| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_014034 | 2,177,289 | 2 bp→AT | 100% | coding (87‑88/990 nt) | rbsB ← | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_014034 | 2,177,289 | 0 | T→A | 100.0% | 1029.5 | 271 | T30S (ACA→TCA) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (157/113): ref base (0/0): total (158/113) | ||||||||||
| * | NC_014034 | 2,177,290 | 0 | A→T | 100.0% | 1053.0 | 266 | C29* (TGT→TGA) | rbsB | ribose ABC transporter periplasmic ribose‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (156/110): ref base (0/0): total (156/110) | ||||||||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
CATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAA..GGGTT..G..GTCGGTCTT.GTGTACAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.A.GCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GGCAGAGG.CCCC.AACAGGGCCAG.TTGCGCATC > NC_014034/2177202‑2177374
||
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cATAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGAtcagacag < 2:3363886/101‑1 (MQ=255)
aTAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAgg > 2:141270/1‑101 (MQ=255)
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tAGGTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGc > 2:5559158/1‑101 (MQ=255)
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ggTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGccc < 2:3898558/101‑1 (MQ=255)
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gTCGAGAGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGcccc < 2:3620723/101‑1 (MQ=255)
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agCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTc < 1:4986210/100‑1 (MQ=255)
agCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTc < 1:4608615/100‑1 (MQ=255)
gCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCg < 2:4878979/101‑1 (MQ=255)
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cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCg > 2:6516097/1‑101 (MQ=255)
cAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCg < 1:3727032/101‑1 (MQ=255)
gCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aa < 1:758724/101‑2 (MQ=255)
cccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.aagc < 1:1158659/101‑4 (MQ=255)
cccATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCAG.atcg < 2:5866813/101‑4 (MQ=255)
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tctcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAA.gccgcc < 1:1034807/101‑1 (MQ=255)
tctcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCAGCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAA.gccgcc > 1:5014790/1‑101 (MQ=255)
ctcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAA.GCCGccc < 2:3469838/101‑1 (MQ=255)
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tcGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAA.GCCGcccc > 2:4588810/1‑101 (MQ=255)
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cGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAAAGGGGTT..GGTGTCGGTCTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAA.GCCGCCCCg > 1:5445054/1‑101 (MQ=255)
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tgtcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAA.GCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCC.AACAGGGCCAG.tttgcgc > 2:1030149/2‑96 (MQ=255)
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tcggtcTTGGTGATCAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCGAA.GCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCAGGGCAGAGGCCCCC.AACAGGGCCAG.tttgcccat > 1:2189961/1‑94 (MQ=255)
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||
CATAGGTCGAGGGCACCAGCCCCATCTCGGTCGCCTTTGCCGAAGCACCTTCCTTCATCTTGACGAAAA..GGGTT..G..GTCGGTCTT.GTGTACAGACAGGCCCCGGTTTCGGCCG.A.GCCGCCCCGGCCAGCGCGGAAAACGCCA.GGCAGAGG.CCCC.AACAGGGCCAG.TTGCGCATC > NC_014034/2177202‑2177374
Base quality scores:
ATCG
< 3 ≤
ATCG
< 24 ≤
ATCG
< 31 ≤
ATCG
< 35 ≤
ATCG
< 41 ≤
ATCG
|