| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 682,547 | C→G | 11.8% | A354P (GCG→CGG) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 682,547 | 0 | C→G | 11.8% | 44.1 ‑2.9 ‑0.3 | 168 | A354P (GCG→CCG) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/15): ref base (73/75): total (78/90) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.51e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.53e-01 | ||||||||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
TGCGCCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCG > NC_014034/682447‑682647
|
tGCGCCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTgcgc > 1:1019432/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGcc > 2:2593953/1‑101 (MQ=255)
cgcCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGccc < 1:2368347/101‑1 (MQ=255)
cgcCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGccc < 1:1508529/101‑1 (MQ=255)
gcCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAACTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGcccc < 1:973510/101‑1 (MQ=255)
ccGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCg < 1:2328311/101‑1 (MQ=255)
ccGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCg < 1:2441204/101‑1 (MQ=255)
ccGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCg < 1:3675479/101‑1 (MQ=255)
cGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCgg > 1:1706328/1‑101 (MQ=255)
cGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCgg < 2:2621298/101‑1 (MQ=255)
gAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGt < 2:3475540/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAgcg < 1:4410992/101‑1 (MQ=255)
gcgcCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGcgcc > 1:1906813/1‑101 (MQ=255)
gcgcCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGcgcc < 2:2953205/101‑1 (MQ=255)
gcgcCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGcgcc < 2:4260773/101‑1 (MQ=255)
gcCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGcgccgc < 1:2001811/101‑1 (MQ=255)
ccTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCgccgcc < 1:4575033/101‑1 (MQ=255)
cTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCa < 2:3947725/101‑1 (MQ=255)
ggcggcCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGtt > 1:3083707/1‑101 (MQ=255)
ggcggcCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGtt < 2:1074326/101‑1 (MQ=255)
gcggcCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTc < 2:2743757/101‑1 (MQ=255)
gcCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGAt > 2:261312/1‑101 (MQ=255)
ctcctcGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCg > 2:391459/1‑101 (MQ=255)
ctcctcGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGACAGCGCCGCCAGTTCGATCg > 1:4723742/1‑101 (MQ=255)
tcctcGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.t > 1:4598400/1‑101 (MQ=255)
tcctcGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCACCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.t > 2:884054/1‑101 (MQ=255)
ctcGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGc < 1:2835160/101‑1 (MQ=255)
ctcGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGc > 2:4171812/1‑101 (MQ=255)
ctcGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGc > 1:3628364/1‑101 (MQ=255)
cGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTc > 2:1987944/1‑101 (MQ=255)
ggACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCa < 1:709116/101‑1 (MQ=255)
ggACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCa > 2:74562/1‑101 (MQ=255)
ggACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCa < 1:1619824/101‑1 (MQ=255)
ggACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCa < 2:2183582/101‑1 (MQ=255)
ggACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCa < 1:194714/101‑1 (MQ=255)
ggACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCa < 1:2041919/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGcc < 2:111528/101‑1 (MQ=255)
aGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGcccgcgtt < 2:3007970/101‑8 (MQ=255)
gcgcCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCg < 1:4490119/101‑1 (MQ=255)
gccgcGATCTGCCGAGTGCCCAGAACCCACGGCTGGGCCGTCCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCCCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGc < 2:3141095/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCAt < 2:909346/101‑1 (MQ=255)
gcgATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCAt < 1:2139128/101‑1 (MQ=255)
aTCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTc > 2:250588/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTc < 1:3531332/101‑1 (MQ=255)
aTCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTc > 2:2387493/1‑101 (MQ=255)
tCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTcc > 2:4503712/1‑101 (MQ=255)
cTGTCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCt < 1:3909966/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCt > 1:1353116/1‑101 (MQ=255)
cgTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCg < 1:2933333/101‑1 (MQ=255)
gTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGa > 1:1827081/1‑101 (MQ=255)
gTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGa > 2:2152582/1‑101 (MQ=255)
tGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGaa > 2:3533789/1‑101 (MQ=255)
gCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGaaa > 1:3476918/1‑101 (MQ=255)
cccAGATCCCCCAGCTGGGCCGGGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAg < 2:1985583/101‑1 (MQ=255)
cccAGACCCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAg < 1:3144448/101‑1 (MQ=255)
ccAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGc < 1:1082765/101‑1 (MQ=255)
aGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGccc > 2:2824666/1‑101 (MQ=255)
gccgccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCtt < 2:424278/97‑1 (MQ=37)
gccgccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCtt < 1:3296719/97‑1 (MQ=37)
aCCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCtt > 2:2837347/1‑101 (MQ=255)
aCCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCtt > 2:4060486/1‑101 (MQ=255)
aCCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCtt < 2:4052756/101‑1 (MQ=255)
ccccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCa < 2:1906701/101‑1 (MQ=255)
gccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAg > 1:233123/2‑101 (MQ=37)
ccAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGGTCCCGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAgc < 1:4060728/101‑1 (MQ=255)
ccAGCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAgc > 1:901690/1‑101 (MQ=37)
aGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAgcgc > 1:431124/1‑101 (MQ=255)
gCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGcgcg < 1:3335553/101‑1 (MQ=255)
gCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGcgcg > 1:1397443/1‑101 (MQ=255)
gCTGCGCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAGcgcg < 2:426741/101‑1 (MQ=25)
cTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcgg > 1:512498/1‑101 (MQ=255)
cTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcgg < 2:3496815/101‑1 (MQ=255)
cTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCACCTTCAGcgcgc > 2:1273313/1‑100 (MQ=255)
tGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggc > 2:466941/1‑101 (MQ=255)
gggCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggcg < 1:2594105/101‑1 (MQ=255)
gggCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCgcggcg < 1:250613/101‑1 (MQ=255)
ggCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGcggcgg > 1:4254797/1‑101 (MQ=255)
ggCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGcggcgg < 2:3364864/101‑1 (MQ=255)
cgCCGTGCTCAGCGCCGCCACCTGCTGCGAGGTCATCGCCGCCA.TCTGATCGCCGGTCAGCGCGACGATGTCGCCGGTCGACAGCCCCTTGAGcgcgccac < 2:244022/100‑5 (MQ=25)
gTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGcc > 2:2453138/1‑101 (MQ=255)
tGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCg < 1:391503/101‑1 (MQ=255)
tGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCg < 2:650203/101‑1 (MQ=255)
cTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGAt > 1:1049712/1‑101 (MQ=255)
tCAGCGCCGCCATCTGCCCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATc < 1:754819/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcg > 2:1399077/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcg > 2:4446391/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcg < 2:3008287/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcgcc < 2:1706223/101‑1 (MQ=255)
gccgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATcgccgc > 1:1959417/1‑101 (MQ=255)
ccgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCa < 2:1353024/101‑1 (MQ=255)
cgccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGCCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGGGCCGATCGCCGCaa > 2:516674/1‑101 (MQ=255)
gccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCaaa > 2:3719108/1‑101 (MQ=255)
ccATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAg > 2:4563260/1‑101 (MQ=255)
cATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAgg > 2:2909949/1‑101 (MQ=255)
cATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAgg < 1:2860437/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCcg < 1:1666574/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCcg > 2:4066918/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCcgc > 2:2019194/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAAGCcgc > 2:3223827/1‑101 (MQ=255)
gcCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGcc < 2:512447/101‑1 (MQ=255)
|
TGCGCCGAACTCAGCGCCTCGGCGGCCTCCTCGGACAGCGCCGCGATCTGCCGCGTGCCCAGAACCCCCAGCTGGGCCGTGCTCAGCGCCGCCATCTGCGCCCCGGTCAGCGCCGCCAGTTCGATCG.TGCTCAGCCCGGCCATGTCCTCGGTCGAAAGCCCCTTCAGCGCGGCGGTGCCGATCGCCGCAAAGGCCGCGCCG > NC_014034/682447‑682647
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 28 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|