BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_014034	222,096	G→C	2.0%	T187T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
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*	NC_014034	222,096	0	G→C	2.0%	15.4 ‑2.0 ‑1.7	591	T187T (ACC→ACG)	RCAP_rcc00185	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (3/9): ref base (290/289): total (293/298)
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.42e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.87e-02

Only 100 of 786 total aligned reads displayed.


CGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGCAG  >  NC_014034/221996‑222196


ccgtgggATCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcg                                                                                                      <  2:4711708/96‑1 (MQ=17)


ccgtcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCGGTGGGGTCGGTGGGGCCCGTGGGGtcg                                                                                                      >  2:3267064/3‑101 (MQ=11)


 ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGAtcgg                                                                                                     >  2:385098/1‑101 (MQ=11)


  ggcgggtgcGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCCGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggt                                                                                                    <  2:4601617/93‑1 (MQ=17)


   tgggATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                                   >  1:1093684/3‑101 (MQ=14)


   tcggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCTGTCGGTTGCGGGGGGTCGGGGGGAtcggcg                                                                                                   >  2:54120/1‑99 (MQ=2)


   tcggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGTCCGTCGGAtccgtg                                                                                                   >  1:1879357/1‑100 (MQ=11)


    cggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtgg                                                                                                  <  2:6177014/101‑3 (MQ=11)


     gggtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                                                 <  1:3259536/98‑1 (MQ=14)


     ggATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGAtccgtggg                                                                                                 <  2:6541102/101‑1 (MQ=11)


     ggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCAGAtcggaaga                                                                                                 >  2:2201870/1‑97 (MQ=11)


     ggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGAtccgtggg                                                                                                 >  1:3023230/1‑101 (MQ=11)


       gtCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgggt                                                                                               <  1:957758/100‑3 (MQ=14)


       aTCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGAt                                                                                               >  1:386015/1‑101 (MQ=17)


        tCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTGGGATCCGTGGGATc                                                                                              <  1:1714764/101‑1 (MQ=11)


         gtgtagggtcggacggATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                                             <  2:5017701/93‑1 (MQ=11)


           gcggcaTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                                           <  2:2751174/96‑1 (MQ=14)


           gccgagtcggtgggGTCCGTGGGATCGGTCGGGACCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGt                                                                                           <  2:6062759/95‑1 (MQ=18)


           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCGGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGCCGGATCCGTGGGGGCCGTGGGGtcggtcggggccgg                                                                                           >  2:6619672/1‑95 (MQ=11)


           gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCgg                                                                                           >  1:342088/1‑100 (MQ=14)


            tcggATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTg                                                                                          <  2:422186/99‑1 (MQ=255)


             aggATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGTGGGAACGGTCGGGGCCGtcg                                                                                         >  2:3552135/2‑99 (MQ=14)


              gggtgggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTggg                                                                                        <  1:1566030/96‑1 (MQ=14)


               ggtcggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGAGCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                       <  1:2063368/99‑1 (MQ=17)


               gATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGa                                                                                       >  1:6796199/1‑101 (MQ=17)


                aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAt                                                                                      >  1:5655371/1‑101 (MQ=17)


                 tccgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGTTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtc                                                                                     <  2:1497832/95‑1 (MQ=18)


                 tccgtggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGCCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTGGGATCCGTGGGAtc                                                                                     >  1:813298/7‑101 (MQ=18)


                  cctgggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcg                                                                                    <  2:44608/96‑1 (MQ=255)


                   ggtcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGGCCGTCGGGTCCGGGAGATCGGGCGGGGCCGTcgggtggg                                                                                   >  2:2975731/1‑96 (MQ=9)


                     tggggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGAtcggtc                                                                                 <  2:1249804/99‑1 (MQ=255)


                     tcggGTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtc                                                                                 >  1:1379535/1‑101 (MQ=17)


                     gcggGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtc                                                                                 <  2:3913286/100‑1 (MQ=17)


                       gggTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGCTCGGTTGGATCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               >  1:4848464/1‑101 (MQ=255)


                       gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGAtcggtcgg                                                                               >  2:1953126/1‑101 (MQ=17)


                       gggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGAtcggtcgg                                                                               >  2:814544/1‑101 (MQ=17)


                       ggatCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGCCCGCGGGATCGGTCGGGTCCGCAGGAtcgaccgg                                                                               >  1:2630899/4‑96 (MQ=17)


                        ggTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCggg                                                                              >  1:3689927/1‑101 (MQ=11)


                         gTCGGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt                                                                             <  1:2428406/101‑1 (MQ=17)


                         gTCCGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGt                                                                             <  2:1106803/101‑1 (MQ=17)


                           ctgTGGGATGGGTCGGGTGCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTcc                                                                           <  1:5524831/99‑1 (MQ=11)


                           ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTcc                                                                           >  1:2955561/1‑101 (MQ=255)


                           ccGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGATCGGCCGGGTcc                                                                           >  2:5228954/1‑101 (MQ=17)


                            cGTCGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCg                                                                          <  1:4670666/101‑1 (MQ=17)


                             gggggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                         <  1:3577272/99‑1 (MQ=17)


                             gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                         >  1:1235648/1‑101 (MQ=255)


                             gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGCGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                         >  1:6311469/1‑101 (MQ=255)


                             gTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGt                                                                         >  2:6883237/1‑101 (MQ=1)


                             gTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGGGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCGGTGGGAGCGGTGGGGTCCgg                                                                         >  2:5701574/1‑100 (MQ=14)


                              tcggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGCCCGTg                                                                        >  1:4215369/3‑101 (MQ=17)


                              tGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTg                                                                        >  1:4991870/1‑101 (MQ=255)


                               cggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgg                                                                       >  1:3169683/2‑101 (MQ=17)


                                ggATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGggg                                                                      >  1:2514626/1‑101 (MQ=255)


                                ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGACCGGTCGGGCCCGGGGGATCGGTCGGGCCCGTagg                                                                      >  1:1779743/1‑101 (MQ=17)


                                  aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGGCCGGGGGGc                                                                    >  1:1022575/1‑101 (MQ=255)


                                   tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatc                                                                   <  2:5568022/101‑4 (MQ=14)


                                   tcggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatc                                                                   <  1:4562104/101‑4 (MQ=14)


                                    cggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtg                                                                  >  2:6315733/1‑101 (MQ=255)


                                    cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcg                                                                  >  2:7025713/1‑97 (MQ=14)


                                    cggtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcg                                                                  <  1:6097803/101‑5 (MQ=14)


                                     ggtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtgg                                                                 <  1:2877982/101‑1 (MQ=255)


                                     ggtcggATCCGGGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcgg                                                                 <  1:2365724/101‑6 (MQ=14)


                                      gtcggGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCtggg                                                                >  2:3133945/1‑100 (MQ=255)


                                      gtcggATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCCGTGGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGATCGGTCGGGTCCGTgggatcggt                                                                <  2:2913204/101‑7 (MQ=11)


                                          ggtCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGa                                                            <  1:6700170/99‑1 (MQ=255)


                                          gATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTaggatcggccggg                                                            >  2:745452/1‑91 (MQ=14)


                                            tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtc                                                          <  2:5805251/101‑1 (MQ=255)


                                             ccGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcg                                                         >  2:3374884/1‑101 (MQ=255)


                                               gTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATGGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggt                                                       >  2:3684456/1‑101 (MQ=255)


                                                  ggATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGAtcggtcgg                                                    >  1:5096093/1‑101 (MQ=255)


                                                    aTCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAc                                                  <  1:7106420/101‑1 (MQ=255)


                                                     tcggtcggGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGAcc                                                 >  1:4041490/1‑101 (MQ=255)


                                                           ggctCCGTAGGATGGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTc                                           <  2:265503/98‑1 (MQ=255)


                                                             gTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgc                                         <  2:1022540/101‑1 (MQ=255)


                                                             gTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGGCGGGGCCGTGGGGCTGGTGGGGTCGGTCGGACCGCGGTcgc                                         >  2:2296364/1‑101 (MQ=25)


                                                              tCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgcc                                        <  1:445858/101‑1 (MQ=255)


                                                                 gTAGGACCCGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgcc                                     <  2:5926445/101‑1 (MQ=255)


                                                                  tAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTcgccgccg                                    >  2:402917/1‑101 (MQ=255)


                                                                  tAGGAACGGACGGGACCGTCGGGTCCGTGGGTTCGGTCGGATCCGTGGGATAGGTAGGGGCCGCAGGGCTGAAGGGCACAGTCGAACAGCCGTcgacgcca                                    >  2:253978/1‑100 (MQ=9)


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                                                                             gggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAcc                         >  2:890470/1‑101 (MQ=255)


                                                                             gggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAcc                         <  1:2152163/101‑1 (MQ=255)


                                                                             gggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAcc                         <  1:395762/101‑1 (MQ=255)


                                                                              ggtccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAccc                        >  1:346366/1‑101 (MQ=255)


                                                                              gggccgtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGAccc                        <  2:1718547/98‑1 (MQ=255)


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                                                                                   gtcgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGCCAGACCCAggcc                   >  1:6437825/1‑101 (MQ=255)


                                                                                     cgggtccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAggccgg                 >  2:6811511/1‑101 (MQ=255)


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                                                                                          ccgtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGa            <  1:5921142/101‑1 (MQ=255)


                                                                                            gtGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGAcc          <  1:6992500/101‑1 (MQ=255)


                                                                                             tGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCg         >  1:2732209/1‑101 (MQ=255)


                                                                                               ggATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGc       >  2:6700199/1‑101 (MQ=255)


                                                                                                gATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGcc      <  1:5229219/101‑1 (MQ=255)


                                                                                                 aTCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCCGGTGGGGTCGGTCGGACCGGTGGGGCCGCCGGCGGACGGCGCCAGGCCGGGCAgggccggcc     >  2:3773517/1‑93 (MQ=12)


CGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTAGGATCGGTCGGGTCCGTCGGGTCCGTGGGATCGGTCGGATCCGTGGGATCGGTCGGGTCCGTGGGGCTGGTGGGATCGGTCGGACCGCTGTCGCCGCCGCCGGACAGACCCAGGCCGGCCAGACCGGCCGCAG  >  NC_014034/221996‑222196

Base quality scores:


ATCG

< 3 ≤


ATCG

< 18 ≤


ATCG

< 24 ≤


ATCG

< 33 ≤


ATCG

< 40 ≤


ATCG