BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	221,991	G→C	5.7%	P222P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	221,991	0	G→C	5.7%	101.0 ‑1.1 ‑0.0	993	P222P (CCC→CCG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (36/23): ref base (510/424): total (546/447)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.49e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 2705 total aligned reads displayed.


TGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221891‑222091


  ttGGGGGGCAGCGTCGCCGGATCGCGCTGATCGACTGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggg                                                                                                    <  2:1039959/101‑1 (MQ=37)


         tCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                                                                                             <  2:16096/101‑1 (MQ=255)


            gatcggtcgggtctgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                                                                                          >  2:6868661‑M1/54‑100 (MQ=255)


              tcggtccgatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtc                                                                                        >  2:5940885‑M1/52‑98 (MQ=255)


              gTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                                        >  2:5544918/1‑101 (MQ=255)


               cggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                       >  2:6757872‑M1/51‑101 (MQ=255)


                ggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCg                                                                                      <  2:2020795‑M1/52‑1 (MQ=255)


                 gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                     <  1:6901722‑M1/53‑1 (MQ=255)


                  ccGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                    <  2:287352/101‑1 (MQ=255)


                   cGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                   >  1:3601882/1‑101 (MQ=255)


                     gATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGa                                                                                 >  1:7058460/1‑101 (MQ=255)


                      gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                <  2:5009311‑M1/58‑1 (MQ=255)


                       tCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                               <  1:1635346/101‑1 (MQ=255)


                        ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                              <  1:776304‑M1/60‑1 (MQ=255)


                        ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                              >  1:2589132‑M1/42‑101 (MQ=255)


                        ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTCGGATccgtggggtcc                                                                              <  1:2791124‑M1/60‑5 (MQ=255)


                             ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                         <  1:3489968‑M1/65‑1 (MQ=255)


                                tCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                                                      <  1:2444531/101‑1 (MQ=255)


                                 cggtcgggtccgtgggagcggtcggggccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     >  2:4348315‑M1/33‑101 (MQ=255)


                                 cGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                     >  1:6782098/1‑101 (MQ=255)


                                     ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                 >  1:6654342/1‑101 (MQ=255)


                                     cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                 >  2:3023117‑M1/29‑101 (MQ=255)


                                     cgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                 <  1:5202220‑M1/73‑1 (MQ=255)


                                       ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                               <  1:4154575‑M1/75‑1 (MQ=255)


                                       ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtgggg                                                               <  2:3603451‑M1/75‑2 (MQ=255)


                                        gtccgtgggttccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                              >  2:1160623‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                        atccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                              >  1:5441151‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                         tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                             >  2:3891838‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                           cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                           <  1:4649964‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                           cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                           <  1:1214853‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                           cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGgatccg                                                           <  1:4806175‑M1/79‑3 (MQ=255)


                                            gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                          >  2:71678‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                            gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                          <  1:1325339‑M1/80‑1 (MQ=255)


                                             tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                         >  2:5797468‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                             tgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                         >  1:3374757‑M1/21‑101 (MQ=255)


                                               ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                       <  1:300680‑M1/83‑1 (MQ=255)


                                                 aTGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                     >  1:2878909/1‑101 (MQ=255)


                                                      tGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtc                                                >  1:4287213/1‑100 (MQ=11)


                                                       cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                               <  2:86559‑M1/91‑1 (MQ=255)


                                                          gtccgtcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGCATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                            >  1:4381833/5‑101 (MQ=11)


                                                           tcggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                           <  2:3249777/101‑1 (MQ=11)


                                                           tcggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                           <  1:23257/101‑1 (MQ=255)


                                                           tccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtc                                           <  2:2669392/98‑1 (MQ=11)


                                                           gccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                           >  2:4567192‑M1/7‑101 (MQ=255)


                                                            ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTAGAATCCGTgggggca                                          >  1:3868550/6‑97 (MQ=11)


                                                             ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg                                         >  1:1896743/1‑101 (MQ=11)


                                                              gtggggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggt                                        >  2:3524997/10‑101 (MQ=11)


                                                              gtgggatcggtcaggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGGtcggc                                        >  1:5069026/4‑100 (MQ=11)


                                                               tggggtccgtcgggtgcgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggtc                                       <  1:897663/93‑1 (MQ=14)


                                                               tgcgaccggccgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                       <  2:230315/95‑1 (MQ=11)


                                                               tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                       <  2:2410830‑M1/99‑1 (MQ=255)


                                                                gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGGCGGATCCGTGGGGTCGGGCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                      >  2:4889884/2‑101 (MQ=11)


                                                                gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                      <  1:4010425‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                gGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCTGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                      <  1:3725904‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                                 ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGATCGGTGGGGGCCGTGGGAtcggtcgg                                     >  2:1878817/1‑101 (MQ=14)


                                                                  ggtgggtggggtccgggggatcgggcgggtcggtgggatgGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcgga                                    <  1:3915605/97‑2 (MQ=11)


                                                                    tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                  <  2:4136769/101‑1 (MQ=11)


                                                                     cggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATcc                                 <  1:218737/101‑1 (MQ=11)


                                                                     cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                 <  1:1488818/101‑1 (MQ=11)


                                                                      ggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                <  2:5668881/101‑1 (MQ=11)


                                                                       gtcgggtccgtgggctcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                               <  2:6652116/101‑1 (MQ=14)


                                                                       gtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcgGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGt                               >  2:2128235/1‑101 (MQ=11)


                                                                       ggcggggccgtggggccgggcgcgtccttgggatcgggCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                               <  1:6537434/99‑1 (MQ=11)


                                                                        tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                              >  2:1781615/1‑100 (MQ=11)


                                                                        tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                              >  1:4915837‑M2/1‑100 (MQ=255)


                                                                        tcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                              <  2:7040451‑M2/101‑2 (MQ=255)


                                                                         cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGACCGCGGGATCGGTCGGGAGCGTGGGGTTGTTCGGGGCCGCGGGATCGGTCgggacagagg                             >  2:5325254/1‑94 (MQ=2)


                                                                         cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGCGGGAtcgttcggaacagagg                             >  2:2755618/1‑93 (MQ=11)


                                                                          gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGACCGGCCGGGTCCGTGgg                            >  1:5955755/1‑101 (MQ=14)


                                                                           ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGTGCGGGCGGGTCCGTTGGa                           >  2:3757149/1‑101 (MQ=14)


                                                                           ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgGGGCCGGGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGCCGGGCCCGTGggt                           >  2:1311753/1‑100 (MQ=11)


                                                                           ggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggga                           >  1:6232247‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                                            gtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggt                          >  1:5564775/1‑99 (MQ=14)


                                                                            atccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                          <  2:4459887/100‑1 (MQ=11)


                                                                             tccgtggggtcggtcgtgtccgtgggttcggtcgaGTCCGGAGGATCGGCCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                         <  2:5170933/101‑1 (MQ=11)


                                                                              ccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcc                        >  1:6084984‑M2/1‑94 (MQ=255)


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                                                                               cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg                       >  1:1000254/1‑96 (MQ=11)


                                                                               cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGAGGGATCGGGCGGCGCCGTGGGATCGGGCGGGTCCCTGGGAtcgg                       >  2:2550454/1‑101 (MQ=11)


                                                                               cgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                       <  2:620145/101‑1 (MQ=11)


                                                                                gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGACCGGTCGGTTCCGAGGGAtcggt                      >  2:65294/1‑101 (MQ=11)


                                                                                gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGtcggg                      >  2:6063537/1‑100 (MQ=11)


                                                                                  gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGGGGGATCGGTGGGGTCGGTGGGATGGGCCGGATCGGTGGGATCGGTGGGGCCCGGGGGGtgggtcg                    >  2:3147664/1‑101 (MQ=9)


                                                                                   gggctcgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                   <  1:2695615/95‑1 (MQ=11)


                                                                                   ggatcggtcgggtccgtgggatcgggcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcgg                   <  1:3159439/101‑1 (MQ=17)


                                                                                       cgggcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatcc               >  1:2040444‑M2/1‑85 (MQ=255)


                                                                                        ggtcggttccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg              >  2:5440281‑M2/1‑84 (MQ=255)


                                                                                        ggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGCGTCGgtcgggtccg              >  1:1097804/1‑101 (MQ=11)


                                                                                        gggtgggtccgtgtgatccctaggATCCTTCGTATCGGCCCGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg              <  1:5694048/97‑1 (MQ=11)


                                                                                         gtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt             <  1:4530195‑M2/101‑19 (MQ=255)


                                                                                         gtcggatccgtggggtccgtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGggggggtccgg             >  2:4246913/1‑100 (MQ=11)


                                                                                           cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg           <  1:5825059‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                                           cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGTTCCGTGGGATCGgtcgggtccgggg           >  2:3424596/1‑98 (MQ=11)


                                                                                           cggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGTTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcg           >  1:533355/1‑101 (MQ=14)


                                                                                            ggttccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg          <  2:4000300/98‑1 (MQ=11)


                                                                                            ggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg          <  1:3264487‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                              gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtggggt        >  2:4716641‑M2/1‑78 (MQ=255)


                                                                                              atccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcggggccgtcggat        >  2:6338151/2‑99 (MQ=14)


                                                                                               tccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtc       >  1:1790884/1‑101 (MQ=14)


                                                                                               tccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtc       <  1:6374816/101‑1 (MQ=11)


TGTTGGTGGTCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGG  >  NC_014034/221891‑222091

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 24 ≤


ATCG

< 32 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG