| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 2,304,900 | 2 bp→CA | 100% | coding (2674‑2675/2808 nt) | RCAP_rcc02139 ← | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 2,304,900 | 0 | A→C | 100.0% | 620.6 | 181 | V892G (GTA→GGA) | RCAP_rcc02139 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (92/89): ref base (0/0): total (92/89) | ||||||||||
| * | NC_014034 | 2,304,901 | 0 | C→A | 100.0% | 616.4 | 181 | V892L (GTA→TTA) | RCAP_rcc02139 | methyl‑accepting chemotaxis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (91/89): ref base (1/0): total (92/89) | ||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
GATAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCGCCCTGCATG.C.GAAGACCG.CGTACGCTCCCGCA.GGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTG > NC_014034/2304808‑2304988
||
gATAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCCGCTccc > 2:2893587/1‑101 (MQ=255)
aTAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCg > 2:7146/1‑101 (MQ=255)
tAATCTTGCGCAAACCGCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGc < 2:819529/101‑1 (MQ=255)
tAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGc > 1:1097237/1‑101 (MQ=255)
aaTCTTCCGCAAAACTGGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGCCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCa < 1:2088995/101‑1 (MQ=255)
ctggcaaaaaaCTCGGCCGGATCGGGCGTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.ggg < 2:1424661/94‑2 (MQ=255)
ttGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggc > 1:4776095/1‑99 (MQ=255)
tGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGGCTGTCAGCCCGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggtc > 2:159248/1‑98 (MQ=255)
tGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.ggggc > 2:4853549/1‑98 (MQ=255)
gcgcAAACCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggtct < 2:3803548/101‑5 (MQ=255)
gcgcAAACCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggtct < 2:2183115/101‑5 (MQ=255)
gcgcAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggtct > 1:2473089/1‑97 (MQ=255)
gcgaAAACCCCGGCCGGACCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggtct < 2:77489/101‑5 (MQ=255)
cgcAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.gggtctg > 2:4285698/1‑96 (MQ=255)
gcAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.ggggctgc > 2:2567359/1‑95 (MQ=255)
gcAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCA.ggggctgc > 1:1998611/1‑95 (MQ=255)
ccAAAGCTCGCCCGATTCCGGCCTGCCACCCGCCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTgc < 2:2519334/100‑1 (MQ=255)
aaaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGGCTGCGcc > 1:1823300/1‑101 (MQ=255)
aaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCt > 1:2523181/1‑101 (MQ=255)
aaCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCt > 1:3949382/1‑101 (MQ=255)
aCTCGGCCGGTTCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTc < 2:2629083/101‑1 (MQ=255)
aCTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTc > 2:2543504/1‑101 (MQ=255)
cTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCg < 1:3179931/101‑1 (MQ=255)
cTCGGCCGGACCGGCCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCg < 2:4912025/101‑1 (MQ=255)
cTCGGCCGGACCCGGCCGGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCg < 1:977032/101‑1 (MQ=255)
gggCCGGATCGGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGcc < 1:4986565/100‑1 (MQ=255)
cGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGGCTGCGCCTCGcc > 2:3532872/1‑101 (MQ=255)
ggCCGGATCCGGCCGGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGccc < 1:868752/101‑1 (MQ=255)
gcgggACCCGGCCGGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCca < 1:2056116/98‑1 (MQ=255)
gCCGGACCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCca < 2:4309164/101‑1 (MQ=255)
ggATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagca > 2:706426/1‑101 (MQ=255)
ggATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagca > 1:2784044/1‑101 (MQ=255)
ggATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagca > 2:1966451/1‑101 (MQ=255)
gATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagcag > 1:1524288/1‑101 (MQ=255)
gATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCcagcag > 1:2438177/1‑101 (MQ=255)
acccGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCagcagc < 1:4277411/99‑1 (MQ=255)
cggccttggcAGGCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGGCCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAgcgc < 2:4011356/92‑1 (MQ=255)
ccGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAgcgc < 1:4115481/101‑1 (MQ=255)
ccGGCCTGCCGGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAgcgc < 1:3684678/101‑1 (MQ=255)
gCCTGCCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTg < 1:2740276/101‑1 (MQ=255)
ccTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCTCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGc > 1:4370972/1‑101 (MQ=255)
tGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGt > 2:3322317/1‑101 (MQ=255)
gTCGGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCggc < 2:1286962/101‑3 (MQ=255)
gTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATGCC.GAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc < 1:4246878/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc > 2:2753618/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTc < 1:624535/101‑1 (MQ=255)
tCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcg < 2:4711541/101‑1 (MQ=255)
cAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTcgc > 2:1232618/1‑101 (MQ=255)
ccGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGGGCCTGCGTCGCGGc > 2:3344873/1‑101 (MQ=255)
ccGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGc > 1:3158477/1‑101 (MQ=255)
cgcccTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGcc < 1:3482132/98‑1 (MQ=255)
cGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGcc < 1:4709747/101‑1 (MQ=255)
cGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGcc < 1:402868/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGt < 1:4041239/101‑1 (MQ=255)
gCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGttt > 2:4435963/1‑101 (MQ=255)
gCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAACAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGttt > 1:707899/1‑101 (MQ=255)
gCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCCCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCCttt < 1:304956/101‑1 (MQ=255)
ccGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGgttt > 1:2879519/1‑101 (MQ=255)
cGCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTc > 1:3268232/1‑101 (MQ=255)
gCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTcc > 2:4607544/1‑101 (MQ=255)
gCAACGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTcc > 1:1692389/1‑101 (MQ=255)
aCGGCGGCGCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCg > 2:2732058/1‑101 (MQ=255)
gcggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAAc < 1:683096/101‑1 (MQ=255)
gcggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAAc > 2:3909909/1‑101 (MQ=37)
gcggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAAc > 1:4799363/1‑101 (MQ=37)
cggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCACGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACa > 2:2574315/1‑101 (MQ=255)
ggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACAt < 1:1005113/101‑1 (MQ=255)
ggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACAt > 2:1702234/1‑101 (MQ=255)
ggcgCCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACAt > 1:4902892/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGGTGGCG.CCTGCAGG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATc < 2:1498221/101‑1 (MQ=25)
cgcCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcg < 1:2413117/101‑1 (MQ=25)
cgcCGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcg < 1:1439524/101‑1 (MQ=25)
ccGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgcc > 1:573408/1‑101 (MQ=25)
ccGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgcc < 2:595284/101‑1 (MQ=25)
cGGTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccg > 2:1380820/1‑101 (MQ=25)
ggTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccgc > 1:2852134/1‑101 (MQ=25)
ggTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccgc > 2:3092883/1‑101 (MQ=25)
ggTGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATcgccgc > 2:3288950/1‑101 (MQ=25)
tGGCG.CCTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAt > 2:4240703/1‑101 (MQ=25)
gttgcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCa > 1:1797605/7‑101 (MQ=21)
gggcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAt < 2:3408481/96‑1 (MQ=25)
ggcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAtt > 1:1330578/5‑101 (MQ=25)
ggcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAtt < 2:3949090/97‑1 (MQ=25)
ggcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCAtt < 1:3124796/97‑1 (MQ=25)
gcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtg < 1:2243237/98‑1 (MQ=25)
gcgccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtg < 1:3193565/98‑1 (MQ=25)
gccTGCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATtgtg < 1:282353/100‑1 (MQ=25)
gCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg > 1:1005533/1‑101 (MQ=21)
gCATG.CGGAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTgg > 2:3663920/1‑101 (MQ=21)
gcggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGa > 2:2676707/4‑101 (MQ=21)
gcggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGa < 2:2719885/98‑1 (MQ=25)
cggAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGGCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTggggaac > 2:2033939/3‑97 (MQ=21)
gAAGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCt < 1:3910201/101‑1 (MQ=25)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg > 2:4716689/1‑101 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg < 2:2916737/101‑1 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg < 1:2574496/101‑1 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg < 2:4919456/101‑1 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg < 1:3072427/101‑1 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg > 2:2236410/1‑101 (MQ=21)
aaGACCGCCGTCAGCTCCCGCAGGGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTg > 1:1750586/1‑101 (MQ=21)
||
GATAATCTTGCGCAAAACTCGGCCGGATCCGGCCTGTCAGCCGGCCTGCCGCAACGGCGGCGCCGGTGGCGCCCTGCATG.C.GAAGACCG.CGTACGCTCCCGCA.GGTCTGCGCCTCGCCCAGCAGCGCCTGCGTCGCGGCCGCGTTTTCCTCGAACATCGCCGCATTGTGCTGGGTGACCTG > NC_014034/2304808‑2304988
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|