| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 222,048 | 0 | A→G | 2.1% | 78.7 ‑5.2 ‑1.3 | 2423 | D203D (GAT→GAC) | RCAP_rcc00185 | hypothetical protein |
| Rejected: Prediction has biased read strand distribution supporting polymorphism. | ||||||||||
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (13/42): ref base (1009/1354): total (1026/1397) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 5.30e-03 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.59e-02 | ||||||||||
Only 100 of 3060 total aligned reads displayed.
GCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAC > NC_014034/221948‑222148
|
gttcgcgggctcgggcgggtccgcgggatcggtcggggccgggggaTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt < 1:5325521/91‑1 (MQ=11)
gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt > 1:4350406‑M1/8‑101 (MQ=255)
gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAt > 1:5936640‑M1/8‑101 (MQ=255)
tcggtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc > 1:4211853‑M1/7‑101 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcg > 2:332993/1‑101 (MQ=11)
ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg > 1:86374/1‑101 (MQ=11)
ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcgg > 1:4080019/1‑101 (MQ=11)
gtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAttggt < 1:3270207‑M1/98‑1 (MQ=255)
tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGatcggtg < 2:3596404‑M1/99‑2 (MQ=255)
tcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc < 2:2216719/101‑1 (MQ=255)
ggGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc > 1:6193994‑M1/3‑101 (MQ=255)
cggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcg > 2:4029492/1‑101 (MQ=14)
gggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg < 1:2202433/98‑1 (MQ=11)
gtcggttgcgtgcgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat < 2:708691/100‑3 (MQ=11)
tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGGTCGGGCGGGTGGGAGGGGtcggtccgatc > 2:5217935/1‑96 (MQ=11)
cggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatCGGTCGGCGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc < 2:5896953/101‑1 (MQ=11)
cggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 1:138494/101‑1 (MQ=14)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggagcc > 2:5758059/1‑97 (MQ=11)
cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAGCGGTGGGATCCGTGGGCccgggcggagcg > 2:5498895/1‑97 (MQ=11)
cggtcgagtccgtgggagcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc < 2:6801435/101‑1 (MQ=11)
gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGCTCCGTGGGATCGGTTGGGtcgggcggcacggg > 2:4505129/1‑95 (MQ=11)
gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt < 2:2655443/101‑1 (MQ=11)
tgggtccgttgggtcggtcgggtccgtgggatctgtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg < 1:2666806/100‑3 (MQ=11)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg < 1:4506248‑M2/101‑3 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTCGGGGCCGtgg > 2:5610760/1‑99 (MQ=11)
gggtctgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgg > 1:6869015/1‑101 (MQ=11)
gggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgcggg > 2:1850570/1‑97 (MQ=11)
ggtacgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga > 2:1114783‑M2/1‑97 (MQ=255)
gatccgtgagatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTAGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa < 1:1271283/99‑1 (MQ=11)
gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTgggga < 2:2868349‑M2/101‑6 (MQ=255)
tttttgggatctgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 2:6664832‑M2/5‑95 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc > 2:207029‑M2/1‑95 (MQ=255)
tccgtgggatcggtcgggtccggggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGCCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCCTGGGAtc > 2:4636388/1‑101 (MQ=14)
ccgtcggatcggtcgcgtctgtggagtccgtcggATGCGAGGGATCGGGTGTATCCGTGGGACCGGCCAGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGAtcg < 2:2753883/101‑1 (MQ=2)
cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg > 1:1000254/1‑96 (MQ=11)
cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtccg > 1:6533844‑M2/1‑93 (MQ=255)
gtgggtcggttggatccgtgggatcgggcgtATCCGCGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtc < 1:517652/96‑1 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtccgccg > 1:4768888/1‑96 (MQ=11)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgggcg < 2:6942314‑M2/101‑12 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 1:3159439/101‑1 (MQ=17)
gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCGGGGGGATCGgacggg > 2:4933297/1‑101 (MQ=11)
tcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtc < 2:6399337/101‑1 (MQ=255)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCAGTGGGGTCGGTGGGGTCCGTAGGTTCGGTGGGGGCAGTGCGATCGgaggggtcc > 1:2894289/1‑101 (MQ=2)
cggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatcc > 1:6656237‑M2/1‑85 (MQ=255)
gtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt > 1:6768093‑M2/1‑83 (MQ=255)
tcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtc < 2:6260898/101‑1 (MQ=255)
cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg < 1:567999‑M2/101‑21 (MQ=255)
gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg < 2:4163367‑M2/101‑22 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg < 1:2438714‑M2/101‑22 (MQ=255)
ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATGCGTGGGATCGGACGGGTTCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg > 2:892953/4‑101 (MQ=14)
tccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtc < 1:6374816/101‑1 (MQ=11)
gccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtc < 2:6135123/100‑1 (MQ=11)
gtgggatccgtgtgATGCGTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcgggtccgt < 2:5068766/101‑1 (MQ=17)
gggatcggtcggATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTgg > 1:1106838/1‑101 (MQ=11)
cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgg > 2:1954236/11‑101 (MQ=11)
cgggtccgtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTgg > 2:5979086/11‑101 (MQ=11)
ggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg < 1:3498262‑M2/101‑31 (MQ=255)
atcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt < 2:6545441‑M2/101‑33 (MQ=255)
tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtggggtc < 2:2538963‑M2/101‑34 (MQ=255)
cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGGGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGtcg > 2:4294547/1‑101 (MQ=11)
cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc > 2:3233006/1‑100 (MQ=11)
gcggGTCCGTGGGATCGGTAGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcggtc < 1:1947874/100‑1 (MQ=11)
gtcggTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt < 1:1579191/97‑1 (MQ=17)
tgggtcggATCGGTGGGGTACGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc < 1:4636627/95‑1 (MQ=17)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcgg < 1:3751902‑M2/101‑45 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg < 2:3921555‑M2/101‑45 (MQ=255)
gtcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCgc > 2:2408038/4‑100 (MQ=17)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcg < 1:5448302‑M2/101‑48 (MQ=255)
gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg < 1:2793234‑M2/101‑48 (MQ=255)
ggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg > 2:3815666‑M2/1‑53 (MQ=255)
ggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg < 1:4931227/101‑1 (MQ=255)
ggtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa < 1:2063368/99‑1 (MQ=17)
ggtccgtcggatCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgga > 1:5558894‑M2/3‑52 (MQ=255)
gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa > 1:715245/1‑101 (MQ=17)
gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt > 1:3019287/4‑101 (MQ=255)
gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgt < 1:2338262‑M2/101‑55 (MQ=255)
tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggagcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtg < 1:3878267‑M2/101‑56 (MQ=255)
cggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcggggccgtgg < 2:1391371‑M2/101‑57 (MQ=255)
cggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg > 1:1738973/1‑101 (MQ=17)
gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg < 2:4778439/101‑1 (MQ=255)
ggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtggg < 2:173793‑M2/101‑58 (MQ=255)
cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg < 2:2980327/101‑1 (MQ=255)
gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgt < 1:5797770‑M2/101‑64 (MQ=255)
aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATGCGGCGGGTCGGtcg > 2:1004871/2‑99 (MQ=14)
gtccggcggATCCGGGGGACCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggat < 2:1551144/95‑3 (MQ=14)
aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCC.TAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCCTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGATCGGCCGGGTCCGTggggtg > 2:1249489/1‑99 (MQ=18)
ggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcgc < 1:3955719‑M2/101‑72 (MQ=255)
gggcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccg > 1:3596540‑M2/9‑30 (MQ=255)
gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtgga > 2:774032/1‑100 (MQ=255)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggg > 2:3693105/1‑95 (MQ=14)
gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt > 1:1846/1‑95 (MQ=14)
tcggactggggggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggtg < 1:6063849/91‑1 (MQ=18)
tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtg > 2:3489797‑M2/1‑28 (MQ=255)
ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggtcgg > 1:2559619/1‑92 (MQ=14)
ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCCTGGTGGGAtcg < 1:5058059/101‑1 (MQ=255)
tGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtc > 1:3401494/1‑101 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg < 1:7020774‑M2/101‑84 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatccgtcgggtccgggggatcggtcg < 2:5359193‑M2/101‑84 (MQ=255)
gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcg < 2:4385417‑M2/101‑84 (MQ=255)
ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcggatccgtgggatcggtggg < 2:3096565‑M2/101‑85 (MQ=255)
|
GCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAC > NC_014034/221948‑222148
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 15 ≤
ATCG
< 23 ≤
ATCG
< 32 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|