Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA NC_014034 222,013 Δ1 bp 0.4% coding (644/2748 nt) RCAP_rcc00185 ← hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*NC_014034222,0130T→. 0.4% 6.8 ‑1.3 ‑0.61655coding (644/2748 nt)RCAP_rcc00185hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (5/2):  ref base (804/836):  total (814/841)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 2.80e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.32e-01

Only 100 of 2031 total aligned reads displayed.

ATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC  >  NC_014034/221913‑222113
                                                                                                    |                                                                                                    
   gcgcTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                                   >  2:1141842/1‑101 (MQ=255)
    gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGatcggc                                                                                                  <  1:1885760‑M1/62‑2 (MQ=255)
       ggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                               >  1:2986073‑M1/37‑101 (MQ=255)
         aTCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCgggg                                                                                             >  2:3653711/1‑100 (MQ=255)
           cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                           >  1:3404558‑M1/33‑101 (MQ=255)
             gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                         >  1:3208038‑M1/31‑101 (MQ=255)
              cGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                                        <  1:288857/101‑1 (MQ=255)
               cggttccgtgggatcggtcggttccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                                       >  2:1780607‑M1/29‑101 (MQ=255)
                ggctccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                      >  1:2703996‑M1/28‑101 (MQ=255)
                  gtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                    >  2:3558284‑M1/26‑101 (MQ=255)
                  atccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAt                                                                                    <  2:4214778‑M1/76‑1 (MQ=255)
                   tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                   >  1:2791101‑M1/25‑101 (MQ=255)
                    gCGTCGGATGCGTGGGCTGGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                  <  2:3410818/101‑1 (MQ=255)
                    ccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTccgtggggtcc                                                                                  >  2:1067565‑M1/24‑97 (MQ=255)
                      gTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGGCCGTCGGGtccgt                                                                                >  1:927309/1‑101 (MQ=11)
                      gTCGGATGCGTGGGCTGGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                <  2:3318434/101‑1 (MQ=255)
                             cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                         <  1:2362864‑M1/87‑1 (MQ=255)
                              cGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                                        >  1:4434124/1‑101 (MQ=255)
                                 gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                     <  2:592236/101‑3 (MQ=11)
                                     tccggcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                                                 <  1:3705485/96‑1 (MQ=11)
                                     cccagcgcatcgctcggacctgtcgggtcgctcgggtccgggggATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                 <  2:1455662/93‑1 (MQ=11)
                                       cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                               >  2:504117‑M1/5‑101 (MQ=255)
                                         tgggacgggtaggggccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                             <  1:557168/94‑1 (MQ=11)
                                          gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                            <  1:4878154/100‑1 (MQ=11)
                                          gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                            <  1:63284‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                          gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                            <  1:141266‑M1/100‑1 (MQ=255)
                                           gggtcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggaTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                           <  1:3527732/98‑1 (MQ=11)
                                           ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                                           <  2:3948608/101‑1 (MQ=11)
                                            gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGTTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgga                                                          <  2:4418604/101‑2 (MQ=11)
                                            gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGGCGGGGCCGAGGGACCGGCCGGGCTCGTGGGAGCGGACggg                                                          >  1:4364462/1‑101 (MQ=11)
                                             gtctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                         <  1:1568596/97‑3 (MQ=14)
                                             gtcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                         <  2:3479008/100‑1 (MQ=11)
                                               cggtcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                       <  2:1007709/101‑1 (MQ=11)
                                                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCg                                                      >  2:4768829/1‑101 (MQ=11)
                                                 gtgggatccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                     <  2:4326875/95‑1 (MQ=11)
                                                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg                                                     >  1:1060985/1‑100 (MQ=14)
                                                 gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCGGGAGGAtcggg                                            >  2:4571006/1‑100 (MQ=17)
                                                  tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                    >  2:2514352/1‑100 (MQ=14)
                                                  tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATGGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCGGGTcggag                                                    >  2:2882447/1‑97 (MQ=11)
                                                   cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCgggagcgtgg                                                   >  2:3816888/1‑94 (MQ=11)
                                                   cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                   <  1:1141956/101‑3 (MQ=11)
                                                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                  >  1:348084/1‑101 (MQ=11)
                                                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                  <  1:3125997/101‑1 (MQ=11)
                                                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                  >  1:4731366‑M2/1‑98 (MQ=255)
                                                    gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatctgtgGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                  <  2:4470923/101‑1 (MQ=11)
                                                    gggtccggaggagccgtcgggcccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg                                                  <  2:3735703/101‑1 (MQ=11)
                                                     ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGggt                                                 >  2:4935444/1‑100 (MQ=14)
                                                     ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGAATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGtgcga                                                 >  1:4265177/1‑97 (MQ=11)
                                                      gtccgtggggtcggtcgggtgcgggggttcggtgggGTCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                <  1:2564046/101‑1 (MQ=11)
                                                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGCGGGGGCGGTCGCATCGGCGGGCTCGCTCGGGGCCgcgccgc                                                >  2:2694685/1‑95 (MQ=9)
                                                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGGTCGGTCGGGGCCGCGGGAt                                                >  2:747197/1‑101 (MQ=11)
                                                      ggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                                >  1:766247‑M2/3‑96 (MQ=255)
                                                       ccggtgggatcggtcgggtccgtgggctccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                               <  2:2286651/98‑1 (MQ=11)
                                                          gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                            <  1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)
                                                           ttggatctgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtc                                           <  2:1364439/99‑1 (MQ=14)
                                                           tgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGACGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTTCGTGGGAtcgtac                                           >  1:2460987/1‑98 (MQ=11)
                                                           ggggatgtgtcgggtccgtgggatctgtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                           <  2:3082998/100‑1 (MQ=11)
                                                            ggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGAtcgtgcg                                          >  1:1480797/1‑97 (MQ=11)
                                                            gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGCCGGCtcggtcg                                          >  1:866401/1‑101 (MQ=11)
                                                             ggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGtcggtcgg                                         >  2:2970381/1‑101 (MQ=11)
                                                             ggaggggtcgggtccgtgggggccgtcggATCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                         <  1:1777129/96‑1 (MQ=11)
                                                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtcc                                     <  1:1329977‑M2/101‑17 (MQ=255)
                                                                 cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc                                     >  2:4853558‑M2/1‑85 (MQ=255)
                                                                 cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc                                     <  1:2618574/101‑1 (MQ=255)
                                                                    gcggatccgtaggagcggtctgGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtc                                  <  1:2172192/100‑1 (MQ=11)
                                                                     cgggtccggggggtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcg                                 <  1:4648572/101‑1 (MQ=11)
                                                                      ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgg                                <  1:4804619/98‑1 (MQ=11)
                                                                       ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggga                               <  1:4516413‑M2/101‑23 (MQ=255)
                                                                       ggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCGgtcgggccggtggga                               >  2:2406988/1‑92 (MQ=11)
                                                                       ggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggga                               <  1:4103659‑M2/101‑23 (MQ=255)
                                                                       gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgga                               >  2:4670301/3‑100 (MQ=255)
                                                                       gatccgtgggatatgtttgATCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggga                               <  1:5040321/99‑2 (MQ=11)
                                                                         tccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtgggggccgtcggggc                             >  2:124864/1‑99 (MQ=11)
                                                                          ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                            <  1:4008036/101‑1 (MQ=11)
                                                                            gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCTGGGCCGGGGGATGGgtcgggtcggtcggatcggc                          >  2:659155/1‑98 (MQ=11)
                                                                             taggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGGCCGTg                         >  1:2092185/3‑101 (MQ=11)
                                                                              cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGGgg                        >  1:2260910/11‑101 (MQ=11)
                                                                               gggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTcgg                       >  2:2028635/7‑101 (MQ=11)
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                                                                                gagcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGa                      <  1:3604027/98‑1 (MQ=14)
                                                                                  tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                    <  2:2181896‑M2/101‑34 (MQ=255)
                                                                                  tcggtcggGGCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                    >  1:1242705‑M2/1‑68 (MQ=255)
                                                                                   cggtcggATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATGGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc                   <  1:677466/101‑2 (MQ=11)
                                                                                   cggtcggAGCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                   >  1:1988912‑M2/1‑67 (MQ=255)
                                                                                    cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccg                  <  2:849232/100‑3 (MQ=11)
                                                                                       cggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgg               >  1:3771408‑M2/1‑63 (MQ=255)
                                                                                        gggtcggTGGGGTCCATCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg              <  2:2767931/95‑1 (MQ=17)
                                                                                        ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg              <  1:1687410‑M2/101‑40 (MQ=255)
                                                                                        ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg              <  2:2594445‑M2/101‑40 (MQ=255)
                                                                                        ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtggg              >  2:2121645/1‑101 (MQ=11)
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                                                                                            ccGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATcg          <  1:4165231/101‑2 (MQ=11)
                                                                                             cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcgg         <  2:903777‑M2/101‑45 (MQ=255)
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                                                                                                  gATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa    >  1:3888247/1‑101 (MQ=17)
                                                                                                    |                                                                                                    
ATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC  >  NC_014034/221913‑222113

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG