Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,951,528 | 2 bp→GC | 100% | coding (65‑66/528 nt) | ssb1 ← | single‑stranded DNA‑binding protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_014034 | 1,951,528 | 0 | C→G | 100.0% | 823.4 | 222 | T22T (ACG→ACC) | ssb1 | single‑stranded DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (111/111): ref base (0/0): total (111/111) | ||||||||||
* | NC_014034 | 1,951,529 | 0 | G→C | 100.0% | 827.6 | 221 | T22R (ACG→AGG) | ssb1 | single‑stranded DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (110/111): ref base (0/0): total (110/111) |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
CATTCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAACGTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCG > NC_014034/1951433‑1951623
||
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cGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCAcc > 1:1907039/1‑101 (MQ=255)
cGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCAcc > 1:99622/1‑101 (MQ=255)
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cgcTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCgg < 1:2123710/101‑1 (MQ=255)
tCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTc > 2:4772644/1‑101 (MQ=255)
tCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTc < 1:2624612/101‑1 (MQ=255)
ccTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTcg > 2:4454717/1‑101 (MQ=255)
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cGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGc < 2:1786577/101‑1 (MQ=255)
cGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGAGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGc > 2:1943170/1‑101 (MQ=255)
gATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGcc > 1:621597/1‑101 (MQ=255)
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aTTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGccc < 2:1361021/101‑1 (MQ=255)
aTTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGccc > 1:3176230/1‑101 (MQ=255)
ttGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGcccc > 2:2433033/1‑100 (MQ=255)
ttGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCcca < 2:2571257/101‑1 (MQ=255)
ttGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGGGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCcca > 2:747880/1‑101 (MQ=255)
tGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccac < 1:2456261/101‑1 (MQ=255)
tGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGATGCccac > 1:129711/1‑101 (MQ=255)
gCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccacc > 1:513081/1‑101 (MQ=255)
gCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccacc < 2:3175979/101‑1 (MQ=255)
cTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccacca > 1:3781369/1‑101 (MQ=255)
cTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccacca < 1:1139830/101‑1 (MQ=255)
ttGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAg < 2:3283512/101‑1 (MQ=255)
ttGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAg < 2:2559128/101‑1 (MQ=255)
ttGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAg < 1:2212433/101‑1 (MQ=255)
tGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGa > 2:2920281/1‑101 (MQ=255)
tGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGa > 2:4805844/1‑101 (MQ=255)
tCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAAt < 2:4886989/101‑1 (MQ=255)
cgcgCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGTCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATg < 2:4372060/101‑1 (MQ=255)
cgcgCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATg < 2:934467/101‑1 (MQ=255)
cgcgCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATg < 1:3019036/101‑1 (MQ=255)
cgcgCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATg < 1:367697/101‑1 (MQ=255)
gcgcCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGa > 1:4089599/1‑101 (MQ=255)
gcCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGAcc > 2:1658548/1‑101 (MQ=255)
gcCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGAcc > 2:704568/1‑101 (MQ=255)
ccAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCt > 2:3694896/1‑101 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt > 2:3350982/1‑101 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt < 1:2639287/101‑1 (MQ=255)
aGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTg > 1:3240967/1‑101 (MQ=255)
ggTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGt > 2:1241692/1‑101 (MQ=255)
gTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGtt < 1:1383204/101‑1 (MQ=255)
gTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGACCACCAGAATGACCTTGtt > 2:431771/1‑101 (MQ=255)
tctcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTc > 1:1935780/1‑101 (MQ=255)
ctcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTTCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCa < 1:4329467/101‑1 (MQ=255)
ctcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCa > 2:118130/1‑101 (MQ=255)
tcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCAc < 2:4161938/101‑1 (MQ=255)
tcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCAc < 2:308975/101‑1 (MQ=255)
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ccGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCAcc > 1:308775/1‑101 (MQ=255)
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cGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCg > 2:2654503/1‑101 (MQ=255)
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cGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGcc < 1:4137998/101‑1 (MQ=255)
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aTGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCAt > 1:3729521/1‑101 (MQ=255)
gcgcAGGTTGCAGCCCTTCCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGa < 1:2753094/101‑1 (MQ=255)
cgcAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGaa < 1:234336/101‑1 (MQ=255)
aGGTTGCAGCCCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAAct < 2:2927491/101‑1 (MQ=255)
ttGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCTCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACtctc < 2:5010685/101‑1 (MQ=255)
ttGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACtctc > 1:3522586/1‑101 (MQ=255)
ttGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACtctc > 1:1580872/1‑101 (MQ=255)
tGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTcc < 1:452724/101‑1 (MQ=255)
tGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTcc > 1:4044373/1‑101 (MQ=255)
tGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTcc > 1:3421728/1‑101 (MQ=255)
gCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCg > 2:306655/1‑101 (MQ=255)
cAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGt > 2:3752440/1‑101 (MQ=255)
cAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGt < 2:4016190/101‑1 (MQ=255)
aGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTa < 1:2324636/101‑1 (MQ=255)
aGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCCCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTa < 2:4124189/101‑1 (MQ=255)
ccTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTg < 1:1237996/101‑1 (MQ=255)
tGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGcc > 1:894533/1‑101 (MQ=255)
cgccATTGGCGAAGCTGCGCAACTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGa > 1:2860861/1‑101 (MQ=255)
gccATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAg > 2:2257041/1‑101 (MQ=255)
gccATTGGCGAAGCTCCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCCCCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAg < 2:970691/101‑1 (MQ=255)
ccATTGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGc < 2:1517376/101‑1 (MQ=255)
cATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCg > 1:293128/1‑101 (MQ=255)
ttGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAc > 2:1985291/1‑101 (MQ=255)
tGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAcc < 1:4480902/101‑1 (MQ=255)
ggCGAAGCTGCGCTCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAccc < 1:2007692/101‑1 (MQ=255)
ggCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGTTTGCCCACCAGAATGACCTTTTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAccc < 1:4002622/101‑1 (MQ=255)
gCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCg < 1:4973453/101‑1 (MQ=255)
||
CATTCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAACGTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCG > NC_014034/1951433‑1951623
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|