Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 681,471 | G→C | 21.0% | T712T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 681,471 | 0 | G→C | 21.0% | 100.2 ‑3.2 ‑0.2 | 207 | T712T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (16/27): ref base (89/73): total (106/101) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.14e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.29e-01 |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
CGCCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCA > NC_014034/681371‑681571
|
cTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTc > 2:3110101/1‑101 (MQ=255)
tGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCa < 2:341932/101‑1 (MQ=255)
tGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCa < 2:1013222/101‑1 (MQ=255)
gAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAg > 1:2196410/1‑101 (MQ=255)
aaaGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAgc < 1:1960564/101‑1 (MQ=255)
aaaGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAgc < 1:4642062/101‑1 (MQ=255)
aGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAgcgc > 1:4718585/1‑101 (MQ=255)
gCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.t < 1:2003158/101‑1 (MQ=255)
cgaTCTTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.Tc < 1:1636810/99‑1 (MQ=255)
ccATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.Tc > 1:2815165/1‑101 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCt < 1:4342142/101‑1 (MQ=255)
cATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCt < 1:4662578/101‑1 (MQ=255)
aTCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTg > 2:3594988/1‑101 (MQ=255)
aTCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTg > 1:1130143/1‑101 (MQ=255)
tCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.agatcg < 2:4024827/101‑6 (MQ=255)
tCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTgc < 2:670652/101‑1 (MQ=255)
gTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTgcgc > 2:4254391/1‑101 (MQ=255)
gTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTgcgc > 1:3258451/1‑101 (MQ=255)
ggCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGTCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCg < 1:811363/101‑1 (MQ=255)
ggCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCg > 1:1016974/1‑101 (MQ=255)
gCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGa > 1:2906909/1‑101 (MQ=255)
gCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGa < 1:3878016/101‑1 (MQ=255)
cGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGc > 1:1709621/1‑101 (MQ=255)
cGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGc > 1:2726182/1‑101 (MQ=255)
gAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGcc > 1:126515/1‑101 (MQ=255)
gcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCa < 1:1746313/101‑1 (MQ=255)
cccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAg > 1:4376953/1‑101 (MQ=255)
cccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGAcgcg > 2:3316963/1‑101 (MQ=255)
ccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACgcgc < 1:3848647/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgc < 1:901284/101‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcg < 2:1060608/101‑1 (MQ=255)
tCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgcc < 2:4579189/101‑3 (MQ=255)
cgcgCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcg < 1:3983329/101‑1 (MQ=255)
cgcgCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcg > 2:4631046/1‑101 (MQ=255)
cggtGATTTGCGCCAGTTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCTATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgttgtc < 2:2435431/98‑1 (MQ=21)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc > 1:2637116/1‑101 (MQ=255)
cgcTGATCGGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc < 2:2196286/101‑1 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa > 2:1369879/1‑101 (MQ=255)
gggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAg < 2:3790946/91‑1 (MQ=2)
tGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc > 2:1672570/1‑101 (MQ=255)
gagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg < 2:1264514/93‑1 (MQ=2)
gagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg < 1:3384721/93‑1 (MQ=2)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 2:3848803/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 1:1369973/101‑1 (MQ=255)
caccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGa < 2:3302928/99‑1 (MQ=9)
accAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 1:984012/100‑1 (MQ=2)
cAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt > 1:2452113/1‑101 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa < 2:3946993/101‑1 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTAAt > 2:1646819/1‑101 (MQ=255)
ccgccgCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCg > 2:2667852/1‑101 (MQ=255)
cgccgcCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 1:1219475/1‑101 (MQ=255)
cggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTg > 2:3532720/9‑101 (MQ=9)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc < 2:4119962/94‑1 (MQ=9)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc < 1:2090106/94‑1 (MQ=9)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc > 2:2908168/8‑101 (MQ=9)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc > 2:4737815/7‑101 (MQ=9)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc > 1:4741115/7‑101 (MQ=9)
tttccaGCGCCGCAGCCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccg < 2:3093756/96‑2 (MQ=9)
tttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccg < 2:3466386/96‑2 (MQ=9)
ttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccga > 2:2309584/5‑99 (MQ=9)
ttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccga > 1:1565832/5‑99 (MQ=9)
cTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaa < 2:1709516/101‑1 (MQ=255)
cTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaa > 1:4282807/1‑101 (MQ=255)
tccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgag > 2:2619696/4‑98 (MQ=2)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGGGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGAAGCCCCCCCTGCGCCGGCCTCGGCGCCACGATGACATCGGTTCCaaa > 2:2375335/1‑101 (MQ=25)
cggatcatggcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa > 2:1176306/10‑101 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg > 2:2768087/1‑101 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg < 1:3833270/101‑1 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc > 2:4309115/1‑101 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc < 2:4341185/101‑1 (MQ=255)
caGCGCCGCAACCGGCGTGCTAGACAGCGC.CAG.AGGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc < 2:640729/100‑6 (MQ=2)
aGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGcc > 1:4110491/1‑101 (MQ=255)
aGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGcc < 2:4158643/101‑1 (MQ=255)
cgccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccct < 1:648886/101‑3 (MQ=9)
ccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcccttg < 1:1694970/101‑5 (MQ=2)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt > 2:3148797/1‑101 (MQ=255)
cgATCTGCGTGCGGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATc < 2:539470/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCGAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 2:725484/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 1:2570581/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg > 1:1175207/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgc > 2:4664536/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgc > 2:2834675/1‑101 (MQ=255)
cTGCGTGCTCGACAGCGC.CAGAA.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCCCTTGATcgcat > 2:1937268/1‑99 (MQ=2)
tGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgccgc < 2:4636776/101‑1 (MQ=255)
gCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCgccgcc > 2:1794634/1‑101 (MQ=255)
cGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGccgccg > 2:4086839/1‑101 (MQ=255)
cGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGccgccg < 1:509934/101‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt < 2:4458266/101‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt > 2:1555431/1‑101 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGTGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCAAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg < 1:4059472/101‑1 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 1:1643301/1‑101 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 1:3727914/1‑101 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 2:235040/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCTCCGAGCCCAGACGCACCGCCTGGGCGGTCGCCAGCGCCACGATGTCATCGGTGGCAAAGCCTTGGATCGCCGCCGTGccc < 2:250019/101‑1 (MQ=25)
tGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGccc < 1:2365085/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGccc < 1:2668006/101‑1 (MQ=255)
tGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGCGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGccc > 2:3264522/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 1:2062363/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa > 2:507516/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa > 1:2608189/1‑101 (MQ=255)
|
CGCCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCA > NC_014034/681371‑681571
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|