Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_014034 | 1,951,528 | 2 bp→GC | 100% | coding (65‑66/528 nt) | ssb1 ← | single‑stranded DNA‑binding protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_014034 | 1,951,528 | 0 | C→G | 100.0% | 1047.1 | 286 | T22T (ACG→ACC) | ssb1 | single‑stranded DNA‑binding protein |
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* | NC_014034 | 1,951,529 | 0 | G→C | 100.0% | 1046.5 | 286 | T22R (ACG→AGG) | ssb1 | single‑stranded DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (117/169): ref base (0/0): total (117/169) |
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
CATTCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAACGTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCG > NC_014034/1951433‑1951623
||
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ttCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCa > 1:2207024/1‑101 (MQ=255)
tCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCAc > 2:6171150/1‑101 (MQ=255)
tCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCAc > 2:1068580/1‑101 (MQ=255)
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cgcTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCgg > 1:1575992/1‑101 (MQ=255)
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cccccgccGATTGCTTGCCGCCCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCg < 2:679134/95‑1 (MQ=255)
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cccGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGtt < 1:1078737/101‑1 (MQ=255)
cGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGc > 2:1690601/1‑101 (MQ=255)
gATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGcc < 1:3391772/101‑1 (MQ=255)
gATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGcc > 1:1376062/1‑101 (MQ=255)
aTTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGccc > 1:57657/1‑101 (MQ=255)
aTTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGccc > 2:3378955/1‑101 (MQ=255)
ttGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCcca < 1:2642210/101‑1 (MQ=255)
tGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccac < 1:4839003/101‑1 (MQ=255)
gCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGCTGCccacc > 1:1852651/1‑101 (MQ=255)
cTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCccacca > 2:1848626/1‑101 (MQ=255)
ttGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAg > 1:2396583/1‑101 (MQ=255)
ttGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAg > 2:1372804/1‑101 (MQ=255)
tGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGTTTGCCCACCAGa < 1:5138318/101‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCGGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGaa < 2:4994301/101‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGaa < 2:1257228/101‑1 (MQ=255)
tCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAAt > 2:6864350/1‑101 (MQ=255)
cgcgCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATg < 1:5468786/101‑1 (MQ=255)
cgcCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGAc < 1:6225257/101‑1 (MQ=255)
cgcCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGAc < 1:435207/101‑1 (MQ=255)
gcCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGAcc < 2:3410514/101‑1 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt < 2:716483/101‑1 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt < 1:4533886/101‑1 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt < 1:561829/101‑1 (MQ=255)
cAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCtt < 2:2206929/101‑1 (MQ=255)
ggTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGt < 1:4088332/101‑1 (MQ=255)
gTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGtt > 2:5417403/1‑101 (MQ=255)
tctcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTc < 2:6289514/101‑1 (MQ=255)
tcCGGGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACNTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCAc < 1:3626128/101‑1 (MQ=255)
tcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCAc < 2:7002982/101‑1 (MQ=255)
tcCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGACCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCAc > 1:2277633/1‑101 (MQ=255)
gggTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCCCCTCCGGGTCGCGCCCCAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGAt < 1:5009091/100‑1 (MQ=255)
ctgTGGCGATTCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGAt < 2:3274752/99‑1 (MQ=255)
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cgcAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGaa > 2:2809394/1‑101 (MQ=255)
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aGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAAct > 1:7058989/1‑101 (MQ=255)
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gTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAActct < 2:5639041/101‑1 (MQ=255)
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ttGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACtctc > 2:475228/1‑101 (MQ=255)
ttGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACtctc > 2:2415328/1‑101 (MQ=255)
tGCAGGCCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTcc < 1:5661925/101‑1 (MQ=255)
tGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTcc < 1:6632060/101‑1 (MQ=255)
tGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTcc < 2:3727117/101‑1 (MQ=255)
gCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCg < 1:3895030/101‑1 (MQ=255)
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gACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAg > 1:7126960/1‑101 (MQ=255)
gACCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAg < 1:475240/101‑1 (MQ=255)
aCCTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGt < 1:3997025/101‑1 (MQ=255)
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cTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTgg > 1:3125615/1‑101 (MQ=255)
cTTGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTgg > 2:4904600/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGcc > 2:4273720/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGcc > 1:254053/1‑101 (MQ=255)
tGCCGCCATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGACATGAAACTCTCCGTAGTGGcc > 1:5202033/1‑101 (MQ=255)
ccgccATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCgg < 1:4454603/101‑1 (MQ=255)
gtgtttGGCGAAGGCGCCGCCCTCCGGGTCGCGCCCGCGGTGGCCCACAAGAATGTCTTTGTTCACCGAGCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAg < 2:3052010/97‑1 (MQ=255)
gccATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAg < 1:2737850/101‑1 (MQ=255)
cATTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCg < 1:5409326/101‑1 (MQ=255)
aTTGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGa > 1:3746237/1‑101 (MQ=255)
ttGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAc > 1:985709/1‑101 (MQ=255)
tgggCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAc < 2:2936907/99‑1 (MQ=255)
tGGCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAcc > 1:1258515/1‑101 (MQ=255)
ggCGAAGCTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGAccc > 1:3522529/1‑101 (MQ=255)
||
CATTCGGTGCGCTCCTTGCGCTCGCCCGATTGCTTGTCGCGCCAGGTCTCCGAGGTGGCGATGCGCAGGTTGCAGACCTTGCCGCCATTGGCGAACGTGCGCACCTCCGGGTCGCGCCCGAGGTTGCCCACCAGAATGACCTTGTTCACCGATCCTGCCATGAAACTCTCCGTAGTGGCCGGAGCGACCCG > NC_014034/1951433‑1951623
Base quality scores: 
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 22 ≤
ATCG
< 29 ≤
ATCG
< 34 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|