| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 681,482 | C→G | 21.0% | G709R (GGC→CGA) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 681,482 | 0 | C→G | 21.0% | 169.9 ‑2.1 ‑0.7 | 309 | G709R (GGC→CGC) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (27/37): ref base (129/113): total (159/150) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.24e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.86e-01 | ||||||||||
Only 100 of 326 total aligned reads displayed.
CCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACC > NC_014034/681382‑681582
|
ccGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGcc < 1:4395944/101‑1 (MQ=255)
cGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCg > 1:175494/1‑101 (MQ=255)
cGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCg > 1:562620/1‑101 (MQ=255)
ggCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGa > 2:2623441/1‑101 (MQ=255)
gCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAt < 1:4650493/101‑1 (MQ=255)
gCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAt < 1:2263511/101‑1 (MQ=255)
aTCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTg > 1:362498/1‑101 (MQ=255)
cGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTgcg > 2:1328201/1‑101 (MQ=255)
gTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTgcgc > 1:60321/1‑101 (MQ=255)
tGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGcc > 2:6584258/1‑101 (MQ=255)
tGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGcc < 2:2386848/101‑1 (MQ=255)
ccGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAg < 1:4209453/101‑1 (MQ=255)
cGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGc > 2:4129041/1‑101 (MQ=255)
agcccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGccc > 2:3579797/1‑101 (MQ=255)
cccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAg < 1:1044410/101‑1 (MQ=255)
cccagcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAg < 2:6255120/101‑1 (MQ=255)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc < 1:2626774/101‑1 (MQ=255)
cGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgcc < 2:5468187/101‑1 (MQ=255)
gagaGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgccgc > 2:4820244/1‑101 (MQ=255)
gagaGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGcgccgc > 2:1009445/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgc < 2:5185693/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgc < 1:6691583/101‑1 (MQ=255)
tcctcggtgcTGATCTGCGCCAGATTCGCCGGCTCGAGCGCCGCGACCTGCGTGCTGTTCAGCGCGCAGAT.CTGCGCCCAGCCGAGATGCGCTGCCTgctc > 2:3516807/9‑99 (MQ=255)
gcCGTCGCGCTGATCTGCGCCGGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgcgc < 2:5858508/101‑1 (MQ=255)
gcCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgcgc < 2:538015/101‑1 (MQ=255)
gTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgt > 1:1665798/1‑101 (MQ=255)
gcgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtcgt > 2:565433/1‑101 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc > 1:3846750/1‑101 (MQ=255)
cgcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCgtcgtc < 2:3363780/101‑1 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa < 1:2979479/101‑1 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa < 2:6743848/101‑1 (MQ=255)
tGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 1:6094901/101‑1 (MQ=255)
ggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 2:4450011/92‑1 (MQ=2)
ggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 2:5049895/92‑1 (MQ=2)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCGGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg < 1:1267621/101‑1 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 2:1588922/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 1:5960451/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGCCAGAACCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcgc > 1:5079241/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 1:1639376/101‑1 (MQ=255)
gccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 1:1785488/95‑1 (MQ=2)
ccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa < 1:6327368/96‑1 (MQ=2)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa < 1:3963508/101‑1 (MQ=255)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa > 2:4971896/1‑101 (MQ=255)
tGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 2:747290/101‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGACCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 1:6584598/101‑1 (MQ=255)
cgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 1:231204/97‑1 (MQ=2)
gcgcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCGACg > 2:2115011/1‑101 (MQ=255)
gcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGGGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGAt < 2:3985633/101‑1 (MQ=255)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc > 1:4105284/1‑101 (MQ=255)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc < 1:2743221/101‑1 (MQ=255)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGATGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc > 1:3713877/1‑101 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 1:3313505/1‑101 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa < 2:3034504/101‑1 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 1:4411883/1‑101 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 2:6004962/1‑101 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCCCGATGTCAt > 2:4343735/1‑101 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCAt < 1:5278396/101‑1 (MQ=255)
ggcggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 2:4879981/11‑101 (MQ=9)
cgccgcCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGGCATCgg > 2:4027826/1‑101 (MQ=255)
ccgccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTg < 2:1498806/101‑1 (MQ=255)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc > 1:7097368/7‑101 (MQ=9)
cccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCTGCGCCCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 2:2033015/100‑1 (MQ=255)
tttccaGCGCCGCAGCCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccg < 2:1109432/96‑2 (MQ=9)
ccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCa > 2:2987071/1‑101 (MQ=255)
ccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCa > 1:2363580/1‑101 (MQ=255)
ttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccga > 1:5463988/5‑99 (MQ=2)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 1:3451612/101‑1 (MQ=255)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 1:6253503/101‑1 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg > 2:1899488/1‑101 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg < 2:3254667/101‑1 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc < 1:2767272/101‑1 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc < 1:5895809/101‑1 (MQ=255)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc > 1:3190736/2‑96 (MQ=2)
aGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcc < 1:2644158/101‑1 (MQ=9)
ccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcccttg < 1:6994464/101‑5 (MQ=2)
ccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcccttg < 1:68503/101‑5 (MQ=2)
gcgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGAt < 2:6428237/101‑1 (MQ=255)
tgtCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 2:6922615/99‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg > 1:4527112/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg > 2:4611648/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg > 1:4946297/1‑101 (MQ=255)
tCTGCTTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgcc < 2:592949/101‑1 (MQ=255)
tCTGCGTGCGGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgcc < 1:5698647/101‑1 (MQ=255)
ccTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGTCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCACCTGATcgca > 2:2222327/2‑100 (MQ=2)
tGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgccgc < 2:3443149/101‑1 (MQ=255)
gCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCACCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCCCTTGATcgcattg < 2:1259152/101‑5 (MQ=0)
gggCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt < 1:131929/99‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt > 2:5580703/1‑101 (MQ=255)
gCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGc > 2:2543454/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCNNNcn > 1:6741340/1‑100 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGcc > 1:3065129/1‑101 (MQ=255)
ggTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCa < 1:63946/101‑1 (MQ=255)
gTCAGCCCCCCGAC.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAg < 2:2893659/101‑1 (MQ=255)
cAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcg > 2:1781979/1‑101 (MQ=255)
cAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGACAAAGCAGCGGATCGCCGCCGTGccagatc > 1:1222562/1‑96 (MQ=255)
aGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcgc > 1:1886389/1‑101 (MQ=255)
aGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAgcgc > 1:919335/1‑101 (MQ=255)
gcCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCa < 2:632945/101‑1 (MQ=255)
ccGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAc > 2:7046074/1‑101 (MQ=255)
cGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCAcc < 1:4003680/101‑1 (MQ=255)
|
CCGGCCATCGTGGCCGAGCCCAGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACC > NC_014034/681382‑681582
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 18 ≤
ATCG
< 26 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|