| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,823,740 | +C | 100% | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687 → / → RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,823,740 | 1 | .→C | 100.0% | 94.0 | 268 | intergenic (+25/‑148) | RCAP_rcc01687/RCAP_rcc01688 | HK97 family phage major capsid protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (156/80): ref base (1/30): total (158/110) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.03e-12 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 4.51e-03 | ||||||||||
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCC > NC_014034/1823640‑1823835
|
tATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.c > 1:124327/1‑101 (MQ=255)
tATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.c > 1:728231/1‑101 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGTTCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.cc < 1:6436581/101‑1 (MQ=255)
aTGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.cc > 2:5965393/1‑101 (MQ=255)
tGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccc < 1:2171047/101‑1 (MQ=255)
gCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.cccc < 2:3098612/101‑2 (MQ=255)
gCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.cccc < 1:5523764/101‑2 (MQ=255)
cGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccg < 1:5299804/101‑3 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccgg < 2:2544032/101‑4 (MQ=255)
gAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.ccccgg < 2:3915644/101‑4 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTgc > 1:5153196/1‑101 (MQ=255)
aaGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTgc > 1:2382844/1‑101 (MQ=255)
aGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTgcc > 1:6106587/1‑101 (MQ=255)
gCGGGTGGGCGGGGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTgccg < 1:1866706/101‑1 (MQ=255)
tGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGCTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGt > 2:5540858/1‑101 (MQ=255)
gggCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGtt < 2:6717898/101‑1 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTc < 1:5246047/101‑1 (MQ=255)
ggcggcGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTc < 2:6559606/101‑1 (MQ=255)
ggggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCg < 2:2512042/99‑1 (MQ=255)
gcggcgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCg > 2:1215788/1‑101 (MQ=255)
cgATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCgg < 1:6975921/101‑1 (MQ=255)
gATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGt > 1:2543797/1‑101 (MQ=255)
aTGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTc > 1:1180888/1‑101 (MQ=255)
tGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcg < 1:5840094/101‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcg > 1:5897008/1‑101 (MQ=255)
gTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTcgg > 1:4545693/1‑101 (MQ=255)
cAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGGA.AGCCCGGCTGCCGCCGGGTCGCCGGGcgggg > 2:2273949/1‑100 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 1:1010765/1‑101 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 1:3399460/1‑101 (MQ=255)
gATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCgggcgggc > 2:540123/1‑101 (MQ=255)
aTTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGggcgggcg > 2:1474522/1‑101 (MQ=255)
tttCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgc < 2:4868748/101‑1 (MQ=255)
cgccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcggg > 1:445692/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcgggc > 1:373313/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcgggc > 1:3505735/1‑101 (MQ=255)
gccgcGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGgcgggcgcgggc < 2:6466322/101‑1 (MQ=255)
cggcgTTCAAGTTGGTGAAGTTCGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCt < 1:1788867/99‑1 (MQ=255)
cgcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCtt > 1:6210875/1‑101 (MQ=255)
gcgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTc > 2:4285151/1‑101 (MQ=255)
cgATCAAGCTTTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGGCGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc < 1:3131548/101‑1 (MQ=255)
cgATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTcc > 1:6742242/1‑101 (MQ=255)
aTCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCgg < 2:233743/101‑1 (MQ=255)
aTCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCgc > 2:3385678/1‑100 (MQ=255)
gCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCt < 2:834317/101‑1 (MQ=255)
cTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTg > 1:4213209/1‑101 (MQ=255)
tGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGc < 1:892020/101‑1 (MQ=255)
ggtggAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGc < 1:2242026/97‑1 (MQ=255)
gTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGcc > 1:6559412/1‑101 (MQ=255)
ttGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCt > 1:3967949/1‑101 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa > 2:1922629/1‑101 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa > 2:6794735/1‑101 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa < 1:4953652/101‑1 (MQ=255)
tGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTa > 1:3461945/1‑101 (MQ=255)
gTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctg > 2:4155986/1‑101 (MQ=255)
tttGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAgctgc > 1:7051194/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc < 1:2663365/101‑1 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc > 1:3764250/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctc > 2:3820065/1‑101 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc > 1:3856157/1‑101 (MQ=255)
gccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctcc < 1:1659564/101‑1 (MQ=255)
ccgccTCGTAGCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccc < 2:1444075/101‑1 (MQ=255)
ccgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccc > 1:6308792/1‑101 (MQ=255)
ccgccTCGGAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccc < 2:2102081/101‑1 (MQ=255)
cgccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct < 2:4955632/101‑1 (MQ=255)
cgccCCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGCCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccct < 1:5107740/101‑1 (MQ=255)
gccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctc < 2:372067/101‑1 (MQ=255)
ccTCTTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc < 2:628383/101‑1 (MQ=255)
ccTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGctccctcc > 2:6993580/1‑101 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTCGCTGCTCCCtccg > 1:4026136/1‑101 (MQ=255)
cTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccg < 1:2180151/101‑1 (MQ=255)
cGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtc < 1:2993768/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 2:4535296/101‑1 (MQ=255)
gTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc > 2:3531342/1‑101 (MQ=255)
ctagcGGGCGGGGAAGGGCCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCtccgtcc < 2:1985571/97‑1 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa < 2:5471229/101‑1 (MQ=255)
aaCGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGa > 1:2882952/1‑101 (MQ=255)
cGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGt < 2:2882843/101‑1 (MQ=255)
cGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGGCCGAgg > 2:3198424/1‑100 (MQ=255)
gggGGGTGAGGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg < 1:97903/101‑1 (MQ=255)
gggCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTg > 1:1571500/1‑101 (MQ=255)
gCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGc < 1:3600850/101‑1 (MQ=255)
gCGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGc < 2:5274373/101‑1 (MQ=255)
cGGTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCg < 1:5690445/101‑1 (MQ=255)
cGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCg > 1:5985333/1‑101 (MQ=255)
gTGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGt < 2:1799802/101‑1 (MQ=255)
tGAAGGGGCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTg < 2:1589964/101‑1 (MQ=255)
tGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTg > 1:5005546/1‑101 (MQ=255)
tGAAGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTg > 2:1647898/1‑101 (MQ=255)
aaGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGGGCg > 1:3250507/1‑101 (MQ=255)
aGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCgg > 1:4083672/1‑101 (MQ=255)
aGGGGCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCgg > 2:1048413/1‑101 (MQ=255)
ggggCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCCGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCggg < 2:3449974/101‑1 (MQ=255)
ggCCGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCggggg > 1:6198230/1‑100 (MQ=255)
gCCGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTc < 1:6888188/101‑1 (MQ=255)
ccGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 1:815214/101‑1 (MQ=255)
ccGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCt < 2:7134746/101‑1 (MQ=255)
cGGGGGCACC.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg < 1:6819950/101‑1 (MQ=255)
cGGGGGCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTg > 1:1460018/1‑101 (MQ=255)
gggggCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGGGCGGGGTCTgc > 1:4782085/1‑101 (MQ=255)
gggCA.ACCCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTgcgc > 2:5864209/1‑101 (MQ=255)
|
CTATGCGAGCAAGCGGGTGGGCGGCGATGTCAGCGATTTCGCCGCGATCAAGCTGTTGAAGTTTGCCGCCTCGTAACGGGCGGTGAAGGGGCCGGGGGCA.A.CCCGGCTGCCGCCGGTTCGCCGGTCGGGCGGGCGCGGGCTTCCGGCCGCTGCCTAGCTGCTCCCTCCGTCCGAGTGGCGGTGCGGGGTCTGCGCC > NC_014034/1823640‑1823835
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|