| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 681,461 | T→C | 20.8% | M716V (ATC→GTC) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 681,461 | 0 | T→C | 20.8% | 165.7 ‑1.8 ‑1.2 | 307 | M716V (ATC→GTC) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (29/35): ref base (135/108): total (164/143) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.60e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.65e-02 | ||||||||||
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
GCGATCTGCGCGCCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCC > NC_014034/681361‑681561
|
gcgATCTGCGCGCCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGAt < 1:554348/101‑1 (MQ=255)
aTCTGCGCGCCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTg < 2:675403/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGCGCCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCAGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGc > 2:3451488/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCGCCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCg > 1:3394254/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCGCCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTCCg > 2:2766972/1‑101 (MQ=255)
gcgcgcCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTg > 1:5450195/1‑101 (MQ=255)
gcgcCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCt < 1:3564946/101‑1 (MQ=255)
ccTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGt > 2:235001/1‑101 (MQ=255)
cTGACAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTc < 2:4519097/101‑1 (MQ=255)
cTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTc < 1:1560429/101‑1 (MQ=255)
tGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCa > 2:853969/1‑101 (MQ=255)
tGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCa > 1:2868541/1‑101 (MQ=255)
tGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCa < 2:1293308/101‑1 (MQ=255)
gAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAg > 1:4764078/1‑101 (MQ=255)
gAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAg > 1:659549/1‑101 (MQ=255)
aaaGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGGGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAgc > 1:6005042/1‑101 (MQ=255)
aaaGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAgc < 1:6054488/101‑1 (MQ=255)
ggCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGa > 2:2623441/1‑101 (MQ=255)
gCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAt < 1:4650493/101‑1 (MQ=255)
aTCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTg > 2:5894934/1‑101 (MQ=255)
aTCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTg > 1:4124744/1‑101 (MQ=255)
gTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTgcgc > 2:4209258/1‑101 (MQ=255)
tGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGcc < 2:2386848/101‑1 (MQ=255)
ggCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCg < 1:3905556/101‑1 (MQ=255)
ggCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCg > 1:4052557/1‑101 (MQ=255)
ccGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAg < 1:4209453/101‑1 (MQ=255)
gAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGcc > 1:1660882/1‑101 (MQ=255)
gcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCa < 1:235004/101‑1 (MQ=255)
cccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAg < 1:1044410/101‑1 (MQ=255)
ccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGa > 1:3007125/1‑101 (MQ=255)
cagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGAc < 1:4935718/101‑1 (MQ=255)
ccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACgcgc < 1:4407491/101‑1 (MQ=255)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc < 2:5468187/101‑1 (MQ=255)
ggAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgccg > 2:5052794/1‑101 (MQ=255)
gagaGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgccgc > 2:4820244/1‑101 (MQ=255)
agagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCgccgcc > 1:6106615/1‑101 (MQ=255)
agagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCgccgcc < 2:2083177/101‑1 (MQ=255)
gagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCt > 1:6726803/1‑101 (MQ=255)
agCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTg < 2:3736554/101‑1 (MQ=255)
agCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTg < 1:3795200/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCCCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgc < 1:3699806/101‑1 (MQ=255)
tcctcggtgcTGATCTGCGCCAGATTCGCCGGCTCGAGCGCCGCGACCTGCGTGCTGTTCAGCGCGCAGAT.CTGCGCCCAGCCGAGATGCGCTGCCTgctc > 2:3516807/9‑99 (MQ=255)
gcCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgcgc < 2:538015/101‑1 (MQ=255)
ccGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGcc < 1:177261/101‑1 (MQ=255)
ccGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGcc < 1:1426059/101‑1 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc < 2:3363780/101‑1 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc > 2:211815/1‑101 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa > 2:5641927/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 2:1588922/1‑101 (MQ=255)
cagccgcgcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 2:5820085/6‑101 (MQ=255)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa > 1:6321273/1‑101 (MQ=255)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa > 2:4971896/1‑101 (MQ=255)
gcgcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACg < 1:6683125/101‑1 (MQ=255)
caccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGa > 1:592505/3‑101 (MQ=2)
caccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGa > 2:1912849/3‑101 (MQ=2)
gcCAGCTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGGCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 1:2733073/101‑1 (MQ=255)
gcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 1:529540/101‑1 (MQ=255)
gcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt > 2:632557/1‑101 (MQ=255)
gcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGGGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 2:3985633/101‑1 (MQ=255)
accAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 1:939404/100‑1 (MQ=9)
accAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 2:1744351/100‑1 (MQ=9)
ccAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGGCAGCGCCACGATg > 2:7057178/1‑101 (MQ=255)
cAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGt < 1:182541/101‑1 (MQ=255)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGGCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTTCGCCGTCGCACGCGTCTCGATGTc > 2:1110867/1‑101 (MQ=25)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa < 2:3034504/101‑1 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 1:3313505/1‑101 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAt < 1:2498059/101‑1 (MQ=255)
tCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATc < 1:7017639/101‑1 (MQ=255)
tCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATc < 1:6444442/101‑1 (MQ=255)
ggcggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 2:4879981/11‑101 (MQ=9)
cgccgcCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 1:1704400/1‑101 (MQ=255)
cgccgcCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 2:616016/1‑101 (MQ=255)
cgccgcCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGGCATCgg > 2:4027826/1‑101 (MQ=255)
cggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTg > 1:2628802/9‑101 (MQ=9)
cggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTg > 2:1037426/9‑101 (MQ=9)
cgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGCTGc > 1:2285413/1‑101 (MQ=255)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:4482228/95‑1 (MQ=9)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:3981151/95‑1 (MQ=9)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc > 1:7097368/7‑101 (MQ=9)
gccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:6257624/101‑1 (MQ=255)
ccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCa < 2:3306070/101‑1 (MQ=255)
ccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCa > 2:5983090/1‑101 (MQ=255)
ccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCa > 2:2987071/1‑101 (MQ=255)
ttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccga > 1:2089769/5‑99 (MQ=2)
tccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgag < 1:6960136/98‑4 (MQ=9)
tccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgag > 1:586661/4‑98 (MQ=2)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 1:3451612/101‑1 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc > 2:6453958/1‑101 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc < 1:2767272/101‑1 (MQ=255)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc > 1:1293356/2‑96 (MQ=9)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc > 1:3190736/2‑96 (MQ=2)
aGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGCAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcc < 2:5259344/101‑1 (MQ=9)
gcgcCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCcg < 1:5642217/101‑1 (MQ=255)
cgccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccct < 1:5089339/101‑3 (MQ=9)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt > 1:1261454/1‑98 (MQ=2)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt < 2:6428237/101‑1 (MQ=255)
cgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATc > 1:4355056/1‑101 (MQ=255)
cgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATc > 2:1395423/1‑101 (MQ=255)
tgtCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 2:6922615/99‑1 (MQ=255)
tCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgcc > 2:4371042/1‑101 (MQ=255)
|
GCGATCTGCGCGCCTGAAAGCCCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCC > NC_014034/681361‑681561
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|