| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,006 | 0 | C→G | 1.8% | 42.4 ‑3.1 ‑2.9 | 1633 | T217T (ACG→ACC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (22/9): ref base (822/780): total (844/789) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.42e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.40e-03 | ||||||||||
Only 100 of 1991 total aligned reads displayed.
TCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCG > NC_014034/221906‑222106
|
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ggcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:2035118‑M1/49‑101 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTgg < 2:149019‑M1/55‑1 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 1:584887‑M1/55‑1 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg < 1:2282338‑M1/56‑1 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCgtggggt < 2:2600389‑M1/58‑3 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt < 1:4456751‑M1/58‑1 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtgggtc < 2:4455688‑M1/63‑1 (MQ=255)
tgggatcggtccgatccgtgggatcggtcgtgtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:841143‑M1/39‑101 (MQ=255)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:4922199‑M1/64‑1 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:507015‑M1/65‑1 (MQ=255)
gcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:1055934‑M1/34‑101 (MQ=255)
gggtggggggCGTCGGGGGGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:3415430/94‑1 (MQ=1)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:771369‑M1/69‑1 (MQ=255)
tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTccggg < 1:4135838‑M1/72‑3 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:598041‑M1/78‑1 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg < 1:1240349‑M1/78‑1 (MQ=255)
ccGTTGGATCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:1554360/100‑1 (MQ=11)
ttgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 2:504344‑M1/22‑101 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:2122483‑M1/22‑101 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 2:3212490‑M1/80‑1 (MQ=255)
gtgagatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 2:1275418‑M1/22‑101 (MQ=255)
tCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:3720793/1‑101 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:4033926‑M1/20‑101 (MQ=255)
gatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGa < 2:4827904‑M1/84‑1 (MQ=255)
gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 2:3432393/101‑1 (MQ=255)
cgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:3543401‑M1/15‑101 (MQ=255)
cgggcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 2:1599804‑M1/15‑101 (MQ=255)
tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 1:185182/1‑101 (MQ=255)
tGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTg > 2:192723/1‑101 (MQ=255)
gcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg > 2:1704212‑M1/12‑101 (MQ=255)
gtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 2:3708140/97‑1 (MQ=11)
ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:3786074‑M1/6‑101 (MQ=255)
ccgggggatgggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:4769152/96‑1 (MQ=11)
ccggcggATCCGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:4744983/97‑1 (MQ=11)
cgcggtctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg < 2:2790062/94‑1 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCAGTCGGATCCGGGGGTTGGGGTGGATCCGGGGGAtgggg > 1:1399601/4‑100 (MQ=11)
gtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCTGATCCGTGGGAtcggt < 1:2647513‑M1/98‑1 (MQ=255)
gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtgggg > 1:274605/1‑100 (MQ=11)
tgGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGgatccgtggggtccgtg > 2:2316202‑M1/3‑94 (MQ=255)
gcggGTCCGTCGGGTCCGTGCGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc < 2:1088473/100‑1 (MQ=11)
cggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGCCGGGGCCGTGGGATCGGTTGGGCCCGTGGGAccggtcg > 1:3338615/1‑101 (MQ=11)
cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:3631390/1‑101 (MQ=255)
gtcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat < 1:698307/100‑3 (MQ=11)
atcgataggttccgtgggatccgtgggatccgtaggCTCGGTCGGGTCCGTAGGATCCGTCGGGTCCGTCGGAACGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt < 2:3515249/101‑1 (MQ=2)
tcggtagggtccgggggatcggtcgggcccgtcggaTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTc < 1:1467259/101‑1 (MQ=11)
gcggtcgggtcccggggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:2514526/100‑1 (MQ=14)
cggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgttggacCGGTCGCGTCCGCGGCATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:2702307/101‑1 (MQ=11)
ccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTAGAGACCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCAGACGGGtac > 1:1659424/3‑99 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGCCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTGGGATGCGTGGGATGGGACGGGTGCg > 2:4194990/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGGGGGAAGGAGCGGGTCCg > 2:1009283/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 1:283683/1‑101 (MQ=11)
gcgggtcctggggatcggtcggagccgtgggatcggtGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGtg < 1:392842/100‑2 (MQ=11)
gggggcggtgggatcggtcggagccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAg < 1:937970/94‑1 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGACCCGtgg > 1:4190476/1‑99 (MQ=14)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGAATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg > 1:3040754/1‑99 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTgg < 2:4648249‑M2/101‑3 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggtatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg < 2:2198415/101‑1 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGAGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTCGGGTGCGTGgg > 2:3919840/1‑101 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGAGGGGCCTGCCGGATCGGTAGGATCGGTCGGATCCgaggg > 2:2145837/1‑97 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGCccacgggc > 1:1323605/1‑95 (MQ=14)
gtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat > 1:4690685‑M2/1‑96 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggat > 1:4404726‑M2/1‑96 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGGCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:3495273/1‑101 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg < 2:4117932‑M2/101‑8 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGGCGGGTCCGGGGTATCGGAAGGGACCGTGGGAtcgg > 2:3340531/1‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTGGGTCGGGTCCGGGGGGTCGGGCGGGTCGGTGgggggggt > 2:2418798/1‑95 (MQ=11)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt < 1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcccac < 2:4000632/101‑5 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:2533318/1‑101 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggctcgggcg < 2:3125759‑M2/101‑12 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGAtcggtcgg > 1:4586031/1‑101 (MQ=11)
ggatcgggcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgg > 1:2190418‑M2/1‑89 (MQ=255)
gcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTTGGATCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtg < 1:4312772/100‑2 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtggg > 1:4957687‑M2/1‑80 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggt > 2:4561036‑M2/1‑78 (MQ=255)
atcggtggggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcggat < 1:4828231/97‑3 (MQ=11)
cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcgg > 1:1753431/1‑99 (MQ=11)
gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCTGGGCCGGGGGATGGgtcgggtcggtcggatcggc > 2:659155/1‑98 (MQ=11)
gtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggt > 2:4311654/1‑101 (MQ=11)
tggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTcgggtccgtggggtccgtc > 1:2394478/1‑100 (MQ=14)
tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc < 2:2054555/101‑2 (MQ=11)
tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGCCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggcccgtcggatcggcc > 1:1138227/1‑97 (MQ=11)
ggggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtc > 1:3218212‑M2/2‑73 (MQ=255)
gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTggg > 2:4408427/7‑101 (MQ=14)
ggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTggg < 1:4907258/101‑1 (MQ=14)
gccgtgggATCGGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtc < 1:1934419/95‑1 (MQ=14)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc < 1:64775‑M2/101‑35 (MQ=255)
ccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:2588672/96‑1 (MQ=14)
ccgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcg < 2:3002455‑M2/99‑35 (MQ=255)
gtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgg < 1:3150466‑M2/101‑37 (MQ=255)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgg > 2:722785/1‑98 (MQ=11)
gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:1185449/98‑1 (MQ=14)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtggg < 2:1820251‑M2/101‑40 (MQ=255)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtggg < 2:3780467‑M2/101‑40 (MQ=255)
aTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt < 1:2933531/101‑1 (MQ=11)
tCCGTTGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc > 2:362002‑M2/1‑59 (MQ=255)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg > 1:871432‑M2/1‑58 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg > 2:2893710‑M2/1‑57 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcgg < 2:903777‑M2/101‑45 (MQ=255)
|
TCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCG > NC_014034/221906‑222106
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|