| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,018 | 0 | C→G | 3.0% | 82.2 ‑7.1 ‑2.2 | 1654 | P213P (CCG→CCC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (38/16): ref base (750/841): total (794/860) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.04e-04 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.00e-03 | ||||||||||
Only 100 of 2050 total aligned reads displayed.
GCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCG > NC_014034/221918‑222118
|
tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatcggtcggatc > 1:3212741‑M1/34‑98 (MQ=255)
tcggtcgcttccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 2:839510‑M1/34‑101 (MQ=255)
cGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:2565137/1‑101 (MQ=255)
gACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:3061190/101‑1 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg > 2:4409892‑M1/29‑101 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 2:3947552‑M1/73‑1 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:478227‑M1/28‑101 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGggg < 1:2001979‑M1/74‑1 (MQ=255)
gCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:1895603/101‑1 (MQ=255)
cggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTtggggcc > 1:843734/3‑97 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 2:3407094‑M1/80‑1 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 1:1688614‑M1/22‑101 (MQ=255)
gATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGa > 1:982663/1‑101 (MQ=255)
tccGTGGGGTTGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:4342756/99‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:2362864‑M1/87‑1 (MQ=255)
ggagccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:4669518/95‑1 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgagGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCCGAAGCCAACGTGGTATCGGACGGTTCGGTGGGa > 1:409787/9‑101 (MQ=2)
gtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:546986/97‑1 (MQ=11)
gtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:3530553/97‑1 (MQ=11)
gtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 2:1433750‑M1/98‑1 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCCGGGGGGtcggcg > 2:3543131/3‑99 (MQ=11)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:2092250/99‑1 (MQ=11)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 2:1898741‑M1/3‑101 (MQ=255)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:149035‑M1/3‑101 (MQ=255)
nnnnnnnnnncgggtccntgggatcggtcgggtccgtcggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:1336348/91‑1 (MQ=11)
ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:5005436/8‑101 (MQ=14)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 2:2184969/1‑101 (MQ=14)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGGCGGGGCCGTGGGGacgggcgg > 2:1242584/1‑101 (MQ=11)
gtctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat < 1:1568596/97‑3 (MQ=14)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGGGGGGCCGGGGGATCGGGGGGGTCGGGGGGAtcgtgggggc > 2:3728284/1‑94 (MQ=11)
tgggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:2714030/99‑1 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:4162409/1‑101 (MQ=11)
tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATAGGTCGGATCCGTGGGAGCGGTCGGGTc > 1:3772286/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc > 2:583967/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATTGGTCGGGGTCGTGGGGTCGGGCGGGAcc > 2:4320269/1‑101 (MQ=11)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc > 2:653902/1‑101 (MQ=11)
cgctcgggtccgtgagatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:4141322/98‑1 (MQ=11)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATGGGTCGGGTCCg > 2:1776999/1‑101 (MQ=11)
ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 1:3975612/1‑101 (MQ=11)
ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 1:3000167/1‑101 (MQ=11)
cgtcagatccctgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 2:1687281/94‑1 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCgg > 1:1060985/1‑100 (MQ=14)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg > 2:2514352/1‑100 (MQ=14)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg > 1:3493529/1‑100 (MQ=14)
tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg > 2:3796832/1‑100 (MQ=11)
tcggatccgtgggatctgtcggatccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg < 2:4468521/101‑2 (MQ=11)
cggttccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg > 1:2637944‑M2/1‑99 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGGCCGtgg > 2:719818/1‑99 (MQ=14)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 1:4473456‑M2/101‑3 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCAGGTCCGTGGGGTCCTTCGGACCCGTGGGATCGGCCGGCTccctgg > 1:4242450/1‑97 (MQ=14)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTGGGGTCCGTGgg > 2:3298188/1‑101 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg > 1:916030/1‑101 (MQ=11)
ggctccgtgggatcggtcgtgtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGgg > 1:2891471/4‑101 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCgg < 1:3316895/98‑1 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtggGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCggggga > 1:362055/1‑96 (MQ=11)
ccggtgggatcggtcgggtccgtgggctccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:2286651/98‑1 (MQ=11)
ccgtgggttcgttcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:3477343/101‑1 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcagatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTCGGAtcg > 1:3108322/1‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt > 1:1246404‑M2/1‑92 (MQ=255)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt < 1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 1:2264172‑M2/101‑11 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg > 2:2953171/1‑101 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgg > 1:4710059/1‑101 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt < 2:4920883‑M2/101‑15 (MQ=255)
tctgtcggggccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc < 2:900145/98‑1 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtcc > 2:3176530‑M2/1‑85 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtcc < 1:1329977‑M2/101‑17 (MQ=255)
ggtggggtccgtgggatcggtcggGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg > 2:2694236‑M2/1‑84 (MQ=255)
ggtcgtgtccgtgggaccgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg < 2:1052719/101‑1 (MQ=11)
tcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtc < 1:4918931/101‑1 (MQ=11)
ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggg < 1:4853885‑M2/101‑23 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCGgtcgggccggtggga > 2:2406988/1‑92 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatc < 1:625403‑M2/101‑25 (MQ=255)
cgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg > 1:673417/1‑101 (MQ=14)
gtgggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTcgggtccgtcggatccgt > 2:4568572/1‑101 (MQ=11)
gggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgg > 1:755246/1‑101 (MQ=11)
gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg > 2:2765094/7‑101 (MQ=11)
gggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGGCCGTcgg > 2:2028635/7‑101 (MQ=11)
gatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggg < 1:1780740‑M2/101‑32 (MQ=255)
gtccgtcggaTCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt > 2:4031667‑M2/2‑69 (MQ=255)
atctgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgggt < 1:4418923‑M2/101‑33 (MQ=255)
cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtcc > 2:4756924‑M2/1‑67 (MQ=255)
ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg < 1:3408830‑M2/101‑36 (MQ=255)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtacgg < 2:1136382‑M2/101‑37 (MQ=255)
tcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtg > 2:484697/1‑100 (MQ=14)
tcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGCTCCGTGGGGtccgtg > 1:1146235/1‑100 (MQ=11)
ggggttCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtg > 1:2172996‑M2/3‑64 (MQ=255)
cggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtgg < 1:2461276/101‑3 (MQ=11)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgg < 2:2856757‑M2/101‑39 (MQ=255)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg < 2:2594445‑M2/101‑40 (MQ=255)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtggg > 2:2121645/1‑101 (MQ=11)
ggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg > 2:365174/3‑100 (MQ=14)
aTCGGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt < 1:3708260/101‑1 (MQ=18)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcg > 1:2802825‑M2/1‑58 (MQ=255)
ggtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 2:5030160/5‑101 (MQ=17)
gATGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa > 1:3888247/1‑101 (MQ=17)
gATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCggcggg > 2:1554230/1‑96 (MQ=17)
tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGCCCTGGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 2:421017/1‑101 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc < 1:4600946‑M2/101‑53 (MQ=255)
ggtcggGTCCGTGGGATCAGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccg < 1:1406813‑M2/101‑54 (MQ=255)
|
GCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCG > NC_014034/221918‑222118
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 16 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|