| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 1,395,494 | T→G | 18.4% | intergenic (+306/‑625) | RCAP_rcc01306 → / → RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 1,395,494 | 0 | T→G | 18.4% | 190.5 ‑4.0 ‑1.7 | 394 | intergenic (+306/‑625) | RCAP_rcc01306/RCAP_rcc01307 | Cas2 family CRISPR‑associated protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (23/50): ref base (150/169): total (174/220) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.85e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 2.06e-02 | ||||||||||
Only 100 of 418 total aligned reads displayed.
AACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCG > NC_014034/1395394‑1395594
|
aaCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGt < 2:4806765/101‑1 (MQ=255)
aCTGCCCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 2:2127539/101‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTa < 1:4148418/101‑1 (MQ=255)
aCTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTa > 1:2972067/1‑101 (MQ=255)
cTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTaa < 1:6450452/101‑1 (MQ=255)
tGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAAc > 2:5087139/1‑101 (MQ=255)
aCCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGCCAGGCTGGTAACgcg > 2:1351670/1‑99 (MQ=255)
cccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACgtgt < 2:1455811/101‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTc < 2:1641019/101‑1 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCg < 1:6771000/101‑1 (MQ=255)
cGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCg > 2:5344640/1‑101 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGc < 2:5474588/101‑1 (MQ=255)
gCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGGAACGTGTCGc > 1:2661362/1‑101 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc < 1:4675789/101‑1 (MQ=255)
gCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccc < 1:100025/101‑1 (MQ=255)
ccTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTccccc < 2:3536974/101‑1 (MQ=255)
cTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTcccccc > 1:3415308/1‑101 (MQ=255)
tGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcg < 2:4954754/101‑1 (MQ=255)
gcgggtgatcggtgctcCGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc < 2:2023382/98‑1 (MQ=255)
gCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCcgc > 1:4737716/1‑101 (MQ=255)
gtgatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCgggg < 1:557146/101‑1 (MQ=255)
gatcggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc > 2:2289707/1‑101 (MQ=255)
cggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg < 2:3739982/101‑1 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 1:3338880/101‑1 (MQ=255)
ggtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg < 2:1847939/101‑1 (MQ=255)
gtgatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 2:670421/1‑101 (MQ=255)
tgccgctgcgTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACACCCCGAACCTGTCGGCGG.CGA.ATACCGATACCGCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:5367378/92‑1 (MQ=2)
ctggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 1:1907630/93‑1 (MQ=0)
tggacgtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 2:6572241/94‑1 (MQ=2)
gatcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc < 2:1203036/101‑1 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 1:2376017/101‑1 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg > 2:3250141/1‑101 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCg < 2:2847743/101‑1 (MQ=255)
atcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCg > 1:2076237/1‑101 (MQ=255)
tcAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCTCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGa < 2:5585230/101‑1 (MQ=255)
cAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaa < 1:1985748/101‑1 (MQ=255)
aGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGaaa < 1:3143625/101‑1 (MQ=255)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGCAACa > 2:305981/3‑101 (MQ=2)
gtggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa < 2:4274681/99‑1 (MQ=2)
gCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAAc < 1:6965863/101‑1 (MQ=255)
cGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACa > 2:1067385/1‑101 (MQ=255)
ggTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGGTCCCCCCGCGGGGGCGGGGATCGAAACAt > 1:1488535/1‑101 (MQ=255)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGGGGGTCGAAACAcct > 2:7043087/1‑101 (MQ=0)
gTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtc > 1:3642701/1‑101 (MQ=255)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctt < 1:2848035/101‑2 (MQ=2)
tCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtct > 1:5659688/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc > 2:19991/1‑101 (MQ=255)
cGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAtctc < 1:6217824/101‑1 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttc < 1:740277/101‑4 (MQ=2)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 1:1161415/1‑101 (MQ=255)
gCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCg > 1:3839374/1‑101 (MQ=255)
cgccccgcGCGGGGGCGTGGATCGCACCA..TCGCCGCT.TTGGCCGTCGACAGGCTCGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCgg < 2:65015/99‑1 (MQ=37)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 1:5822231/101‑5 (MQ=2)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 1:3269440/101‑5 (MQ=2)
cTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttca < 2:301044/101‑5 (MQ=2)
gccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaa < 1:1825736/100‑6 (MQ=0)
ccccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGCACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaat < 1:861952/101‑7 (MQ=0)
cccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACT..ACACCGGG.GCTCTGGTC.ACGGTTTGGGACGGAGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACAgctttcaatg < 2:335451/101‑8 (MQ=2)
ccccGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGcc < 2:71059/101‑1 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGc > 1:4364972/1‑101 (MQ=255)
cgGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGc > 2:4425763/1‑101 (MQ=255)
gggggCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCt < 1:1727795/101‑1 (MQ=255)
gTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCa > 2:6078652/1‑101 (MQ=255)
tGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTTCCATCGCTCGTCCAg > 2:591367/1‑101 (MQ=255)
ggATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGCCGCTCGTCCAGc > 2:3910154/1‑101 (MQ=255)
gAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGcc < 1:6728613/101‑1 (MQ=255)
aaaCA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt < 1:1241700/101‑1 (MQ=255)
aaaCA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCt < 1:1576947/101‑1 (MQ=255)
aaCA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg > 1:6098403/1‑101 (MQ=255)
aaCA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg > 2:5682041/1‑101 (MQ=255)
aaCA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg < 1:2240420/101‑1 (MQ=255)
aaCA..GCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTg < 1:559098/101‑1 (MQ=255)
a..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtc < 2:1891547/101‑1 (MQ=255)
agcgccgcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtc < 2:4670891/99‑1 (MQ=255)
cgccgcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgt < 1:1409203/101‑1 (MQ=255)
gccgcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATTGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgtc < 1:3918751/101‑1 (MQ=255)
gccgcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGGtcgtc > 2:2564652/1‑101 (MQ=255)
gccgcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGCGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCtcgtc > 1:483669/1‑101 (MQ=255)
gcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGcc > 2:3440429/1‑100 (MQ=255)
gcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCt < 2:6306192/101‑1 (MQ=255)
gcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCt < 2:6254381/101‑1 (MQ=255)
gcT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCt > 1:2473712/1‑101 (MQ=255)
cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTc > 1:6594888/1‑101 (MQ=255)
cT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTc < 2:2070953/101‑1 (MQ=255)
t.ttGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTAGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTcc > 1:5100944/1‑101 (MQ=255)
ggCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTccccc > 2:2457311/1‑101 (MQ=255)
ggTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCcgc < 1:1780708/101‑1 (MQ=255)
gTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTGCCGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCcccg > 2:6163043/1‑101 (MQ=255)
cGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGGTCCCCCCGCggg > 1:7080735/1‑101 (MQ=255)
cAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGc < 2:1753228/101‑1 (MQ=255)
ggCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGt > 1:4558014/1‑101 (MQ=255)
gCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:6382314/1‑101 (MQ=255)
gCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTg > 1:4622481/1‑101 (MQ=255)
cTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTgg > 2:6997094/1‑101 (MQ=255)
tGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa < 1:2766275/101‑1 (MQ=255)
tGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 2:4895176/1‑101 (MQ=255)
tGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCGGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGa > 2:54058/1‑101 (MQ=255)
ggTACCGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:4060107/101‑1 (MQ=255)
ggTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGAt < 2:3156785/101‑1 (MQ=255)
gTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATc > 2:2687919/1‑101 (MQ=255)
|
AACTGCACCCGCTGGCCCTGCCGGTGATCGGTGATCAGCGGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACA..TCGCCGCT.TTGGCGGTCGACAGGCTGGTAACGTGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCGAAACATCTCGGTGCCGTCGCTCGTCCAGCCGGCCTGCTCGTCGCTCCCCCCGCGGGGGCGTGGATCG > NC_014034/1395394‑1395594
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|