BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,054	C→G	1.1%	P201P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,054	0	C→G	1.1%	11.5 ‑0.3 ‑0.6	1120	P201P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (6/6): ref base (492/615): total (499/621)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.75e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.81e-01

Only 100 of 1688 total aligned reads displayed.


TCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGT  >  NC_014034/221954‑222154


tgtgatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                      <  2:421737/98‑1 (MQ=11)


tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                                      <  2:4378221/99‑1 (MQ=11)


 ggggtccgtgggatcgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                                     >  1:3487813‑M1/65‑101 (MQ=255)


  gggtcgttgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                    >  2:4312334‑M1/64‑101 (MQ=255)


  gggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                    <  2:2329151/95‑1 (MQ=14)


   gatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGatcggtcgga                                                                                                   <  1:2535034‑M1/90‑2 (MQ=255)


    atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGat                                                                                                  >  1:1747933‑M2/1‑99 (MQ=255)


     tcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                                 <  1:4588683/101‑1 (MQ=14)


     caggtggggtccgtgggctcgttcgggcccgtgggatgGGTGGGGTCCGTTGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                                 <  1:4307997/99‑1 (MQ=11)


      cggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                                                <  1:1106284/101‑1 (MQ=11)


      cggtcgtgtccgtgggctccgtcggatccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                <  2:4468024/101‑1 (MQ=11)


      cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCGGTGGGGGCGGTCggggcg                                                                                                >  2:1611777/1‑98 (MQ=11)


        gtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                              >  1:4223082/7‑101 (MQ=11)


        gtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                              <  2:2394601/101‑1 (MQ=11)


        gacggctccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgt                                                                                              >  2:3200291‑M2/3‑95 (MQ=255)


         tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGtg                                                                                             >  2:1416017/1‑100 (MQ=14)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgg                                                                                            <  1:3995759‑M2/101‑9 (MQ=255)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGGCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGTTCCgggg                                                                                            >  2:1985202/1‑98 (MQ=14)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgg                                                                                            >  1:3396856‑M2/1‑93 (MQ=255)


          cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatacgtgg                                                                                            <  2:1202696‑M2/101‑9 (MQ=255)


          cggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGtccgcgg                                                                                            <  2:4660498‑M1/97‑4 (MQ=255)


           gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAATGGTCGGGTCCCTGGGGTCGGTCGGGCCCGTGgg                                                                                           >  1:4072422/1‑101 (MQ=11)


             gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGGTTGGTCGGGGCCGtggtcg                                                                                         >  1:992069/1‑96 (MQ=14)


             atcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAt                                                                                         >  1:7675‑M1/53‑101 (MQ=255)


              tcggtcggagccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAtc                                                                                        >  1:1051201‑M1/52‑101 (MQ=255)


              gcggagggaccggtgggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                        <  2:3116752/96‑1 (MQ=11)


              gccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                        <  1:1190850/100‑1 (MQ=14)


               ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGATCCGTGGGATCGCTTGGGTCCgcgtgatag                                                                                       >  2:1512624/1‑93 (MQ=14)


               ccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                       <  1:30024/101‑1 (MQ=11)


                cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcgg                                                                                      <  1:3842764‑M2/101‑15 (MQ=255)


                 gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggt                                                                                     <  2:2898035‑M2/101‑16 (MQ=255)


                 gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggt                                                                                     <  2:3714980‑M2/101‑16 (MQ=255)


                   gggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                                   >  1:4428133/1‑101 (MQ=11)


                    ggatccgtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                  <  2:722141/101‑1 (MQ=11)


                     gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggttgga                                                                                 <  2:475288‑M2/101‑20 (MQ=255)


                      gtcggtggggtccgtaggttcggtcggGTCCGTGGGGTCGGTTTGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt                                                                                <  1:2141614/100‑1 (MQ=11)


                      gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggt                                                                                >  1:4668117‑M2/2‑81 (MQ=255)


                       tcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcggatc                                                                               >  2:211510‑M2/1‑80 (MQ=255)


                       tcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGGACCGGGGGATTGgtcgggcc                                                                               >  2:3463216/1‑99 (MQ=11)


                       tcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                                               <  2:2498798/101‑1 (MQ=11)


                       tcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc                                                                               <  1:1564835/101‑1 (MQ=255)


                          gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgt                                                                            <  1:2209533‑M2/101‑25 (MQ=255)


                          gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggcccgt                                                                            <  1:2299983‑M2/101‑25 (MQ=255)


                          gtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgt                                                                            <  1:3202116/101‑1 (MQ=11)


                           tcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc                                                                           <  2:390780/101‑1 (MQ=11)


                           gggggtccgtgggatcggtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtg                                                                           >  1:2845022‑M2/3‑76 (MQ=255)


                             gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccggggg                                                                         >  2:2688918/1‑97 (MQ=11)


                             ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                         <  1:451098‑M1/65‑1 (MQ=255)


                             ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGggcggggccgtcgg                                                                         <  2:1365758‑M1/65‑1 (MQ=255)


                               atccgtgggatcggtcggGTCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGATGGATCGggcggatccgtcggac                                                                       >  2:192311/2‑99 (MQ=11)


                                tccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatc                                                                      <  2:653851/101‑1 (MQ=255)


                                  cgttggatcggtcggGTCCTTTGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcggatccgtggggtccg                                                                    <  2:3825718/101‑1 (MQ=14)


                                  cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                                                                    >  1:874046/1‑101 (MQ=14)


                                   gtgggctctggcggGTCCGTTGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgt                                                                   <  2:3265127/101‑1 (MQ=11)


                                   gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggt                                                                   >  1:2905390/1‑101 (MQ=11)


                                    tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc                                                                  <  1:2445331/101‑2 (MQ=11)


                                    tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtc                                                                  <  1:3734620‑M2/101‑35 (MQ=255)


                                    taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTg                                                                  >  1:3683001/3‑101 (MQ=14)


                                     gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                                                                 >  2:4166078/1‑99 (MQ=11)


                                     cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCTGTAGGATCGGTCGCGTCCGTCGGGTCCGGgg                                                                 >  1:3930411/11‑101 (MQ=11)


                                       ggtccggggggtcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa                                                               >  1:1459292‑M1/27‑101 (MQ=255)


                                        gtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                                                              >  1:496892‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                        atcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                              >  1:2601282‑M2/1‑63 (MQ=255)


                                         tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                             <  2:3362218/101‑1 (MQ=14)


                                          cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatcc                                                            <  2:2587251‑M2/101‑41 (MQ=255)


                                          cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc                                                            <  2:820988/101‑2 (MQ=11)


                                            gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTCGGCTCCGTGGGGtcggc                                                          >  1:3307279/4‑100 (MQ=14)


                                              gggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgggatcgtgcg                                                        <  2:1863264‑M1/82‑5 (MQ=255)


                                              cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcg                                                        >  2:410112/1‑101 (MQ=14)


                                              cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                        <  2:553441/101‑1 (MQ=14)


                                               gggcgcgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                       >  2:1050979‑M2/6‑56 (MQ=255)


                                                ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                                                      >  1:4356859/3‑100 (MQ=14)


                                                gatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa                                                      <  1:3097827‑M1/84‑1 (MQ=255)


                                                gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgggc                                                      >  2:2052796/1‑100 (MQ=11)


                                                      cgggaTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc                                                >  2:1133912‑M2/2‑49 (MQ=255)


                                                         gATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                             <  1:4167757‑M2/101‑56 (MQ=255)


                                                         gATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa                                             >  2:927135/1‑101 (MQ=14)


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                                                            ccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                          >  1:1266462‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                             ggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg                                         <  2:3004558‑M2/101‑60 (MQ=255)


                                                             ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg                                         >  2:3539751/1‑101 (MQ=17)


                                                              gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgg                                        <  1:358186‑M2/101‑61 (MQ=255)


                                                                cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtag                                      >  1:584058‑M2/1‑39 (MQ=255)


                                                                 gggTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtagg                                     >  1:1860933‑M2/1‑38 (MQ=255)


                                                                   gTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggat                                   >  1:2356442‑M2/1‑36 (MQ=255)


                                                                    tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                  <  2:363914‑M2/101‑67 (MQ=255)


                                                                     gcgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg                                 >  1:683724‑M2/2‑34 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggcagggtcggtgggatcggt                               <  2:2817004‑M2/101‑70 (MQ=255)


                                                                       gTGGGAGCGGTCGGGTCGGTGGGGTCTGGGGGGTCCGGAGGAGCGGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                               <  1:2013303/101‑1 (MQ=17)


                                                                        gcggctcgggcggATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTg                              <  2:2253517/96‑1 (MQ=14)


                                                                         gggATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                             <  2:2175771/101‑1 (MQ=255)


                                                                                 tcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                     <  1:2074406/101‑8 (MQ=11)


                                                                                   gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                   <  1:195697‑M2/101‑82 (MQ=255)


                                                                                    ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggt                  <  1:1363606‑M2/99‑83 (MQ=255)


                                                                                    ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa                  >  1:1000596/3‑101 (MQ=255)


                                                                                    gATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGCGGGTCGGTgggatcgggcggg                  >  2:4584257/1‑91 (MQ=11)


                                                                                          tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggtatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc            >  2:1725609‑M2/1‑13 (MQ=255)


                                                                                          tGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGGtcggtc            >  1:16866/1‑101 (MQ=255)


                                                                                             gatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggga         <  2:1268888‑M2/101‑92 (MQ=255)


                                                                                                 ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGc     >  1:27091/1‑101 (MQ=255)


TCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGT  >  NC_014034/221954‑222154

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG