Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA NC_014034 222,033 G→C 6.5% T208T (ACC→ACG)  RCAP_rcc00185 ← hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*NC_014034222,0330G→C 6.5% 299.2 ‑2.4 ‑0.92456T208T (ACC→ACG) RCAP_rcc00185hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (62/105):  ref base (1003/1283):  total (1066/1390)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 9.02e-02
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.14e-01

Only 100 of 3094 total aligned reads displayed.

GCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGG  >  NC_014034/221933‑222133
                                                                                                     |                                                                                                    
 cgtgggatcggtcggatccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                                     >  1:4683789‑M1/23‑101 (MQ=255)
   tgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   >  1:6693690‑M1/21‑101 (MQ=255)
         gCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                                                                                             <  1:1353545/101‑1 (MQ=255)
             gggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTC.CGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                                         >  1:2847987/1‑99 (MQ=1)
              gggtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTggg                                                                                        >  1:2531023‑M1/10‑101 (MQ=255)
                gtccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAt                                                                                      <  1:5720915‑M1/94‑1 (MQ=255)
                gtccgtcggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAt                                                                                      <  2:4010250/97‑1 (MQ=11)
                gtccgggggatcgggcgggtccgtggggtccgtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                      <  1:2037349/94‑1 (MQ=11)
                 tcctgcggATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTC.CGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                                     <  1:6932484/96‑1 (MQ=11)
                 gccgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                     >  1:3532238‑M1/7‑101 (MQ=255)
                 cccgtgcgatcggtcgggtctgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGtc                                                                                     <  2:5579703/94‑1 (MQ=11)
                  gagtgggattggtcgggtccgtggggtccgtgggctccgtgGGGTCGGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                    <  1:3225203/96‑1 (MQ=11)
                   cgtgGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcgg                                                                                   <  2:5728254‑M1/97‑1 (MQ=255)
                     tgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTC.CGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                 <  2:448857/99‑1 (MQ=11)
                      ggggtccgtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcgGTCGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtcggaga                                                                                >  2:2580783/8‑98 (MQ=14)
                      gggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtaGGATCGGTCGGGTC.CGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcg                                                                                >  2:5871042/2‑101 (MQ=11)
                      gGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAccggtcg                                                                                <  1:363861‑M1/100‑1 (MQ=255)
                       ggatcggtggggtccgtgggatcggtcgggtccgtgGGATCGGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGtccgtggg                                                                               <  1:190883/101‑1 (MQ=11)
                       ggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcGGATCGGTGGGATC.CGTGGGATCGGTAGCGGCCGTGGGACCGGGAGGGCCCGGGGGAtcgtgccg                                                                               >  2:414598/1‑96 (MQ=9)
                        gatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggGATCGGTCGGGTC.CGTGGGGTCCGTCGGATCCGGGGGATCGGTCGGATCCGGGGGAGCGGTCggg                                                                              >  2:1080320/1‑101 (MQ=11)
                        gatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtggGATCGGGCTGGGC.CGTGGGCACGGCTGGGCTCGAGGGACCGGGCGGGCCCGTgggccggcttcgg                                                                              >  1:5228455/1‑91 (MQ=2)
                         gtcggttgcgtgcgtgggatcggtcgggtccgtgggaTCGGTCGGGTC.CGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtcggat                                                                             <  2:708691/100‑3 (MQ=11)
                         atcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggATCGGTCGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTCGGGTCCGTGGGGtccgtcggat                                                                             >  2:77425/1‑99 (MQ=11)
                           cggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatCGGTCGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTAggggag                                                                           >  2:4273165/1‑98 (MQ=11)
                            ggtgggttccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcGGTCGGGTC.CGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                          <  2:6660959/101‑1 (MQ=11)
                            ggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcGGTCGGATC.CGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGACCGGTCGGATCCg                                                                          >  2:5456468/1‑101 (MQ=11)
                            gggcgggtccgtcggatgggtcgggtccgtgggatcggtCGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCg                                                                          <  2:1485939/98‑1 (MQ=11)
                              tcgggtgcgtggaatcggacgaatccgtgggatcggGCTGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCTGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGtg                                                                        <  1:7094536/101‑2 (MQ=11)
                              tcgggtccgtgggcgcggtcgggtccgtgggctcggTCGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtg                                                                        <  2:318464/101‑2 (MQ=11)
                               cggatccgtgggatcggtcggatccgtaggatcggtCGGGTC.CGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGtcg                                                                       <  2:5325012/101‑3 (MQ=11)
                                ggttccgtaggctcggtcggctccgtgggatcggtcggCTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGgg                                                                      <  2:4890906/98‑1 (MQ=11)
                                ggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcGGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                      <  2:122433‑M2/101‑4 (MQ=255)
                                ggatccgtgggatcggtcggatccgtaggancggtcggGTC.CGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCgg                                                                      <  1:3090323/98‑1 (MQ=11)
                                 ggtccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgGGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGCTCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                     >  1:2960802/1‑101 (MQ=14)
                                 ggtccgtaagagcggtcgggtccgtggcatccgtcgGGCC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGa                                                                     <  2:517356/101‑1 (MQ=11)
                                  gtccgtgggaacggtcgggcgcgtggcgtcgg.cggcGCTCGTGGGATCGGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                    <  2:4377718/101‑1 (MQ=2)
                                   tgtgtgggattggtggggtccgtgggatcggtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGAtc                                                                   <  1:2302526/98‑1 (MQ=14)
                                   tgcgttggagctgtcgggttcgtggggtccgtcggAGC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   <  1:3310364/99‑1 (MQ=11)
                                   tccgtgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGAC.CGCGGGATCGGTCGGGACCATGGGATCGTTCAGGACGGGGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   >  2:2808456/1‑101 (MQ=2)
                                   tccgtgggaccggtcggatccgttgggtcgctccgGTC.CGTGGGATCGTTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   <  2:3789259/101‑1 (MQ=11)
                                   cgatctggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtc                                                                   <  2:3447822/95‑1 (MQ=11)
                                    ccctgggatcggtcggctccgtcggcccggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                  <  2:6919692/98‑1 (MQ=11)
                                     cgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGgggcggg                                                                 >  1:1000254/1‑96 (MQ=11)
                                     cggggggtcggtcgggtccgtggggtccgtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                 <  1:1101313/98‑1 (MQ=11)
                                      gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                                <  1:2651096‑M2/101‑10 (MQ=255)
                                      gtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggc                                                                >  2:2315371/1‑100 (MQ=11)
                                      gtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGCGGGACCGATCGGCTCCGTGGGAttggt                                                                >  1:2748117/1‑101 (MQ=14)
                                       tgggatcggtggggtccgtcggatcggtgggATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                               <  1:6262102/101‑1 (MQ=11)
                                       tgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                                                               <  1:3907123‑M2/101‑11 (MQ=255)
                                       tgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtc                                                               <  1:5979400‑M2/101‑11 (MQ=255)
                                        gggatcggtggggtccggggcatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcg                                                              <  1:5600045/101‑1 (MQ=11)
                                           atcggtcggttccgtgggatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                                           >  2:3648346‑M2/1‑87 (MQ=255)
                                           atcggtcgggtccgtgggatcggtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggt                                                           <  2:6377275‑M2/101‑15 (MQ=255)
                                            tcggtcgggtccgtcggatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                          <  2:6122379/101‑1 (MQ=11)
                                            tcggtcgggtccgtccggtcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtc                                                          <  2:188290/101‑1 (MQ=11)
                                              ggtcggatccgtagcatcgggcggGTC.CGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCgtggggtccg                                                        <  2:6239883/101‑1 (MQ=11)
                                               gtcgggtccgtgggatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGTGGGGTCGggcggggcggg                                                       >  1:819547/1‑96 (MQ=11)
                                                 cgggtccgtgggatcggtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGGCCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGCTGGGTCCGGGGGATCGgtggggtccgcgg                                                     >  2:1338077/1‑98 (MQ=11)
                                                  gggtccgtgggatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggggtcggtcgggtccgtggg                                                    <  1:1534188‑M2/101‑22 (MQ=255)
                                                  gggtccgtgggatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggg                                                    <  2:4724160‑M2/101‑22 (MQ=255)
                                                  ggatccgtgggatcggtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATGCGTGGGATCGGACGGGTTCGTGGGATCGgtcgggtccgtggg                                                    >  2:892953/4‑101 (MQ=14)
                                                   ggtccgtgggatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggc                                                   <  2:6794715‑M2/101‑23 (MQ=255)
                                                   ggtccgtgggatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtggga                                                   <  1:3795386‑M2/101‑23 (MQ=255)
                                                      ccgtggggtccgtcggCTC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGgtcgggtccgtggggtcc                                                <  2:4621057/101‑1 (MQ=11)
                                                       cgtggggtccgtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGTTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGCCGGCGGGATCGgtcggatccgtgggagggg                                               >  1:1798308/1‑96 (MQ=11)
                                                       cgtgggatcggtcggGTC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGTATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGGgggatcggtcgggtccgtgggatcgg                                               <  2:3568006‑M2/101‑27 (MQ=255)
                                                       cgtgggatcggtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGgtcgggtccgtcggatcgg                                               >  2:33035/1‑99 (MQ=255)
                                                        gtgggatcggtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTcgggtccgtcggatcggt                                              >  2:2690733/1‑101 (MQ=11)
                                                           gggtcggtcggATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgg                                           >  1:4278704‑M2/1‑71 (MQ=255)
                                                           gggtccgtcggATC.CGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTggg                                           >  1:6122691/7‑101 (MQ=11)
                                                             gtccgtcggATC.CGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGag                                         >  1:1707015/5‑100 (MQ=11)
                                                              tccgccggATC.CGTGGTGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtc                                        <  2:1631125/96‑1 (MQ=11)
                                                               cggtcggGGC.CGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                       <  1:5868777/101‑1 (MQ=14)
                                                               ccgtgggATC.GGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                       <  2:3902590/96‑1 (MQ=14)
                                                                 gtcggGTC.CGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTGCGTCGGGTCCGTGGGGtcggt                                     >  1:6409434/1‑101 (MQ=14)
                                                                     ggtc.cGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggga                                 >  1:6564606‑M2/3‑61 (MQ=255)
                                                                      gtc.CGTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggat                                >  1:4849858‑M2/2‑60 (MQ=255)
                                                                      gtC.CGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt                                <  1:2154080/100‑3 (MQ=14)
                                                                      aTC.CGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtcggtggggt                                >  2:3065200/1‑99 (MQ=11)
                                                                       gtcggccggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                <  2:2916008/94‑1 (MQ=17)
                                                                       gc.cGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATc                               <  2:2447494/100‑1 (MQ=11)
                                                                         cggTGGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATcc                              <  1:4957352/99‑1 (MQ=255)
                                                                            ggggaTCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtc                           >  1:4160266‑M2/2‑55 (MQ=255)
                                                                             gggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcg                          <  1:6801789‑M2/101‑48 (MQ=255)
                                                                                 tcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcggatc                      >  1:2431352‑M2/1‑50 (MQ=255)
                                                                                  cggtcggGTCGGTGGGGTCGGTCGGAGCTGTGGGTTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcg                     <  1:5502749/101‑1 (MQ=17)
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                                                                                    gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                   >  2:5019712/4‑101 (MQ=255)
                                                                                    gtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggt                   <  1:4532712/98‑1 (MQ=255)
                                                                                     tcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtg                  <  2:1787590‑M2/101‑56 (MQ=255)
                                                                                      cggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtgggatccgtgg                 <  2:6540481‑M2/101‑57 (MQ=255)
                                                                                       gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtggg                >  1:3438935‑M2/1‑44 (MQ=255)
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                                                                                            cGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtcggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcgg           <  1:5351364‑M2/101‑63 (MQ=255)
                                                                                             gTGGGGTCCGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggt          >  1:9507‑M2/1‑38 (MQ=255)
                                                                                             gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt          >  1:1235648/1‑101 (MQ=255)
                                                                                              tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg         >  1:400512/1‑101 (MQ=17)
                                                                                               gggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtggggtccgtggggtcggtcg        <  2:2133946‑M2/101‑66 (MQ=255)
                                                                                                    cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcggatccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtcc   >  1:439721‑M2/1‑31 (MQ=255)
                                                                                                     ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtgggatcggtcgggtccgtggggtccgtcggatccg  <  2:2020795‑M2/101‑72 (MQ=255)
                                                                                                     |                                                                                                    
GCGTCGGATGCGTGGGCTCGGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATC.CGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGG  >  NC_014034/221933‑222133

Base quality scores:  ATCG  < 3 ≤  ATCG  < 15 ≤  ATCG  < 23 ≤  ATCG  < 31 ≤  ATCG  < 40 ≤  ATCG