Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 3,717,668 | +G | 1.8% | coding (268/699 nt) | hemD → | uroporphyrinogen‑III synthase |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 3,717,668 | 1 | .→G | 1.8% | 4.2 ‑4.3 ‑0.1 | 227 | coding (268/699 nt) | hemD | uroporphyrinogen‑III synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (4/0): ref base (74/149): total (78/149) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.32e-02 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.76e-01 |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
CATCTTCACCTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGCCCGCGG > NC_014034/3717568‑3717768
|
cATCTTCACCTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTgcggc < 2:7079540/101‑1 (MQ=255)
tCTTCACCTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGcggc.gg > 1:6752935/1‑101 (MQ=255)
cTTCACCTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCggc.ggg > 1:3685729/1‑101 (MQ=255)
tgcACCTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCggc.gggc < 2:6177767/99‑1 (MQ=255)
tCACCTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCggc.ggggg > 2:20315/1‑99 (MQ=255)
tCACCTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCggc.gggc.g < 2:1217714/101‑1 (MQ=255)
aCCTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGc.gggg.ggg > 2:6254827/1‑101 (MQ=255)
cTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGc.gggg.ggggg > 2:177220/1‑99 (MQ=255)
cTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGGGGGGCGGg.gggg.ggggg > 1:3817982/1‑99 (MQ=255)
tCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGttt < 1:5886246/101‑1 (MQ=255)
tCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGttt < 1:6113791/101‑1 (MQ=255)
tCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCCTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGttt < 1:1360243/101‑1 (MQ=255)
ggAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTcc < 2:1424255/101‑1 (MQ=255)
ggAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGGGGGGCGGc.gggg.ggggggtc > 2:2302502/1‑96 (MQ=255)
gAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGGTccc > 2:6746230/1‑101 (MQ=255)
aaCAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTctcc > 1:5536627/1‑98 (MQ=255)
aaCAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGGGGTGCGGC.GGGG.GGGGTTTCCg > 2:5107199/1‑101 (MQ=255)
aCAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTGGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGc.gggg.gggggtgcccg > 1:6412160/1‑93 (MQ=255)
cAGGCNGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGt < 1:2010590/101‑1 (MQ=255)
aGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGCGGGGG.GGGTTTCCCgtg > 2:1623566/1‑99 (MQ=255)
ggCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGc < 2:4205948/101‑1 (MQ=255)
cGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGCGGGGG.GGGGTTCCCgggggg > 1:5811693/1‑97 (MQ=255)
cGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.g < 1:3624123/101‑1 (MQ=255)
ggTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGGTCCCCGGGCT.gg > 1:5121053/1‑101 (MQ=255)
aaaCCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGGTTCCGGGGCT.GGGCgg > 1:7115695/1‑100 (MQ=255)
cTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGTTCCCCGGGGT.GGGCGGCGcccc > 2:3375477/1‑101 (MQ=255)
cTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGCGGGGTTTCCCGG.GCT.GGGCGGGGcccc > 1:4946578/1‑101 (MQ=255)
tGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGGTTCCGGGGGT.GGGCGTCGcccga > 2:2514236/1‑99 (MQ=255)
ccGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCTGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGAt < 2:2108719/101‑1 (MQ=255)
cGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGTTTGCCGTGGT.GGGCGGTGGCCCCGagg > 2:428364/1‑99 (MQ=255)
gAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGGTCCCGGGGCC.CGCCGTCGcccccaccgc > 2:6981931/1‑96 (MQ=255)
aaaGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGTTTCCGGGGGT.GGGCGTCGCCCCCCAGGcc > 1:3450504/1‑101 (MQ=255)
aaaGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCCGGGCC.GGCCGGCGCCCCCGATGcc > 1:4549342/1‑101 (MQ=255)
aaGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGCGGGGG.GGGTTTCCCGG.GCG.GGGCGGCGCCCCCCCTGccc > 1:5629574/1‑100 (MQ=255)
aaGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCg < 2:1895396/101‑1 (MQ=255)
aGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGTCGa < 1:2934972/101‑1 (MQ=255)
aGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGa < 1:2302597/101‑1 (MQ=255)
aGCGCCCTTTCGGGCCGCCCGCCCTTTTGCGCCGGCGAGCGGCCGGCGGCGGTGGGGCGGC.GGGG.GGGGTTCCCGGGGCT.GGCCGCCCCCCCCCCTGCCgg > 2:1000555/1‑100 (MQ=255)
cgcCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGc < 1:1755165/101‑1 (MQ=255)
cgcCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGc < 2:491682/101‑1 (MQ=255)
gcCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGTTTCCGGGGCT.GGGCGGCGCCCCCCCTGcccggca > 2:1492783/1‑96 (MQ=255)
ccTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCCGGGGT.GGGCGTCGCCCCCGCTGccccgcacc > 1:828646/1‑94 (MQ=255)
cTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGTTTCCCGTGCT.GGCCGTCGCCCCCCCTGCCggggctct > 1:2838957/1‑94 (MQ=255)
tttCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGTTTCCGGGGGT.GGGCGGCGGCCCCGCTGCCCAggctccg > 2:6908510/1‑95 (MQ=255)
tCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCT.GGCCGGCGCCCCCCCGGCCGGGCCTCTGtt > 1:3880493/1‑101 (MQ=255)
cGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTc < 2:270949/101‑1 (MQ=255)
cGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTc < 2:3817819/101‑1 (MQ=255)
gggCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGTTTCCGGGGGT.GGGCGTCGCCCCCGATGCCGCGCATCTGTTCg > 1:4680507/1‑101 (MQ=255)
gggCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTTCCGGGGCT.GGGCGGCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCg > 1:4518781/1‑101 (MQ=255)
ccGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAg < 2:3048617/101‑1 (MQ=255)
gTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGTTTCCGGGGGT.GGCCGGCGCCCCCGATGCCGGGCCTCTGTTCGGAggg > 1:2123340/1‑99 (MQ=255)
gTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTg < 1:5238195/101‑1 (MQ=255)
ccGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGAt < 1:2530227/101‑1 (MQ=255)
ccGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTTCCGGGGCT.GGGCGGCGCCCCCGCTGCCGAGCATCTGTTTGAAGGGAt > 1:62697/1‑101 (MQ=255)
cGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATc < 1:5733690/101‑1 (MQ=255)
ggCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGG.GGGGTTCCCCGTGCT.GGGCGGCGCCCCCCCTGCCGGGCACCTGTTCGTAGGGAttc > 1:2507315/1‑99 (MQ=255)
ggCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATcc < 2:3944274/101‑1 (MQ=255)
ccgatctcGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTg < 2:1114701/94‑1 (MQ=255)
cTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGCGGGGG.GGGTTTCCCGG.GCT.GGCCGGCGCCCCCGCTGCCGGGCCTCTGTTCGAAGTGATCCTgg > 2:6670478/1‑100 (MQ=255)
cTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGt < 1:1826243/101‑1 (MQ=255)
cTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGt < 1:6529671/101‑1 (MQ=255)
ttttGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGCTTCCCCGGGGT.GGCCTTGGCCCCCCATGCCGAGGCTCTGCTCGAAGTGGTTCTGTc > 2:4746156/1‑101 (MQ=255)
tttGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTcc < 1:1000590/101‑1 (MQ=255)
tttGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTcc < 1:1623627/101‑1 (MQ=255)
ttGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTccg < 2:214206/101‑1 (MQ=255)
ttGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCT.GGGCGGCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGGAGTGATCCTGTccg > 2:5959019/1‑101 (MQ=255)
gCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTccgcc < 2:1202434/101‑1 (MQ=255)
cGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCT.GGCCGGCGCCCCCCCTGCCCAGCCTCTGTTCGGAGTGGTcccgaggccgg > 1:1114736/1‑92 (MQ=255)
gTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTTCCGGTGCT.GGCCGGCGCCCCCCATGCCCAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTccgccgc > 1:4581102/1‑101 (MQ=255)
cGGGGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTccgccgccg < 2:636078/101‑1 (MQ=255)
cGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTccgccgccg < 2:5165058/101‑1 (MQ=255)
cGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTTCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCCCTGCCGGGCCTCTGTTCGAAGGGATCCCGTccgcccccc > 1:403463/1‑100 (MQ=255)
ggCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCT.GGGCGTCGCCCCCCATGCCGGGCATCCGTTCGAAGGGATCCCGTccccccccca > 1:6818837/1‑99 (MQ=255)
gCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGAt < 2:6467358/101‑1 (MQ=255)
gAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCT.GGCCGGCGCCCCCCATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATcc > 1:768648/1‑101 (MQ=255)
gAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCG.GGCCGTCGCCCCCGGTGCCGAGGATCCGGTCGGAGTGAGCCCGTCCGCCGCCGGTcc > 1:2055307/1‑101 (MQ=255)
ggACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCgggg < 2:5830776/101‑1 (MQ=255)
cggcggcggTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGGCCGCCGCCGGTCCCGGGCCg > 1:4373526/1‑101 (MQ=255)
ggcggcggTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGa > 1:1428131/1‑101 (MQ=255)
ggcggTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATcc < 2:2221538/101‑1 (MQ=255)
ggcggTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATcc < 1:5350478/101‑1 (MQ=255)
ggcggTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGGGCT.GGGCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCCGGGCCGAGcc > 2:5365618/1‑101 (MQ=255)
gcggTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCTGGGGCCGATCCt < 1:5097270/101‑1 (MQ=255)
gcggTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCt < 2:3582009/101‑1 (MQ=255)
gcggTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCt < 1:5823403/101‑1 (MQ=255)
cggTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCTGGGCCGCGGCCCCCG.TGCCGAGCATCTGTTCGAAGGGATCCTGTCCCCCGCCGCTCCGGGGCCGATCCtc > 2:5712615/1‑100 (MQ=255)
cggTGGTGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCtc > 2:3752979/1‑100 (MQ=255)
ggtggtGCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGc > 2:3467990/1‑101 (MQ=255)
tggcgCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATTCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCAt < 2:5275660/101‑1 (MQ=255)
ggtgCGGC.GGGC.GGGTTTTCCCGTGCC.TGCCGCCGCCCCCCATGCCGAGCGTCTGTTTGAAGTGCTCCTGTTCGCCGCCGACCCCGCGGCCATCCTGCacc > 2:414722/1‑99 (MQ=255)
ggtgCGGC.GGGC.GGGGTTCCCGGGGCT.GGGCGTCGCCCCCGCTGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCCGGGGCGATCCTGCATg > 2:5531941/1‑101 (MQ=255)
tgCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTCCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGcc < 1:3294304/101‑1 (MQ=255)
gtgcgc.gggc.ggGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCTCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGcc < 2:5309767/97‑1 (MQ=255)
gcggc.gGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCTCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGccc < 1:3375600/101‑1 (MQ=255)
gcggc.gGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGccc > 2:6274628/1‑101 (MQ=255)
gcggc.gGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGccc > 1:4318/1‑101 (MQ=255)
cggc.ggGC.GGGTTTCTCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGCCcg > 1:6854021/1‑101 (MQ=255)
ggc.gggc.gGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGCCcgc > 1:4197699/1‑101 (MQ=255)
ggc.gggc.gGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGCCcgc < 2:4580863/101‑1 (MQ=255)
c.gggc.gggTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGCCCGCgg > 2:780120/1‑101 (MQ=255)
|
CATCTTCACCTCGGAACAGGCGGTCAAACCGCTGGCCGAAAGCGCCCTTTCGGGCCGTCCGGCCTTTTGCGTCGGCGAGCGGACGGCGGCGGTGGTGCGGC.GGGC.GGGTTTCCCGGTGCT.GGCCGTCGCCCCCGATGCCGAGCATCTGTTCGAAGTGATCCTGTCCGCCGCCGATCCGGGGCCGATCCTGCATGCCCGCGG > NC_014034/3717568‑3717768
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|