| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,033 | 0 | G→C | 5.3% | 158.9 ‑4.8 ‑0.5 | 1622 | T208T (ACC→ACG) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (27/62): ref base (682/847): total (711/911) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.31e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.31e-01 | ||||||||||
Only 100 of 2121 total aligned reads displayed.
GCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGG > NC_014034/221933‑222133
|
ccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:2253467‑M1/78‑1 (MQ=255)
ccGTTGGATCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 1:1554360/100‑1 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGatcggg < 2:442874‑M1/80‑2 (MQ=255)
tCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:3720793/1‑101 (MQ=255)
ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcgg > 1:988919/1‑101 (MQ=255)
tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc < 1:556772/101‑1 (MQ=255)
cctGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 1:627537/99‑1 (MQ=255)
gggtcggtgggGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg < 1:4588052/98‑1 (MQ=11)
atccgtgggatcggtcgggtccgtgggttcggtcggatccgtgGGTTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCNGATCCGTGGGCTCGGCCGGCCCCGGGGGAt > 1:871304/8‑101 (MQ=11)
tcggtgggATCGGTCGGGTCCGTCGCATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 2:1146121/101‑1 (MQ=11)
tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc > 2:476899/1‑101 (MQ=255)
gcggggggaccggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:2085198/95‑1 (MQ=14)
ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGtcgg > 1:4327192/1‑101 (MQ=11)
tggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGGGGGAtcggtc > 1:4471242/9‑101 (MQ=11)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:3217402‑M1/99‑1 (MQ=255)
gGGCTCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:1062207‑M1/2‑101 (MQ=255)
gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:1399627‑M1/2‑101 (MQ=255)
gGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg < 2:4860325‑M1/100‑1 (MQ=255)
cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:3631390/1‑101 (MQ=255)
ggcttgttcgggacggtgggatcgctcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgg < 2:2952526/94‑1 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGAGGGGTCGGGCGGATCCGAGGGGTGGGGCGGTCCGGGGGGGccggtcgg > 2:4478281/1‑101 (MQ=2)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 2:2184969/1‑101 (MQ=14)
ggaggggtcgggccggtgggcgcggtcggatcggtgggatcGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:3013635/96‑1 (MQ=11)
gtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt < 2:3836376/97‑1 (MQ=14)
atcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat < 2:1434841/101‑3 (MQ=11)
acgggttgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggat < 2:3562458/98‑3 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:4162409/1‑101 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtacgtgcggtCCGTCGGATCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:458473/101‑1 (MQ=14)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:3493360/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggatacg > 2:1543940/1‑96 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg > 1:1766623/1‑101 (MQ=11)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 1:766892/1‑101 (MQ=11)
ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg > 1:3975612/1‑101 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcact > 1:2794953/1‑98 (MQ=14)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGTTCCgg > 2:405038/1‑100 (MQ=14)
gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGGGGGGTCGGTGGGGTcggg > 2:5045926/1‑98 (MQ=11)
gcgtggccgtgggatcggtcggatccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTa < 2:665355/95‑1 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGtgg > 2:2034974/1‑99 (MQ=14)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTAGGTGGGGTCCGTGgg > 2:3298188/1‑101 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg > 1:1872938‑M2/1‑98 (MQ=255)
ggctccgtgggatcggtcgtgtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGgg > 1:2891471/4‑101 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa > 1:2451204/1‑101 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGGCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGggt > 2:4935444/1‑100 (MQ=14)
gctccgtgggatcggtcgggtccgtcggatccgtgggATCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 2:3408567/99‑1 (MQ=11)
gtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat > 1:4690685‑M2/1‑96 (MQ=255)
ctccgtgggtccggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt < 2:3741004/100‑1 (MQ=11)
tccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:1473594/101‑1 (MQ=14)
ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCCGGCGGGTCCGTGGGAtcg > 1:3495273/1‑101 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtgg > 2:4682265/1‑99 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggcccgtgggatcgggcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGGACGGTGGGAtccgt > 1:3329344/1‑101 (MQ=11)
gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt < 1:1001112‑M2/101‑10 (MQ=255)
ttggatctgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtc < 2:1364439/99‑1 (MQ=14)
tgggatcgttcgtaacggtcgggtcggtcggGTCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:274571/101‑1 (MQ=14)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTG.........GGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc > 1:4779939/1‑101 (MQ=11)
ggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgg < 2:2593938‑M2/101‑13 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:1665519/101‑1 (MQ=11)
gtcgggcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggt < 1:3532947/100‑1 (MQ=11)
ggcggtcggggccgtgggagcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat < 1:1948654/99‑3 (MQ=11)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtcc < 1:1329977‑M2/101‑17 (MQ=255)
gtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt < 1:2537986‑M2/101‑19 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGAGCGTGGGATCGATCGGGACAGCGGGATCGatcgggcgcgtgg > 2:1676821/1‑94 (MQ=11)
ggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggg < 1:4853885‑M2/101‑23 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCGgtcgggccggtggga > 2:2406988/1‑92 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcg > 1:1160963/1‑100 (MQ=255)
gggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggcccgtgggatcggtcg < 1:1062320‑M2/101‑30 (MQ=255)
cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgg > 2:4151308/11‑101 (MQ=11)
gggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTggg > 1:4931036/10‑101 (MQ=11)
cggtcggATCCGTGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATGGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtcc < 1:677466/101‑2 (MQ=11)
ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccg < 1:3408830‑M2/101‑36 (MQ=255)
cggggccGGGGGATCGGTCGGGTTGGTCGGGGGGGTCGGATGCGTGGGTTCGGTCGGGGCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGTTCCGTGGGAtcggtcg < 1:4414502/96‑1 (MQ=2)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtggg > 2:2121645/1‑101 (MQ=11)
gATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgcggga < 2:228891‑M2/101‑41 (MQ=255)
tCCTTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 2:3665481/101‑1 (MQ=14)
tCCGTGGGGTCCGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATc < 1:923758/101‑1 (MQ=11)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:3957605/1‑101 (MQ=14)
cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcgg < 2:903777‑M2/101‑45 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggt < 1:3888642‑M2/101‑46 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggcccgtgggatcggt < 1:2702492‑M2/101‑46 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt > 2:251537‑M2/1‑56 (MQ=255)
cggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:4086794‑M2/100‑48 (MQ=255)
aggATCGGTCGGGCCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTTCGtcg > 2:4217022/2‑99 (MQ=14)
gtgtcggtcggTTCCGGGTGATCGGTCGGATCCGTGGTATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:319488/98‑1 (MQ=14)
tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatc > 2:2845650‑M2/1‑50 (MQ=255)
gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 2:3068166/4‑101 (MQ=255)
gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgg < 2:732996‑M2/101‑55 (MQ=255)
gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgt < 1:2356988‑M2/101‑55 (MQ=255)
gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgt > 1:1249286‑M2/1‑47 (MQ=255)
ggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcggatccgtgggg < 1:26112‑M2/101‑59 (MQ=255)
tcggTGGGTTCGGCCGGATCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:3788518/98‑1 (MQ=17)
tCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTc < 1:4221573/101‑1 (MQ=17)
gtggTGGGCTCGGTCGGGTTGGTGGGATCGGTCGGCTCTGTGGGGACCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTc < 1:2169398/98‑1 (MQ=2)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg > 2:603241/1‑101 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 2:1902534‑M2/101‑64 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg > 2:1246292/1‑100 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 1:5030881/1‑101 (MQ=17)
tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtc < 2:2689474‑M2/101‑65 (MQ=255)
tGGGATCGGGCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGta < 1:3121764/101‑2 (MQ=17)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAACCGGGGGAGCGGTCgggggcgggg > 2:4342439/1‑94 (MQ=18)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgg < 2:1776766‑M2/101‑67 (MQ=255)
tcggtcgcTTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc > 2:839510‑M2/1‑32 (MQ=255)
|
GCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGG > NC_014034/221933‑222133
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|