BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,021	G→A	25.2%	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		change	freq	score	reads	annotation	genes	product
*	NC_014034	222,021	0	G→A	25.2%	0.0 ‑0.3 0.0	2634	D212D (GAC→GAT)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (312/351): ref base (941/1025): total (1256/1378)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.53e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00

Only 100 of 3094 total aligned reads displayed.


CATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221921‑222121


 aTCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGt                                                                                                     >  2:1353494/1‑101 (MQ=255)


   cggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                                   <  1:5233017‑M1/69‑1 (MQ=255)


   cggtcgggtccgtgggagcggtcggggccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                                   >  2:4348315‑M1/33‑101 (MQ=255)


     gtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                                 <  1:2765005/92‑1 (MQ=11)


        gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                                              <  1:3865521‑M1/74‑1 (MQ=255)


         ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                             <  2:1495042‑M1/75‑1 (MQ=255)


            caatctggtccGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                          <  2:6376039/91‑1 (MQ=14)


              gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                        >  2:4869091‑M1/22‑101 (MQ=255)


              gtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCAGTGGGatcggc                                                                                        <  2:228479‑M1/80‑2 (MQ=255)


               tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                       >  2:5266673‑M1/21‑101 (MQ=255)


                       gtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                               <  1:2439508‑M1/89‑1 (MQ=255)


                         cgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTgg                                                                             >  2:1629433‑M1/11‑101 (MQ=255)


                         cggctccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                             >  1:3260794‑M1/11‑101 (MQ=255)


                         cggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                                             >  2:1879488‑M1/11‑101 (MQ=255)


                          ggatccgtgGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                            >  2:4708961‑M1/10‑101 (MQ=255)


                          ggCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTggg                                                                            >  1:2033731/1‑101 (MQ=255)


                               ggtcggGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcgg                                                                       >  1:1896743/1‑101 (MQ=11)


                                 tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTAGGATCCGTGGGATCGGTGGGGTGAGTGGGATCGGTGGGTTACGGGCGAtcgggg                                                                     >  1:2310791/3‑99 (MQ=11)


                                 tgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGgatcggcc                                                                     <  2:5121234‑M1/99‑3 (MQ=255)


                                 tgGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                     >  1:3730593‑M1/3‑101 (MQ=255)


                                 tcggATCGGGCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                     <  1:59957/101‑1 (MQ=255)


                                     gtccgtctggtccgtgggatccgtcggatccgagggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggat                                                                 <  2:3896685/97‑3 (MQ=11)


                                     gtccgtcgggtccgtggggtcggtctggtccgtgggatcgGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtgggat                                                                 <  2:5405688/97‑3 (MQ=11)


                                      tcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATc                                                                <  2:4136769/101‑1 (MQ=11)


                                       cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                               >  2:243238/1‑101 (MQ=11)


                                       cggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                               >  1:6562072/1‑101 (MQ=11)


                                        ggtcgggtccgggggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCg                                                              <  1:5490688/101‑1 (MQ=11)


                                         gtcgggtccgtgggatcggtcgggtacgtgggatcgGTCGGGTGCAGGGGATGGGTGGGGTTCTTGGGGTTCGCCGGATCCTTGGGATAGGTCGGGTCAGt                                                             >  2:2776181/1‑101 (MQ=9)


                                          tgggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTACggg                                                            >  1:4698923/6‑99 (MQ=11)


                                          tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                            >  2:1781615/1‑100 (MQ=11)


                                          tcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggTCCGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                            <  1:5106886/101‑2 (MQ=11)


                                          gcgggttcgttggaacggtccggtccgtgcgatcggtCGGGCTCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                            <  2:749537/100‑2 (MQ=11)


                                          gcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                            >  2:4462655‑M2/2‑100 (MQ=255)


                                           tgggtccgttgggtcggtcgggtccgtgggatctgtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                           <  1:2666806/100‑3 (MQ=11)


                                           cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtgg                                                           >  2:108461/1‑99 (MQ=11)


                                           cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                           <  2:5809328‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                           cgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgg                                                           <  1:6913612‑M2/101‑3 (MQ=255)


                                           cggatccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGGTCCGtgg                                                           >  1:936913/1‑99 (MQ=11)


                                            gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCCGGTCGGATCCggggg                                                          >  1:6130974/1‑97 (MQ=11)


                                            gggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                          >  2:2676385‑M2/1‑98 (MQ=255)


                                             ggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGa                                                         >  1:1232917/1‑101 (MQ=14)


                                              atccgtggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGgggt                                                        >  2:6768645/2‑99 (MQ=11)


                                               tccgtggggtcggtggggtccgtggggtcggtcggGTCCGTGGTATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                       <  2:3795225/101‑1 (MQ=11)


                                               tccgtgggagcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                       >  1:6795069‑M2/1‑95 (MQ=255)


                                               cgatctggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                       <  2:3447822/95‑1 (MQ=11)


                                                ccgtggggtcggtcgggtccgtggggtgcgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                      <  1:1532145/101‑1 (MQ=11)


                                                ccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGAtcg                                                      >  1:534371/1‑101 (MQ=14)


                                                ccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcc                                                      <  1:1362930/101‑2 (MQ=11)


                                                 cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg                                                     >  1:1000254/1‑96 (MQ=11)


                                                 cgtgggatcggtcgggtccgccggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAccgg                                                     <  1:5611050/101‑1 (MQ=11)


                                                 cggggggtcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                     <  1:1101313/98‑1 (MQ=11)


                                                   tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                                                   <  1:800119‑M2/101‑11 (MQ=255)


                                                    gggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcg                                                  <  2:3993050‑M2/101‑12 (MQ=255)


                                                    gggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcg                                                  >  1:4172080‑M2/1‑90 (MQ=255)


                                                       atcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGGCCCGTAGGATAGGTCGGTACCGTCGGGTCGGTGGGGTGCGCTGGGtcgggggcat                                               >  2:5524541/1‑95 (MQ=2)


                                                        tcggtcgggtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatc                                              <  1:2154906/101‑1 (MQ=11)


                                                           gtcgggtccgtggggtccgtcggCGCCGTGGGAGCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccgt                                           <  2:3301156/101‑1 (MQ=11)


                                                            tcgggtccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgta                                          <  1:5904952‑M2/101‑20 (MQ=255)


                                                             cgggtccgtgggatcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgg                                         <  1:3489933‑M2/101‑21 (MQ=255)


                                                             cgggtacgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcggatccgtgg                                         >  2:5946345/1‑99 (MQ=11)


                                                              ggatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATGCGTGGGATCGGACGGGTTCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                        >  2:892953/4‑101 (MQ=14)


                                                               gatccgtgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcgga                                       <  1:6671309/99‑2 (MQ=255)


                                                                gtccgtggggtccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTACGTGGGATCGgtcggatccgtgggat                                      >  2:6892552/1‑99 (MQ=11)


                                                                  ccgtaggatcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccgtcgggtcc                                    >  2:256655/1‑101 (MQ=14)


                                                                   cgtgggctcggtcgtGTGCGTGGGATCGGTCGGGTGCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccg                                   <  2:567979/101‑1 (MQ=11)


                                                                     tgggatcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcggatccgcgggatcggtc                                 >  2:653442‑M2/1‑73 (MQ=255)


                                                                       gggtccgtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg                               >  1:6263291/7‑101 (MQ=11)


                                                                        gatcggtgggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggg                              <  1:2552652‑M2/101‑32 (MQ=255)


                                                                        gatcggtcggGGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGCGATCGGTGGGCTCGGTGGCGGCCGTGCGa                              >  2:317666/1‑101 (MQ=11)


                                                                         atcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAt                             >  2:2113361/1‑101 (MQ=11)


                                                                          tgcgtcggatcCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtc                            >  1:5741328‑M2/4‑68 (MQ=255)


                                                                           cggtcggGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc                           >  1:4299360‑M2/1‑67 (MQ=255)


                                                                           cggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                           <  2:3067424/101‑1 (MQ=14)


                                                                           cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcc                           <  2:4585312/101‑2 (MQ=11)


                                                                            ggtcggGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGtcgggtccgtggggtccgaccgatccc                          <  2:2903630/101‑10 (MQ=11)


                                                                            ggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccg                          >  2:6097491/1‑99 (MQ=11)


                                                                             gtgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                         >  1:7071159/4‑101 (MQ=14)


                                                                             gtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTGCGTCGGGTCCGTGGGGtcggt                         >  1:6409434/1‑101 (MQ=14)


                                                                             gtcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCATCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTCGGATCGGTGGGAtccgt                         >  2:4235508/1‑101 (MQ=11)


                                                                             gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGCTCGGGGGGAtcggc                         >  2:363943/1‑100 (MQ=11)


                                                                              tgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAacggtc                        >  1:2980436/3‑101 (MQ=14)


                                                                              tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtg                        <  2:6231928‑M2/101‑38 (MQ=255)


                                                                                   gccgGGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatc                   >  1:2853089‑M2/2‑59 (MQ=255)


                                                                                     cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTctg                 >  1:4554984/1‑99 (MQ=14)


                                                                                     cGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                 <  1:3932398/101‑1 (MQ=14)


                                                                                      gTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggt                >  2:4982587‑M2/1‑56 (MQ=255)


                                                                                       tGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc               >  1:3126809‑M2/1‑55 (MQ=255)


                                                                                        gggATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg              <  1:4411115‑M2/101‑48 (MQ=255)


                                                                                        gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtaggatcggtcgggtccgtgggatcggtcg              <  1:4967179‑M2/101‑48 (MQ=255)


                                                                                        gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcg              <  1:1695664‑M2/101‑48 (MQ=255)


                                                                                        gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGCTCCGTGGGACCGGTCGGGTcccggg              >  2:1231174/1‑97 (MQ=11)


                                                                                        aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGAACGGTCGGGGCCGtcg              >  2:3552135/2‑99 (MQ=14)


                                                                                         ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg             >  1:3588077/1‑101 (MQ=14)


                                                                                            tccgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc          <  1:1787654/95‑1 (MQ=21)


                                                                                             gggtcggcTCCCTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc         >  2:2009260‑M2/2‑49 (MQ=255)


                                                                                              ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccg        <  1:4853728‑M2/101‑54 (MQ=255)


                                                                                               gtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggt       <  1:4035444/101‑1 (MQ=14)


                                                                                                  gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg    >  2:7068862/1‑101 (MQ=17)


                                                                                                  ggaTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtcggtcgggtccgtggg    <  2:6655629‑M2/101‑58 (MQ=255)


                                                                                                    gTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat  >  1:3364105‑M2/1‑42 (MQ=255)


CATCGACGGTGGGCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGT  >  NC_014034/221921‑222121

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 15 ≤


ATCG

< 24 ≤


ATCG

< 32 ≤


ATCG

< 41 ≤


ATCG