Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 681,491 | C→T | 22.3% | A706T (GCG→ACG) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 681,491 | 0 | C→T | 22.3% | 127.3 ‑3.5 0.0 | 210 | A706T (GCG→ACG) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (16/31): ref base (86/77): total (102/108) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.09e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCG > NC_014034/681391‑681589
|
gTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTgcgc > 1:3258451/1‑101 (MQ=255)
gTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTgcgc < 1:1640554/101‑1 (MQ=255)
ggCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCg > 1:1016974/1‑101 (MQ=255)
ggCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCg > 2:304737/1‑101 (MQ=255)
ggCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGAGCCg < 2:4017818/101‑1 (MQ=255)
gCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGa > 1:2906909/1‑101 (MQ=255)
gCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGa < 1:3878016/101‑1 (MQ=255)
cGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGc > 1:2726182/1‑101 (MQ=255)
gAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGcc > 2:4059230/1‑101 (MQ=255)
gcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCa > 2:1895284/1‑101 (MQ=255)
gcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCa < 1:1746313/101‑1 (MQ=255)
cccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAg > 1:4376953/1‑101 (MQ=255)
ccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGa < 1:1554873/101‑1 (MQ=255)
cccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGAcgcg > 2:3833035/1‑101 (MQ=255)
cccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGAcgcg > 2:3316963/1‑101 (MQ=255)
ccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACgcgc < 1:3848647/101‑1 (MQ=255)
ggAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGcgccg < 2:467954/101‑1 (MQ=255)
gagaGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGcgccgc > 1:1692907/1‑101 (MQ=255)
gagaGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGcgccgc > 2:1291037/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgc > 1:2628432/1‑101 (MQ=255)
ccGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGAGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGcc < 2:4558929/101‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcg < 2:1060608/101‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGACCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcg > 2:3100594/1‑101 (MQ=255)
cgcgCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcg < 1:3983329/101‑1 (MQ=255)
cgcgCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcg > 2:1517549/1‑101 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa < 2:3293948/101‑1 (MQ=255)
ggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 2:3440122/92‑1 (MQ=2)
ggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 1:4742664/92‑1 (MQ=2)
gagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg < 2:1264514/93‑1 (MQ=2)
gagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg < 1:3384721/93‑1 (MQ=2)
aTCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcgc > 2:1740547/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGACAGCGcc > 2:2570429/1‑101 (MQ=255)
gccgccccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 2:2086493/95‑1 (MQ=2)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa < 2:2906733/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGGTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 2:4594053/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc > 2:2810807/1‑101 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt > 1:2452113/1‑101 (MQ=255)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc > 2:2433586/1‑101 (MQ=255)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc > 1:2691703/1‑101 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa < 1:2654212/101‑1 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAt < 2:2448470/101‑1 (MQ=255)
ccgccgCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCg > 2:2667852/1‑101 (MQ=255)
ccgccgCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCg > 1:250044/1‑101 (MQ=255)
ccgccgCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCg > 1:837536/1‑101 (MQ=255)
cgccgcCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 1:1219475/1‑101 (MQ=255)
gcggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGt < 2:3262802/92‑1 (MQ=9)
cggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTg > 2:3532720/9‑101 (MQ=9)
ccgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTg > 2:2750991/1‑101 (MQ=255)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc < 1:2012253/94‑1 (MQ=9)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc < 1:2090106/94‑1 (MQ=9)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc > 2:4737815/7‑101 (MQ=9)
ttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccga > 2:2309584/5‑99 (MQ=9)
cTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaa > 2:4319929/1‑101 (MQ=255)
cTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaa > 1:4282807/1‑101 (MQ=255)
cTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaa < 2:1709516/101‑1 (MQ=255)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 2:625910/101‑1 (MQ=255)
cggatcatggcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa > 2:1176306/10‑101 (MQ=255)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAGAA.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc > 1:954597/2‑96 (MQ=2)
caGCGCCGCAACCGGCGTGCTAGACAGCGC.CAG.AGGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc < 2:640729/100‑6 (MQ=2)
aGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGcc < 2:4158643/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCTCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcg < 2:3913077/101‑1 (MQ=255)
cgccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccct < 1:648886/101‑3 (MQ=9)
ccgcGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCgg > 1:1709743/1‑101 (MQ=255)
ccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcccttg < 1:2197683/101‑5 (MQ=2)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt < 1:2751155/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt > 2:3148797/1‑101 (MQ=255)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt < 1:1700138/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCGAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 2:725484/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg > 1:1604753/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg > 1:1175207/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 1:2570581/101‑1 (MQ=255)
accTGCGTCCTGGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCCCTTGATcgc < 2:4258274/99‑1 (MQ=2)
tCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGTGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgcc < 1:4081175/101‑1 (MQ=255)
ccTGCGTGCTCGACAGCGCCAGA.A.GCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCCCTTGATcgca > 2:4657948/2‑100 (MQ=2)
cTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgccg < 1:4738116/101‑1 (MQ=255)
tGCGTGCTGGTTAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgccgc < 2:1004462/101‑1 (MQ=255)
gCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCgccgcc < 1:4122590/101‑1 (MQ=255)
gCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCgccgcc > 2:225326/1‑101 (MQ=255)
cGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGccgccg < 1:509934/101‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt < 2:4458266/101‑1 (MQ=255)
tGCTGGTCGGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg < 2:4117500/101‑1 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 2:1655766/1‑101 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 2:235040/1‑101 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 1:4438953/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGcc > 1:1342590/1‑101 (MQ=255)
tGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGccc < 2:3685157/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 1:2062363/101‑1 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa > 2:507516/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcg > 1:2605464/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcg < 1:2825582/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcg > 2:4225365/1‑101 (MQ=255)
gcgcCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGcgccgc > 1:3812341/1‑101 (MQ=255)
cG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAcc < 2:4438703/101‑1 (MQ=255)
cG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAcc > 1:1119008/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTc < 1:694452/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCg < 2:2492160/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCg < 1:3703746/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCg < 1:359525/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGc < 1:4254638/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGc < 2:3705232/101‑1 (MQ=255)
|
GTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCG.A.TCTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCG > NC_014034/681391‑681589
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|