BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,985	G→A	16.1%	D224D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	221,985	0	G→A	16.1%	0.0 ‑2.5 0.0	992	D224D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (77/83): ref base (463/367): total (540/452)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.29e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2630 total aligned reads displayed.


CTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGT  >  NC_014034/221885‑222085


 ttCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggt                                                                                                      <  2:5502527/101‑1 (MQ=255)


  tCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                                     <  2:2523702/101‑1 (MQ=255)


   gggtcggctccctgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                                    >  2:2009260‑M1/69‑101 (MQ=255)


   cGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                                                                                                    <  2:158127/101‑1 (MQ=255)


         ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                                                              <  1:6063071‑M1/39‑1 (MQ=255)


         gatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                                                                              <  2:1034757‑M1/39‑1 (MQ=255)


          ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGAtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggac                                                                                             >  2:1872934/1‑100 (MQ=255)


          ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                             <  1:191040/101‑1 (MQ=255)


          ggtggtCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                                                                             <  1:6216717/101‑1 (MQ=255)


           gccgtgggatcggtcggggccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                                                                                            >  2:6625970‑M1/61‑101 (MQ=255)


              gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggg                                                                                         <  1:5175384‑M1/44‑2 (MQ=255)


               tcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggta                                                                                        <  2:5106626‑M1/45‑2 (MQ=255)


               tCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                        >  2:6739972/1‑101 (MQ=255)


               ggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                        >  1:5674634‑M1/57‑101 (MQ=255)


                 aGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGgtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgg                                                                                      <  1:1489477/101‑1 (MQ=255)


                       gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGt                                                                                <  1:749561‑M1/53‑1 (MQ=255)


                        gccgctccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                               >  2:2397436‑M1/48‑101 (MQ=255)


                         cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                              >  1:3601882/1‑101 (MQ=255)


                          ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                             >  1:5547251‑M1/46‑101 (MQ=255)


                             tCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                          <  1:1635346/101‑1 (MQ=255)


                              ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                         >  1:2589132‑M1/42‑101 (MQ=255)


                               cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                        <  2:311826‑M1/61‑1 (MQ=255)


                                  cTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                     >  1:3369714/1‑101 (MQ=255)


                                       cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                >  1:7040825‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                        ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                               <  2:5599705‑M1/70‑1 (MQ=255)


                                           ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcagatcggaaa                                                            >  2:1302533/1‑91 (MQ=255)


                                             gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                          >  1:5413867‑M1/27‑101 (MQ=255)


                                              gggCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                         >  2:284897/1‑101 (MQ=255)


                                               tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                        >  1:5947617‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                               tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                        >  1:63363‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                               tccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                        >  1:6530101‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                               tccgtgggatcggtcggcgccgtgCGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                        >  2:5871228‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                                 cgtgtgttcggtcgggtccgtgGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc.gg                                                     >  2:6130662‑M1/23‑101 (MQ=255)


                                                   tgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc.ggtc                                                   >  2:86373‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                                     ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc.ggtcgg                                                 <  1:300680‑M1/83‑1 (MQ=255)


                                                      gatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGatc.ggtcggc                                                <  2:4665695‑M1/84‑2 (MQ=255)


                                                        tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGggatc.ggtcgggtc                                              <  1:269820‑M1/86‑4 (MQ=255)


                                                        tcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATc                                              >  1:451308‑M1/16‑101 (MQ=255)


                                                        tGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATc                                              <  1:3163592/101‑1 (MQ=255)


                                                          ggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCg                                            <  1:4884365‑M1/88‑1 (MQ=255)


                                                           gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGt                                           <  2:4385977/101‑1 (MQ=255)


                                                            tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGtc                                          >  1:4287213/1‑100 (MQ=11)


                                                               ggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGa                                       >  1:891737‑M1/9‑101 (MQ=255)


                                                               gatcggtcggGGCCGTTGGATCCGTTGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATC.GGTCGGGTCCGTcggg                                       <  2:3359826/99‑2 (MQ=14)


                                                                gttcgcgggctcgggcgggtccgcgggatcggtcggggccgggggaTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAt                                      <  1:5325521/91‑1 (MQ=11)


                                                                gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTG.CGGCGGATCCGTggggc                                      >  2:1749479/8‑99 (MQ=11)


                                                                gtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAt                                      >  1:6644095‑M1/8‑101 (MQ=255)


                                                                ggccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGAt                                      <  1:4760019/91‑1 (MQ=11)


                                                                 tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtc                                     <  1:23257/101‑1 (MQ=255)


                                                                 gccgtttgatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtc                                     <  2:713400/94‑1 (MQ=11)


                                                                  gcgttgcataggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                    <  2:2092905/91‑1 (MQ=11)


                                                                  ccgttggctcggtcgggtccgtcggctcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                    <  2:4071669/93‑1 (MQ=11)


                                                                  ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATC.GGTAGAATCCGTgggggca                                    >  1:3868550/6‑97 (MQ=11)


                                                                  ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                    >  2:4302996‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                                   ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTGGGGCCCGTCGGAtcgg                                   >  1:5807766/1‑101 (MQ=11)


                                                                   cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                   <  2:5728254‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                                   cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGCtcgg                                   <  1:6878744‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                                    gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATC.TGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                  >  2:4187649/4‑101 (MQ=11)


                                                                      gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCTGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                <  1:3725904‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                       ggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGAtcgggcgg                               >  2:3486457/1‑101 (MQ=11)


                                                                       ggatcgggcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                               <  1:4013641/101‑1 (MQ=11)


                                                                         atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGAGCCGTGGGAtcggtcggat                             >  2:2977066/1‑99 (MQ=11)


                                                                          tcggtcgggtccgtggggcgcgtcgggtccgtgggaCCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                            <  2:1155281/101‑1 (MQ=11)


                                                                          tcggccgggtccggcggatcggtcgggtccgtcggaTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                            <  2:4830454/101‑1 (MQ=11)


                                                                           tggtcgggtccgtggggccggtccggtccgtgggatcCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                           <  2:1422115/100‑1 (MQ=11)


                                                                           tcggtggctccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                           <  1:2795827/93‑1 (MQ=11)


                                                                           cggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                           <  1:218737/101‑1 (MQ=11)


                                                                           cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                           <  1:1324815/101‑1 (MQ=11)


                                                                            ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGT.GGATCGGGTCGGATCCGTGGGAT.GGTCGGGACCgg                         >  2:4949991/1‑100 (MQ=14)


                                                                              tcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                        >  2:3579105‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                                              tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                        >  2:5960561‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                                              taggttccgttggatcgggcgggtccgtgggatccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                        <  2:6829911/96‑2 (MQ=14)


                                                                                 ggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcgGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGggg                     >  2:3939460/1‑100 (MQ=14)


                                                                                  gtccgtggtgtcgggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCCTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                    <  1:5040692/101‑1 (MQ=11)


                                                                                  gtccgtgggagcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                    <  2:5400535/101‑1 (MQ=11)


                                                                                   tccgtgggctcggtcgggtccgtcggatccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                   <  2:6413165/101‑1 (MQ=11)


                                                                                   tccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCtc                   >  1:1229012/1‑101 (MQ=11)


                                                                                    gcgtggggtcggtcgggtccgtggggtcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                  <  1:2043357/100‑1 (MQ=14)


                                                                                    ccgtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGtcg                  >  1:4157541/1‑101 (MQ=11)


                                                                                    ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                  >  1:6768999‑M2/1‑94 (MQ=255)


                                                                                     cgtgggttcggtcggggccgtgggggccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                 <  1:1093753/101‑1 (MQ=14)


                                                                                     cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg                 >  1:1000254/1‑96 (MQ=11)


                                                                                     cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg                 <  1:2439602‑M2/101‑9 (MQ=255)


                                                                                      gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCGGGGGGGGCGGTCGGGTCAGTGCGGtcggt                >  2:3204923/1‑101 (MQ=11)


                                                                                      gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTC.GGTCGGGTCCGAGGGATCGAGCGGCACCGTGGGAtcggc                >  2:265031/1‑100 (MQ=11)


                                                                                        ggtctcggtgggctccgcgcgttcggtcggCTCCGCGGGATCGGTCGGCTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg              <  2:3690910/97‑1 (MQ=1)


                                                                                        gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtca              <  2:3854‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                                        gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCgggctcggtgg              <  1:2886008‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                                         ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtgcg             <  1:462352‑M2/101‑13 (MQ=255)


                                                                                         ggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTC.CGTCGGATCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTGGGAtcggtcgg             >  2:4523372/1‑101 (MQ=14)


                                                                                          gatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgtg            <  1:180264‑M2/101‑14 (MQ=255)


                                                                                            tccgtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatc          <  1:4375488/98‑1 (MQ=11)


                                                                                              ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg        <  2:2244730‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                                                 cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg     <  1:3489933‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                                                 cgggtccgtcggatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGgtcgggtccgtgg     >  2:273984/1‑99 (MQ=11)


                                                                                                  gggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg    <  1:3923404‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                                  ggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg    <  2:6267023‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                                  ggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg    <  1:3264487‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                                  ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtccggggg    <  2:5271656‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                                    gtctgtcgggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtcggat  <  2:7022097/101‑3 (MQ=11)


CTTCGGTGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATC.GGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGT  >  NC_014034/221885‑222085

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 17 ≤


ATCG

< 24 ≤


ATCG

< 32 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG