| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 681,503 | G→C | 21.7% | R702G (CGT→GGT) | RCAP_rcc00630 ← | ice nucleation protein repeat family protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 681,503 | 0 | G→C | 21.7% | 176.9 ‑1.8 ‑1.7 | 304 | R702G (CGT→GGT) | RCAP_rcc00630 | ice nucleation protein repeat family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (29/37): ref base (129/108): total (158/146) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.63e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.97e-02 | ||||||||||
Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
AGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGC > NC_014034/681403‑681602
|
agcccGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGAcg > 1:6480073/1‑101 (MQ=255)
gagCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCt > 1:6726803/1‑101 (MQ=255)
agCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTg < 1:3795200/101‑1 (MQ=255)
agCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTg < 2:3736554/101‑1 (MQ=255)
gcCGTCGCGCTGATCTGCGCCGGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTgcgc < 2:5858508/101‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcg > 1:1503299/1‑101 (MQ=255)
gcgcgCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCcgtc < 2:542454/100‑1 (MQ=255)
gcTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCa > 2:5641927/1‑101 (MQ=255)
cTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAg > 2:4017661/1‑101 (MQ=255)
tGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc > 2:4119247/1‑101 (MQ=255)
tGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc > 2:5329462/1‑101 (MQ=255)
ggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 1:5921145/92‑1 (MQ=2)
ggagccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgc < 2:4450011/92‑1 (MQ=2)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 1:5960451/1‑101 (MQ=255)
gATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAgcg > 2:1588922/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc > 1:615640/1‑101 (MQ=255)
gccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 1:256566/95‑1 (MQ=2)
gccgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGcc < 1:1785488/95‑1 (MQ=2)
cTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCa > 1:6321273/1‑101 (MQ=255)
cgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 1:231204/97‑1 (MQ=2)
cgcaccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCAc < 2:5526735/97‑1 (MQ=2)
gcgcCAGATCCGTCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCTAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACg > 1:5097759/1‑101 (MQ=255)
gcgcCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCGACg > 2:2115011/1‑101 (MQ=255)
caccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGa > 1:3859458/3‑101 (MQ=2)
caccAGATCGGCGGTTTCCAGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGa > 1:1105011/3‑101 (MQ=2)
ccAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGGCAGCGCCACGATg > 2:7057178/1‑101 (MQ=255)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGGCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTTCGCCGTCGCACGCGTCTCGATGTc > 2:1110867/1‑101 (MQ=25)
aGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGATGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTc > 1:3713877/1‑101 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 1:4411883/1‑101 (MQ=255)
gATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCa > 1:3313505/1‑101 (MQ=255)
aTCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCCCGATGTCAt > 2:4343735/1‑101 (MQ=255)
tCCGCCCCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCAAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATc < 1:7029558/101‑1 (MQ=255)
ggcggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 2:2729381/11‑101 (MQ=9)
cgcggcCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg < 2:5009225/101‑1 (MQ=255)
cgccgcCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 1:1704400/1‑101 (MQ=255)
cgccgcCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCgg > 1:2695396/1‑101 (MQ=255)
cggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTg > 2:3578396/9‑101 (MQ=9)
cggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTg > 2:1037426/9‑101 (MQ=9)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc < 2:4929670/94‑1 (MQ=9)
ggtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGc > 2:2907028/8‑101 (MQ=9)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 2:1879065/95‑1 (MQ=12)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:3981151/95‑1 (MQ=9)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:5462613/95‑1 (MQ=9)
gtttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 1:4482228/95‑1 (MQ=9)
gccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACTCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGcc < 2:3394130/101‑1 (MQ=255)
tttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccg < 1:6054484/96‑2 (MQ=9)
tttccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccg > 2:5107543/6‑100 (MQ=2)
ccTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCa > 1:2363580/1‑101 (MQ=255)
tccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgag > 1:586661/4‑98 (MQ=2)
tccaGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgag < 1:6960136/98‑4 (MQ=9)
tCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCaaa < 1:3451612/101‑1 (MQ=255)
cGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAg < 2:3254667/101‑1 (MQ=255)
gAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGc > 2:6453958/1‑101 (MQ=255)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc < 2:6281244/100‑6 (MQ=9)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc > 1:1293356/2‑96 (MQ=9)
caGCGCCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGC.CAGAAGCTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGccgaggc > 1:3190736/2‑96 (MQ=2)
aGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGGCAGCGCCACGCTGTCATCGGCGCCAAAGcc > 1:556632/1‑101 (MQ=255)
gcgcCGCAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGCGCCGAGGccc < 1:6624869/101‑2 (MQ=9)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt > 1:1261454/1‑98 (MQ=2)
gccgcAACCTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGccctt < 1:2847488/101‑4 (MQ=9)
ccgcAACCTGCGTGCTCGCCAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGcccttg < 2:6839919/101‑5 (MQ=2)
cgATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATc > 1:4355056/1‑101 (MQ=255)
tgtCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg < 2:6922615/99‑1 (MQ=255)
gATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcg > 1:678763/1‑101 (MQ=255)
aTCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgc > 2:2449926/1‑101 (MQ=255)
tCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgcc < 2:3007016/101‑1 (MQ=255)
ccTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGTCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCACCTGATcgca > 2:2222327/2‑100 (MQ=2)
cTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATcgccg < 1:4957250/101‑1 (MQ=255)
cTGCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCACCGGTGCCGAGGCCCTTGATcgcat > 1:4553372/1‑99 (MQ=2)
gCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCgccgcc < 2:1441887/101‑1 (MQ=255)
gCGTGCTCGACAGCGCCAGAAG.CTGCGTCGAGCCCAGCGCCGCCGCCTGCACCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCGAGGCCCTTGATcgcattg < 2:1259152/101‑5 (MQ=0)
gggCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt < 1:131929/99‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGt > 1:2746274/1‑101 (MQ=255)
tGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTg > 2:5198170/1‑101 (MQ=255)
gCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGc > 2:3483571/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGcc > 1:3065129/1‑101 (MQ=255)
cTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGcc > 1:1834766/1‑101 (MQ=255)
gcgcgcCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGcgcc < 2:1972002/101‑1 (MQ=255)
gcgcgcCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGcgcc < 1:2498362/101‑1 (MQ=255)
gcgcCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGcgccgc < 1:6386533/101‑1 (MQ=255)
cgcCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCgccgcc < 2:5744931/101‑1 (MQ=255)
gcCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCa > 2:2575603/1‑101 (MQ=255)
gcCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCa < 2:632945/101‑1 (MQ=255)
gAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCg > 1:966471/1‑101 (MQ=255)
gAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCg > 2:1744610/1‑101 (MQ=255)
gAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCg < 2:3313389/101‑1 (MQ=255)
t.CTGGGCCGAGCCCAGGCGCGCCCCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTc < 2:3854053/101‑1 (MQ=255)
t.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTc < 1:3028570/101‑1 (MQ=255)
gcCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGa < 2:4754096/101‑1 (MQ=255)
cGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAg < 1:4119442/101‑1 (MQ=255)
aGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGcc < 2:832142/101‑1 (MQ=255)
gCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCa < 2:615620/101‑1 (MQ=255)
gCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCa < 2:5960147/101‑1 (MQ=255)
cccAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAg > 2:6397489/1‑101 (MQ=255)
ccAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAgc < 1:835239/101‑1 (MQ=255)
ccAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAgc > 1:5289112/1‑101 (MQ=255)
cAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAgcg > 1:3594558/1‑101 (MQ=255)
aGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAgcgc > 1:2008147/1‑101 (MQ=255)
aCGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCAAGcgccg > 2:4851147/1‑101 (MQ=255)
cgcgCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGcgccgc < 1:213545/101‑1 (MQ=255)
|
AGCCCGGAGAGCGCCGTCGCGCTGATCTGCGCCAGATCCGCCGCCTCGAGCGCCGCGATCTGCGTGCTGGTCAGCGCGCCGAT.CTGCGCCGAGCCCAGACGCGCCGCCTGCGCCGTCGTCAGCGCCACGATGTCATCGGTGCCAAAGCCGCGGATCGCCGCCGTGCCCAGCGCCGCCACCGTCGCCGAAGCCAGCGCCGC > NC_014034/681403‑681602
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 20 ≤
ATCG
< 27 ≤
ATCG
< 33 ≤
ATCG
< 40 ≤
ATCG
|