BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,045	G→C	6.1%	P204P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,045	0	G→C	6.1%	158.6 ‑0.7 ‑0.0	1497	P204P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (34/55): ref base (568/770): total (641/856)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.06e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2000 total aligned reads displayed.


TGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221945‑222145


tcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                                      <  2:3487601‑M1/84‑1 (MQ=255)


gcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                                      >  1:1126666‑M1/18‑101 (MQ=255)


 cgggtccgtgggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                                     >  2:1997079‑M1/23‑101 (MQ=255)


  ggtgcggtaggAGCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgg                                                                                                    <  2:1077854/97‑1 (MQ=0)


  ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGAACCGCGGCATCGGTGGGATCCGTggg                                                                                                    >  2:4239837/10‑101 (MQ=11)


    atcaggcggAGCGCTCGGGCCCGTCGGAGCGGTCGGGCCCGTCGGACCCGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                                                  <  2:2927323/95‑1 (MQ=2)


     tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                                 <  1:2526376/101‑1 (MQ=255)


     tccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGATCCGTGGGatg                                                                                                 <  2:1247776‑M1/83‑2 (MQ=255)


      ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                <  2:2420980/96‑1 (MQ=11)


      ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAgcg                                                                                                >  2:3643353/6‑101 (MQ=11)


        gtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGAtcggg                                                                                              >  1:722214/1‑100 (MQ=11)


        gtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGGGGGAtcgtg                                                                                              >  1:1355117/1‑99 (MQ=11)


         tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCGGGGGGAtcggtc                                                                                             >  2:235539/3‑101 (MQ=11)


         tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGGTCGGGGGGGCCCGTCGGAtcggcg                                                                                             >  2:1587716/1‑99 (MQ=14)


         tcggATCGGTCGGGTCCGTGGAATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                             >  1:2689733/1‑101 (MQ=255)


          ttgatgggtcgggttcgtggggtttgtcggatccgtgcGATCTGTCGGATCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                            <  2:4659081/99‑1 (MQ=11)


          gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCGGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGtcggtcg                                                                                            >  2:219314/2‑101 (MQ=11)


          cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                            >  1:4378468/1‑101 (MQ=255)


           gggtcgttgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                           >  2:4312334‑M1/64‑101 (MQ=255)


             gtcggttggttccgtgggttcggtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                         <  2:83521/100‑1 (MQ=11)


             gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggtccgtcggat                                                                                         >  1:3838070‑M2/2‑88 (MQ=255)


             atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAGCGGTCGGGt                                                                                         >  2:4460828/1‑101 (MQ=11)


             atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat                                                                                         <  2:3232551‑M2/101‑3 (MQ=255)


             atcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTcgggc                                                                                         <  1:3420178‑M1/91‑2 (MQ=255)


              tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGAGCCGTCGGGTCGCTCcggcc                                                                                        >  1:4648018/1‑99 (MQ=11)


              tccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                        <  2:284606‑M1/92‑1 (MQ=255)


              tccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGAATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                        <  1:4309850‑M1/92‑1 (MQ=255)


               tggtcgggtccgtgggggccgtcggagccgggggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                       <  1:2333623/100‑1 (MQ=11)


               cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGAATCGGTCGGATcc                                                                                       >  1:4083470/1‑101 (MQ=14)


               cggtcggaTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                       >  2:3577829‑M1/9‑101 (MQ=255)


                 gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                     >  1:4223082/7‑101 (MQ=11)


                 gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGt                                                                                     >  1:3202836/7‑101 (MQ=11)


                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGt                                                                                     >  2:4051867/1‑101 (MQ=11)


                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                  <  1:2995619‑M2/101‑21 (MQ=255)


                    gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagg                                                                                  >  2:2294778‑M2/1‑92 (MQ=255)


                    ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg                                                                                  >  1:4167798‑M2/1‑92 (MQ=255)


                     ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga                                                                                 <  1:628649‑M2/101‑11 (MQ=255)


                      gtgcgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggttggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                <  2:666297/98‑1 (MQ=11)


                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGGCCGtggcgt                                                                                >  1:4524782/1‑96 (MQ=11)


                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggat                                                                                >  1:1633565‑M2/1‑90 (MQ=255)


                      gtccgggggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                <  1:2178736/101‑1 (MQ=14)


                       tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGatccgtgggatc                                                                               >  2:2070499‑M2/1‑89 (MQ=255)


                       gccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc                                                                               >  1:4461078‑M2/2‑89 (MQ=255)


                        ccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGAtcg                                                                              >  2:1013262/1‑101 (MQ=11)


                         cgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCAGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                             >  1:4009674/1‑101 (MQ=11)


                           ggggataggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                           <  1:3941337/100‑1 (MQ=14)


                            gggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggATCGGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                          <  2:1780134/101‑1 (MQ=17)


                            gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                          >  2:1937901/1‑101 (MQ=14)


                            gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                          <  1:205874‑M2/101‑29 (MQ=255)


                              gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggg                                                                        >  1:2899484‑M2/1‑82 (MQ=255)


                              gacgggctgggtcctttgggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggg                                                                        <  2:3324112/93‑1 (MQ=11)


                               atccgtgggatcggtcgggtcggtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggt                                                                       <  1:3495623‑M1/58‑1 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGGCGGGGGATCGgtcggggcg                                                                     >  2:1398617/1‑98 (MQ=11)


                                  ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccg                                                                    <  2:2122687‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                    tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCGCTGGGGTCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGgtcgggcccctg                                                                  >  2:3716271/1‑98 (MQ=11)


                                    tcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc                                                                  >  1:2430934/1‑101 (MQ=11)


                                     cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGggccgtgggatcggtcgggtccgtgg                                                                 <  2:2717424‑M2/101‑27 (MQ=255)


                                     cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg                                                                 >  1:1999155/1‑101 (MQ=255)


                                      gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                                                <  1:53776/101‑1 (MQ=11)


                                      gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggcgggtccgtggg                                                                >  2:4173667/1‑101 (MQ=11)


                                      ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                <  1:1935548/98‑1 (MQ=255)


                                       gatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcggg                                                               >  2:738460/3‑101 (MQ=11)


                                           tttgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                                                           <  1:1263587/99‑1 (MQ=11)


                                           cgttggatcggtcggGTCCTTTGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcggatccgtggggtccg                                                           <  2:3825718/101‑1 (MQ=14)


                                           cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                                           <  1:933368‑M2/101‑33 (MQ=255)


                                            gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggt                                                          <  2:1698017‑M2/101‑34 (MQ=255)


                                             tggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc                                                         <  2:3402857/101‑2 (MQ=11)


                                              gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                        >  2:1881419‑M2/1‑66 (MQ=255)


                                              gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                        <  2:1332173‑M2/101‑36 (MQ=255)


                                              gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                                                        <  1:2288250/101‑3 (MQ=11)


                                               gggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                                                       <  2:1501030‑M1/74‑1 (MQ=255)


                                                 atcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                     >  1:2601282‑M2/1‑63 (MQ=255)


                                                  tcggtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatc                                                    >  1:1051201‑M2/1‑51 (MQ=255)


                                                   cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcg                                                   <  1:3325750‑M2/101‑52 (MQ=255)


                                                    ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGGCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                  >  2:570399/1‑101 (MQ=14)


                                                          aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                            >  2:2598640/1‑101 (MQ=11)


                                                           tcggtgggatccgtgGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                           >  1:3734863‑M1/16‑101 (MQ=255)


                                                            ccGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                          >  1:2817169‑M2/1‑52 (MQ=255)


                                                                aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                      <  1:1534931/100‑3 (MQ=14)


                                                                 ggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                     <  1:1732433‑M2/101‑55 (MQ=255)


                                                                     cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtcc                                 >  1:1180721‑M2/1‑32 (MQ=255)


                                                                       gtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGatcggg                               <  1:1855157‑M1/98‑2 (MQ=255)


                                                                       gtcggGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGATCCGTGGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTGGGAccggt                               >  2:4374858/1‑101 (MQ=14)


                                                                       gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgg                               <  1:358186‑M2/101‑61 (MQ=255)


                                                                         gggctCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtcg                             <  2:2505595/97‑1 (MQ=11)


                                                                          gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGCtcggtcgg                            >  2:47630/1‑101 (MQ=17)


                                                                             tccctgggatcggtcggctccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                         >  2:3028483‑M2/1‑35 (MQ=255)


                                                                             gccgTGGGATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtgggatc                         >  2:4107367‑M2/2‑24 (MQ=255)


                                                                                gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt                      <  1:211535‑M2/101‑70 (MQ=255)


                                                                                gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTTCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGGTCCgg                      >  2:3134924/1‑100 (MQ=255)


                                                                                 tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtc                     >  1:817873‑M2/1‑31 (MQ=255)


                                                                                  cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgg                    <  2:1145008/100‑1 (MQ=17)


                                                                                    gATCGGTCGGATCCGTGgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgga                  <  1:3097827‑M2/101‑85 (MQ=255)


                                                                                        ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccg              >  1:3681448‑M2/1‑24 (MQ=255)


                                                                                           cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgg           >  2:933291‑M2/1‑21 (MQ=255)


                                                                                             ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa         >  1:1000596/3‑101 (MQ=255)


                                                                                             gATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCGGTgggatcgggcggg         >  2:4584257/1‑91 (MQ=11)


                                                                                               tccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatc       >  2:3937201‑M2/1‑17 (MQ=255)


                                                                                                 cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtagg     >  1:4711662/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                   tggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc   <  1:1425316‑M2/101‑89 (MQ=255)


TGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221945‑222145

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG