BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,010	Δ1 bp	0.4%	coding (647/2748 nt)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,010	0	G→.	0.4%	7.1 ‑1.3 ‑0.4	1690	coding (647/2748 nt)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/2): ref base (829/853): total (834/856)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.82e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.24e-01

Only 100 of 2045 total aligned reads displayed.


CGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGG  >  NC_014034/221910‑222110


cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                                      <  2:3783041‑M1/55‑1 (MQ=255)


       cgcTCATGGACGGTGGGCGTCGGATGCTTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                               <  1:215715/101‑1 (MQ=255)


        tgggatcggtccgatccgtgggatcggtcgtgtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                              >  2:841143‑M1/39‑101 (MQ=255)


            gtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                          >  2:1302528‑M1/35‑101 (MQ=255)


             tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGggatcggtcggatc                                                                                         >  2:5030897‑M1/34‑98 (MQ=255)


             tcggtcggagccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                         >  1:1572893‑M1/34‑101 (MQ=255)


              cggtcggatccgtgggatcggtcgggtgcgtgGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                        >  2:2563740‑M1/33‑101 (MQ=255)


               ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                       >  2:4298858‑M1/32‑101 (MQ=255)


                  gggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                                    >  2:3460898/8‑99 (MQ=11)


                     gtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                 <  1:538029‑M1/76‑1 (MQ=255)


                       ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                               <  1:2253467‑M1/78‑1 (MQ=255)


                        ggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcgggcccg                                                                              >  2:1040893/2‑96 (MQ=11)


                         gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                             <  1:3368471‑M1/80‑1 (MQ=255)


                         gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                             <  2:2816821‑M1/80‑1 (MQ=255)


                         gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                             >  1:3280239‑M1/22‑101 (MQ=255)


                              gtctgttgggtcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAt                                                                        <  2:3720515/91‑1 (MQ=14)


                                  gtcgcgtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                    >  2:1212920‑M1/13‑101 (MQ=255)


                                     gggtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGGCGGTggg                                                                 >  2:3640827/7‑101 (MQ=11)


                                       gtcggtgggCTCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                               <  2:1719598/100‑1 (MQ=11)


                                       atcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                               <  1:3752871/100‑1 (MQ=11)


                                        tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                              <  2:2454578/101‑1 (MQ=255)


                                        tcgggggggtcggtggggtcggtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc                                                              <  1:18811/92‑1 (MQ=11)


                                        tccgtcggAGCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                              <  1:478423/98‑1 (MQ=11)


                                          ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGAtcgg                                                            >  1:3515519/1‑101 (MQ=255)


                                           gtgggatcggtttcgttcgtgggctccgtcgggtccgtgGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgt                                                           <  2:1653886/98‑1 (MQ=11)


                                           gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                           <  2:2718996/98‑1 (MQ=11)


                                           gtgGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                           >  1:3844926‑M1/4‑101 (MQ=255)


                                           gggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                           <  1:1776896/98‑1 (MQ=11)


                                            tgggctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                          <  2:2240155/96‑1 (MQ=11)


                                            tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGgggcgcggcg                                                          >  1:2087040/3‑94 (MQ=11)


                                            tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcggtg                                                          >  2:4746835/3‑100 (MQ=11)


                                            tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                          >  1:149035‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                            tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                          <  1:3969350/101‑1 (MQ=255)


                                             gggatcggtcgggtgcgtgagatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGTTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                         <  1:2871098/100‑1 (MQ=11)


                                                agcggtcgggcccgtgggttcggtggggggcgtggggtCGGTCGGGTCCCTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                      <  1:4714244/99‑3 (MQ=9)


                                                 tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATc                                                     <  2:584808/101‑1 (MQ=11)


                                                  cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                    >  2:653902/1‑101 (MQ=11)


                                                  cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                    <  1:1423228/101‑1 (MQ=11)


                                                  cggtccggtcggtggggtcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                    <  2:2157491/101‑1 (MQ=11)


                                                   ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGCCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGATGCGTGGGATGGGACGGGTGCg                                                   >  2:4194990/1‑101 (MQ=11)


                                                   ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCg                                                   >  1:2781043/1‑101 (MQ=11)


                                                    gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                                                  >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)


                                                    gtcggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCgg                                                  >  2:1944465/1‑100 (MQ=11)


                                                     tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGtg                                                 >  2:2637759/1‑100 (MQ=11)


                                                     tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTCGGATCGGCCGGCGCCGTGGGATCGGGCGGTCCCGtg                                                 >  1:836985/1‑100 (MQ=11)


                                                     tcgggtccgggggtgcggtcgggtccgtgggatgggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                 <  1:4341719/101‑2 (MQ=11)


                                                      cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGtgg                                                >  2:719818/1‑99 (MQ=14)


                                                      cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                <  1:4473456‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                      cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                <  1:1960936‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                                      cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                <  1:1141956/101‑3 (MQ=11)


                                                       gggtccgtgggatctgtcaggtccgtgggatcggtcGAATCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                               <  2:3370330/101‑1 (MQ=14)


                                                       gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                               >  2:4401227/1‑101 (MQ=11)


                                                       gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAgg                                               >  1:4084898/1‑101 (MQ=11)


                                                       ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGgg                                               >  2:4451843/4‑101 (MQ=11)


                                                        ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                              >  1:2451204/1‑101 (MQ=11)


                                                        ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGCTCCGTGGGGTCAGTCGGATCCGtgagg                                              >  2:3027368/1‑97 (MQ=11)


                                                         gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggt                                             <  1:4414714‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                                          tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                            >  1:3083236/1‑101 (MQ=11)


                                                           ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                           <  2:4117932‑M2/101‑8 (MQ=255)


                                                            cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtccg                                          >  1:2970609‑M2/1‑93 (MQ=255)


                                                            cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg                                          >  1:3468788‑M2/1‑93 (MQ=255)


                                                            cgggggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                          <  1:4862407/98‑1 (MQ=11)


                                                             gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggg                                         <  1:955185‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                             gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                         <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                               gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                       <  1:2346339‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                  atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                    <  2:4920883‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                                    cggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                  >  1:2699735‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                    cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtcc                                  <  1:1329977‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                                     ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccg                                 >  1:3678473/1‑101 (MQ=11)


                                                                     ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggcgggtccg                                 <  1:1244360‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                     cgtggggtcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg                                 <  2:4651997/97‑1 (MQ=11)


                                                                      gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                                <  1:2537986‑M2/101‑19 (MQ=255)


                                                                      gtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcggt                                >  2:3267742/1‑101 (MQ=11)


                                                                         gggggcgtggggttcgtcggAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                             <  1:3593690/96‑1 (MQ=11)


                                                                         ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                             >  1:4234142/4‑101 (MQ=11)


                                                                           gtgcgtgggatgggtcggATGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtgggat                           <  1:747287/98‑3 (MQ=11)


                                                                           gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggt                           >  2:4561036‑M2/1‑78 (MQ=255)


                                                                            tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatc                          <  1:625403‑M2/101‑25 (MQ=255)


                                                                            tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatc                          >  1:4922526‑M2/1‑77 (MQ=255)


                                                                               gtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtgggtgccggcggggccgg                       >  2:1399865/4‑100 (MQ=11)


                                                                                tgggatgggtcgcGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc                      <  2:1110099/101‑2 (MQ=11)


                                                                                 ggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTCGGCTCGgtcggctccgtggggcccccag                     >  2:2334648/1‑97 (MQ=2)


                                                                                 gggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtcggctcggtcg                     >  1:4602164/1‑99 (MQ=11)


                                                                                   gatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                   <  1:665671‑M2/101‑32 (MQ=255)


                                                                                    gtgcgtggcgtCCGTCGGGTCGGTGGGGTACGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt                  <  1:4157733/91‑1 (MQ=14)


                                                                                    gcgcggaagATCCGTGGGGTAGGTGGGGTGCGTGGGAGGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAt                  <  1:2608537/93‑1 (MQ=2)


                                                                                      cggtgggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                <  2:4015326/101‑1 (MQ=14)


                                                                                      cggtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtcagcgcg                <  2:2082484/101‑8 (MQ=11)


                                                                                      ccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                >  2:2919006/6‑101 (MQ=14)


                                                                                        gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt              >  2:1514056/4‑101 (MQ=14)


                                                                                         tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtg             >  2:484697/1‑100 (MQ=14)


                                                                                           ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg           <  1:3190694/101‑1 (MQ=1)


                                                                                           ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg           <  1:1687410‑M2/101‑40 (MQ=255)


                                                                                           ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtggg           >  1:5006197/1‑101 (MQ=11)


                                                                                           ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtggg           <  1:893711/101‑1 (MQ=11)


                                                                                            ggtccGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggga          >  2:3150215‑M2/3‑61 (MQ=255)


                                                                                             aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggag         <  2:3925114‑M2/101‑42 (MQ=255)


                                                                                                cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg      <  2:3528637‑M2/101‑45 (MQ=255)


                                                                                                cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcgg      <  2:903777‑M2/101‑45 (MQ=255)


                                                                                                  taggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc    >  2:1843953/3‑100 (MQ=14)


CGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGG  >  NC_014034/221910‑222110

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 22 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG