Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 678,569 | A→C | 3.2% | S1680A (TCG→GCG) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 678,569 | 0 | A→C | 3.2% | 5.4 ‑1.0 ‑0.4 | 158 | S1680A (TCG→GCG) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/1): ref base (82/70): total (86/72) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.79e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.44e-01 |
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GTGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCAGG > NC_014034/678469‑678669
|
gTGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGa > 2:3759489/1‑101 (MQ=255)
gTGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGa < 2:1086307/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGAc < 2:906031/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGAc < 2:1978170/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGAc < 1:3269424/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACa > 1:1371986/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACa < 1:526122/101‑1 (MQ=255)
cgcCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGcgccg < 2:38307/101‑1 (MQ=255)
ccGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGGGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCcgcg > 1:3302915/1‑101 (MQ=255)
tggAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGa > 1:983369/2‑101 (MQ=255)
cGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGa > 2:2798608/1‑101 (MQ=255)
gAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGAcc > 2:39666/1‑101 (MQ=255)
aaTGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCt > 2:2267297/1‑101 (MQ=255)
aaTGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCt < 1:2548400/101‑1 (MQ=255)
aTGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTg < 2:4084838/101‑1 (MQ=255)
aTGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTg > 2:2497404/1‑101 (MQ=255)
tGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTgc > 2:4480393/1‑101 (MQ=255)
gACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTgcg > 1:1797949/1‑101 (MQ=255)
gACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTgcg > 1:454357/1‑101 (MQ=255)
gACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCGGCGCCGTGCCAACGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGGGACCGCCGCGCCCGACCGCGCCGCGACCTgcg > 1:3212873/1‑101 (MQ=255)
gcTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGc > 2:3812654/1‑101 (MQ=255)
gcTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGATGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGc > 2:2420716/1‑101 (MQ=255)
gCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCa > 2:1209747/1‑101 (MQ=255)
gCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCa < 1:3622925/101‑1 (MQ=255)
gCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCa < 2:3835857/101‑1 (MQ=255)
gCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCa > 1:1012659/1‑101 (MQ=255)
ccAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAgc < 1:1416792/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAgcg < 2:1674282/101‑1 (MQ=255)
cggcgcgATCTGCGCCGCGCTCAGCGCCGCGATCTGCGCCGAGCCGAGCCCGCCGACCGCGGCACTGGCCAGCGCCGCGACCTGATCGGTGCCCAgactgg > 1:2714021/4‑96 (MQ=2)
gccgcGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGcgccgc < 1:1390997/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGcgccgc < 1:3573757/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGAc > 2:1990450/1‑101 (MQ=255)
gcgATCTGCGCCGCGCTCAGCGCCGCGATCTGCGCCGAGCCGAGCCCGCCGACCGCGGCACTGGCCAGCGCCGCGACCTGATCGGTGCCCAgactggccag > 2:2905860/1‑92 (MQ=0)
gATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACtt > 2:1288984/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACtt < 2:3302713/101‑1 (MQ=255)
aTCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACttc > 2:1138684/1‑100 (MQ=255)
aTCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTg > 1:775329/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGcc > 2:4211881/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCcg > 1:1942760/1‑101 (MQ=255)
gcCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGcgt < 1:1883959/101‑1 (MQ=255)
ccGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGcgtc > 2:156346/1‑101 (MQ=255)
cGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGTCGcgtcg > 1:2265091/1‑101 (MQ=255)
cGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGcgtcg > 2:1485929/1‑101 (MQ=255)
cGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGcgtcg < 2:37327/101‑1 (MQ=255)
tGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCgtcgtc > 1:3124276/1‑101 (MQ=255)
tGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCgtcgtc > 2:2714716/1‑101 (MQ=255)
ctccAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCgtcgtc < 1:1706556/99‑1 (MQ=255)
gcaaaaGTCCGCAAGCTGCGCCGAGCCGAGCTCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCa < 1:1562186/98‑1 (MQ=38)
gCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCa < 2:1044561/101‑1 (MQ=255)
gCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCCCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCa < 1:3993649/101‑1 (MQ=255)
ccAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAg < 2:1402224/101‑1 (MQ=255)
cAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCTGCGACTTGCCGCGTCGTCAGc < 1:2702788/101‑1 (MQ=255)
cAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGc > 1:725727/1‑101 (MQ=255)
aaaGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGcc > 2:1343996/1‑101 (MQ=255)
aaaGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGcc > 2:1393658/1‑101 (MQ=255)
aaaGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGcc < 1:2053511/101‑1 (MQ=255)
aaGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGccc > 1:719109/1‑101 (MQ=255)
aaGCCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGccc < 2:1652794/101‑1 (MQ=255)
aGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGcccc < 1:617972/101‑1 (MQ=255)
ccgccAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCa > 1:2862646/1‑101 (MQ=255)
cgccAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCaa < 1:1990567/101‑1 (MQ=255)
cgccAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCaa < 2:1315093/101‑1 (MQ=255)
gccAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAAt < 1:2420851/101‑1 (MQ=255)
ccAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATc < 1:3830332/101‑1 (MQ=255)
cAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcg < 1:1138770/101‑1 (MQ=255)
agccggggccgagccgaACGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcg < 2:2462463/94‑1 (MQ=255)
aGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgc > 1:2474390/1‑101 (MQ=255)
gCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgcc < 2:4251601/101‑1 (MQ=255)
gCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgcc < 1:3759724/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgccg > 1:2462570/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgccg < 1:1056500/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgccgc > 1:2553325/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACGTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATcgccgc > 2:798496/1‑101 (MQ=255)
cgcCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCgcgc < 1:1767416/101‑1 (MQ=255)
gccgagccgaGGGCGGTGACCGCCGCGTTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCt > 2:3159974/1‑101 (MQ=255)
gccgagccgaGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCt > 1:4257299/1‑101 (MQ=255)
gagccgagcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTggc > 2:609811/1‑100 (MQ=255)
agccgagcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTc > 1:228306/1‑101 (MQ=255)
cgagcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGc > 1:2216770/1‑101 (MQ=255)
agcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCcg < 2:2478566/101‑1 (MQ=255)
agcGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCcg < 1:1988738/101‑1 (MQ=255)
gcgGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCcgcgc < 2:1742900/101‑1 (MQ=255)
ggTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGa > 2:1682005/1‑101 (MQ=255)
gTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGAt < 2:4535538/101‑1 (MQ=255)
gTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGACCCGCAATCCGCGCGCTGGGCAGCCGCGCGAt > 2:3111599/1‑101 (MQ=38)
gTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGGGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCTGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGAt < 2:1145002/101‑1 (MQ=255)
gACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCt < 1:3952369/101‑1 (MQ=255)
ccgccgCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTgc < 2:2047025/101‑1 (MQ=255)
cgccgcGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTgcg < 2:719036/101‑1 (MQ=255)
cgccgcGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTgcg > 2:69359/1‑101 (MQ=255)
cgccgcGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTgcg < 1:3245529/101‑1 (MQ=255)
cgcTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTg < 2:1884661/101‑1 (MQ=255)
cgcTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTg < 1:2632907/101‑1 (MQ=255)
tCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTc < 2:1740625/101‑1 (MQ=255)
tCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTc < 2:2699220/101‑1 (MQ=255)
cGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCa > 1:2967695/1‑101 (MQ=255)
cGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCa > 1:4152395/1‑101 (MQ=255)
gACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCAg < 1:4740653/101‑1 (MQ=255)
gACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCAg > 2:1388378/1‑101 (MQ=255)
aCAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCAgg > 2:1435040/1‑101 (MQ=255)
|
GTGGTCAGCGCCGGAATGACCGCGCTGCCCAGCGCCGCGATCTGCGCCGTGCCAAAGGCCGCCAGCTGCGCCGAGCCGAGCGCGGTGACCGCCGCGCTCGACAGCGCCGCGACCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCGACTTGCCGCGTCGTCAGCCCCGCAATCGCCGCGCTGGTCAGCCGCGCGATCTGCGCCGTGGTCAGG > NC_014034/678469‑678669
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|