| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,030 | 0 | A→G | 6.8% | 0.0 ‑2.5 ‑5.2 | 2632 | D209D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has significantly lower quality scores supporting polymorphism compared to reference. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (73/113): ref base (1123/1319): total (1198/1434) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.92e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.22e-06 | ||||||||||
Only 100 of 3131 total aligned reads displayed.
TGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGC > NC_014034/221930‑222130
|
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gatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGatcggtcggg < 2:379526‑M1/84‑2 (MQ=255)
tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc < 1:6399661‑M1/86‑1 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt > 2:257195/1‑101 (MQ=11)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc > 1:4287213/1‑100 (MQ=11)
cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg > 2:1629433‑M1/11‑101 (MQ=255)
ggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 2:6908765‑M1/93‑1 (MQ=255)
tcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc < 1:7069236/101‑1 (MQ=11)
atcttgggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtc < 1:2136200/95‑1 (MQ=11)
ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcg < 2:5452989‑M1/96‑1 (MQ=255)
ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg > 1:6909222/1‑101 (MQ=255)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGACCGGTGGGAtgggc > 2:3176545/4‑100 (MQ=11)
gtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCCGGAgcggt > 1:4170158/1‑101 (MQ=11)
tggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGAtcggtg > 2:1880340/9‑100 (MQ=11)
tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtgcgagGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGTTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGAtctgtg > 1:1785773/3‑100 (MQ=11)
gggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtc < 1:5348231/93‑1 (MQ=14)
ggggctcggtcgggtccgagtgaacagacgggtccgtggtaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:2803280/96‑1 (MQ=14)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGGCGGATCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:4889884/2‑101 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggggccgtgGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGAGGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:1781673/2‑101 (MQ=11)
gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg < 2:3452594‑M1/100‑1 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGTTGGGaagagccgc > 2:6782796/1‑93 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGGCggg > 2:6117711/1‑101 (MQ=11)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcgGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCggg < 2:5310887/101‑1 (MQ=11)
atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGCCGGGt > 1:2846379/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGACTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCgggggcg > 2:3898049/1‑97 (MQ=11)
ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCg > 2:4610978/1‑101 (MQ=11)
ggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg < 1:5490688/101‑1 (MQ=11)
cgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGCTCGGTCGGGGCCg > 2:751003/2‑101 (MQ=11)
gcgggtccgtgggatcggtcgggtccggggggtcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGtg < 1:455291/100‑2 (MQ=11)
cggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGtgg > 1:936913/1‑99 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCCGTCGGGTCGGTGgg > 1:3324055/4‑101 (MQ=11)
ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:122433‑M2/101‑4 (MQ=255)
tgcacgtgggagctggcggggccgtgtgaccgggcggCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 2:892073/97‑1 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGa > 1:2960802/1‑101 (MQ=14)
gatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGa < 1:1893723/99‑1 (MQ=11)
gtgcgtggggtccgccggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:1509169/98‑1 (MQ=11)
tccgtgggatcggtcggctccgtgggatcggtcggCTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 2:2431483‑M2/1‑95 (MQ=255)
tccgtgggagcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 1:6795069‑M2/1‑95 (MQ=255)
gccgtgggatcgggcggggccgggggatcggtcggATCCGTGGGATCTGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc < 1:3557759/100‑1 (MQ=14)
gcgtcggctcggtcgggtccgtgggatcggtcgggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg > 1:5228754‑M2/2‑94 (MQ=255)
gcctggggtccggcgggtccgtcggatcgctcggGTCCGTTGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg < 2:2276003/98‑1 (MQ=11)
ccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcc < 1:4023212/101‑2 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg > 1:1000254/1‑96 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgcgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAccgg < 1:5599995/101‑1 (MQ=11)
cgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtccg < 2:6538648/101‑3 (MQ=11)
cgtaggatcggtcgggtccgtaggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTAggggccg > 2:2686692/1‑96 (MQ=11)
gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGACCGATCGGCTCCGTGGGAttggt > 1:2748117/1‑101 (MQ=14)
gtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTGGGGtcggc > 2:3054819/1‑100 (MQ=11)
tgggatcggtcgggtccgggggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:2020875/101‑1 (MQ=14)
tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc < 2:4272499‑M2/101‑11 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtcggctcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGCTCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:5847027/101‑1 (MQ=11)
atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt < 2:6377275‑M2/101‑15 (MQ=255)
cggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCCGGGGAGCGGTCGGGTCGGTGGGAtccgtggcggcg > 1:2274430/1‑94 (MQ=2)
ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGCGTCGgtcgggtccg > 1:1097804/1‑101 (MQ=11)
ggtcggatccgtagcatcgggcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccg < 2:6239883/101‑1 (MQ=11)
gtggatccgtcggctccgtcggATCGTTTGGTTCCGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc < 1:1338128/96‑1 (MQ=11)
cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg < 1:6113670/101‑1 (MQ=255)
ggttccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg < 2:4000300/98‑1 (MQ=11)
gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg < 1:2426256‑M2/101‑22 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtcggggggt > 2:4371355/1‑94 (MQ=11)
ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggg < 2:4483821‑M2/101‑23 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggg < 1:1230730‑M2/101‑23 (MQ=255)
ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggga > 2:555905‑M2/1‑79 (MQ=255)
gtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggat < 2:5959791/101‑3 (MQ=255)
gccggtgggatcggtcgggtccGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggat > 2:472196‑M2/5‑78 (MQ=255)
tcggtgggatgggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatc < 1:6666546/98‑1 (MQ=14)
ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc > 1:3912160/1‑101 (MQ=14)
cgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGgggatcggtcgggtccgtgggatcgg < 2:3568006‑M2/101‑27 (MQ=255)
cgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcgg > 2:33035/1‑99 (MQ=255)
tgtgagcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggtc < 2:1334554/95‑2 (MQ=11)
ggggatcggtcggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtc > 2:1075875‑M2/2‑73 (MQ=255)
gatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg < 1:2651822‑M2/101‑32 (MQ=255)
atcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGAt > 1:5713775/1‑101 (MQ=11)
atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt > 2:2113361/1‑101 (MQ=11)
atcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTggggc > 2:3663463/1‑99 (MQ=11)
cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc < 1:6256653‑M2/101‑35 (MQ=255)
cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTcggtccc > 1:805009/1‑97 (MQ=11)
ggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccgaccgatccc < 2:2903630/101‑10 (MQ=11)
gcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:3096678/100‑1 (MQ=11)
gggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgg > 1:4952453/4‑101 (MQ=11)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtggg < 1:381422/101‑1 (MQ=11)
gtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt > 1:6555547/2‑99 (MQ=14)
gtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt > 1:4850760/2‑99 (MQ=14)
aTGCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggat > 1:4693108‑M2/1‑60 (MQ=255)
tCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATc < 1:3452453/101‑1 (MQ=11)
gtgtagggtcggacggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:5017701/93‑1 (MQ=11)
gtaggATCGGGCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 1:3233122/98‑1 (MQ=14)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGACGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt < 1:5972708‑M2/101‑46 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:4411115‑M2/101‑48 (MQ=255)
aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATAGGTCGGGTCCGtcg > 1:2523567/2‑99 (MQ=14)
gggtcggcTCCCTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc > 2:2009260‑M2/2‑49 (MQ=255)
ccgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatcc < 1:5092898‑M2/99‑53 (MQ=255)
cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 2:4138050/1‑101 (MQ=17)
gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg > 2:7068862/1‑101 (MQ=17)
cGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg < 1:3663612/101‑1 (MQ=17)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTgg > 1:1694947/1‑101 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg > 2:6658941/1‑101 (MQ=255)
ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg > 2:14826‑M2/1‑35 (MQ=255)
ggAGCGGTCGGGTCCGGGGGAGCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg < 2:5860244/101‑1 (MQ=18)
|
TGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGC > NC_014034/221930‑222130
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|