Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,948,851 | +G | 89.1% | coding (1069/2472 nt) | quiP ← | acyl‑homoserine‑lactone acylase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,948,851 | 1 | .→G | 89.1% | 103.3 ‑0.8 ‑0.9 | 313 | coding (1069/2472 nt) | quiP | acyl‑homoserine‑lactone acylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (113/166): ref base (16/18): total (129/184) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.67e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.24e-01 |
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
TGATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.GCCC.ACCCTCGGGGCTGCGG.T.A.CGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGC > NC_014034/1948751‑1948943
|
gATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.g > 1:7009051/1‑101 (MQ=255)
gATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.g > 1:2298711/1‑101 (MQ=255)
ccGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggcc > 1:1459776/1‑101 (MQ=255)
ggcGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACAC.Ggccca < 2:1633686/99‑3 (MQ=255)
gACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggccca < 1:4455495/101‑3 (MQ=255)
aCGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggcccaa < 1:5221834/101‑4 (MQ=255)
ggCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggcccaacc < 1:1548856/101‑6 (MQ=255)
agcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggcccaaccctc < 1:1018757/101‑9 (MQ=255)
agcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggcccaaccctc < 1:5135463/101‑9 (MQ=255)
agcaCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.Ggcccaaccctc < 2:5124810/101‑9 (MQ=255)
caCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTTAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGTGGGTCCACTCGGCCCAACCCTCgg > 2:4272579/1‑101 (MQ=255)
caCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCgg < 2:1997132/101‑1 (MQ=255)
caCCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGAGCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGGGAACTCGGCCCAACCCTCgg > 2:2236201/1‑101 (MQ=255)
ccGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCgggg > 1:5536046/1‑101 (MQ=255)
ccGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCgggg > 1:1943051/1‑101 (MQ=255)
gggCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCt > 1:6053769/1‑101 (MQ=255)
ggCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTg < 2:4555715/101‑1 (MQ=255)
gCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGc < 2:4718637/101‑1 (MQ=255)
ccGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCg < 2:3348388/101‑1 (MQ=255)
gTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.t < 2:6267170/101‑1 (MQ=255)
gTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.t > 2:803577/1‑101 (MQ=255)
gTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.t > 2:6227324/1‑101 (MQ=255)
ttttCGGTCCAGCGCAGNGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.a < 2:941926/101‑1 (MQ=255)
tttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.ag < 1:278631/101‑2 (MQ=255)
ttCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.agc < 1:4591741/101‑3 (MQ=255)
cGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.agcgc < 2:6029048/101‑5 (MQ=255)
ggTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.agcgct > 2:56002/1‑96 (MQ=255)
gTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTc < 2:6430832/101‑1 (MQ=255)
gTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTc < 2:2367207/101‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCgg < 1:6240631/101‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCgg < 1:3526471/101‑1 (MQ=255)
ccAGCCCAGGGGGAGGGTGATCGGGGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCgg > 2:7027772/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCATCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCggg < 1:3663971/101‑1 (MQ=255)
aGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGc > 2:5234988/1‑101 (MQ=255)
aGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGc < 2:3036088/101‑1 (MQ=255)
gcgcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCg > 2:1499148/1‑101 (MQ=255)
cgcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGt < 2:440607/101‑1 (MQ=255)
gcAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGtt > 2:5951038/1‑101 (MQ=255)
agggtgagggtgATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.TCG.CGCTCGGGCGtttt < 1:5639518/101‑1 (MQ=255)
agggtgagggtgATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGtttt > 1:2114523/1‑101 (MQ=255)
gggtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTc < 2:5785071/101‑1 (MQ=255)
ggtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCg < 2:1171816/101‑1 (MQ=255)
ggtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCg > 1:4036584/1‑101 (MQ=255)
gtgagggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCgg < 2:2619671/101‑1 (MQ=255)
agggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATc > 1:1773203/1‑101 (MQ=255)
gggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCa < 2:6883029/101‑1 (MQ=255)
gggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCa < 2:3884823/101‑1 (MQ=255)
gggtgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCa < 2:121452/101‑1 (MQ=255)
tgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGt > 2:3823060/1‑101 (MQ=255)
tgaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGt > 2:566306/1‑101 (MQ=255)
gaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGtt < 2:1458423/101‑1 (MQ=255)
gaTCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGtt > 1:6648538/1‑101 (MQ=255)
ggCGCGGCATGCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACTCCCGGGGCGGAGGAG.A.AGCTCGGGCGATTTCGGATCAAATTCCTc > 2:3293189/1‑101 (MQ=255)
ggCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTc < 1:39136/101‑1 (MQ=255)
gcgcGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcg < 1:580170/101‑1 (MQ=255)
gcgcGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGAGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcg < 1:5951342/101‑1 (MQ=255)
cgcgGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcga > 1:2703878/1‑101 (MQ=255)
gcgGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcgac < 1:4108443/101‑1 (MQ=255)
gcgGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcgac < 2:2998277/101‑1 (MQ=255)
cgGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTcgacg < 1:2556598/101‑1 (MQ=255)
gCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGaa < 1:791440/101‑1 (MQ=255)
tCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAg > 2:2443793/1‑101 (MQ=255)
tCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAg < 1:676299/101‑1 (MQ=255)
ccTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAgg > 1:1334998/1‑101 (MQ=255)
cTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGt < 1:4895323/101‑1 (MQ=255)
cTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGt < 1:222067/101‑1 (MQ=255)
cTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGt < 1:6529456/101‑1 (MQ=255)
ttGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTc > 2:1886925/1‑101 (MQ=255)
gACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCt < 1:1060168/101‑1 (MQ=255)
gACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCt < 2:3255401/101‑1 (MQ=255)
aCCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.TCG.CGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTc < 2:4866432/101‑1 (MQ=255)
aCCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTc > 2:2712147/1‑101 (MQ=255)
ccGTGACGATCTTCTTGCTGCTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCg < 1:4377347/101‑1 (MQ=255)
gTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTc > 1:2989163/1‑101 (MQ=255)
tGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAATCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCa < 1:3372922/101‑1 (MQ=255)
tGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCa > 1:4662091/1‑101 (MQ=255)
tGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCa > 1:7105638/1‑101 (MQ=255)
gACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCAt < 1:986446/101‑1 (MQ=255)
gACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCAt > 2:3132060/1‑101 (MQ=255)
gACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCAt < 2:4029831/101‑1 (MQ=255)
gACGATCACCTTGCGGGTGGCGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCAt < 1:5603351/101‑1 (MQ=255)
cGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCg < 2:1344389/101‑1 (MQ=255)
cGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCg > 2:3619833/1‑101 (MQ=255)
cGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCg < 1:3195843/101‑1 (MQ=255)
gATCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCgg < 2:6692815/101‑1 (MQ=255)
aTCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGc > 2:613936/1‑101 (MQ=255)
tCACCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCg > 2:540388/1‑101 (MQ=255)
cACCTTGCGGGGGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACCAGCAGGTCCTCGTCATCGGCGa > 2:3487777/1‑101 (MQ=255)
aCCTTGCGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.G.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGaa > 2:3461228/1‑101 (MQ=255)
cGGGTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAggcggc > 1:3014319/1‑101 (MQ=255)
gggTGGTGAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGgcggcg < 1:1808979/101‑1 (MQ=255)
ggtgAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGa > 1:5030475/1‑101 (MQ=255)
ggtgAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGa > 2:6626562/1‑101 (MQ=255)
ggtgAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGa > 2:2873284/1‑101 (MQ=255)
ggtgAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGa < 2:4661852/101‑1 (MQ=255)
tgAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATg < 1:6445449/101‑1 (MQ=255)
gAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGc < 1:3823223/101‑1 (MQ=255)
gAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGc > 1:4705288/1‑101 (MQ=255)
gAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGc < 2:2666657/101‑1 (MQ=255)
gAACTCGGCCCAACCCTCGGGGCTGCGG.T.AGCGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGGGATGc > 1:1512012/1‑101 (MQ=255)
|
TGATCCGACGGCAGCACCGGGCCGTTTTCGGTCCAGCGCAGGGTGAGGGTGATCGGCGCGGCATCCTTGACCGTGACGATCACCTTGCGGGTGGTGAACTC.GCCC.ACCCTCGGGGCTGCGG.T.A.CGCTCGGGCGTTTTCGGATCAAGTTCCTCGACGAACAGGTCCTCGTCATCGGCGAAGGCGGCGGTGATGC > NC_014034/1948751‑1948943
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|