Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_014034 | 1,951,208 | G→C | 89.3% | A129G (GCG→GGG) | ssb1 ← | single‑stranded DNA‑binding protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_014034 | 1,951,208 | 0 | G→C | 89.3% | 49.1 ‑1.8 0.0 | 197 | A129G (GCG→GGG) | ssb1 | single‑stranded DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (97/79): ref base (15/6): total (112/85) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.70e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
GCCCGACGAGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGCGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCGCG.CGTAATTGCCACCGCCGCGCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGCACCACCTCGGTCGT > NC_014034/1951114‑1951299
|
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ccggaggggggggCG.GGGGGC.CCGCCCCCCCCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAAtt < 2:6056642/93‑1 (MQ=255)
cgaggggggggCG.GGGGAG.CCGCCGCCCCCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGc < 1:5538650/95‑1 (MQ=255)
cgacgaGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGc > 1:3761978/1‑101 (MQ=255)
gacgaGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGcc > 2:244223/1‑101 (MQ=255)
gacgaGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGca > 2:6249892/1‑100 (MQ=255)
acgaGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCa > 2:5980250/1‑101 (MQ=255)
gggggggcCC.GAGGGC.CCGCCGCCCCCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCAc < 2:6276530/98‑1 (MQ=255)
gcggggggGC.GCGGGC.CCCCCGCCCCCCGCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCAc < 2:1014075/98‑1 (MQ=255)
cgaGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCAc > 1:2453453/1‑101 (MQ=255)
gggggggCG.GAGGAC.CCGCCGCCCCCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCAcc < 1:1426110/99‑1 (MQ=255)
gggggggCC.GGGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCAcc < 1:4582093/99‑1 (MQ=255)
gaGGGGGCG.GGGGAG.CCGCCGCCCCCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCAcc < 1:666131/101‑1 (MQ=255)
gaGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCCcc > 1:817749/1‑101 (MQ=255)
gaGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCAcc > 2:647671/1‑101 (MQ=255)
gaGGCGCCC.GAGGAG.CCCCCGCCCCCGCCCCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCAcc < 2:6002220/101‑1 (MQ=255)
ggggggCCGGGGGGG.CCGCCGCCCCCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCAcc < 1:58547/100‑1 (MQ=255)
aGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCAccg > 1:3952748/1‑101 (MQ=255)
aGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCAccg > 2:1379137/1‑101 (MQ=255)
gggggCC.GGGGCGCCCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCGGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCAccg < 1:6288507/101‑1 (MQ=255)
gggggCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTCCCACCCGCCGC.CGTAATTGCCAccgc > 2:6960848/1‑101 (MQ=255)
cc.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACcgccgccc > 1:3498116/1‑99 (MQ=255)
cgggggac.CCCCCGCCCCCCCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACcgccgccc < 2:3507469/97‑3 (MQ=255)
c.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCcgcccg > 2:1202467/1‑101 (MQ=255)
ggaggcgcgcccgccacctccgcgaAGGCGCTGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCCCGGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCcgcccg < 1:4369263/91‑1 (MQ=255)
gaggag.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGa > 1:2846347/1‑101 (MQ=255)
gaggag.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGa > 2:5907897/1‑101 (MQ=255)
ggag.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAgc > 2:5198877/1‑101 (MQ=255)
gccccgccccccccgccgccaTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAgcc < 1:2158537/98‑1 (MQ=255)
ag.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCAGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAgccg > 1:5504849/1‑101 (MQ=255)
gcccgccccccccgccgccaTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAgccg < 2:2559340/99‑1 (MQ=255)
gccgccaccgccgccaTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAgccgccgc > 1:1373781/1‑101 (MQ=255)
cccccccgcccccaTAGCCGGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCa < 2:222974/96‑1 (MQ=255)
ccccccgccgccaTGGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCAt < 1:2194422/97‑1 (MQ=255)
ccccgccgccaTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATcc < 1:6769489/99‑1 (MQ=255)
ccccgcccccaTAGCCCGGGCCGGCATCGTGCCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATcc < 2:1977404/99‑1 (MQ=255)
cccccccgccaTGGCCGGGGCCGTCATCGTAGCCCCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATcc < 2:6619862/96‑1 (MQ=255)
ccccccgccaTAGCCCGGGCCTTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATccc < 1:2578270/97‑1 (MQ=255)
ccccccgccaTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATccc < 1:1506724/97‑1 (MQ=255)
cgccgccaTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCgg > 2:2685356/1‑101 (MQ=255)
gccgccaTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGgc > 2:4490073/1‑101 (MQ=255)
ccgccaTAGCCCGGGCCGTCATCGTACCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGgcc < 1:5122000/101‑1 (MQ=255)
gccaTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGgccgc > 2:4261776/1‑101 (MQ=255)
ccaTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGgccgcc > 2:6676085/1‑101 (MQ=255)
caTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCa > 2:6742026/1‑101 (MQ=255)
caTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCa > 2:6529103/1‑101 (MQ=255)
caTAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCa > 1:2528195/1‑101 (MQ=255)
ccgatctggcccGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCaa < 1:7089939/91‑1 (MQ=255)
tAGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCCag > 2:304280/1‑101 (MQ=255)
acccggggcCCTCATCGGCGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAagc < 2:3261306/94‑1 (MQ=255)
aGCCCGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCaacc > 1:4697721/1‑99 (MQ=255)
gCCCGGCCCGTCACCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAagca < 2:4403077/101‑1 (MQ=255)
cccGGGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAagcag > 2:1484016/1‑101 (MQ=255)
cggggcCGTCATCTTACCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAagcagc < 1:6559891/97‑1 (MQ=255)
gggcCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCaaagatcgg > 2:7089565/3‑94 (MQ=255)
gggcCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGt > 2:5753398/3‑101 (MQ=255)
gggcCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGt > 1:552316/3‑101 (MQ=255)
ggcCGTCATCGTGGCCGCCCCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTc < 1:1037013/100‑1 (MQ=255)
gcgctCATGGTACCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCa < 1:243322/97‑1 (MQ=255)
gcCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCACGCAGCGTCa > 2:6504906/1‑101 (MQ=255)
gcCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCAAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCa > 2:6404214/1‑101 (MQ=255)
cGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAgg > 2:400481/1‑101 (MQ=255)
gTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGt > 2:6301788/1‑101 (MQ=255)
cgtcctccgcccccgccACAGCCCCCGCCCTGCTACCCCCCCC.CGTAATTGCCCCCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGtt < 1:2279614/93‑1 (MQ=255)
cATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTg > 1:4887464/1‑101 (MQ=255)
cATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTg > 2:4087713/1‑101 (MQ=255)
cATCGTAGCCGCCGCCATAGCCCCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCCTCCCGGCCGCCAAGCACCGTCAGGttc > 2:6988982/1‑100 (MQ=255)
tCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGcc > 1:1886151/1‑101 (MQ=255)
cggcccccccgccCTAGCCGCGGCCCTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGccc < 2:1526391/93‑1 (MQ=255)
cGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGccc < 1:5072325/101‑1 (MQ=255)
cGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGccc > 2:1213547/1‑101 (MQ=255)
cGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATACCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGccc > 1:4970856/1‑101 (MQ=255)
cGTACCCCCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGccc < 2:2060769/101‑1 (MQ=255)
tgccccccgccATACCCGCCGCCCTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGt < 1:5908200/95‑1 (MQ=255)
tAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGt > 2:3588639/1‑101 (MQ=255)
aGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGta > 1:4548512/1‑101 (MQ=255)
aGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGta > 1:5436569/1‑101 (MQ=255)
cgccgccATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAg > 2:5752138/1‑101 (MQ=255)
cgccgccATAGCCGCCCCCCTGCGACCCGCCGC.CGTAGTTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAg < 1:5270/101‑1 (MQ=255)
gccgccATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAgg > 1:108529/1‑101 (MQ=255)
gccgccATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGATGCCCGTATAgg > 1:7044521/1‑101 (MQ=255)
cccgccAGAGCCGCCGCCCTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCATATAgg < 2:4695133/100‑1 (MQ=255)
cgccATAGCCGCCGCCCTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCACCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAgggg < 1:1462105/101‑1 (MQ=255)
ccATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGgcg > 2:1686439/1‑101 (MQ=255)
agcgccgccgccCTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCgca < 1:6393740/98‑1 (MQ=255)
aTAGCCGCCGCCCTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCgca < 1:2685452/101‑1 (MQ=255)
aTAGCCGCCGCCCTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCgca > 1:4716828/1‑101 (MQ=255)
tAGCCGCCGCCCTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCgcag > 1:6180714/1‑101 (MQ=255)
aGCCGCCGCCCTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCgcagc > 1:1121313/1‑101 (MQ=255)
gccgccgccCTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCgcagca > 1:828902/1‑101 (MQ=255)
cccccgccCTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGcac < 2:6209993/98‑1 (MQ=255)
gccgccCTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGcacca > 1:1796091/1‑101 (MQ=255)
gccCTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGCACCACCt < 2:2528101/101‑1 (MQ=255)
gccCGGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGCACCACCt < 1:3147561/101‑1 (MQ=255)
ccccTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGCACCACCt < 2:474125/100‑1 (MQ=255)
cccTGCGACCCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGCACCACCTc < 1:6404538/101‑1 (MQ=255)
cccTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGCACCACCTc < 2:4602331/101‑1 (MQ=255)
cccTGCGAACCGC.CGCCGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGCACCACCTc > 1:1076365/1‑101 (MQ=255)
cTGCGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGCACCACCTCgg > 1:3690051/1‑101 (MQ=255)
cGAACCGCCGC.CGTAATTGCCACCGCCGCCCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGCACCACCTCGGTCg > 1:1584991/1‑101 (MQ=255)
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GCCCGACGAGGGGGCC.GAGGAG.CCGCCGCCACCGCCGCCATAGCCCGCGCCGTCATCGTAGCCGCCGCCATAGCCGCCGCCCTGCGAACCGCGCG.CGTAATTGCCACCGCCGCGCGAGCCGCCGCCATCCCGGCCGCCAAGCAGCGTCAGGTTGCCCGTATAGGGGCGCAGCACCACCTCGGTCGT > NC_014034/1951114‑1951299
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 25 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|