BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	NC_014034	222,011	Δ1 bp	0.4%	coding (646/2748 nt)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,011	0	G→.	0.4%	7.1 ‑1.3 ‑0.4	1685	coding (646/2748 nt)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/2): ref base (826/851): total (832/853)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.82e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.43e-01

Only 100 of 2040 total aligned reads displayed.


GGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGA  >  NC_014034/221911‑222111


gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                                      >  1:3177803‑M1/46‑101 (MQ=255)


    cgcgCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                  <  1:4410823/101‑1 (MQ=255)


    cgcgCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                                  <  1:719765/101‑1 (MQ=255)


      cgcTCATGGACGGTGGGCGTCGGATGCTTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                                                <  1:215715/101‑1 (MQ=255)


            tcggtcgcttccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                                          >  2:839510‑M1/34‑101 (MQ=255)


             ctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                         >  1:2605150‑M1/33‑101 (MQ=255)


             cgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                         >  2:4846033‑M1/33‑101 (MQ=255)


              ggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                                        <  2:2713829‑M1/70‑1 (MQ=255)


               aCGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                       >  2:3025185/1‑101 (MQ=255)


                 cggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                     >  2:4298122‑M1/29‑101 (MQ=255)


                    ggccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                  >  1:477224‑M1/26‑101 (MQ=255)


                     tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                 <  1:2448932‑M1/77‑1 (MQ=255)


                      gcgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                >  1:521453‑M1/24‑101 (MQ=255)


                        gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                              <  2:3149271‑M1/80‑1 (MQ=255)


                         tCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtccgtg                                                                             <  1:3836763/101‑2 (MQ=11)


                               cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                       >  1:1776158‑M1/15‑101 (MQ=255)


                               cggTGGGCTCGGTGGGATCCGTCGGGTCCGTTGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                       <  2:119583/99‑1 (MQ=14)


                                   cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                   <  1:3659073‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                    gtgcccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGCGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                  <  1:4320586/95‑1 (MQ=11)


                                    gggtcggtgggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                  <  1:4588052/98‑1 (MQ=11)


                                     gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGT.GGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                <  1:611012/93‑1 (MQ=11)


                                        ctgttggatcggtcgggtccgtcgggtccggcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                              <  2:4190159/96‑1 (MQ=11)


                                         cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTGGGGTCCGTGGGGGCGGTCGGGCCGGTgggcgcgg                                                             >  1:1878509/5‑96 (MQ=11)


                                          gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                            >  1:3742595/4‑101 (MQ=11)


                                           tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGGCGGGTCCGTggggtggggg                                                           >  2:3524893/3‑94 (MQ=11)


                                           tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcggtg                                                           >  2:4746835/3‑100 (MQ=11)


                                           tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                           >  1:149035‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                           tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                           >  2:1098996‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                           tgGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                           >  2:2213253‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                            gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGGtcggtcg                                                          >  2:1834129/2‑101 (MQ=11)


                                            gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                          >  1:3267994‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                            gGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                          >  1:2965611‑M1/2‑101 (MQ=255)


                                               gtctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                       <  1:1568596/97‑3 (MQ=14)


                                               atcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggGCCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                       <  1:659244/101‑1 (MQ=14)


                                                tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATc                                                      <  2:584808/101‑1 (MQ=11)


                                                tcggtcgggtccctggggtccgtcgggtccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                      <  2:1501795/101‑1 (MQ=14)


                                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGGGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGttc                                                     >  1:3508660/1‑99 (MQ=14)


                                                 cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                     <  1:1423228/101‑1 (MQ=11)


                                                 cggtccgttccgtgagatcggtcgggtccgcgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                     <  2:4113265/101‑1 (MQ=11)


                                                 ccgtcggttccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                     <  2:3261507/99‑1 (MQ=14)


                                                  tgtcgggtccgtttgatctggcgggtccgtggtatcgGTAGGGTCCGTGGGTGCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                    <  1:80726/100‑1 (MQ=11)


                                                   gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                                                   >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)


                                                    tggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatctgtcGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                  <  1:4467127/99‑2 (MQ=11)


                                                    tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCCTGGGCTCGGGCGGGTCGGGGGGATCGGTCGGGCCCGtg                                                  >  1:2535958/1‑100 (MQ=11)


                                                     cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                 >  2:2901441/1‑99 (MQ=11)


                                                     cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                 <  1:1141956/101‑3 (MQ=11)


                                                      gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGAGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGGTGCGTGgg                                                >  2:3919840/1‑101 (MQ=11)


                                                      gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGGGGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGgg                                                >  2:2803356/1‑101 (MQ=11)


                                                      ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTGCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGgg                                                >  2:4451843/4‑101 (MQ=11)


                                                       gggacgtgggctcggtctggtccgtgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                               <  2:653232/97‑1 (MQ=11)


                                                        gtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                              >  1:2856970‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                        gtccgtgggatcggtcggatccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTGGGACCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGAt                                              <  1:4701539/101‑1 (MQ=11)


                                                         tgcgtgggctcggtcgggtccgtcggatcgggcggGTCCGTGCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                             <  2:1645500/99‑1 (MQ=11)


                                                          ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                            >  1:4916240‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                           cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGCCCGTGGGGTCCGGCGGATCCGCGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGGGGGAccgg                                           >  1:946624/1‑101 (MQ=11)


                                                            gtgggttcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                          <  2:3368208/101‑1 (MQ=11)


                                                            gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                          <  1:3572914‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                            gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                          <  2:1942198‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                            gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                          <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                              tggtttcgtccggtccgtgggatccgtcggGTTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                        <  2:2444502/94‑1 (MQ=11)


                                                              gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                        <  1:2346339‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                               ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgg                                       <  1:2082668‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                 gtcggtcgggtccgtgggatccgtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                     >  2:716621‑M2/2‑87 (MQ=255)


                                                                 gtccggcggatccgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggat                                     <  1:3444720/95‑3 (MQ=11)


                                                                 ggcggtcggggccgtgggagcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                     <  1:1948654/99‑3 (MQ=11)


                                                                 atcggtcgggtccgtggtatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                     >  2:4544756‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                                                 atcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggat                                     >  2:214630‑M2/1‑87 (MQ=255)


                                                                 atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                     <  2:4920883‑M2/101‑15 (MQ=255)


                                                                  tctgtcggggccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                    <  2:900145/98‑1 (MQ=11)


                                                                  tcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                    <  1:3362093/101‑1 (MQ=11)


                                                                   cggtggggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                   >  1:4061327‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                   cggtcgggtccgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatcc                                   >  1:3962217‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                   cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtcc                                   <  1:1329977‑M2/101‑17 (MQ=255)


                                                                   cggcggggtccgtgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcc                                   <  1:2241823/96‑1 (MQ=11)


                                                                    ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggcgggtccg                                  <  1:1244360‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                    cgtggggtcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccg                                  <  2:4651997/97‑1 (MQ=11)


                                                                      tcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtg                                <  2:2560681‑M2/101‑20 (MQ=255)


                                                                      tcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtccgtg                                >  1:2768133/1‑100 (MQ=11)


                                                                        ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg                              >  2:4007734/4‑101 (MQ=255)


                                                                         ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtagggtgcgtgggg                             >  2:2072889/1‑101 (MQ=11)


                                                                          gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggt                            <  1:880647‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                                          atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat                            >  2:2630990/2‑99 (MQ=255)


                                                                            ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGTATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg                          <  2:1030616/101‑2 (MQ=14)


                                                                              gtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGtcgggtccgtcggatccgg                        >  2:1277311/1‑100 (MQ=11)


                                                                               tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtccgtgggatcggtc                       <  2:4397470‑M2/101‑29 (MQ=255)


                                                                                cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgg                      >  2:1712103/11‑101 (MQ=11)


                                                                                 ggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTcgg                     <  2:3631119/101‑1 (MQ=11)


                                                                                     ccgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc                 <  1:4995012‑M2/99‑35 (MQ=255)


                                                                                       gtcggATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt               <  2:2325817/101‑1 (MQ=17)


                                                                                          ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg            <  1:1687410‑M2/101‑40 (MQ=255)


                                                                                          ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtggg            <  2:3780467‑M2/101‑40 (MQ=255)


                                                                                            gtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt          <  2:139350/100‑3 (MQ=14)


                                                                                            aTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt          <  1:3057546/101‑1 (MQ=11)


                                                                                              cggtgGGACCGGTTGGGTCAGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcg        >  2:3437259‑M2/3‑58 (MQ=255)


                                                                                              ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgggggatcggtcgggtccgtgggatcg        <  1:4212839‑M2/101‑44 (MQ=255)


                                                                                               ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg       >  2:5030160/5‑101 (MQ=17)


                                                                                                  gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgcgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg    <  2:3708550‑M2/101‑48 (MQ=255)


                                                                                                  gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg    <  1:4152941‑M2/101‑48 (MQ=255)


                                                                                                  cggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTCGGGGCCGTGGGATCGGGCGGATCCGGgg    >  1:2696781/2‑101 (MQ=17)


                                                                                                    gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggaccgtgggctcggtcgggtccgtggggtcggtcggg  <  1:4852966‑M2/101‑50 (MQ=255)


GGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGA  >  NC_014034/221911‑222111

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG