BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,051	G→C	1.7%	T202T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,051	0	G→C	1.7%	24.9 ‑0.2 ‑1.0	1144	T202T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/11): ref base (501/620): total (511/633)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.27e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.55e-02

Only 100 of 1734 total aligned reads displayed.


CGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGC  >  NC_014034/221951‑222151


  gtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGAtcggg                                                                                                    >  2:2732026/1‑100 (MQ=11)


   tggggttggtcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  1:3622798/94‑1 (MQ=11)


   tgggatgagtccgggccgtgggatccgtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGTTCGGTCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  2:1310893/93‑1 (MQ=11)


   tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTTGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAacagtc                                                                                                   >  2:4320415/3‑101 (MQ=11)


   tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   <  2:4378221/99‑1 (MQ=11)


    gggaccggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcg                                                                                                  >  1:4261334/2‑101 (MQ=11)


      gatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGatcggtcgga                                                                                                <  1:2535034‑M1/90‑2 (MQ=255)


       gtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat                                                                                               >  2:4244936‑M2/2‑99 (MQ=255)


       atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat                                                                                               <  2:417551‑M2/101‑3 (MQ=255)


       atcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAGCGGTCGGGt                                                                                               >  2:4460828/1‑101 (MQ=11)


        tgggtcgggtccgtggggtcggtcgggtgcgtcgggtcGTGGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTc                                                                                              <  1:3230805/99‑1 (MQ=11)


         tggtcggatctgtgggatcggtcggacccgaaggctcGGTCGGGTCCGTAAGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             <  2:734405/100‑1 (MQ=11)


         gtctcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatcc                                                                                             >  2:2610845‑M2/4‑97 (MQ=255)


         cggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                             <  2:1019090/101‑1 (MQ=11)


         cggtccggtccgtgggatcgttcgggtccgtcggatCGGTCGCGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             <  2:3327970/101‑1 (MQ=11)


         cggcgggttccgtgggatcggtcgggtcggggggatcggtccgGGCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             <  1:3494132/93‑1 (MQ=11)


          ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccg                                                                                            <  1:1197535‑M2/101‑6 (MQ=255)


          ctttctgttcgtggggtccgtccggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                                            <  2:2133338/92‑1 (MQ=11)


           gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCTCGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                           >  1:1881420/1‑101 (MQ=14)


           gtcgggtccgggggatgggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                           <  1:819691/101‑1 (MQ=14)


             cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggattggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGGCGCACCCGCGGGGTCCGTGgggccagccg                                                                                         >  2:823896/1‑94 (MQ=11)


             cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCTGtgg                                                                                         >  1:3324314/1‑99 (MQ=11)


              gggtggctgggctcggtggtgtgcgctggatgggtcggGCGCGTGGGGTCGGGCGGGTGCCTCGGACCCGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                        <  1:3692799/94‑1 (MQ=2)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtggg                                                                                        >  1:403274‑M2/1‑92 (MQ=255)


              gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGgg                                                                                        >  1:4439363/1‑101 (MQ=14)


              gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtagg                                                                                        >  2:2294778‑M2/1‑92 (MQ=255)


              ggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGgg                                                                                        >  1:4630226/4‑101 (MQ=11)


               gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtggga                                                                                       >  1:1969819‑M2/3‑91 (MQ=255)


                gtgcgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggttggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                      <  2:666297/98‑1 (MQ=11)


                gtccgtgggatcgttcggatccgtgtgatccgtcggATTCGTTGGATCGGTCGGATTCGTTGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAt                                                                                      <  1:2906896/101‑1 (MQ=17)


                gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGgggt                                                                                      >  1:1369792/1‑99 (MQ=11)


                ggccgtgggatcgggcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                      <  1:3745268/99‑1 (MQ=14)


                 tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatc                                                                                     >  1:1762716‑M2/1‑89 (MQ=255)


                 tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatc                                                                                     >  2:1697116‑M2/1‑89 (MQ=255)


                 tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatc                                                                                     >  1:1117528‑M2/1‑89 (MQ=255)


                 tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGAGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGAtc                                                                                     >  2:3848010/1‑101 (MQ=14)


                  ccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgggcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGGGAGCATCCGCGGGGTGGTGCGGGTGGGTAGGAtcg                                                                                    >  2:1475871/1‑101 (MQ=2)


                    gtgggattggtgggatccgtggggtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                  <  2:2209409/101‑1 (MQ=11)


                    gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGCtgggt                                                                                  >  2:1946119/1‑101 (MQ=11)


                     tgggatcggtcggatcggtgggatcggtgggGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtcggtc                                                                                 <  2:3072929/101‑1 (MQ=11)


                     tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                 >  1:202597/1‑101 (MQ=11)


                       ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgg                                                                               <  2:2855859‑M2/101‑19 (MQ=255)


                       ggatcggtcgggtccgtgggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               <  1:1295110/101‑1 (MQ=17)


                         atcgttcgggtccttgggctccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                                                                             <  2:3245145/101‑1 (MQ=11)


                         atccgtgggatcggtcgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                                                                             <  2:2537102/101‑1 (MQ=14)


                          tcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc                                                                            <  2:2085448/101‑1 (MQ=255)


                          tccgttggatccgtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc                                                                            >  2:3736265‑M1/43‑101 (MQ=255)


                          tccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGgccggatc                                                                            >  1:1584239/4‑101 (MQ=11)


                           cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                           >  2:3419972‑M2/1‑79 (MQ=255)


                           cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGATCGGTGGGGTCGGTGGGAGCCggcgggccg                                                                           >  2:1238001/1‑98 (MQ=11)


                            ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGgtcgggtccg                                                                          >  2:3159523/1‑101 (MQ=11)


                            cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg                                                                          >  1:3861700‑M1/41‑101 (MQ=255)


                             gtcggggccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                                         >  1:284640‑M2/1‑77 (MQ=255)


                             gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                                         >  1:431895‑M2/1‑77 (MQ=255)


                             gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggcccgt                                                                         <  1:2299983‑M2/101‑25 (MQ=255)


                              tcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc                                                                        <  2:4053921/101‑1 (MQ=11)


                              gcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc                                                                        <  1:41764/100‑1 (MQ=11)


                               cgggctcgtggggtgcgtcggATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGgtcggatccgtag                                                                       <  2:1580712/95‑3 (MQ=11)


                               cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg                                                                       <  1:2365748/101‑1 (MQ=255)


                                ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                      <  1:2446678/98‑1 (MQ=255)


                                 gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggg                                                                     <  2:4597711‑M1/66‑1 (MQ=255)


                                  atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGCCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCCTGGGATCGgtcgggtccgtgggat                                                                    >  1:543580/2‑99 (MQ=11)


                                   tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatc                                                                   <  1:638720‑M2/101‑31 (MQ=255)


                                    cggtaggatcggtcggGTCCGTAGGATGGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                                                  <  2:4112178/96‑1 (MQ=11)


                                       tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTg                                                               >  1:4106899/1‑101 (MQ=14)


                                        ggggttcgtcggATCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtcg                                                              <  1:4544227/94‑3 (MQ=11)


                                         gggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTggg                                                             <  2:1801691‑M1/74‑1 (MQ=255)


                                         gggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg                                                             >  1:1473050‑M1/28‑101 (MQ=255)


                                         ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTcgg                                                             >  2:2963085/1‑101 (MQ=11)


                                           atcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                           >  1:2601282‑M2/1‑63 (MQ=255)


                                              ggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgggggccg                                                        >  2:2025386/1‑96 (MQ=11)


                                              cgtgggATCCGGCGGATCCGGTGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                        <  2:2362952/97‑1 (MQ=17)


                                               gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgt                                                       <  1:717830‑M2/101‑43 (MQ=255)


                                               ggtggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                       >  2:3591564‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                                gcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                      <  1:395364/100‑1 (MQ=14)


                                                  gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                    >  2:569602/4‑101 (MQ=14)


                                                  ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg                                                    <  2:3950500‑M2/101‑46 (MQ=255)


                                                   gATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGCtcggtgggc                                                   >  2:3664127/1‑100 (MQ=11)


                                                            gATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa                                          >  2:927135/1‑101 (MQ=14)


                                                              tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggttc                                        >  1:2717578‑M2/1‑44 (MQ=255)


                                                              tccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtc                                        >  1:1053660‑M2/1‑44 (MQ=255)


                                                               cggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcg                                       >  2:1882480/1‑101 (MQ=14)


                                                                 gtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                     <  2:3505178‑M1/98‑1 (MQ=255)


                                                                  ncggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGGCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGGtcgggc                                    >  1:94156/2‑99 (MQ=14)


                                                                    gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGCtcggtcgg                                  >  2:47630/1‑101 (MQ=17)


                                                                     ggTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGctccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                 >  2:1084360‑M2/1‑37 (MQ=255)


                                                                      gTCCGTGGCATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                <  2:4685993/101‑1 (MQ=255)


                                                                       gccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                               >  1:4384068‑M2/2‑35 (MQ=255)


                                                                         cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTGGGCCGGGCCCg                             >  1:2216112/1‑101 (MQ=17)


                                                                           tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtc                           >  1:3021667‑M2/1‑31 (MQ=255)


                                                                            gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg                          <  2:2446542‑M2/101‑72 (MQ=255)


                                                                            cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgg                          <  2:1145008/100‑1 (MQ=17)


                                                                               ctcggtcggttccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggat                       >  2:138430‑M2/2‑27 (MQ=255)


                                                                                  ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtgg                    >  1:3406829/1‑101 (MQ=255)


                                                                                     cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggttg                 >  1:2082038/1‑93 (MQ=14)


                                                                                       ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa               >  1:1000596/3‑101 (MQ=255)


                                                                                           cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtagg           >  1:4711662/1‑101 (MQ=255)


                                                                                             tGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGGtcggtc         >  1:16866/1‑101 (MQ=255)


                                                                                              gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg        <  1:3116952‑M2/101‑90 (MQ=255)


                                                                                                  ttggtcggGTCCGGAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAcc    <  1:2149764/99‑1 (MQ=255)


CGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGC  >  NC_014034/221951‑222151

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG