Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 678,567 | C→G | 3.1% | S1680S (TCG→TCC) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 678,567 | 0 | C→G | 3.1% | 3.3 ‑1.0 ‑0.0 | 157 | S1680S (TCG→TCC) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/1): ref base (80/72): total (84/73) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.73e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
CGTGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCA > NC_014034/678468‑678667
|
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gTGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGa < 2:1086307/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGAc < 2:1978170/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGAc < 2:906031/101‑1 (MQ=255)
cgcCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGcgccg < 2:38307/101‑1 (MQ=255)
ccGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGGGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCcgcg > 1:3302915/1‑101 (MQ=255)
tggAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGa > 1:983369/2‑101 (MQ=255)
gAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGAcc > 2:39666/1‑101 (MQ=255)
aaTGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCt < 1:2548400/101‑1 (MQ=255)
aaTGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCt > 2:2267297/1‑101 (MQ=255)
aaTGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCCCGACCt > 1:775292/1‑101 (MQ=255)
aTGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTg < 2:1504886/101‑1 (MQ=255)
aTGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTg < 2:4084838/101‑1 (MQ=255)
tGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTgc > 2:4480393/1‑101 (MQ=255)
gACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTgcg > 1:1797949/1‑101 (MQ=255)
gACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCGGCGCCGTGCCAACGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGGGACCGCCGCGCCCGACCGCGCCGCGACCTgcg > 1:3212873/1‑101 (MQ=255)
aCCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTgcgc > 1:3182212/1‑101 (MQ=255)
aCCGCCCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTgcgc < 1:4412591/101‑1 (MQ=255)
cagagcTACCCACCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGcc < 2:388071/97‑1 (MQ=255)
gcTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGc > 2:3812654/1‑101 (MQ=255)
cTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCt > 2:4221149/1‑101 (MQ=255)
gCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCa > 2:1209747/1‑101 (MQ=255)
gCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCa > 1:1012659/1‑101 (MQ=255)
ccAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAgc < 1:1416792/101‑1 (MQ=255)
ccAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAgc > 2:2565029/1‑101 (MQ=255)
ccAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAgc > 2:1401444/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGcgccgc < 1:1390997/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGcgccgc < 1:3573757/101‑1 (MQ=255)
ccgcGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCcgcg > 2:2020778/1‑101 (MQ=255)
gcgATCTGCGCCGCGCTCAGCGCCGCGATCTGCGCCGAGCCGAGCCCGCCGACCGCGGCACTGGCCAGCGCCGCGACCTGATCGGTGCCCAgactggccag > 2:589489/1‑92 (MQ=2)
gcgATCTGCGCCGCGCTCAGCGCCGCGATCTGCGCCGAGCCGAGCCCGCCGACCGCGGCACTGGCCAGCGCCGCGACCTGATCGGTGCCCAgactggccag > 2:2905860/1‑92 (MQ=0)
gcgATCTGCGCCGCGCTCAGCGCCGCGATCTGCGCCGAGCCGAGCCCGCCGACCGCGGCACTGGCCAGCGCCGCGACCTGATCGGTGCCCAgactggccag > 1:3954396/1‑92 (MQ=2)
gATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACtt < 2:3302713/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACtt > 2:1288984/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACttc > 2:1138684/1‑100 (MQ=255)
aTCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTg > 1:1315185/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTg > 1:775329/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCcg > 1:1942760/1‑101 (MQ=255)
cgcCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAACCGAGCGCGATGACCGCCGCGCTCGGCAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCcgcg < 1:4714607/101‑1 (MQ=255)
ccGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGcgtc > 2:156346/1‑101 (MQ=255)
cGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGcgtcg > 2:2806232/1‑101 (MQ=255)
cGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGcgtcg < 2:37327/101‑1 (MQ=255)
tGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCgtcgtc > 2:2714716/1‑101 (MQ=255)
ctccAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCgtcgtc < 1:1706556/99‑1 (MQ=255)
gCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCa < 1:2756800/101‑1 (MQ=255)
gCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCCCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCa < 1:3993649/101‑1 (MQ=255)
gCCAAAGGCCCCTAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGCCCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCa < 1:2266309/101‑1 (MQ=255)
ccAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAg > 2:1679108/1‑101 (MQ=255)
ccAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAg > 1:2047146/1‑101 (MQ=255)
cAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCTGCGACTTGCCGCGTCGTCAGc < 1:2702788/101‑1 (MQ=255)
aaaGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGcc > 2:1393658/1‑101 (MQ=255)
aaaGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGcc > 2:1343996/1‑101 (MQ=255)
aaaGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGcc < 1:2053511/101‑1 (MQ=255)
aaGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGccc > 2:1403453/1‑101 (MQ=255)
aaGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGccc > 1:719109/1‑101 (MQ=255)
aaGCCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGccc < 2:1652794/101‑1 (MQ=255)
aGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGcccc < 1:617972/101‑1 (MQ=255)
cctccAGCTGCGCCGATCCGAGCGCGGTGTCCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGTCCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCa < 2:775218/98‑1 (MQ=38)
ccgccAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCa > 1:2862646/1‑101 (MQ=255)
ccgccAGCTCCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCa < 2:1045788/101‑1 (MQ=255)
cgccAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCaa > 2:1767307/1‑101 (MQ=255)
cgccAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCaa < 2:1315093/101‑1 (MQ=255)
gccAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAAt < 1:2420851/101‑1 (MQ=255)
ccAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATc < 1:3830332/101‑1 (MQ=255)
cAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcg < 1:1138770/101‑1 (MQ=255)
agccggggccgagccgaACGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcg < 2:2462463/94‑1 (MQ=255)
aGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgc > 1:2474390/1‑101 (MQ=255)
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gCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgcc < 1:3759724/101‑1 (MQ=255)
gCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgcc > 2:244065/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgccg < 1:1056500/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACGTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgccgc > 2:798496/1‑101 (MQ=255)
cgcCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCgcgc < 1:1767416/101‑1 (MQ=255)
gccgagccgaGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCt > 1:4257299/1‑101 (MQ=255)
gccgagccgaGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCt > 1:3752573/1‑101 (MQ=255)
ccgagccgagCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTg > 2:37816/1‑101 (MQ=255)
gagccgagcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTggc > 2:609811/1‑100 (MQ=255)
agccgagcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTc > 1:228306/1‑101 (MQ=255)
cgagcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGc > 1:2216770/1‑101 (MQ=255)
cgagcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGc > 1:1459956/1‑101 (MQ=255)
cgagcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGc < 1:3293689/101‑1 (MQ=255)
agcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCcg < 2:2478566/101‑1 (MQ=255)
agcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCcg < 1:1988738/101‑1 (MQ=255)
cgcgGTACCCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCcgcg < 2:3212672/101‑1 (MQ=255)
ggTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGa > 2:1682005/1‑101 (MQ=255)
gTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGACCCGCAATCCGCGCGCTGGGCAGCCGCGCGAt > 2:3111599/1‑101 (MQ=38)
gTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGGGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCTGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGAt < 2:1145002/101‑1 (MQ=255)
ccgccgCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTgc < 2:2047025/101‑1 (MQ=255)
cgccgcGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTgcg > 2:69359/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTgcg < 1:3245529/101‑1 (MQ=255)
cgcTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTg < 1:2632907/101‑1 (MQ=255)
cgcTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTg < 2:1884661/101‑1 (MQ=255)
gcTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTgg > 1:2465741/1‑101 (MQ=255)
tCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTc > 1:577535/1‑101 (MQ=255)
tCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTc < 2:2699220/101‑1 (MQ=255)
tCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTc < 1:1907502/101‑1 (MQ=255)
tCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTc < 2:1740625/101‑1 (MQ=255)
cGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCa > 1:256185/1‑101 (MQ=255)
cGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCa > 1:2967695/1‑101 (MQ=255)
cGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCa > 1:4152395/1‑101 (MQ=255)
|
CGTGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCA > NC_014034/678468‑678667
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 39 ≤
ATCG
|