353‑M2/1‑61 (MQ=255)


                                                                cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                      >  2:3806430‑M2/1‑57 (MQ=255)


                                                                  gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgggg                                    >  2:3696882/1‑100 (MQ=11)


                                                                  gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgggc                                    >  2:2052796/1‑100 (MQ=11)


                                                                   ctcCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat                                   >  2:416707‑M2/2‑54 (MQ=255)


                                                                        tcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGCTCGGCCGGGTCCCTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                              >  2:1866826/3‑101 (MQ=17)


                                                                           gATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                           <  1:4167757‑M2/101‑56 (MQ=255)


                                                                           gATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa                           >  2:927135/1‑101 (MQ=14)


                                                                              ccgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc                        <  2:796147‑M2/99‑59 (MQ=255)


                                                                                gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgt                      >  1:2264930‑M2/1‑41 (MQ=255)


                                                                                gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcgggtccgt                      <  1:1353805‑M2/101‑61 (MQ=255)


                                                                                  cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtag                    <  1:1130312‑M2/101‑63 (MQ=255)


                                                                                   gggTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                   <  1:2519882‑M2/101‑64 (MQ=255)


                                                                                   ggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGGGCCGCAGAAtcggtccg                   >  2:485224/4‑99 (MQ=17)


                                                                                          gcggctcgggcggATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTg            <  2:2253517/96‑1 (MQ=14)


                                                                                              aagagtcggGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGc        <  1:4472518/97‑1 (MQ=255)


                                                                                               tcggtgggATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggatc       >  1:3550023‑M2/1‑15 (MQ=255)


                                                                                                cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtgggatccgtgggatcggtcggatcc      <  2:4563150‑M2/101‑77 (MQ=255)


TCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGG  >  NC_014034/221936‑222136

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG