BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,057	G→A	10.2%	D200D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,057	0	G→A	10.2%	172.7 ‑2.2 0.0	753	D200D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (25/52): ref base (285/390): total (311/442)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.12e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 1016 total aligned reads displayed.


GATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGC  >  NC_014034/221957‑222157


gttcggtcgggtcggtcggatccgtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                                                                      <  2:1018240/99‑1 (MQ=1)


gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcgGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCggg                                                                                                      <  2:2167918/101‑1 (MQ=11)


gagaggtcgggtcggtgggattcggcgggtgcgtgtgatcGGTCGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCggg                                                                                                      <  1:205989/97‑1 (MQ=11)


 atcggttgggtccgggggatcggtcgggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                                     <  1:774913/101‑1 (MQ=11)


  tcggtgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                                    >  1:3028671/1‑101 (MQ=11)


  tcggtcggaacggtggggcgggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                                    <  2:4391384/101‑1 (MQ=11)


   tggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTGGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   <  2:2368785/100‑1 (MQ=11)


   gggtcgggtccggtgtatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGTTCGGTCGGATcc                                                                                                   <  2:3514465/100‑1 (MQ=11)


   gcggggggtccgtgggagcggtggggtccgtgggatcggtgGGGTGGGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                                                                                   <  1:4290622/96‑1 (MQ=2)


   cggtggggtgcgtgggagcggtcgggtacgtgggatCGGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   <  1:4192428/101‑1 (MQ=14)


   cggtgggacccgggggatgggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGGCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   <  1:3946449/92‑1 (MQ=11)


   cggtcgtgtccgtgggctccgtcggatccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   <  2:4468024/101‑1 (MQ=11)


   cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGCCGGTGGGTTCGGTGGGGTCGTGCggggcg                                                                                                   >  2:3399772/1‑98 (MQ=11)


    gggggtgtccgtgggatcggtcgggtccgttggatccgtcggGTCTGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                                  <  1:4556089/95‑1 (MQ=11)


     gtcgggggcgtggggtgggtcgggtccgggggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                                 <  1:3249859/101‑1 (MQ=11)


       cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCTGtgg                                                                                               >  1:3324314/1‑99 (MQ=11)


       cggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGtccgcgg                                                                                               <  2:4660498‑M1/97‑4 (MQ=255)


        gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGgg                                                                                              >  1:4439363/1‑101 (MQ=14)


        gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                                                              >  1:675418/1‑101 (MQ=11)


        ggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGgg                                                                                              >  1:4630226/4‑101 (MQ=11)


         ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGACGGAACCGGGGGATCGGTCGGGTcgggcggt                                                                                             >  2:3874522/1‑94 (MQ=14)


         ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtggGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGGCGGGTCCGTGggg                                                                                             >  2:1943135/1‑100 (MQ=11)


         gaTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGa                                                                                             >  1:3717328‑M1/3‑101 (MQ=255)


          gtgcgggggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                            <  1:1860585/95‑1 (MQ=11)


          gtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGGCCGTGGGAGGGGTCGGGGCCGtggtcg                                                                                            >  2:3249658/1‑96 (MQ=11)


            cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGAGGAtcg                                                                                          <  1:1737681‑M1/51‑1 (MQ=255)


            cgctgggatcgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGCATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                          <  2:546619/98‑1 (MQ=11)


            ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGAGGTCGGTAGGGTCGGtgtggtgg                                                                                          >  2:2646427/1‑94 (MQ=11)


             cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGGCGGGGCGGTGGGAtcgg                                                                                         >  2:1708108/1‑101 (MQ=1)


             cgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtccg                                                                                         <  2:4112167/101‑3 (MQ=11)


              gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                        >  2:2307961/1‑101 (MQ=11)


              gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATGGGTCGGATCCGTGGGATCGATCGCATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggt                                                                                        >  1:4054163/1‑101 (MQ=14)


              gggggatctgtcgggttcgtcgggtcggtcgtATCCTGGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                        <  2:1827921/99‑1 (MQ=11)


                  gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcggg                                                                                    >  2:600853‑M1/45‑101 (MQ=255)


                    tgtgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc                                                                                  <  1:2587403/98‑1 (MQ=14)


                     ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc                                                                                 <  1:1553634‑M1/60‑1 (MQ=255)


                      ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAACGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTCGGATCGgtcgggtccg                                                                                >  2:3159523/1‑101 (MQ=11)


                      ggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGTGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg                                                                                >  1:1352460/1‑101 (MQ=14)


                       gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGACCGggcgggtcagg                                                                               >  2:1359750/1‑98 (MQ=11)


                       gtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGAACCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggggcagt                                                                               >  1:3825953/1‑96 (MQ=14)


                        tcgggtccgtgggaacggtcggACCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg                                                                              <  2:4066906/101‑2 (MQ=11)


                        tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggggccgtc                                                                              >  2:1190760/1‑101 (MQ=11)


                         cgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgg                                                                             >  1:4072906/1‑99 (MQ=11)


                          gggtccgtggggtcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                                                                            <  1:1202786/101‑1 (MQ=14)


                          gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGGTAGGTGGGGTCTGTGGGAtcagtgggaaacggggg                                                                            >  2:1504501/1‑92 (MQ=11)


                          gggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                                                            <  1:53776/101‑1 (MQ=11)


                          gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                            <  2:3635098/101‑1 (MQ=11)


                          ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                                                                            <  1:1935548/98‑1 (MQ=255)


                                gtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcggggccgtggggtgcgg                                                                      >  2:917942/1‑100 (MQ=11)


                                gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggtccgtcgggtccgt                                                                      <  2:2250265/98‑1 (MQ=11)


                                 tgggatcggtcggGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc                                                                     <  2:675354/101‑2 (MQ=11)


                                 taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtggggtccgtcggggccggg                                                                     >  2:2746207/3‑99 (MQ=11)


                                 taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTg                                                                     >  1:3683001/3‑101 (MQ=14)


                                  gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                                                                    <  2:425937/101‑3 (MQ=11)


                                  gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtcg                                                                    >  2:4166078/1‑99 (MQ=11)


                                  gggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                    <  1:2238764/101‑1 (MQ=11)


                                    ggtccgtgggatccgtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa                                                                  >  2:1294716‑M1/27‑101 (MQ=255)


                                    gatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa                                                                  >  2:1885251/1‑101 (MQ=14)


                                     gtcggtcggGTCCGTGGGATCGGGCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt                                                                 <  2:4601938/100‑1 (MQ=11)


                                     atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt                                                                 >  1:3488324/1‑101 (MQ=11)


                                     atcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggt                                                                 >  2:395320/1‑99 (MQ=11)


                                        cgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccg                                                              <  2:2430799/100‑3 (MQ=11)


                                         gtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGgtcggg                                                             <  2:2120756‑M1/80‑2 (MQ=255)


                                         gtgggatcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGatcggc                                                             <  2:3464772‑M1/80‑2 (MQ=255)


                                          tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtg                                                            >  1:2311802/1‑100 (MQ=11)


                                           cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCTGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcgggag                                                           >  1:2390850/1‑98 (MQ=17)


                                           cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg                                                           >  1:1449835/1‑99 (MQ=11)


                                            ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGGTCCGTTTGAtccgtggg                                                          >  1:1138940/1‑101 (MQ=11)


                                             ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg                                                         >  1:4356859/3‑100 (MQ=14)


                                             gATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgggg                                                         >  2:3696882/1‑100 (MQ=11)


                                               tcggtcggatccgtgGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                       <  1:1049475‑M1/86‑1 (MQ=255)


                                                   taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGtc                                                   >  2:4752290/3‑100 (MQ=14)


                                                   ggggACCGGTCCGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                   <  2:793280/100‑1 (MQ=14)


                                                        tcggtcggGTCCGTCGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                              <  2:2875952/101‑1 (MQ=14)


                                                        tccgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCCGAGCCGGGGGagc                                              >  2:734934/7‑99 (MQ=17)


                                                            ncggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGGCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGGtcgggc                                          >  1:94156/2‑99 (MQ=14)


                                                                 tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                     <  1:3159723/101‑1 (MQ=255)


                                                                    gTGGGAGCGGTCGGGTCGGTGGGGTCTGGGGGGTCCGGAGGAGCGGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                  <  1:2013303/101‑1 (MQ=17)


                                                                     tcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTg                                 >  1:294804/3‑101 (MQ=18)


                                                                     tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                 <  2:205849/101‑1 (MQ=255)


                                                                      cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTCGGGTCCGTgg                                >  2:106404/2‑101 (MQ=17)


                                                                         aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGc                             >  2:3078381/1‑101 (MQ=255)


                                                                           cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGGggggtcg                           >  2:2541955/1‑98 (MQ=17)


                                                                           cggtcggATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTGCGTCGGAACGGTGGGGTGCATgggatcg                           >  2:1588049/1‑97 (MQ=9)


                                                                            ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtgg                          >  1:3406829/1‑101 (MQ=255)


                                                                             gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGGTCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggt                         <  1:2467737/101‑1 (MQ=255)


                                                                               cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtgg                       >  2:3749841/1‑101 (MQ=255)


                                                                                gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTggg                      >  2:3336104/4‑101 (MQ=255)


                                                                                 ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa                     >  1:1000596/3‑101 (MQ=255)


                                                                                    ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcg                  >  2:2970874/1‑101 (MQ=255)


                                                                                     cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtagg                 >  1:4711662/1‑101 (MQ=255)


                                                                                       tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtc               <  2:4334630/101‑1 (MQ=18)


                                                                                       tGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGGtcggtc               >  1:16866/1‑101 (MQ=255)


                                                                                       tGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtc               >  1:2801446/1‑101 (MQ=255)


                                                                                       tGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGGTGGGGGGAtcggtc               >  1:3570542/1‑101 (MQ=255)


                                                                                            ttggtcggGTCCGGAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAcc          <  1:2149764/99‑1 (MQ=255)


                                                                                              ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGc        >  1:27091/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                 cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGCCCGCTGt     >  2:1412030/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                 cggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGt     <  2:2016188/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                  gggTCCGTAGGGTCCGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTc    <  2:1135740/101‑1 (MQ=255)


GATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGC  >  NC_014034/221957‑222157

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG