BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,000	C→G	5.8%	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,000	0	C→G	5.8%	142.9 ‑1.2 ‑0.0	1396	P219P (CCG→CCC)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (49/34): ref base (695/614): total (746/650)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 3.09e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.80e-01

Only 100 of 2848 total aligned reads displayed.


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100


tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtc                                                                                                      <  1:3574743‑M1/45‑1 (MQ=255)


 cAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg                                                                                                     <  2:873622/101‑1 (MQ=255)


          cggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                                            <  1:3473419‑M1/55‑1 (MQ=255)


            gatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGa                                                                                          <  2:2755322‑M1/57‑1 (MQ=255)


                      aTCGACGGGGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                <  1:20188/101‑1 (MQ=255)


                       tcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGggatcggtcggatc                                                                               >  2:3238135‑M1/34‑98 (MQ=255)


                        cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                              >  1:7040825‑M1/33‑101 (MQ=255)


                        cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                              >  2:3950424‑M1/33‑101 (MQ=255)


                        cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                              >  1:3673843‑M1/33‑101 (MQ=255)


                          gtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                            <  1:2765005/92‑1 (MQ=11)


                          gtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCcgg                                                                            <  2:1864400‑M1/71‑2 (MQ=255)


                            ggTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                          >  1:6654342/1‑101 (MQ=255)


                             gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                         >  1:4337120‑M1/28‑101 (MQ=255)


                              gatccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                        <  1:4874495‑M1/75‑1 (MQ=255)


                               ttccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                       >  2:4410893‑M1/26‑101 (MQ=255)


                               gtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                       >  2:1725411‑M1/26‑101 (MQ=255)


                               atccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCTGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                       >  2:2105492‑M1/26‑101 (MQ=255)


                                tgcggcggatctgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                      >  2:4090431‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                tccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                      >  1:3990118‑M1/25‑101 (MQ=255)


                                 ccgggggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTccgtggggtcc                                                                     >  1:3812460‑M1/24‑97 (MQ=255)


                                  cgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                    <  1:1214853‑M1/79‑1 (MQ=255)


                                   gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                   >  2:4676248‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                   gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                                                                   >  2:71678‑M1/22‑101 (MQ=255)


                                     cGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                                 >  2:5649432/1‑101 (MQ=255)


                                      ggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                >  1:5010786‑M1/19‑101 (MQ=255)


                                         tccGTGGGTTCGGTCGGATCCTTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATc                                                             <  2:2660267/99‑1 (MQ=11)


                                          ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                            >  2:4967077/2‑101 (MQ=11)


                                            gTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                          <  1:2669116/101‑1 (MQ=255)


                                              gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                        >  1:2847987/1‑99 (MQ=1)


                                              cgggatcgtgggatcggtggggtcggtgggatcggtcggggccgcgGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                        <  2:3001338/91‑1 (MQ=11)


                                               gggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                       <  1:5954240‑M1/92‑1 (MQ=255)


                                                 gttcttggcatcgttcgggctcgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                     <  2:4206619/92‑1 (MQ=11)


                                                 gttcgcgggctcgggcgggtccgcgggatcggtcggggccgggggaTCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                     <  1:5325521/91‑1 (MQ=11)


                                                 ctccgtgcgatcggtgggctcggcgggatccgtcggctccgtggGATCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                     <  2:6853215/93‑1 (MQ=11)


                                                  tccgtgggatcggccgtgtccgtgggctccgccgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                    <  2:31250/95‑1 (MQ=11)


                                                   ccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                   >  1:5809315‑M1/6‑101 (MQ=255)


                                                   ccggcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                   <  2:674995/97‑1 (MQ=11)


                                                    ggtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGAGAtcgg                                                  >  2:3490761/1‑101 (MQ=255)


                                                    cgtggggtcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                  <  1:1471268/94‑1 (MQ=11)


                                                    cgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGACCGGTGGGATCGGCCGGCGCCGCggggccgg                                                  >  2:3388759/5‑96 (MQ=11)


                                                    cgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGCtcgg                                                  <  1:6878744‑M1/97‑1 (MQ=255)


                                                      tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATACGGGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgggg                                                >  2:4533211/3‑99 (MQ=11)


                                                      tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGatcggtg                                                <  2:3596404‑M1/99‑2 (MQ=255)


                                                       gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGTTCCGTGGGAtcggtcg                                               <  1:892097‑M1/100‑1 (MQ=255)


                                                        ggatcgttcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGACGGGACCGTGGGAGCGGTCGGGTCCGGGGGGGTCGTCGGAGCCGGGGGAgcggtcgg                                              >  2:1035227/1‑101 (MQ=9)


                                                         ggtccgtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcgga                                             >  2:3703061/6‑100 (MQ=11)


                                                         gatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATGGGTCggg                                             >  1:3346358/1‑101 (MQ=11)


                                                          gtccgtcgggtccgtggggtcggtctggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat                                            <  2:5405688/97‑3 (MQ=11)


                                                          atcggtcggctccgtcggatcggtgggatccgtgggATCGGTCGGGGCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGTGATCGGTCGGGTCCCGGGGGACCGTCGGGt                                            >  2:6318007/1‑101 (MQ=2)


                                                          atcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                            >  1:4455421/1‑99 (MQ=11)


                                                           tcggtcgggtccgtggggcgcgtcgggtccgtgggaCCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                           <  2:1155281/101‑1 (MQ=11)


                                                           tcggccgggtccggcggatcggtcgggtccgtcggaTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTc                                           <  2:4830454/101‑1 (MQ=11)


                                                            tgatgggatccgtggggtctgtcgggtccgtggggtcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          <  2:5789043/93‑1 (MQ=11)


                                                            cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                          <  1:1324815/101‑1 (MQ=11)


                                                              gtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                        >  1:6095226/1‑101 (MQ=11)


                                                               tcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                       <  1:2145354‑M2/101‑2 (MQ=255)


                                                                ggggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                      <  1:3246773/100‑3 (MQ=11)


                                                                cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                      >  2:2000833/1‑99 (MQ=11)


                                                                 gggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGgg                                     >  1:4567718/1‑101 (MQ=14)


                                                                  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggg                                    >  1:6540812‑M2/1‑97 (MQ=255)


                                                                  ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgggcgGGGCCGGGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGCTCGGCCGGGCCCGTGggt                                    >  2:1311753/1‑100 (MQ=11)


                                                                  ggtccgtgcgacgggtcgggtgcgtgggatgggccgTGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCggggga                                    <  2:3871595/101‑6 (MQ=11)


                                                                   gtccgtggggtccgtcgggtccgggggatcggtcggGGCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAt                                   <  1:2954724/101‑1 (MQ=11)


                                                                   gtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTgggga                                   <  2:2868349‑M2/101‑6 (MQ=255)


                                                                   gtccgtgggagcggtcgggtccgtggggtcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggat                                   >  2:1590424‑M2/1‑96 (MQ=255)


                                                                     ccgttggatcggtcgggtccgtcggctcggggggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                 <  2:2399119/101‑1 (MQ=11)


                                                                      cgtgggatcggtgggggccgtggggtccgtcggATCCGTGGGCTGGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcgg                                <  1:6389004/101‑1 (MQ=11)


                                                                      cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg                                >  1:1000254/1‑96 (MQ=11)


                                                                      cggggggtcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                <  1:1101313/98‑1 (MQ=11)


                                                                       gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggc                               <  2:6053329‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                       gtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                               <  1:742822‑M2/101‑10 (MQ=255)


                                                                        gtgggtcggttggatccgtgggatcgggcgtATCCGCGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtcggtc                              <  1:517652/96‑1 (MQ=11)


                                                                         gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtcggtcg                             >  2:6460974/1‑101 (MQ=11)


                                                                         gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggttcggtcg                             <  1:6773081‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                                         gggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                             >  2:4312348‑M2/1‑90 (MQ=255)


                                                                              cggtcggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtcc                        <  1:6251176/101‑1 (MQ=255)


                                                                              cggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCCGGGGAGCGGTCGGGTCGGTGGGAtccgtggcggcg                        >  1:2274430/1‑94 (MQ=2)


                                                                              ccgtcggatccgtgggatcggtcggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatcc                        <  1:5440553‑M2/99‑17 (MQ=255)


                                                                               ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                       <  2:5126652‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                               ggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                       <  1:4711096‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                               ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGTgggatcggtcgggcccg                       <  1:3112790‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                               ggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGGCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccg                       <  2:2244730‑M2/101‑18 (MQ=255)


                                                                               gggtgggtccgtgtgatccctaggATCCTTCGTATCGGCCCGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccg                       <  1:5694048/97‑1 (MQ=11)


                                                                                ggcgggtccgtgggatcggtcggatCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgt                      >  1:3898212‑M2/3‑83 (MQ=255)


                                                                                  cgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg                    <  1:1879560‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                                                   gggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                   <  2:6643753‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                   gggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                   <  1:2426256‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                   ggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                   <  1:5557202‑M2/101‑22 (MQ=255)


                                                                                   ggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGCGGATCCgtggggtccgtcgg                   >  2:5514226/4‑101 (MQ=11)


                                                                                    ggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCAGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggg                  <  1:4210287‑M2/101‑23 (MQ=255)


                                                                                     gtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggt                 <  1:4090625‑M2/101‑24 (MQ=255)


                                                                                      tccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatc                >  2:1437780‑M2/1‑77 (MQ=255)


                                                                                             gatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg         <  1:2552652‑M2/101‑32 (MQ=255)


                                                                                              cgatctcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAt        <  1:1778576/96‑1 (MQ=11)


                                                                                              atcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAt        >  1:1631186/1‑101 (MQ=14)


                                                                                               tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggggtcggtggggtc       <  2:2538963‑M2/101‑34 (MQ=255)


                                                                                                cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc      >  2:5276867‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                                                                                ccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtcc      <  2:7023140/99‑2 (MQ=11)


                                                                                                  gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGGGGGTAGGAGGGGTCCGTAGGGTACGAGGGAtgagt    >  2:5906734/1‑97 (MQ=1)


                                                                                                    cggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtgg  <  2:6177014/101‑3 (MQ=11)


TCAGCGTCGCCGGATCGCGCTCATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCG  >  NC_014034/221900‑222100

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 23 ≤


ATCG

< 31 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG