| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,012 | 0 | A→G | 5.3% | 228.6 ‑5.5 0.0 | 2618 | D215D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (57/91): ref base (1253/1210): total (1315/1303) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.91e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 3026 total aligned reads displayed.
GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT > NC_014034/221912‑222112
|
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGa < 2:2779992‑M1/57‑1 (MQ=255)
atccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAt > 1:3727884‑M1/44‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtc > 2:4986472‑M1/43‑101 (MQ=255)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGAtcgg > 2:2902149‑M1/41‑101 (MQ=255)
cgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 1:134468‑M1/41‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtctgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:2687356‑M1/39‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTgggatcagat < 2:2136120‑M1/63‑5 (MQ=255)
tcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 2:3886613‑M1/39‑101 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:1104265‑M1/34‑101 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc > 1:2773419‑M1/34‑101 (MQ=255)
cggtgggattcgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 1:5907037‑M1/33‑101 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggagcggtcggggccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc > 2:4348315‑M1/33‑101 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 2:6758739‑M1/25‑101 (MQ=255)
cggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTcggggcc > 1:5086008/3‑97 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt > 2:4869091‑M1/22‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 2:5797468‑M1/21‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc > 1:325414‑M1/21‑101 (MQ=255)
tgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGatcggtg < 2:1627964‑M1/81‑2 (MQ=255)
ggATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 2:23256/1‑101 (MQ=255)
gatctgTGGGTGCGGTCGGGTCCGTCGGCTCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcggg < 2:3167114/96‑2 (MQ=11)
gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt > 2:6869647‑M1/13‑101 (MQ=255)
gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGac > 1:45303/5‑100 (MQ=11)
atccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgac < 1:5737256‑M1/94‑2 (MQ=255)
tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:23257/101‑1 (MQ=255)
cgtgGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg > 1:4939857‑M1/5‑101 (MQ=255)
ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatc.gGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggaga > 2:2580783/8‑98 (MQ=14)
gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATC.GGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:4663466/2‑101 (MQ=11)
ggagcagtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc.gGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:6663042/95‑1 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtggGATC.GGGCTGGGCCGTGGGCACGGCTGGGCTCGAGGGACCGGGCGGGCCCGTgggccggcttcgg > 1:5228455/1‑91 (MQ=2)
gtccgtccggtccgtgggctcggtcgggtccgtgggatc.gGTCGCATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGt < 2:1214805/97‑1 (MQ=14)
tcggtcgggtccgtggggtcgggcgggtccgtgggaTG.GGGCTGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:2867565/101‑1 (MQ=14)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggaTC.GGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGCGGGGTCGGTGgggag > 2:737926/1‑99 (MQ=11)
tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTC.GGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 2:4136769/101‑1 (MQ=11)
gcggtcgggtacgtgggatcggtcgggtccgtgggatC.GGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc < 1:533940/100‑1 (MQ=11)
cggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc < 1:218737/101‑1 (MQ=11)
cggtcggatccgtggtctcggtcggatccgtaggatC.GGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:1071101/101‑1 (MQ=11)
cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatC.GGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 1:6563606/101‑1 (MQ=11)
ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGCCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCGCTCGGATccc > 1:4277452/1‑100 (MQ=11)
gggcgggtccgtcggatgggtcgggtccgtgggatc.ggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:1485939/98‑1 (MQ=11)
gtcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtcggatc.gGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 2:6652116/101‑1 (MQ=14)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg < 1:6913612‑M2/101‑3 (MQ=255)
cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGtgg > 2:4692868/1‑99 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatc.ggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgg > 1:6265325/1‑99 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCCGGTCGGATCCggggg > 1:6130974/1‑97 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 1:4378021‑M2/101‑4 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatc.ggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:7063607‑M2/1‑98 (MQ=255)
atccgtggggtccgtcgggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGTGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGGGGGAt > 1:2036985/2‑101 (MQ=11)
atccgtggggtccgtcgggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCCGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGGGGGAt > 1:312239/2‑101 (MQ=11)
atccgtgggatcggtcggatccgtaggatc.ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt < 2:4459887/100‑1 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggatccgtaggatc.ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc < 2:3626487/101‑1 (MQ=11)
tccgtgggagcggtcgggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 1:6795069‑M2/1‑95 (MQ=255)
gccgtgggatcggtcggatccgtgggatc.ggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 2:2026446‑M2/2‑95 (MQ=255)
ccgtgggatcggtcgggtccgtggggtc.cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGACCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTTGGAgcg > 2:6359068/1‑101 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTCGAATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGCtcg > 2:3438811/1‑101 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtggggtc.cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGGTCCGTGGGAtcgg > 2:3056375/1‑101 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtggggtc.cgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg > 1:1000254/1‑96 (MQ=11)
gttggatcggtcgggtccgtcggatc.ggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:257199/98‑1 (MQ=11)
gtggggtggggcgggtcccgggggtcggggcgGGT.CGTGGGGTTGGTCGGGTTCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:4806847/101‑1 (MQ=2)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGACCGGTCGGTTCCGAGGGAtcggt > 2:65294/1‑101 (MQ=11)
gcggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcgggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc > 1:151173‑M2/3‑91 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg < 2:891713‑M2/101‑12 (MQ=255)
gggatcggtcggatccgtgggatc.ggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg > 1:5980560/1‑101 (MQ=11)
tcggatccgtgggatc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGCGTCCGTGGGAACGgccgcggccgtg > 2:6207489/1‑100 (MQ=14)
cgggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg < 1:3489933‑M2/101‑21 (MQ=255)
cgggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg < 2:5521058‑M2/101‑21 (MQ=255)
cgggtccgtcggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGgtcgggtgggaag > 2:5275648/1‑95 (MQ=11)
cggatccgtgggatc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtgg < 1:3359949‑M2/101‑21 (MQ=255)
gggtccgtggggtc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggg > 1:5485125‑M2/1‑80 (MQ=255)
gggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg < 1:3923404‑M2/101‑22 (MQ=255)
gggtccgtcggatc.ggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccggggg > 1:786197/1‑97 (MQ=11)
ggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggg < 1:1230730‑M2/101‑23 (MQ=255)
ggtccgtgggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggg < 2:1880665‑M2/101‑23 (MQ=255)
tccgtgggatc.tgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatc > 2:3543271‑M2/1‑77 (MQ=255)
tccgtaggatc.ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtc > 1:1790884/1‑101 (MQ=14)
cgtgggatc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcgg > 2:4552970/1‑99 (MQ=255)
cgtaggatc.ggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGtggggtccgtcgggtccg > 1:2447588/1‑101 (MQ=14)
tgtgagc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc < 2:1334554/95‑2 (MQ=11)
tgggatc.ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCAGTGGGGTGGgtggggtacgctgggtgggca > 2:5407913/1‑96 (MQ=11)
ggatc.ggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCTGAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggg < 1:931008/101‑1 (MQ=11)
ggagc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggttgggtccgtgggatcggtcgg < 1:5605238‑M2/101‑31 (MQ=255)
gggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTcgg > 2:3989943/7‑101 (MQ=11)
ggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGAGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTgggg > 1:6413495/6‑100 (MQ=11)
atc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggat < 2:56704‑M2/101‑33 (MQ=255)
tc.ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtc < 1:3858608/101‑1 (MQ=11)
tccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtc < 2:7051388/98‑1 (MQ=11)
ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGGCCCGTGGGGtcg > 2:3267064/3‑101 (MQ=11)
gtggggtgcgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgt > 1:2975840‑M2/9‑65 (MQ=255)
gtcggGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggt < 1:4017682/101‑1 (MQ=11)
gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCATCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTGGGAtccgt > 2:4235508/1‑101 (MQ=11)
tcggGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc < 2:5132769/101‑1 (MQ=11)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTAGGAtccgtgg > 1:1657788/1‑99 (MQ=11)
cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtgg < 2:6069926/101‑3 (MQ=11)
ggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 2:1779679/101‑1 (MQ=17)
gccGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATc < 2:2447494/100‑1 (MQ=11)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:3780272/101‑1 (MQ=14)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggt > 1:1900305‑M2/1‑56 (MQ=255)
tGGGTTCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc < 2:592168/101‑2 (MQ=14)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtc < 1:2675690‑M2/101‑47 (MQ=255)
ggggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc > 1:4160266‑M2/2‑55 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 1:3588077/1‑101 (MQ=14)
|
GATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAT > NC_014034/221912‑222112
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 17 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|