Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,979,921 | +G | 2.0% | intergenic (‑37/+47) | tkt1 ← / ← cbbP | transketolase/phosphoribulokinase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,979,921 | 1 | .→G | 2.0% | 9.5 ‑4.3 ‑0.1 | 302 | intergenic (‑37/+47) | tkt1/cbbP | transketolase/phosphoribulokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (6/0): ref base (144/152): total (150/152) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.43e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.24e-01 |
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
CCATCGCCAGCGCCCGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCAGACGCTCGATCAGCGGCGTCAG > NC_014034/1979821‑1980021
|
ccatcGCCAGCGCCCGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAgcggc > 1:7091944/1‑101 (MQ=255)
cGCCAGCGCCCGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.c < 2:4377354/101‑1 (MQ=255)
gCCAGCGCCCGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.cc < 1:5298896/101‑1 (MQ=255)
ccAGCGCCCGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.ccc < 1:6628455/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCCCGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCg < 1:1870902/101‑1 (MQ=255)
gcgcCCGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.GCCggg > 2:6295080/1‑100 (MQ=255)
cgcCCGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTg < 1:2652834/101‑1 (MQ=255)
gcCCGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.ccccggcg > 1:4436350/1‑96 (MQ=255)
cGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTgggcc < 1:694572/101‑1 (MQ=255)
cGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTgggcc < 2:4781618/101‑1 (MQ=255)
ggATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGCGGGG.CCCGGGgggcg > 2:2071891/1‑100 (MQ=255)
ggATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.GCCCGGgggccg > 2:512304/1‑101 (MQ=255)
aTGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGggggcggg > 1:3103575/1‑101 (MQ=255)
ggCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTgggccgggcc < 1:603698/101‑1 (MQ=255)
gCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGGCCCCGGGgggccgggcc > 2:1641319/1‑101 (MQ=255)
gCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCt < 1:1789424/101‑1 (MQ=255)
cATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTc < 2:2957972/101‑1 (MQ=255)
cATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTc < 1:28466/101‑1 (MQ=255)
ttGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGc < 1:6361423/101‑1 (MQ=255)
ttGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGc < 1:4500332/101‑1 (MQ=255)
ttGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGTgggccgggcccccc > 1:5812859/1‑97 (MQ=255)
ttGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGGGGGCGCGGCCTccc > 2:6602849/1‑99 (MQ=255)
ggCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCa < 2:192794/101‑1 (MQ=255)
ccATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAAt < 2:4433432/101‑1 (MQ=255)
ccATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGCC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAAt < 1:6283574/101‑1 (MQ=255)
ccGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGGCGGGGCTCGCCCATGTC.t > 2:32762/1‑101 (MQ=255)
cgcgTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.tt < 1:159816/101‑1 (MQ=255)
cgcgTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.tt < 2:1990591/101‑1 (MQ=255)
cgcgTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.tt < 2:6353172/101‑1 (MQ=255)
ttCCTGCGCCATAGCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAAt < 2:4044302/101‑1 (MQ=255)
ccTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGGCGGGCCTCGCCCATGTC.ttagatcgg > 1:2408080/1‑94 (MQ=255)
ccTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTACCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCg < 1:3371116/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGt < 1:5472258/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGt < 2:3076619/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGCCTCGCCCACGTC.CTTaaaatgt > 2:6851793/1‑97 (MQ=255)
cgcgcCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGtt < 2:2825895/100‑1 (MQ=255)
cgcCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTcc < 2:1013865/101‑1 (MQ=255)
cgcCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTcc < 1:5124643/101‑1 (MQ=255)
gcCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCg < 2:391951/101‑1 (MQ=255)
gcCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCg < 2:4719499/101‑1 (MQ=255)
gcCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCg < 2:554488/101‑1 (MQ=255)
ccATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCgg < 2:5011871/101‑1 (MQ=255)
ccATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCgg < 2:2133940/101‑1 (MQ=255)
ccATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGGGGGCCGGGCCTCGCCAACGGC.TTGAAAACGTTcccg > 2:4293493/1‑99 (MQ=255)
cATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGGGGGGCGGGCCCCGCCCATGTC.TTTGAATCCTTCCCGt > 1:3903565/1‑101 (MQ=255)
cATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGGGGGCCGGGGCCCGCCCATGTCTTTGAAATCTTCCCgg > 2:5293703/1‑101 (MQ=255)
atatCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGGGGGCCGGGGCCCGCCCATGTC.TTTAAAACGTTCCGGtt > 1:2000870/1‑101 (MQ=255)
atatCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGGGGGCCGGGCCCCGCCCATGTC.TTTAAATCCTTCCgggt > 1:6706178/1‑99 (MQ=255)
tatCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTc < 1:2110314/101‑1 (MQ=255)
tatCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGGCGGGGCCCGCCCATTGT.TTTAAAACGGTCCgggtt > 2:3506359/1‑98 (MQ=255)
tatCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGGCTCGCCCATGTC.TTTAAATCCTTCCGGTTc > 1:6162791/1‑101 (MQ=255)
cGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAgg < 1:4960426/101‑1 (MQ=255)
agaTCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGGCGGGCCTCGCCCATGTC.TTTGAAACGTTCCGGTTCAgggc > 2:28665/1‑99 (MQ=255)
agaTCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGGCGGGCCTCGCCAATGTC.TTTAAATCGTTTCGGGTCAGGcc > 2:5637807/1‑101 (MQ=255)
aTCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGGGGGCCGGGCCCCCCCCAAGTC.TTTAAACTGTTCCGGGTTAGGcccc > 1:3431042/1‑100 (MQ=255)
ttCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCcgcgcg < 2:3037905/101‑1 (MQ=255)
ttCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGCGGGCGGGACCCGCCCCACTC.TTGAACACGGCCCGGGTCAGGGCcacgcg > 2:4951396/1‑101 (MQ=255)
tCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGCCTCGCCCATGTC.TTGAAATCGTTCCGGGTTAGGCCcccgcgc > 1:4920370/1‑101 (MQ=255)
aTGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTTAAAACGTTCCGGGTGACGCCcccgcggcg > 2:1206001/1‑98 (MQ=255)
tGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGAc < 1:4991402/101‑1 (MQ=255)
tGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGAc < 1:426280/101‑1 (MQ=255)
tGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGAc < 1:1206049/101‑1 (MQ=255)
ggCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGCCTCGCCCATGGC.TTGAAATCGTTCCGGGTTAGGCCCGCGCGCGACg > 1:2701635/1‑101 (MQ=255)
ctcctcctcCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGc < 1:32763/101‑1 (MQ=255)
ctcctcctcCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGGGGGCCGGGCCTCGCCCATGTC.TTGAAATCGTTCCGGGTCAGGCCCGCGCGCGGCGGc > 1:6501/1‑101 (MQ=255)
ctcctccCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCtt < 2:1388284/101‑1 (MQ=255)
tcctccCTGATGAGCCTTTCTTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTc < 2:5771995/101‑1 (MQ=255)
tcctccCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTc < 2:2428228/101‑1 (MQ=255)
tcctccCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTc < 1:4031969/101‑1 (MQ=255)
cctccCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTcg < 1:4590563/101‑1 (MQ=255)
cctccCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTcg > 2:3188141/1‑101 (MQ=255)
ctccCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTcgc < 1:4400964/101‑1 (MQ=255)
ctccCTGATGAGCCTTTCGTCCGAACGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTcgc < 2:7033148/101‑1 (MQ=255)
tccCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGCCTCGCCCATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGGCCGCGCGCGGCGGCCTTcgcg > 2:5682157/1‑101 (MQ=255)
cccTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCgcgc < 2:6669866/101‑1 (MQ=255)
cccTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGGCGGGCCTCGCCCATGTC.TTTAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGGCGGGCTTCccgc > 1:2185699/1‑101 (MQ=255)
cccTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCgcgc > 1:157668/1‑101 (MQ=255)
cTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCAc < 1:4859313/101‑1 (MQ=255)
cTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGGCGGCCTTCGCGCAc > 1:3864102/1‑101 (MQ=255)
tgatgaGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCAcc < 1:1478696/101‑1 (MQ=255)
tgatgaGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCAcc > 2:6868941/1‑101 (MQ=255)
tgatgaGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCCGGCCTCGCCAATGTC.TTTAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCAcc > 2:2527774/1‑101 (MQ=255)
gatgaGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCa < 2:6245856/101‑1 (MQ=255)
ttccgatcttCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCAg < 2:3891524/93‑1 (MQ=255)
tgaGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCCCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGGCTTCGCGCCcccca > 1:4165339/1‑98 (MQ=255)
gaGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGTGGGCCGGGCCCCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGCTCAGGCCCCGGCGCGGCGGCCTTCGCGCACCAGAc > 2:6748805/1‑101 (MQ=255)
gaGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCCGTGGGCCGGGCCCCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCCGGTCAGGCCCCCGCGCGGCGGACTTtgcggccccgac > 2:720411/1‑93 (MQ=255)
aGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCCATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGGCGGCCTTCGCGCACCAGACg > 1:565095/1‑101 (MQ=255)
aGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGGCGGCCCTCGCGCACCCGACg > 2:3637370/1‑101 (MQ=255)
gcttttCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCAGACGc < 2:4424171/98‑1 (MQ=255)
ccTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCAGACGCt < 2:4901969/101‑1 (MQ=255)
ccTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGCCCCGCCAATGTC.TTGAAAACGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCCGACGCt > 1:6868917/1‑101 (MQ=255)
cTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGCCGGCCTTCGCGCACCAGACGCTc > 2:540459/1‑101 (MQ=255)
tttCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGGCTCGCCCATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGGCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCCGACGCTcc > 2:6061577/1‑100 (MQ=255)
tCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGGGGGCCGGGCCCCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGGTCAGGCCCGCGCGCGGCGGCCTTCGCGCCCCAGACGCTCGAt > 1:4749858/1‑101 (MQ=255)
gTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGTCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCAGACGCTCGATCa < 2:2645508/101‑1 (MQ=255)
gAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCAGACGCTCGATCAgcgg > 1:3641460/1‑101 (MQ=255)
cggc.ggG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCAGACGCTCGATCAgcggcgg > 1:1081206/1‑100 (MQ=255)
ggc.ggG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCAGACGCTCGATCAGCGGCGTc > 1:7132041/1‑101 (MQ=255)
c.ggG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCAGACGCTCGATCAGCGGCGTCAg > 1:1347417/1‑101 (MQ=255)
|
CCATCGCCAGCGCCCGGATGGCATTGGCCATCCGCGTTTCCTGCGCCATATCGAGATCCTTCATGGCTCCTCCTCCCTGATGAGCCTTTCGTCCGAGCGGC.GGG.CCCGGTGGGCCGGGCCTCGCCAATGTC.TTGAAATCGTTCCGGTTCAGGCCCGCGCGCGACGGCCTTCGCGCACCAGACGCTCGATCAGCGGCGTCAG > NC_014034/1979821‑1980021
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|